MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 4850

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006086	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006086	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	50913347
3	NC_006086	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	50913347
4	NC_006086	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	50913347
5	NC_006086	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	50913347
6	NC_006086	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006086	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	50913348
8	NC_006086	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	50913348
9	NC_006086	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	50913348
10	NC_006086	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	50913348
11	NC_006086	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	50913348
12	NC_006086	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006086	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006086	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	50913350
15	NC_006086	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	50913350
16	NC_006086	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	50913350
17	NC_006086	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	50913351
18	NC_006086	TTGA	2	8	6359	6366	25 %	50 %	25 %	0 %	50913352
19	NC_006086	ACGA	2	8	6432	6439	50 %	0 %	25 %	25 %	50913352
20	NC_006086	CCTT	2	8	6472	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	50913352
21	NC_006086	AGTG	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	50913352
22	NC_006086	TGAT	2	8	7419	7426	25 %	50 %	25 %	0 %	50913352
23	NC_006086	ACCA	2	8	7576	7583	50 %	0 %	0 %	50 %	50913352
24	NC_006086	AAAG	2	8	7708	7715	75 %	0 %	25 %	0 %	50913352
25	NC_006086	TTGA	2	8	7799	7806	25 %	50 %	25 %	0 %	50913352
26	NC_006086	TCGG	2	8	8144	8151	0 %	25 %	50 %	25 %	50913352
27	NC_006086	AGCA	2	8	8192	8199	50 %	0 %	25 %	25 %	50913352
28	NC_006086	AATC	2	8	8236	8243	50 %	25 %	0 %	25 %	50913352
29	NC_006086	TCAA	2	8	8326	8333	50 %	25 %	0 %	25 %	50913352
30	NC_006086	GAAC	2	8	8754	8761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_006086	AAAT	2	8	9027	9034	75 %	25 %	0 %	0 %	50913353
32	NC_006086	AAGA	2	8	9173	9180	75 %	0 %	25 %	0 %	50913354
33	NC_006086	GGAT	2	8	9236	9243	25 %	25 %	50 %	0 %	50913354
34	NC_006086	TATT	2	8	9264	9271	25 %	75 %	0 %	0 %	50913354
35	NC_006086	TCAA	2	8	9759	9766	50 %	25 %	0 %	25 %	50913356
36	NC_006086	ACAA	2	8	10065	10072	75 %	0 %	0 %	25 %	50913356
37	NC_006086	CAAA	2	8	10123	10130	75 %	0 %	0 %	25 %	50913356
38	NC_006086	ATTT	2	8	10839	10846	25 %	75 %	0 %	0 %	50913356
39	NC_006086	AAAT	2	8	10860	10867	75 %	25 %	0 %	0 %	50913356
40	NC_006086	CAAA	2	8	11093	11100	75 %	0 %	0 %	25 %	50913357
41	NC_006086	TTCA	2	8	11529	11536	25 %	50 %	0 %	25 %	50913357
42	NC_006086	AGTT	2	8	11836	11843	25 %	50 %	25 %	0 %	50913357
43	NC_006086	TTTA	2	8	11948	11955	25 %	75 %	0 %	0 %	50913357
44	NC_006086	TTTA	2	8	12035	12042	25 %	75 %	0 %	0 %	50913357
45	NC_006086	GAAG	2	8	12481	12488	50 %	0 %	50 %	0 %	50913358
46	NC_006086	TGTT	2	8	12639	12646	0 %	75 %	25 %	0 %	50913358
47	NC_006086	ATTA	2	8	12909	12916	50 %	50 %	0 %	0 %	50913359
48	NC_006086	GAAA	2	8	13104	13111	75 %	0 %	25 %	0 %	50913359
49	NC_006086	TCAA	2	8	13302	13309	50 %	25 %	0 %	25 %	50913359
50	NC_006086	GTTC	2	8	13576	13583	0 %	50 %	25 %	25 %	50913359
51	NC_006086	ATGG	2	8	13723	13730	25 %	25 %	50 %	0 %	50913359
