MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mesoplasma florum L1 chromosome

Total Repeats: 589

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006055	AAAGAA	2	12	1273	1284	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50364816
2	NC_006055	TAATTC	2	12	3020	3031	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364818
3	NC_006055	TTTCTT	2	12	3163	3174	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50364818
4	NC_006055	GATGTT	2	12	3970	3981	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	50364819
5	NC_006055	TGAAAT	2	12	5760	5771	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364821
6	NC_006055	TTGAAG	2	12	6053	6064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50364821
7	NC_006055	AAATGC	2	12	6426	6437	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50364821
8	NC_006055	TAAAAA	2	12	10216	10227	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364823
9	NC_006055	TTCAGT	2	12	11429	11440	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50364823
10	NC_006055	AAGCTA	2	12	15443	15454	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50364826
11	NC_006055	CTAATT	2	12	19963	19974	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364829
12	NC_006055	ACACCA	2	12	21138	21149	50 %	0 %	0 %	50 %	50364830
13	NC_006055	TAACAC	2	12	21508	21519	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50364830
14	NC_006055	TTCAAT	2	12	21828	21839	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364831
15	NC_006055	AACTTT	2	12	22101	22112	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364831
16	NC_006055	GTTTTA	2	12	23344	23355	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50364831
17	NC_006055	TAATTT	2	12	24274	24285	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50364832
18	NC_006055	CATTAT	2	12	24354	24365	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364832
19	NC_006055	TAAAAA	2	12	25380	25391	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364833
20	NC_006055	CACAAA	2	12	25881	25892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	50364834
21	NC_006055	CAAACT	2	12	26698	26709	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50364834
22	NC_006055	AATAAA	2	12	27301	27312	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364834
23	NC_006055	TCTAAA	2	12	28832	28843	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50364835
24	NC_006055	AACTTC	2	12	31427	31438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50364837
25	NC_006055	ATGCAG	2	12	32411	32422	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50364838
26	NC_006055	CAACTT	2	12	33506	33517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50364838
27	NC_006055	GAGAAA	2	12	33601	33612	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50364838
28	NC_006055	CTACAC	2	12	33980	33991	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	50364838
29	NC_006055	GAAATA	2	12	35348	35359	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50364839
30	NC_006055	TTGAAA	2	12	35862	35873	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364839
31	NC_006055	ATACAA	2	12	36546	36557	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	50364839
32	NC_006055	GCTTTT	2	12	36966	36977	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	50364840
33	NC_006055	CAACTT	2	12	45448	45459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50364848
34	NC_006055	CAGTTG	2	12	46567	46578	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	50364848
35	NC_006055	TAAAAA	2	12	48676	48687	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364849
36	NC_006055	ATTACC	2	12	57921	57932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50364857
37	NC_006055	CCACAT	2	12	63299	63310	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	50364862
38	NC_006055	TGGAAC	2	12	66178	66189	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50364867
39	NC_006055	TATTGA	2	12	71337	71348	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50364872
40	NC_006055	AGTGGT	2	12	75609	75620	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	50364874
41	NC_006055	CTGAAA	2	12	76231	76242	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50364874
42	NC_006055	ACTCAT	2	12	76267	76278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	50364874
43	NC_006055	AACTCA	2	12	76871	76882	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50364874
44	NC_006055	ATTTAG	2	12	76957	76968	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50364874
45	NC_006055	AGTGGT	2	12	77445	77456	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	50364874
46	NC_006055	TTATTT	2	12	77572	77583	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	50364874
47	NC_006055	GAAAAA	2	12	78985	78996	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50364875
48	NC_006055	TTTAAA	2	12	79071	79082	50 %	50 %	0 %	0 %	50364875
49	NC_006055	AAATAG	2	12	80779	80790	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50364877
50	NC_006055	AGAAAA	2	12	82403	82414	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50364878
51	NC_006055	TTGAAA	2	12	83405	83416	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364879
52	NC_006055	CATTAT	2	12	84972	84983	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364880
53	NC_006055	AAATTA	2	12	85099	85110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50364880
54	NC_006055	TCAAAC	2	12	85348	85359	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50364881
55	NC_006055	ATGAAA	2	12	86150	86161	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50364882
