MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 1478

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006086	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	50913348
2	NC_006086	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	50913349
3	NC_006086	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	50913350
4	NC_006086	GATTT	2	10	6138	6147	20 %	60 %	20 %	0 %	50913352
5	NC_006086	ATTAA	2	10	11967	11976	60 %	40 %	0 %	0 %	50913357
6	NC_006086	TACAC	2	10	17002	17011	40 %	20 %	0 %	40 %	50913361
7	NC_006086	TAAAT	2	10	17012	17021	60 %	40 %	0 %	0 %	50913361
8	NC_006086	ACATT	2	10	17579	17588	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_006086	TCGTG	2	10	19200	19209	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
10	NC_006086	GTTAA	2	10	20096	20105	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006086	GGGAG	2	10	20615	20624	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006086	AGGGA	2	10	22826	22835	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006086	GCTTA	2	10	23192	23201	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14	NC_006086	TCGTG	2	10	25201	25210	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_006086	GTTAA	2	10	26097	26106	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006086	GGGAG	2	10	26616	26625	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006086	AGGGA	2	10	28827	28836	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006086	GCTTA	2	10	29193	29202	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_006086	TTCTT	2	10	31004	31013	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_006086	TATAA	2	10	33431	33440	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006086	AGTGA	2	10	34178	34187	40 %	20 %	40 %	0 %	50913364
22	NC_006086	ATTTT	2	10	34877	34886	20 %	80 %	0 %	0 %	50913365
23	NC_006086	TTGAT	2	10	35066	35075	20 %	60 %	20 %	0 %	50913365
24	NC_006086	AATAT	2	10	37226	37235	60 %	40 %	0 %	0 %	50913367
25	NC_006086	GAGTT	2	10	38052	38061	20 %	40 %	40 %	0 %	50913369
26	NC_006086	TTTAT	2	10	38063	38072	20 %	80 %	0 %	0 %	50913369
27	NC_006086	ATCTG	2	10	39888	39897	20 %	40 %	20 %	20 %	50913373
28	NC_006086	AATCG	2	10	40027	40036	40 %	20 %	20 %	20 %	50913374
29	NC_006086	CCTAT	2	10	40081	40090	20 %	40 %	0 %	40 %	50913374
30	NC_006086	AAGCC	2	10	40457	40466	40 %	0 %	20 %	40 %	50913375
31	NC_006086	AGTTG	2	10	40594	40603	20 %	40 %	40 %	0 %	50913376
32	NC_006086	CTACT	2	10	41701	41710	20 %	40 %	0 %	40 %	50913378
33	NC_006086	TTGTA	2	10	43535	43544	20 %	60 %	20 %	0 %	50913380
34	NC_006086	GATAC	2	10	46650	46659	40 %	20 %	20 %	20 %	50913381
35	NC_006086	AGTTA	2	10	48561	48570	40 %	40 %	20 %	0 %	50913383
36	NC_006086	GTTTG	2	10	48958	48967	0 %	60 %	40 %	0 %	50913383
37	NC_006086	GATTG	2	10	51746	51755	20 %	40 %	40 %	0 %	50913388
38	NC_006086	CAAAA	2	10	56537	56546	80 %	0 %	0 %	20 %	50913394
39	NC_006086	CCCTG	2	10	57970	57979	0 %	20 %	20 %	60 %	50913397
40	NC_006086	AAGAT	2	10	60262	60271	60 %	20 %	20 %	0 %	50913402
41	NC_006086	GGCAG	2	10	63732	63741	20 %	0 %	60 %	20 %	50913402
42	NC_006086	GCTAT	2	10	69414	69423	20 %	40 %	20 %	20 %	50913406
43	NC_006086	CAAAA	2	10	71238	71247	80 %	0 %	0 %	20 %	50913409
44	NC_006086	ACAAA	2	10	71350	71359	80 %	0 %	0 %	20 %	50913410
45	NC_006086	TTGGT	2	10	72260	72269	0 %	60 %	40 %	0 %	50913411
46	NC_006086	TAAAT	2	10	72860	72869	60 %	40 %	0 %	0 %	50913411
47	NC_006086	ACTGT	2	10	74706	74715	20 %	40 %	20 %	20 %	50913413
48	NC_006086	TGGTG	2	10	77045	77054	0 %	40 %	60 %	0 %	50913417
