MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 732

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006086	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006086	TTTA	2	8	1633	1640	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006086	TAAA	2	8	3130	3137	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006086	TTGA	2	8	3420	3427	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006086	GAAC	2	8	8754	8761	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_006086	TACT	2	8	17634	17641	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_006086	AAAT	2	8	18078	18085	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006086	ACCT	2	8	18252	18259	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_006086	GTGA	2	8	18533	18540	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006086	TAAC	2	8	18616	18623	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_006086	AGCG	2	8	18704	18711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_006086	TGGT	2	8	19369	19376	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006086	AGCC	2	8	19586	19593	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_006086	AGCG	2	8	19932	19939	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_006086	GTAA	2	8	20182	20189	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006086	ACTA	2	8	20224	20231	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
17	NC_006086	GAAG	2	8	20264	20271	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006086	GCGA	2	8	20338	20345	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_006086	ATTC	2	8	21204	21211	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_006086	CTAA	2	8	21560	21567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_006086	TAGG	2	8	22215	22222	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006086	TTGG	2	8	22398	22405	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006086	AATC	2	8	22407	22414	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_006086	AAAT	2	8	24079	24086	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006086	ACCT	2	8	24253	24260	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_006086	GTGA	2	8	24534	24541	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006086	TAAC	2	8	24617	24624	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
28	NC_006086	AGCG	2	8	24705	24712	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_006086	TGGT	2	8	25370	25377	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006086	AGCC	2	8	25587	25594	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_006086	AGCG	2	8	25933	25940	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_006086	GTAA	2	8	26183	26190	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006086	ACTA	2	8	26225	26232	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_006086	GAAG	2	8	26265	26272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006086	GCGA	2	8	26339	26346	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_006086	ATTC	2	8	27205	27212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_006086	CTAA	2	8	27561	27568	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_006086	TAGG	2	8	28216	28223	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006086	TTGG	2	8	28399	28406	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006086	AATC	2	8	28408	28415	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
41	NC_006086	GCGT	2	8	30255	30262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
42	NC_006086	GTTA	2	8	31020	31027	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006086	ATTC	2	8	31819	31826	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_006086	ATTA	2	8	34594	34601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006086	ATTG	2	8	36808	36815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006086	TAGT	2	8	38274	38281	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006086	TAAA	2	8	38776	38783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006086	TACT	2	8	38786	38793	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_006086	AAAC	2	8	39293	39300	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_006086	ATTG	2	8	40731	40738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006086	TAAC	2	8	47352	47359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_006086	TTAT	2	8	57696	57703	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006086	CTAT	2	8	59553	59560	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_006086	AATT	2	8	74875	74882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006086	TTTA	2	8	74911	74918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006086	GTAA	2	8	76783	76790	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006086	GGAA	2	8	77570	77577	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006086	TAGT	2	8	84178	84185	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006086	AAAG	2	8	84932	84939	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006086	AGAA	2	8	89358	89365	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006086	GATT	2	8	96347	96354	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006086	AAAG	2	8	99137	99144	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006086	ATTT	2	8	102190	102197	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006086	TATT	2	8	108159	108166	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006086	TAAA	2	8	111820	111827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006086	TTAA	2	8	112060	112067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006086	TATT	2	8	116571	116578	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006086	AAAT	2	8	120654	120661	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006086	ACCT	2	8	120828	120835	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_006086	GTGA	2	8	121109	121116	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006086	TAAC	2	8	121192	121199	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_006086	AGCG	2	8	121280	121287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_006086	TGGT	2	8	121945	121952	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006086	AGCC	2	8	122162	122169	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_006086	AGCG	2	8	122508	122515	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_006086	GTAA	2	8	122758	122765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006086	ACTA	2	8	122800	122807	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
78	NC_006086	GAAG	2	8	122840	122847	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006086	GCGA	2	8	122914	122921	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_006086	ATTC	2	8	123780	123787	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_006086	CTAA	2	8	124136	124143	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_006086	TAGG	2	8	124791	124798	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006086	TTGG	2	8	124974	124981	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006086	AATC	2	8	124983	124990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_006086	GCGT	2	8	126212	126219	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
86	NC_006086	TGAT	2	8	127553	127560	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006086	GTTC	2	8	127565	127572	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_006086	AAAT	2	8	127592	127599	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006086	TGGT	2	8	127613	127620	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006086	CAAT	2	8	127727	127734	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_006086	CAAT	2	8	138569	138576	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
92	NC_006086	GTTA	2	8	148902	148909	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006086	TAAG	2	8	151364	151371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006086	TCTA	2	8	159099	159106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_006086	TCTT	2	8	159238	159245	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_006086	AATC	2	8	161372	161379	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_006086	GCAC	2	8	162096	162103	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_006086	TCTA	2	8	162144	162151	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_006086	AAAT	2	8	162185	162192	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006086	AATC	2	8	167163	167170	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
101	NC_006086	CTTT	2	8	168932	168939	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_006086	CAAA	2	8	168959	168966	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_006086	GTCA	2	8	174332	174339	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_006086	TATC	2	8	175099	175106	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_006086	TTAG	2	8	182071	182078	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006086	GCTT	2	8	186055	186062	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_006086	GAAA	2	8	188326	188333	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006086	CCTG	2	8	188546	188553	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_006086	TAGT	2	8	190040	190047	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006086	ACAA	2	8	192125	192132	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
111	NC_006086	AAAG	2	8	196487	196494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006086	TAGC	2	8	196600	196607	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_006086	AAAT	2	8	197400	197407	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006086	AAAT	2	8	197470	197477	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006086	GGAT	2	8	207031	207038	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006086	AGTC	2	8	208850	208857	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
117	NC_006086	ATAG	2	8	216413	216420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006086	CGTG	2	8	216894	216901	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_006086	TAAA	2	8	217414	217421	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006086	ATGG	2	8	217489	217496	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006086	AAGA	2	8	220924	220931	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006086	CTTC	2	8	224394	224401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_006086	TTTA	2	8	224437	224444	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_006086	CATA	2	8	224655	224662	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
125	NC_006086	AAAT	2	8	224841	224848	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_006086	GAAA	2	8	224883	224890	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_006086	AGTA	2	8	225247	225254	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006086	TAGA	2	8	225586	225593	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_006086	GATT	2	8	228986	228993	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130	NC_006086	AGGG	2	8	229114	229121	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
131	NC_006086	AGTG	2	8	230212	230219	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006086	CTTT	2	8	236542	236549	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_006086	CAAG	2	8	236568	236575	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_006086	GGGA	2	8	237992	237999	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
135	NC_006086	ACCG	2	8	239452	239459	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_006086	TAAA	2	8	246377	246384	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006086	CAAT	2	8	246412	246419	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
138	NC_006086	TCAA	2	8	246427	246434	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_006086	TTTG	2	8	246516	246523	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006086	TAGT	2	8	248924	248931	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006086	GTTT	2	8	248969	248976	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006086	TAAA	2	8	253536	253543	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006086	CATA	2	8	253589	253596	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_006086	TTTG	2	8	253652	253659	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006086	AATT	2	8	269583	269590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006086	ATTT	2	8	272119	272126	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006086	TAGG	2	8	272204	272211	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006086	AAAG	2	8	283433	283440	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006086	TAAA	2	8	287985	287992	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006086	GTCA	2	8	288019	288026	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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152	NC_006086	ACCT	2	8	297189	297196	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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