MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesoplasma florum L1 chromosome

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006055	TTTTA	2	10	1510	1519	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006055	TATTT	2	10	13861	13870	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006055	AATTA	2	10	14703	14712	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006055	TTAAA	2	10	14780	14789	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006055	ATTTT	2	10	40104	40113	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_006055	ATTTT	2	10	49498	49507	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006055	AACAA	2	10	62611	62620	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
8	NC_006055	TTAAT	2	10	64437	64446	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006055	ATTAA	2	10	68161	68170	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_006055	AGTCT	2	10	102397	102406	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_006055	ATCTA	2	10	112320	112329	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_006055	ATATT	2	10	112350	112359	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006055	ATTAT	2	10	124539	124548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006055	GAAAG	2	10	127464	127473	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006055	ATTTT	2	10	129792	129801	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006055	AATAG	2	10	144304	144313	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006055	AATAT	2	10	146820	146829	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006055	ATATA	2	10	157765	157774	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006055	AAAAC	2	10	191586	191595	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
20	NC_006055	ATCTA	2	10	191960	191969	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
21	NC_006055	AAAAC	2	10	193387	193396	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_006055	GAAAA	2	10	193798	193807	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006055	AAATA	2	10	205951	205960	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006055	AAGTG	2	10	217662	217671	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006055	ATTAA	2	10	221237	221246	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006055	ATAAA	2	10	229181	229190	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006055	AAAAT	2	10	240036	240045	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006055	TAAAA	2	10	241167	241176	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006055	ACCAC	2	10	242762	242771	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
30	NC_006055	CTTTT	2	10	250953	250962	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_006055	TTTTA	2	10	251961	251970	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006055	ATTAT	2	10	279943	279952	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006055	GTAAA	2	10	282835	282844	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
34	NC_006055	AAATT	2	10	287342	287351	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006055	AAAGG	2	10	288917	288926	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006055	AGGAA	2	10	291442	291451	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006055	AATCA	2	10	314122	314131	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_006055	TTTTA	2	10	315708	315717	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006055	TATAA	2	10	326298	326307	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006055	TTATA	2	10	326708	326717	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006055	TATAA	2	10	336325	336334	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006055	TTAAA	2	10	342827	342836	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006055	TTAAA	2	10	348665	348674	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_006055	TAATA	2	10	375786	375795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006055	TTAAA	2	10	384789	384798	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006055	TAAAG	2	10	384813	384822	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006055	AATAA	2	10	384940	384949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006055	AATAA	2	10	386100	386109	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006055	AAATT	2	10	386110	386119	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006055	AATTT	2	10	391648	391657	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_006055	TATTT	2	10	396558	396567	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006055	TAAAA	2	10	404776	404785	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006055	CTATT	2	10	405098	405107	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_006055	TATAA	2	10	420889	420898	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_006055	ATTTT	2	10	422679	422688	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_006055	TATAT	2	10	435651	435660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_006055	TTGTT	2	10	439961	439970	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006055	CCGAA	2	10	441764	441773	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
59	NC_006055	TTTTA	2	10	443971	443980	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006055	TTTTC	2	10	450374	450383	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_006055	TCGGT	2	10	467415	467424	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
62	NC_006055	TTTTC	2	10	467968	467977	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
63	NC_006055	TGTTT	2	10	468378	468387	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
64	NC_006055	TAGAT	2	10	469806	469815	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006055	TAATT	2	10	482395	482404	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006055	TTTTA	2	10	484191	484200	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006055	TTTAA	3	15	507534	507548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006055	AACAA	2	10	507595	507604	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
69	NC_006055	TAAAA	2	10	510643	510652	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006055	AAAAT	2	10	517719	517728	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006055	AATAA	2	10	517741	517750	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006055	ATATT	2	10	523255	523264	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006055	AAAAT	2	10	523346	523355	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006055	TAAAT	2	10	523623	523632	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006055	GTTTT	2	10	528516	528525	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_006055	TATTT	2	10	528556	528565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006055	ATTTT	2	10	529140	529149	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006055	GCAAA	2	10	529550	529559	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_006055	ATTAA	2	10	529906	529915	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006055	ACAAA	2	10	530734	530743	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
81	NC_006055	ATAAA	2	10	533133	533142	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006055	ATTTA	2	10	533169	533178	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006055	ATTTG	2	10	548637	548646	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006055	TATAT	2	10	553321	553330	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006055	TTTTA	2	10	586479	586488	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_006055	TTAAA	2	10	610477	610486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006055	ATTAT	2	10	611027	611036	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006055	ATTTT	2	10	625657	625666	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006055	ATAAA	2	10	638371	638380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006055	TTTAT	2	10	662321	662330	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006055	ATTTT	2	10	691684	691693	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006055	ATTTT	2	10	705446	705455	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006055	AAAAC	2	10	706426	706435	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
94	NC_006055	CTTTT	2	10	712178	712187	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
95	NC_006055	ATTTT	2	10	713603	713612	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006055	GGAAA	2	10	719045	719054	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
97	NC_006055	CTTTT	2	10	727864	727873	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_006055	TAAAA	2	10	735296	735305	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_006055	AAAAT	2	10	752291	752300	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006055	TAAAA	2	10	789684	789693	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006055	TATAA	2	10	792966	792975	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.