49	NC_006086	AGCGA	2	10	81450	81459	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_006086	AGCAG	2	10	84366	84375	40 %	0 %	40 %	20 %	50913421
51	NC_006086	GGTCA	2	10	84730	84739	20 %	20 %	40 %	20 %	50913421
52	NC_006086	TTGGG	2	10	85126	85135	0 %	40 %	60 %	0 %	50913422
53	NC_006086	GCAGG	2	10	89207	89216	20 %	0 %	60 %	20 %	50913424
54	NC_006086	CTGCC	2	10	90171	90180	0 %	20 %	20 %	60 %	50913426
55	NC_006086	CTCAG	2	10	90564	90573	20 %	20 %	20 %	40 %	50913426
56	NC_006086	TACTA	2	10	92202	92211	40 %	40 %	0 %	20 %	50913427
57	NC_006086	AAATT	2	10	92495	92504	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006086	TCGGA	2	10	95313	95322	20 %	20 %	40 %	20 %	50913430
59	NC_006086	GCTTT	2	10	98058	98067	0 %	60 %	20 %	20 %	50913433
60	NC_006086	TTTTC	2	10	98256	98265	0 %	80 %	0 %	20 %	50913433
61	NC_006086	AAACC	2	10	98321	98330	60 %	0 %	0 %	40 %	50913433
62	NC_006086	ATGGT	2	10	100094	100103	20 %	40 %	40 %	0 %	50913434
63	NC_006086	ATTCA	2	10	100778	100787	40 %	40 %	0 %	20 %	50913434
64	NC_006086	ATTTT	2	10	102043	102052	20 %	80 %	0 %	0 %	50913435
65	NC_006086	AAATA	2	10	103310	103319	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006086	TATAT	2	10	103395	103404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006086	TTTTA	2	10	104549	104558	20 %	80 %	0 %	0 %	50913437
68	NC_006086	AAAGC	2	10	104742	104751	60 %	0 %	20 %	20 %	50913437
69	NC_006086	TTTGG	2	10	108736	108745	0 %	60 %	40 %	0 %	50913444
70	NC_006086	TTCAC	2	10	109092	109101	20 %	40 %	0 %	40 %	50913445
71	NC_006086	GAAAT	2	10	110172	110181	60 %	20 %	20 %	0 %	50913447
72	NC_006086	AAGGA	2	10	111252	111261	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006086	TCCAA	2	10	115871	115880	40 %	20 %	0 %	40 %	161761326
74	NC_006086	GTTTC	2	10	118519	118528	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
75	NC_006086	TCGTG	2	10	121776	121785	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
76	NC_006086	GTTAA	2	10	122672	122681	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006086	GGGAG	2	10	123191	123200	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006086	AGGGA	2	10	125402	125411	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006086	GCTTA	2	10	125768	125777	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
80	NC_006086	ATTAT	2	10	126058	126067	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006086	TATAT	2	10	126141	126150	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006086	CTTGG	2	10	130077	130086	0 %	40 %	40 %	20 %	50913473
83	NC_006086	TCTTA	2	10	130495	130504	20 %	60 %	0 %	20 %	50913473
84	NC_006086	CACTC	2	10	132039	132048	20 %	20 %	0 %	60 %	50913475
85	NC_006086	GATTG	2	10	134300	134309	20 %	40 %	40 %	0 %	50913476
86	NC_006086	TTGAT	2	10	144459	144468	20 %	60 %	20 %	0 %	50913481
87	NC_006086	AAATC	2	10	144627	144636	60 %	20 %	0 %	20 %	50913481
88	NC_006086	TGAAG	2	10	149943	149952	40 %	20 %	40 %	0 %	50913490
89	NC_006086	AGAAA	2	10	151384	151393	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006086	TTTAG	2	10	151653	151662	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006086	TTTAG	2	10	152888	152897	20 %	60 %	20 %	0 %	50913494
92	NC_006086	GTGTT	2	10	157292	157301	0 %	60 %	40 %	0 %	50913500
93	NC_006086	TTAAG	2	10	157492	157501	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006086	TAGGT	2	10	158110	158119	20 %	40 %	40 %	0 %	50913502
95	NC_006086	TAAAT	2	10	158243	158252	60 %	40 %	0 %	0 %	50913502
96	NC_006086	GAGAG	2	10	159278	159287	40 %	0 %	60 %	0 %	50913503
