MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mesoplasma florum L1 chromosome

Total Repeats: 253

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_006055	TTTA	2	8	1404	1411	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_006055	ATTA	2	8	3704	3711	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_006055	TTAA	2	8	5244	5251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_006055	AGAA	2	8	5277	5284	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_006055	TTTC	2	8	14665	14672	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_006055	GATA	2	8	16253	16260	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_006055	AAAG	2	8	27746	27753	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_006055	ATTT	2	8	29911	29918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_006055	TTTC	2	8	30052	30059	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_006055	GAAA	2	8	30073	30080	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
11	NC_006055	TTTA	2	8	30084	30091	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_006055	AAAG	2	8	30108	30115	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_006055	AAAT	2	8	32039	32046	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_006055	ATAA	2	8	40120	40127	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_006055	GTTT	2	8	42968	42975	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_006055	ATTT	2	8	43791	43798	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_006055	AATA	2	8	51265	51272	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_006055	TAAT	2	8	61097	61104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_006055	AATA	2	8	61105	61112	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_006055	CACT	2	8	64314	64321	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_006055	CTTT	2	8	64353	64360	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_006055	AAAT	2	8	67955	67962	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_006055	ATTT	2	8	68871	68878	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_006055	TTAA	2	8	86108	86115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_006055	GGAA	2	8	86131	86138	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_006055	TTAA	2	8	95246	95253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_006055	TAAA	2	8	95323	95330	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_006055	TAAA	2	8	95332	95339	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_006055	TAAA	2	8	100635	100642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_006055	GAAA	2	8	100690	100697	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_006055	TATT	2	8	102161	102168	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_006055	GAAA	2	8	102378	102385	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_006055	ATCA	2	8	104524	104531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
34	NC_006055	ATAA	2	8	114716	114723	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_006055	AGAA	2	8	135303	135310	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_006055	TAAA	2	8	140665	140672	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_006055	TATT	2	8	141136	141143	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_006055	AATT	2	8	141145	141152	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_006055	ATGA	2	8	146883	146890	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_006055	AAAT	2	8	160071	160078	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_006055	TTTA	2	8	160079	160086	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_006055	ATTT	2	8	166377	166384	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_006055	AGCG	2	8	186722	186729	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_006055	TTAA	2	8	187259	187266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_006055	TTTA	2	8	190882	190889	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_006055	TTAT	2	8	191357	191364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_006055	ATTA	2	8	191372	191379	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_006055	ATTA	2	8	191709	191716	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_006055	GTGA	2	8	192248	192255	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_006055	AACG	2	8	192935	192942	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_006055	GTTA	2	8	192954	192961	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_006055	AAGG	2	8	193285	193292	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_006055	GGAT	2	8	193358	193365	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_006055	GCGA	2	8	193832	193839	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_006055	CGTT	2	8	194361	194368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_006055	TCAT	2	8	194904	194911	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_006055	TAGT	2	8	195025	195032	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_006055	GATG	2	8	195068	195075	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_006055	AGGG	2	8	195358	195365	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_006055	GGAT	2	8	196430	196437	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_006055	TTTA	2	8	198370	198377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_006055	TTTA	2	8	199429	199436	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_006055	CAAT	2	8	200959	200966	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
64	NC_006055	ATAA	2	8	205792	205799	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_006055	ATTA	2	8	205859	205866	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_006055	TAAT	2	8	208422	208429	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_006055	TAAA	2	8	212313	212320	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_006055	TTAT	2	8	212325	212332	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_006055	TAAT	2	8	212385	212392	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_006055	AGAA	2	8	212416	212423	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_006055	AATT	2	8	216958	216965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_006055	ATTT	2	8	217604	217611	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_006055	TTTA	2	8	217734	217741	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_006055	ATAA	2	8	228076	228083	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_006055	TAAC	2	8	229740	229747	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_006055	TAAG	2	8	229832	229839	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_006055	AATG	2	8	229876	229883	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_006055	TAGA	2	8	229905	229912	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_006055	GTAA	2	8	230484	230491	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_006055	TTTA	2	8	241082	241089	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_006055	AATA	2	8	241188	241195	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_006055	TAAA	2	8	242496	242503	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_006055	TTTG	2	8	242723	242730	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_006055	TATT	2	8	250963	250970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_006055	AAAC	2	8	250991	250998	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_006055	GAAG	2	8	252656	252663	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_006055	AGGT	2	8	254362	254369	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_006055	AAAG	2	8	256134	256141	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_006055	TAAA	2	8	259261	259268	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_006055	AAAT	2	8	282199	282206	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_006055	ATAA	2	8	282756	282763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_006055	ATTT	2	8	285960	285967	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_006055	TTAA	2	8	324855	324862	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_006055	AAAG	2	8	327660	327667	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
95	NC_006055	AAAT	2	8	342816	342823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_006055	CTTA	2	8	342856	342863	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_006055	AATT	2	8	342886	342893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_006055	CTTT	2	8	361564	361571	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_006055	TAAA	2	8	375777	375784	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_006055	ATTT	2	8	377255	377262	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_006055	AAGT	2	8	384639	384646	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_006055	ATTT	2	8	384738	384745	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_006055	TCAA	2	8	384748	384755	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_006055	TAAT	2	8	385881	385888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_006055	ATGA	2	8	386007	386014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_006055	TAAA	2	8	386036	386043	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_006055	TCTT	2	8	386078	386085	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_006055	ATTA	2	8	389898	389905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_006055	ATTT	2	8	391702	391709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_006055	TATT	2	8	404620	404627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_006055	TTAT	2	8	409415	409422	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_006055	TTTA	2	8	412725	412732	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_006055	AATG	2	8	423901	423908	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_006055	AAAT	2	8	431729	431736	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_006055	TAAA	2	8	439988	439995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_006055	TAAA	2	8	441440	441447	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_006055	GTTG	2	8	441656	441663	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_006055	GGGA	2	8	441747	441754	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
119	NC_006055	TAAA	2	8	441967	441974	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_006055	TAAT	2	8	450298	450305	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_006055	ACCA	2	8	450428	450435	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_006055	TATT	2	8	455918	455925	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_006055	CATC	2	8	465337	465344	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_006055	CCCT	2	8	466410	466417	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
125	NC_006055	CATC	2	8	466700	466707	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_006055	ACTA	2	8	466743	466750	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_006055	ATGA	2	8	466864	466871	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_006055	CTGT	2	8	467103	467110	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_006055	AACG	2	8	467407	467414	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_006055	TCGC	2	8	467936	467943	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_006055	ATTT	2	8	468258	468265	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_006055	ATCC	2	8	468410	468417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_006055	CCTT	2	8	468483	468490	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_006055	TAAC	2	8	468814	468821	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_006055	CGTT	2	8	468833	468840	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_006055	GTTT	2	8	474616	474623	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_006055	ATTT	2	8	482418	482425	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_006055	TTCT	2	8	483968	483975	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_006055	AGTT	2	8	484201	484208	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_006055	ATTT	2	8	487168	487175	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_006055	TAGA	2	8	497303	497310	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_006055	TAAA	2	8	497335	497342	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_006055	CTTT	2	8	502785	502792	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_006055	GTTT	2	8	510663	510670	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_006055	ATTT	2	8	512012	512019	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_006055	TATT	2	8	513563	513570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_006055	ATTA	2	8	517188	517195	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_006055	TTAT	2	8	517751	517758	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_006055	TAAT	2	8	517767	517774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_006055	TAAA	2	8	517816	517823	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.