56	NC_006055	TTCAAA	2	12	86597	86608	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50364883
57	NC_006055	AAAATA	2	12	89992	90003	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364884
58	NC_006055	ATTTTG	2	12	90511	90522	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50364885
59	NC_006055	AAAGCA	3	18	91095	91112	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50364885
60	NC_006055	GTTGCT	2	12	91792	91803	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	50364886
61	NC_006055	AAAGCA	3	18	92536	92553	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50364886
62	NC_006055	AATATT	2	12	93214	93225	50 %	50 %	0 %	0 %	50364887
63	NC_006055	AAGGTA	2	12	95479	95490	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	50364889
64	NC_006055	ACAGGT	2	12	96180	96191	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50364889
65	NC_006055	TAGAAA	2	12	96915	96926	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50364890
66	NC_006055	ATCAAC	2	12	98252	98263	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50364891
67	NC_006055	GAATTG	2	12	99518	99529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50364892
68	NC_006055	AAAAAT	2	12	100467	100478	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364893
69	NC_006055	TAAAAA	2	12	101747	101758	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364894
70	NC_006055	TAAAAA	2	12	101939	101950	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364894
71	NC_006055	GTTGAA	2	12	103477	103488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	50364895
72	NC_006055	TTTCAG	2	12	103999	104010	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50364896
73	NC_006055	AATTCA	2	12	106982	106993	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50364900
74	NC_006055	ATTTAG	2	12	107727	107738	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50364900
75	NC_006055	TTCAGT	2	12	108241	108252	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50364901
76	NC_006055	TTGGTT	2	12	108447	108458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50364901
77	NC_006055	CATTTA	2	12	108477	108488	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364901
78	NC_006055	TAAAAT	2	12	112681	112692	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50364907
79	NC_006055	AAAGTT	2	12	112769	112780	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364907
80	NC_006055	ATTTCA	2	12	113654	113665	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364907
81	NC_006055	TTTCTA	2	12	114297	114308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50364908
82	NC_006055	TTAGAT	2	12	114788	114799	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50364909
83	NC_006055	AGCGAA	2	12	116183	116194	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	50364910
84	NC_006055	GAACAA	2	12	116436	116447	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50364910
85	NC_006055	TATTGC	2	12	118089	118100	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	50364911
86	NC_006055	CAAATG	2	12	119705	119716	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50364912
87	NC_006055	TCAACG	2	12	119995	120006	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50364912
88	NC_006055	GCTGAT	2	12	120230	120241	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	50364912
89	NC_006055	AGAAAA	2	12	120318	120329	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50364912
90	NC_006055	TTTATG	2	12	123419	123430	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50364913
91	NC_006055	TGATGT	2	12	128200	128211	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	50364916
92	NC_006055	AATGAA	2	12	128549	128560	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50364916
93	NC_006055	TAATGA	2	12	130549	130560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364918
94	NC_006055	CTTTTT	2	12	133914	133925	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50364923
95	NC_006055	AATTAG	2	12	137571	137582	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364928
96	NC_006055	TAAAAA	2	12	140280	140291	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	50364930
97	NC_006055	TTTTCA	2	12	142972	142983	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50364934
98	NC_006055	AGTTAA	2	12	143397	143408	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364934
99	NC_006055	AAATCC	2	12	145158	145169	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50364935
100	NC_006055	TAAAGT	2	12	145971	145982	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364935
101	NC_006055	AATTAA	2	12	146000	146011	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50364935
102	NC_006055	AAAAGG	2	12	147625	147636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50364938
103	NC_006055	AGCATT	2	12	148336	148347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50364939
104	NC_006055	AAAATT	2	12	150658	150669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50364944
105	NC_006055	GATGCA	2	12	150835	150846	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	50364944
106	NC_006055	CAAAAA	2	12	152261	152272	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	50364947
107	NC_006055	TAAAGG	2	12	154717	154728	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	50364953
108	NC_006055	CAATTT	2	12	158109	158120	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50364958
109	NC_006055	ATAATC	2	12	158437	158448	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50364959
110	NC_006055	AAAGTT	2	12	158709	158720	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50364959
111	NC_006055	GTTTTG	2	12	159328	159339	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	50364960