97	NC_006086	ACAAT	2	10	163369	163378	60 %	20 %	0 %	20 %	50913505
98	NC_006086	CAACT	2	10	165147	165156	40 %	20 %	0 %	40 %	50913505
99	NC_006086	ATTAA	2	10	165454	165463	60 %	40 %	0 %	0 %	50913505
100	NC_006086	TTTAA	2	10	166316	166325	40 %	60 %	0 %	0 %	50913506
101	NC_006086	TATTC	2	10	166881	166890	20 %	60 %	0 %	20 %	50913506
102	NC_006086	TTTTA	2	10	169358	169367	20 %	80 %	0 %	0 %	50913509
103	NC_006086	GCTTT	3	15	169934	169948	0 %	60 %	20 %	20 %	50913509
104	NC_006086	GTCAT	2	10	170253	170262	20 %	40 %	20 %	20 %	50913509
105	NC_006086	TAGTG	2	10	171196	171205	20 %	40 %	40 %	0 %	50913510
106	NC_006086	GTTAA	2	10	171600	171609	40 %	40 %	20 %	0 %	50913511
107	NC_006086	AATAA	2	10	171629	171638	80 %	20 %	0 %	0 %	50913511
108	NC_006086	TTGAT	2	10	172716	172725	20 %	60 %	20 %	0 %	50913512
109	NC_006086	TTGAC	2	10	173938	173947	20 %	40 %	20 %	20 %	50913514
110	NC_006086	TACCT	2	10	174119	174128	20 %	40 %	0 %	40 %	50913514
111	NC_006086	AATCA	2	10	174897	174906	60 %	20 %	0 %	20 %	50913515
112	NC_006086	TCATG	2	10	175504	175513	20 %	40 %	20 %	20 %	50913516
113	NC_006086	AACAA	2	10	176650	176659	80 %	0 %	0 %	20 %	50913517
114	NC_006086	TTGGC	2	10	176735	176744	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
115	NC_006086	CAAAA	2	10	177867	177876	80 %	0 %	0 %	20 %	50913519
116	NC_006086	TTTTA	2	10	178940	178949	20 %	80 %	0 %	0 %	50913519
117	NC_006086	AAAGC	2	10	180129	180138	60 %	0 %	20 %	20 %	50913521
118	NC_006086	AGTTC	2	10	180379	180388	20 %	40 %	20 %	20 %	50913521
119	NC_006086	GCTGA	2	10	180399	180408	20 %	20 %	40 %	20 %	50913521
120	NC_006086	ATCGC	2	10	183773	183782	20 %	20 %	20 %	40 %	161761324
121	NC_006086	TTGGG	2	10	185176	185185	0 %	40 %	60 %	0 %	50913525
122	NC_006086	GAAAA	2	10	190486	190495	80 %	0 %	20 %	0 %	50913530
123	NC_006086	GGATT	2	10	190603	190612	20 %	40 %	40 %	0 %	50913530
124	NC_006086	TTTTG	2	10	191123	191132	0 %	80 %	20 %	0 %	50913530
125	NC_006086	TCATG	2	10	192629	192638	20 %	40 %	20 %	20 %	50913532
126	NC_006086	GTATC	2	10	193890	193899	20 %	40 %	20 %	20 %	50913533
127	NC_006086	GTCGC	2	10	194329	194338	0 %	20 %	40 %	40 %	50913534
128	NC_006086	ATTAT	2	10	196409	196418	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006086	CTTGT	2	10	198941	198950	0 %	60 %	20 %	20 %	50913538
130	NC_006086	GCAAC	2	10	199874	199883	40 %	0 %	20 %	40 %	50913539
131	NC_006086	AAGGT	2	10	201556	201565	40 %	20 %	40 %	0 %	50913539
132	NC_006086	CGTCA	2	10	201753	201762	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_006086	AACAA	2	10	203492	203501	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
134	NC_006086	ATTTG	2	10	207834	207843	20 %	60 %	20 %	0 %	50913547
135	NC_006086	CAAGA	2	10	209756	209765	60 %	0 %	20 %	20 %	50913548
136	NC_006086	TTTGG	2	10	210923	210932	0 %	60 %	40 %	0 %	50913549
137	NC_006086	TGGAT	2	10	211872	211881	20 %	40 %	40 %	0 %	50913550
138	NC_006086	CCTAA	2	10	212945	212954	40 %	20 %	0 %	40 %	50913550
139	NC_006086	GGAAA	2	10	217974	217983	60 %	0 %	40 %	0 %	50913554
140	NC_006086	TAATC	2	10	220800	220809	40 %	40 %	0 %	20 %	50913558
141	NC_006086	TCTAA	2	10	224083	224092	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
142	NC_006086	TTTAC	2	10	224932	224941	20 %	60 %	0 %	20 %	50913563
143	NC_006086	CAAAC	2	10	227450	227459	60 %	0 %	0 %	40 %	50913566
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270	NC_006086	TCTAC	2	10	375962	375971	20 %	40 %	0 %	40 %	50913713
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