52	NC_006086	GTTG	2	8	13986	13993	0 %	50 %	50 %	0 %	50913359
53	NC_006086	AAAG	2	8	14070	14077	75 %	0 %	25 %	0 %	50913359
54	NC_006086	TGAT	2	8	14498	14505	25 %	50 %	25 %	0 %	50913359
55	NC_006086	ATTG	2	8	14583	14590	25 %	50 %	25 %	0 %	50913359
56	NC_006086	TGAT	2	8	15062	15069	25 %	50 %	25 %	0 %	50913360
57	NC_006086	ACTA	2	8	16116	16123	50 %	25 %	0 %	25 %	50913361
58	NC_006086	TTTA	2	8	16733	16740	25 %	75 %	0 %	0 %	50913361
59	NC_006086	GTAT	2	8	17115	17122	25 %	50 %	25 %	0 %	50913361
60	NC_006086	ATAA	2	8	17551	17558	75 %	25 %	0 %	0 %	50913361
61	NC_006086	TACT	2	8	17634	17641	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_006086	AAAT	2	8	18078	18085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006086	ACCT	2	8	18252	18259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_006086	GTGA	2	8	18533	18540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006086	TAAC	2	8	18616	18623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_006086	AGCG	2	8	18704	18711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_006086	TGGT	2	8	19369	19376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006086	AGCC	2	8	19586	19593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_006086	AGCG	2	8	19932	19939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_006086	GTAA	2	8	20182	20189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006086	ACTA	2	8	20224	20231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_006086	GAAG	2	8	20264	20271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006086	GCGA	2	8	20338	20345	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_006086	ATTC	2	8	21204	21211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_006086	CTAA	2	8	21560	21567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_006086	TAGG	2	8	22215	22222	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006086	TTGG	2	8	22398	22405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006086	AATC	2	8	22407	22414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_006086	AAAT	2	8	24079	24086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006086	ACCT	2	8	24253	24260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_006086	GTGA	2	8	24534	24541	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006086	TAAC	2	8	24617	24624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_006086	AGCG	2	8	24705	24712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
84	NC_006086	TGGT	2	8	25370	25377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006086	AGCC	2	8	25587	25594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_006086	AGCG	2	8	25933	25940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
87	NC_006086	GTAA	2	8	26183	26190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006086	ACTA	2	8	26225	26232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_006086	GAAG	2	8	26265	26272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006086	GCGA	2	8	26339	26346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
91	NC_006086	ATTC	2	8	27205	27212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_006086	CTAA	2	8	27561	27568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
93	NC_006086	TAGG	2	8	28216	28223	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006086	TTGG	2	8	28399	28406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006086	AATC	2	8	28408	28415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_006086	GCGT	2	8	30255	30262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_006086	GTTA	2	8	31020	31027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006086	ATTC	2	8	31819	31826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_006086	AAGT	2	8	32286	32293	50 %	25 %	25 %	0 %	50913363
