MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes MGAS10394 chromosome

Total Repeats: 2023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006086	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	50913347
2	NC_006086	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	50913347
3	NC_006086	TC	3	6	1626	1631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_006086	TA	3	6	1652	1657	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006086	GA	3	6	2335	2340	50 %	0 %	50 %	0 %	50913348
6	NC_006086	GC	3	6	7009	7014	0 %	0 %	50 %	50 %	50913352
7	NC_006086	AC	3	6	10277	10282	50 %	0 %	0 %	50 %	50913356
8	NC_006086	AT	3	6	11782	11787	50 %	50 %	0 %	0 %	50913357
9	NC_006086	GA	3	6	12100	12105	50 %	0 %	50 %	0 %	50913357
10	NC_006086	TA	5	10	12816	12825	50 %	50 %	0 %	0 %	50913359
11	NC_006086	CA	3	6	12879	12884	50 %	0 %	0 %	50 %	50913359
12	NC_006086	TC	3	6	14459	14464	0 %	50 %	0 %	50 %	50913359
13	NC_006086	CT	3	6	15165	15170	0 %	50 %	0 %	50 %	50913360
14	NC_006086	TA	3	6	16968	16973	50 %	50 %	0 %	0 %	50913361
15	NC_006086	AT	3	6	17747	17752	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006086	AG	3	6	17902	17907	50 %	0 %	50 %	0 %	50913362
17	NC_006086	AC	3	6	17917	17922	50 %	0 %	0 %	50 %	50913362
18	NC_006086	AG	3	6	18129	18134	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006086	AG	3	6	18304	18309	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006086	AT	3	6	18833	18838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_006086	CT	3	6	18864	18869	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_006086	AC	3	6	19354	19359	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_006086	AC	3	6	19523	19528	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_006086	CA	3	6	19889	19894	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_006086	TA	3	6	19953	19958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006086	AG	3	6	20446	20451	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006086	CT	3	6	20560	20565	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_006086	TC	3	6	20938	20943	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_006086	TG	3	6	21328	21333	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006086	GA	3	6	21479	21484	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006086	TA	3	6	21533	21538	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006086	GA	3	6	21775	21780	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006086	CT	3	6	21890	21895	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_006086	GA	3	6	22097	22102	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006086	GA	3	6	22912	22917	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006086	AC	3	6	23205	23210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_006086	AG	3	6	24130	24135	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006086	AG	3	6	24305	24310	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006086	AT	3	6	24834	24839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006086	CT	3	6	24865	24870	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_006086	AC	3	6	25355	25360	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_006086	AC	3	6	25524	25529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_006086	CA	3	6	25890	25895	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_006086	TA	3	6	25954	25959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006086	AG	3	6	26447	26452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006086	CT	3	6	26561	26566	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_006086	TC	3	6	26939	26944	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_006086	TG	3	6	27329	27334	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006086	GA	3	6	27480	27485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006086	TA	3	6	27534	27539	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006086	GA	3	6	27776	27781	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006086	CT	3	6	27891	27896	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_006086	GA	3	6	28098	28103	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006086	GA	3	6	28913	28918	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006086	AC	3	6	29206	29211	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_006086	AT	4	8	30652	30659	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006086	AT	3	6	31962	31967	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006086	AG	3	6	33404	33409	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006086	TA	3	6	33447	33452	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006086	AT	3	6	33466	33471	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006086	CT	3	6	36122	36127	0 %	50 %	0 %	50 %	50913366
