MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 25903

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006086	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006086	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006086	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913347
4	NC_006086	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913347
5	NC_006086	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913347
6	NC_006086	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913347
7	NC_006086	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913347
8	NC_006086	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913347
9	NC_006086	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913347
10	NC_006086	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913347
11	NC_006086	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913347
12	NC_006086	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913347
13	NC_006086	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913347
14	NC_006086	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913347
15	NC_006086	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	50913347
16	NC_006086	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913347
17	NC_006086	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913347
18	NC_006086	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913347
19	NC_006086	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913347
20	NC_006086	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913347
21	NC_006086	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_006086	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006086	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006086	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006086	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913348
26	NC_006086	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913348
27	NC_006086	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913348
28	NC_006086	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913348
29	NC_006086	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913348
30	NC_006086	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913348
31	NC_006086	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913348
32	NC_006086	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913348
33	NC_006086	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913348
34	NC_006086	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913348
35	NC_006086	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913348
36	NC_006086	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913348
37	NC_006086	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913348
38	NC_006086	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913348
39	NC_006086	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913348
40	NC_006086	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913348
41	NC_006086	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913348
42	NC_006086	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006086	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006086	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913349
45	NC_006086	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006086	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006086	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_006086	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_006086	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006086	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913350
51	NC_006086	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913350
52	NC_006086	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913350
53	NC_006086	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913350
54	NC_006086	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913350
55	NC_006086	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913350
56	NC_006086	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913350
57	NC_006086	AGA	3	9	4193	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913350
58	NC_006086	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913350
59	NC_006086	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913350
60	NC_006086	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913350
61	NC_006086	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913350
62	NC_006086	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913350
63	NC_006086	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913350
64	NC_006086	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913350
65	NC_006086	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913350
66	NC_006086	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913350
67	NC_006086	GTT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913350
68	NC_006086	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913350
69	NC_006086	GAA	2	6	4593	4598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913351
70	NC_006086	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50913351
71	NC_006086	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913351
72	NC_006086	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913351
73	NC_006086	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913351
74	NC_006086	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913351
75	NC_006086	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913351
76	NC_006086	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913351
77	NC_006086	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913351
78	NC_006086	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913351
79	NC_006086	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913351
80	NC_006086	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913351
81	NC_006086	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913352
82	NC_006086	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913352
83	NC_006086	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
84	NC_006086	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
85	NC_006086	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
86	NC_006086	GAT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
87	NC_006086	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913352
88	NC_006086	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913352
89	NC_006086	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
90	NC_006086	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913352
91	NC_006086	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913352
92	NC_006086	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913352
93	NC_006086	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
94	NC_006086	AGA	2	6	6169	6174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913352
95	NC_006086	ACT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913352
96	NC_006086	CTT	2	6	6256	6261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913352
97	NC_006086	AAC	2	6	6394	6399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913352
98	NC_006086	TGA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
99	NC_006086	ACG	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913352
100	NC_006086	CTG	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913352
101	NC_006086	TAA	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913352
102	NC_006086	ATG	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
103	NC_006086	AGA	2	6	6922	6927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913352