100	NC_006086	AAGC	2	8	32594	32601	50 %	0 %	25 %	25 %	50913363
101	NC_006086	TGGT	2	8	33265	33272	0 %	50 %	50 %	0 %	50913363
102	NC_006086	ATTT	2	8	33292	33299	25 %	75 %	0 %	0 %	50913363
103	NC_006086	ACGC	2	8	33849	33856	25 %	0 %	25 %	50 %	50913364
104	NC_006086	TTGA	2	8	34226	34233	25 %	50 %	25 %	0 %	50913364
105	NC_006086	TGAT	2	8	34239	34246	25 %	50 %	25 %	0 %	50913364
106	NC_006086	TTCT	2	8	34329	34336	0 %	75 %	0 %	25 %	50913364
107	NC_006086	ATTA	2	8	34594	34601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006086	CATT	2	8	35423	35430	25 %	50 %	0 %	25 %	50913365
109	NC_006086	AGCT	2	8	35617	35624	25 %	25 %	25 %	25 %	50913366
110	NC_006086	GGTG	2	8	35658	35665	0 %	25 %	75 %	0 %	50913366
111	NC_006086	TAGC	2	8	36293	36300	25 %	25 %	25 %	25 %	50913366
112	NC_006086	ATTG	2	8	36808	36815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006086	ATCT	2	8	37574	37581	25 %	50 %	0 %	25 %	50913368
114	NC_006086	TTTA	2	8	37602	37609	25 %	75 %	0 %	0 %	50913368
115	NC_006086	TAGT	2	8	38274	38281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006086	TAAA	2	8	38776	38783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006086	TACT	2	8	38786	38793	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_006086	AAAC	2	8	39293	39300	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
119	NC_006086	ACTT	2	8	39352	39359	25 %	50 %	0 %	25 %	50913372
120	NC_006086	TCAA	2	8	39447	39454	50 %	25 %	0 %	25 %	50913372
121	NC_006086	CAAG	2	8	40110	40117	50 %	0 %	25 %	25 %	50913374
122	NC_006086	GAAA	2	8	40515	40522	75 %	0 %	25 %	0 %	50913375
123	NC_006086	ATTG	2	8	40731	40738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006086	AGAA	2	8	40935	40942	75 %	0 %	25 %	0 %	50913377
125	NC_006086	AATT	2	8	41843	41850	50 %	50 %	0 %	0 %	50913378
126	NC_006086	AGTT	2	8	43518	43525	25 %	50 %	25 %	0 %	50913380
127	NC_006086	GACG	2	8	43796	43803	25 %	0 %	50 %	25 %	50913380
128	NC_006086	GGGC	2	8	43851	43858	0 %	0 %	75 %	25 %	50913380
129	NC_006086	TAGA	2	8	44810	44817	50 %	25 %	25 %	0 %	50913380
130	NC_006086	GCAA	2	8	45011	45018	50 %	0 %	25 %	25 %	50913381
131	NC_006086	ACGC	2	8	45468	45475	25 %	0 %	25 %	50 %	50913381
132	NC_006086	TGCA	2	8	46273	46280	25 %	25 %	25 %	25 %	50913381
133	NC_006086	ATGA	2	8	46722	46729	50 %	25 %	25 %	0 %	50913381
134	NC_006086	TAAG	2	8	46897	46904	50 %	25 %	25 %	0 %	50913381
135	NC_006086	ATGA	2	8	47109	47116	50 %	25 %	25 %	0 %	50913381
136	NC_006086	TAAC	2	8	47352	47359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
137	NC_006086	TGAT	2	8	48323	48330	25 %	50 %	25 %	0 %	50913383
138	NC_006086	CTAT	2	8	48692	48699	25 %	50 %	0 %	25 %	50913383
139	NC_006086	GCCA	2	8	48776	48783	25 %	0 %	25 %	50 %	50913383
140	NC_006086	TAGA	2	8	49013	49020	50 %	25 %	25 %	0 %	50913383
141	NC_006086	CAGA	2	8	49027	49034	50 %	0 %	25 %	25 %	50913383
142	NC_006086	TTGC	2	8	49348	49355	0 %	50 %	25 %	25 %	50913385
143	NC_006086	AGAC	2	8	49553	49560	50 %	0 %	25 %	25 %	50913385
144	NC_006086	AACA	2	8	50738	50745	75 %	0 %	0 %	25 %	50913388
145	NC_006086	TGAT	2	8	51684	51691	25 %	50 %	25 %	0 %	50913388
146	NC_006086	ATAC	2	8	52500	52507	50 %	25 %	0 %	25 %	50913389
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148	NC_006086	GGAT	2	8	53806	53813	25 %	25 %	50 %	0 %	50913390
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