62	NC_006086	CT	4	8	36697	36704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_006086	TG	3	6	36755	36760	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006086	TA	4	8	37670	37677	50 %	50 %	0 %	0 %	50913368
65	NC_006086	CT	3	6	37818	37823	0 %	50 %	0 %	50 %	50913369
66	NC_006086	CT	3	6	38039	38044	0 %	50 %	0 %	50 %	50913369
67	NC_006086	AT	3	6	38175	38180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006086	AT	3	6	40378	40383	50 %	50 %	0 %	0 %	50913375
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70	NC_006086	AG	3	6	40801	40806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006086	AG	3	6	40837	40842	50 %	0 %	50 %	0 %	50913377
72	NC_006086	GA	4	8	41032	41039	50 %	0 %	50 %	0 %	50913377
73	NC_006086	CT	3	6	41106	41111	0 %	50 %	0 %	50 %	50913377
74	NC_006086	AG	3	6	43716	43721	50 %	0 %	50 %	0 %	50913380
75	NC_006086	TA	3	6	43892	43897	50 %	50 %	0 %	0 %	50913380
76	NC_006086	AG	3	6	43916	43921	50 %	0 %	50 %	0 %	50913380
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79	NC_006086	AG	3	6	46903	46908	50 %	0 %	50 %	0 %	50913381
80	NC_006086	AT	4	8	47468	47475	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006086	AT	3	6	47486	47491	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006086	TA	3	6	47500	47505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006086	AG	3	6	50102	50107	50 %	0 %	50 %	0 %	50913386
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99	NC_006086	CT	3	6	59633	59638	0 %	50 %	0 %	50 %	50913401
100	NC_006086	GA	4	8	60719	60726	50 %	0 %	50 %	0 %	50913402
101	NC_006086	CA	3	6	63108	63113	50 %	0 %	0 %	50 %	50913402
102	NC_006086	CT	3	6	64065	64070	0 %	50 %	0 %	50 %	50913402
103	NC_006086	AG	3	6	64183	64188	50 %	0 %	50 %	0 %	50913402
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108	NC_006086	CA	3	6	69565	69570	50 %	0 %	0 %	50 %	50913406
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110	NC_006086	CA	3	6	70493	70498	50 %	0 %	0 %	50 %	50913408
111	NC_006086	TC	3	6	70531	70536	0 %	50 %	0 %	50 %	50913408
112	NC_006086	CA	3	6	71574	71579	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_006086	AG	3	6	71762	71767	50 %	0 %	50 %	0 %	50913411
114	NC_006086	CT	3	6	72941	72946	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_006086	TA	3	6	73294	73299	50 %	50 %	0 %	0 %	50913412
116	NC_006086	AT	3	6	73478	73483	50 %	50 %	0 %	0 %	50913412
117	NC_006086	AT	3	6	74151	74156	50 %	50 %	0 %	0 %	50913413
118	NC_006086	CT	3	6	74584	74589	0 %	50 %	0 %	50 %	50913413
119	NC_006086	TA	3	6	74599	74604	50 %	50 %	0 %	0 %	50913413
120	NC_006086	GA	3	6	74777	74782	50 %	0 %	50 %	0 %	50913413
121	NC_006086	AT	3	6	75083	75088	50 %	50 %	0 %	0 %	50913414
122	NC_006086	GA	3	6	77311	77316	50 %	0 %	50 %	0 %	50913417
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129	NC_006086	TA	3	6	83110	83115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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131	NC_006086	TC	3	6	89152	89157	0 %	50 %	0 %	50 %	50913424
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133	NC_006086	TA	4	8	91596	91603	50 %	50 %	0 %	0 %	50913427
134	NC_006086	TA	3	6	91828	91833	50 %	50 %	0 %	0 %	50913427
135	NC_006086	AT	3	6	92273	92278	50 %	50 %	0 %	0 %	50913427
136	NC_006086	TA	3	6	92292	92297	50 %	50 %	0 %	0 %	50913427
137	NC_006086	AG	3	6	92509	92514	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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139	NC_006086	GA	3	6	94121	94126	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006086	TG	3	6	94198	94203	0 %	50 %	50 %	0 %	50913429
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142	NC_006086	AT	3	6	95348	95353	50 %	50 %	0 %	0 %	50913430
143	NC_006086	TA	3	6	95635	95640	50 %	50 %	0 %	0 %	50913430
144	NC_006086	TA	3	6	97156	97161	50 %	50 %	0 %	0 %	50913432
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146	NC_006086	TA	3	6	98156	98161	50 %	50 %	0 %	0 %	50913433
147	NC_006086	AT	3	6	99175	99180	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006086	TG	3	6	99865	99870	0 %	50 %	50 %	0 %	50913434
149	NC_006086	AC	3	6	101347	101352	50 %	0 %	0 %	50 %	50913434
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