112	NC_006055	AGGTCC	2	12	160755	160766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	50364964
113	NC_006055	ATTTAG	2	12	161328	161339	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50364965
114	NC_006055	TTTAAA	2	12	162459	162470	50 %	50 %	0 %	0 %	50364967
115	NC_006055	AGTTAT	2	12	163370	163381	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	50364967
116	NC_006055	AAAGAA	2	12	163428	163439	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	50364967
117	NC_006055	TCATTT	2	12	163625	163636	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50364968
118	NC_006055	AATTTA	2	12	165358	165369	50 %	50 %	0 %	0 %	50364969
119	NC_006055	TTTGAT	2	12	167876	167887	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50364971
120	NC_006055	TAAATT	2	12	168973	168984	50 %	50 %	0 %	0 %	50364971
121	NC_006055	GATAAA	2	12	169103	169114	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	50364971
122	NC_006055	TATAAA	2	12	171136	171147	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50364972
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358	NC_006055	ACATCA	2	12	461847	461858	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50365219
359	NC_006055	TTATTT	2	12	464178	464189	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	50365219
360	NC_006055	ATCTTT	2	12	464705	464716	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50365219
361	NC_006055	TAATAT	2	12	471593	471604	50 %	50 %	0 %	0 %	50365221
362	NC_006055	CAAAAG	2	12	471635	471646	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	50365221
363	NC_006055	GTTTTA	2	12	473455	473466	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50365222
364	NC_006055	ACCTTG	2	12	475873	475884	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50365223
365	NC_006055	CAGCTT	2	12	476411	476422	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	50365225
366	NC_006055	CTTCAT	2	12	477739	477750	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	50365227
367	NC_006055	AGCATC	2	12	480300	480311	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50365228
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369	NC_006055	TTCTTT	2	12	481067	481078	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50365229
370	NC_006055	CCAATA	3	18	483388	483405	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	50365231
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377	NC_006055	AATTAA	2	12	494806	494817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	50365240
378	NC_006055	CAGCTA	2	12	496252	496263	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	50365241
379	NC_006055	TCAATT	2	12	496911	496922	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50365241
380	NC_006055	TTACAA	2	12	497507	497518	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50365242
381	NC_006055	AAGGAA	2	12	498294	498305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	50365243
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383	NC_006055	TTCATT	2	12	500155	500166	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	50365244
384	NC_006055	TCAATA	2	12	505164	505175	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50365247
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388	NC_006055	TTTAAA	2	12	509074	509085	50 %	50 %	0 %	0 %	50365249
389	NC_006055	ATCAAG	2	12	509998	510009	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50365249
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468	NC_006055	GCAATT	2	12	629879	629890	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	50365350
469	NC_006055	ATGCAA	2	12	631243	631254	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50365351
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471	NC_006055	TTGTAT	2	12	635814	635825	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50365357
472	NC_006055	TTCTTT	2	12	638270	638281	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50365360
473	NC_006055	CTTTAC	2	12	641563	641574	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	50365365
474	NC_006055	TTCTAA	2	12	642358	642369	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	50365366
475	NC_006055	ATTTTG	2	12	643617	643628	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	50365368
476	NC_006055	AATATC	2	12	644119	644130	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50365368
477	NC_006055	AAAGTT	2	12	644553	644564	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	50365369
478	NC_006055	CCAATC	2	12	646481	646492	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	50365371
479	NC_006055	CTAAAT	3	18	646805	646822	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50365371
480	NC_006055	TTCTTT	2	12	648138	648149	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	50365372
481	NC_006055	ATTTAA	2	12	648402	648413	50 %	50 %	0 %	0 %	50365372
482	NC_006055	GGAGTT	2	12	648523	648534	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	50365372
483	NC_006055	ATATCA	2	12	649200	649211	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	50365373
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487	NC_006055	AATTTT	2	12	660111	660122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50365384
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498	NC_006055	TTTAAA	2	12	671287	671298	50 %	50 %	0 %	0 %	50365393
499	NC_006055	TTAATT	2	12	671527	671538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	50365393
500	NC_006055	GCAGCT	2	12	671711	671722	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	50365394

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