104	NC_006086	TGA	2	6	6934	6939	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
105	NC_006086	AAG	2	6	6961	6966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913352
106	NC_006086	GAT	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
107	NC_006086	TGA	3	9	7018	7026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
108	NC_006086	AGA	2	6	7045	7050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913352
109	NC_006086	TAG	2	6	7116	7121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
110	NC_006086	CAG	2	6	7226	7231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913352
111	NC_006086	GTA	2	6	7299	7304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
112	NC_006086	ATT	2	6	7355	7360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913352
113	NC_006086	AAC	2	6	7431	7436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913352
114	NC_006086	AAT	2	6	7616	7621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913352
115	NC_006086	GGA	2	6	7664	7669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50913352
116	NC_006086	ATG	2	6	7824	7829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
117	NC_006086	ACA	2	6	7841	7846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913352
118	NC_006086	ATC	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913352
119	NC_006086	GAA	2	6	7950	7955	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913352
120	NC_006086	GAG	2	6	8097	8102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	50913352
121	NC_006086	GAT	2	6	8267	8272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913352
122	NC_006086	AAT	2	6	8471	8476	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913352
123	NC_006086	CTT	2	6	8502	8507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913352
124	NC_006086	ATT	2	6	8529	8534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913352
125	NC_006086	AGA	2	6	8638	8643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913352
126	NC_006086	ATA	2	6	8707	8712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913352
127	NC_006086	AAC	2	6	8719	8724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_006086	TGC	2	6	8798	8803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006086	TTA	2	6	8906	8911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913353
130	NC_006086	CGT	2	6	8914	8919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913353
131	NC_006086	AAG	2	6	8930	8935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913353
132	NC_006086	GAA	2	6	9133	9138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913353
133	NC_006086	AAT	2	6	9158	9163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913354
134	NC_006086	GAA	4	12	9200	9211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913354
135	NC_006086	ATG	2	6	9254	9259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913354
136	NC_006086	GGT	2	6	9328	9333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913354
137	NC_006086	GAT	2	6	9407	9412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913354
138	NC_006086	ATG	3	9	9499	9507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913354
139	NC_006086	AGA	2	6	9594	9599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913355
140	NC_006086	ATT	2	6	9645	9650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913356
141	NC_006086	CAG	2	6	9848	9853	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913356
142	NC_006086	TTA	2	6	9881	9886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913356
143	NC_006086	CTT	3	9	10076	10084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913356
144	NC_006086	TTA	2	6	10140	10145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913356
145	NC_006086	TGA	2	6	10152	10157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913356
146	NC_006086	AAG	2	6	10175	10180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913356
147	NC_006086	ATA	2	6	10238	10243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913356
148	NC_006086	ATT	2	6	10250	10255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913356
149	NC_006086	TGC	2	6	10320	10325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	50913356
150	NC_006086	CAC	2	6	10343	10348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	50913356
151	NC_006086	ATA	2	6	10481	10486	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913356
152	NC_006086	CAA	2	6	10525	10530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913356
153	NC_006086	TTA	2	6	10560	10565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913356
154	NC_006086	TCA	2	6	10572	10577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913356
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156	NC_006086	TTA	2	6	10645	10650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913356
157	NC_006086	ATG	2	6	10672	10677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913356
158	NC_006086	ATC	2	6	10688	10693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913356
159	NC_006086	ATT	2	6	10705	10710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913356
160	NC_006086	CAA	2	6	10738	10743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50913356
161	NC_006086	ATG	2	6	10920	10925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913356
162	NC_006086	TGG	2	6	11003	11008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	50913357
163	NC_006086	AGA	2	6	11117	11122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913357
164	NC_006086	AGC	2	6	11201	11206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913357
165	NC_006086	TAT	2	6	11237	11242	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913357
166	NC_006086	GAT	2	6	11286	11291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913357
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168	NC_006086	TTC	2	6	11447	11452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	50913357
169	NC_006086	ATT	2	6	11494	11499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913357
170	NC_006086	TAC	2	6	11606	11611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50913357
171	NC_006086	ATT	2	6	11671	11676	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913357
172	NC_006086	ATT	2	6	11723	11728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913357
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174	NC_006086	TAT	2	6	11778	11783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913357
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176	NC_006086	ATT	3	9	11890	11898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913357
177	NC_006086	ATT	2	6	12256	12261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50913358
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185	NC_006086	AAT	2	6	12790	12795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50913359
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189	NC_006086	CAG	3	9	13115	13123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	50913359
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249	NC_006086	AGA	2	6	17358	17363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50913361
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253	NC_006086	AGT	2	6	17616	17621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
254	NC_006086	TAA	2	6	17889	17894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_006086	AGT	2	6	17943	17948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50913362
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258	NC_006086	CGA	2	6	18406	18411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
259	NC_006086	GCA	2	6	18480	18485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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