MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 3062

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006086	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006086	AAG	2	6	187	192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006086	AAC	2	6	1605	1610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_006086	CTA	4	12	1666	1677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_006086	TTA	3	9	1679	1687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006086	TTA	2	6	1691	1696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006086	TTA	2	6	2882	2887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006086	ATA	2	6	2900	2905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006086	AGA	2	6	3223	3228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006086	AAT	2	6	3301	3306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006086	TCT	2	6	3373	3378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_006086	TCT	2	6	3395	3400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_006086	TAA	2	6	3412	3417	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006086	AAC	2	6	8719	8724	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_006086	TGC	2	6	8798	8803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_006086	TTA	2	6	14879	14884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006086	GAA	2	6	16058	16063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006086	AGA	2	6	16065	16070	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006086	ATA	2	6	17566	17571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006086	AGT	2	6	17616	17621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006086	TAA	2	6	17889	17894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_006086	GGC	2	6	18161	18166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_006086	CGA	2	6	18406	18411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_006086	GCA	2	6	18480	18485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_006086	CGC	2	6	18527	18532	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_006086	TGT	2	6	18566	18571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006086	AGA	2	6	18575	18580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006086	ATG	2	6	18581	18586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006086	CCA	2	6	18602	18607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_006086	CAG	2	6	18649	18654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_006086	GGA	2	6	18839	18844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006086	GAA	2	6	19103	19108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006086	GGT	2	6	19177	19182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006086	GTC	2	6	19191	19196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_006086	CAT	2	6	19259	19264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_006086	TAA	2	6	19294	19299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006086	GGA	2	6	19303	19308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006086	ATC	2	6	19327	19332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_006086	CGC	2	6	19493	19498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_006086	CAC	2	6	19538	19543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_006086	GAT	2	6	19609	19614	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006086	CCT	2	6	19665	19670	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_006086	AGG	2	6	19764	19769	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006086	CTA	2	6	19810	19815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_006086	ATT	2	6	20052	20057	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006086	TAA	2	6	20058	20063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006086	TAA	2	6	20089	20094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006086	GAA	2	6	20142	20147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006086	ACG	2	6	20159	20164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_006086	TAG	2	6	20330	20335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006086	AGG	2	6	20352	20357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006086	AGA	2	6	20418	20423	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006086	GGA	2	6	20534	20539	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006086	ACA	2	6	20652	20657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_006086	ATG	2	6	20719	20724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006086	TGT	2	6	20789	20794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006086	GGA	2	6	20852	20857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006086	ATC	2	6	21059	21064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_006086	ACC	2	6	21117	21122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_006086	AGC	2	6	21197	21202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_006086	AAG	2	6	21334	21339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006086	GAG	2	6	21349	21354	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006086	TAG	2	6	21662	21667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006086	GAT	2	6	21908	21913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006086	AGG	2	6	21953	21958	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006086	CGG	2	6	21999	22004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_006086	GTT	2	6	22259	22264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006086	TAC	2	6	22269	22274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_006086	CCT	2	6	22357	22362	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_006086	GGT	2	6	22493	22498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006086	TCG	2	6	22608	22613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_006086	CGT	2	6	22688	22693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_006086	CAG	2	6	23129	23134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_006086	AGT	2	6	23386	23391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006086	CGT	2	6	23726	23731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_006086	GAG	2	6	23740	23745	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006086	CTC	2	6	23905	23910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_006086	AGA	2	6	24002	24007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006086	GGC	2	6	24162	24167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_006086	CGA	2	6	24407	24412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_006086	GCA	2	6	24481	24486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_006086	CGC	2	6	24528	24533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
83	NC_006086	TGT	2	6	24567	24572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006086	AGA	2	6	24576	24581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006086	ATG	2	6	24582	24587	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006086	CCA	2	6	24603	24608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_006086	CAG	2	6	24650	24655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_006086	GGA	2	6	24840	24845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006086	GAA	2	6	25104	25109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006086	GGT	2	6	25178	25183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006086	GTC	2	6	25192	25197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_006086	CAT	2	6	25260	25265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_006086	TAA	2	6	25295	25300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006086	GGA	2	6	25304	25309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006086	ATC	2	6	25328	25333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_006086	CGC	2	6	25494	25499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_006086	CAC	2	6	25539	25544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_006086	GAT	2	6	25610	25615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006086	CCT	2	6	25666	25671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_006086	AGG	2	6	25765	25770	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006086	CTA	2	6	25811	25816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_006086	ATT	2	6	26053	26058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006086	TAA	2	6	26059	26064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_006086	TAA	2	6	26090	26095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006086	GAA	2	6	26143	26148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006086	ACG	2	6	26160	26165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_006086	TAG	2	6	26331	26336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_006086	AGG	2	6	26353	26358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006086	AGA	2	6	26419	26424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006086	GGA	2	6	26535	26540	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006086	ACA	2	6	26653	26658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_006086	ATG	2	6	26720	26725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006086	TGT	2	6	26790	26795	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006086	GGA	2	6	26853	26858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006086	ATC	2	6	27060	27065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_006086	ACC	2	6	27118	27123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_006086	AGC	2	6	27198	27203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_006086	AAG	2	6	27335	27340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006086	GAG	2	6	27350	27355	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006086	TAG	2	6	27663	27668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006086	GAT	2	6	27909	27914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_006086	AGG	2	6	27954	27959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006086	CGG	2	6	28000	28005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_006086	GTT	2	6	28260	28265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_006086	TAC	2	6	28270	28275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_006086	CCT	2	6	28358	28363	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_006086	GGT	2	6	28494	28499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006086	TCG	2	6	28609	28614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_006086	CGT	2	6	28689	28694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_006086	CAG	2	6	29130	29135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_006086	AGT	2	6	29387	29392	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006086	CGT	2	6	29727	29732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_006086	GAG	2	6	29741	29746	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_006086	CTC	2	6	29906	29911	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_006086	CGC	2	6	30072	30077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
136	NC_006086	TAT	2	6	30078	30083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006086	ATT	2	6	30188	30193	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006086	GGA	2	6	30196	30201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_006086	TCC	2	6	30279	30284	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_006086	TCG	2	6	30319	30324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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