MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Acinetobacter sp. ADP1 chromosome

Total Repeats: 173

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005966	AATTTA	2	12	48	59	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005966	AAAATG	2	12	15806	15817	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005966	CAAACA	2	12	20368	20379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005966	TGAATG	2	12	20388	20399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005966	TGATGG	2	12	22239	22250	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005966	TCTTTA	2	12	33610	33621	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_005966	TAAAAT	2	12	57148	57159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005966	TAAATT	2	12	105629	105640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005966	GCAAAA	2	12	111131	111142	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_005966	TTTTAT	2	12	133646	133657	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005966	AAAAAG	2	12	145302	145313	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005966	GTTTTT	2	12	147891	147902	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005966	ATTGAC	2	12	179020	179031	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_005966	GATTTT	2	12	186344	186355	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005966	AATATA	2	12	188321	188332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005966	AAAATA	2	12	191227	191238	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005966	TAAAAA	2	12	193188	193199	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005966	TTTTAT	2	12	197917	197928	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005966	ATAAAT	2	12	203910	203921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005966	CAAACA	2	12	215153	215164	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_005966	TGAATG	2	12	215173	215184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005966	TGATGG	2	12	217024	217035	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005966	TAAAAA	2	12	241124	241135	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005966	CAAATT	2	12	280848	280859	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_005966	ATAAGA	2	12	324080	324091	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005966	AAATAT	2	12	386442	386453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005966	TAAAAT	2	12	399940	399951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005966	CAACAT	2	12	413317	413328	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_005966	ATCGAT	2	12	415139	415150	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_005966	TCACTG	2	12	439667	439678	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_005966	CTGAGT	2	12	537082	537093	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_005966	TGATGG	2	12	649951	649962	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005966	AAATAA	2	12	660296	660307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005966	ATAAGT	2	12	699955	699966	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005966	TAAAAA	2	12	730070	730081	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005966	AGTTTG	2	12	775030	775041	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005966	ATTTTA	2	12	840027	840038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005966	TGAATC	2	12	897219	897230	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_005966	AATAAA	2	12	908040	908051	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005966	GAAAAT	2	12	941187	941198	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005966	TAAAAA	2	12	942605	942616	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005966	TCACTT	2	12	947623	947634	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_005966	AAATGG	2	12	963104	963115	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005966	AGGTCG	2	12	996657	996668	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_005966	AAAATA	2	12	996757	996768	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005966	TTTTAA	2	12	1007789	1007800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005966	TTTAAA	2	12	1018906	1018917	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005966	TTTAAT	2	12	1043576	1043587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005966	ATTTTT	2	12	1047607	1047618	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005966	GTTTTT	2	12	1072477	1072488	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005966	TTAATT	2	12	1099966	1099977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005966	TTTAAT	2	12	1109064	1109075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005966	AAAGAA	2	12	1140155	1140166	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005966	TTTTAA	2	12	1161765	1161776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005966	ATTAAT	2	12	1161903	1161914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005966	ATTTTT	2	12	1180433	1180444	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005966	AATTTA	2	12	1211763	1211774	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005966	AAAGAT	2	12	1228861	1228872	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005966	CAAATA	2	12	1237684	1237695	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_005966	AATGAA	2	12	1242989	1243000	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005966	CTTTTT	2	12	1245200	1245211	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_005966	CTTTTT	2	12	1261961	1261972	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_005966	ATAATT	2	12	1261989	1262000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005966	TAAATG	2	12	1267599	1267610	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005966	AATCTC	2	12	1293720	1293731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_005966	TTTTTA	2	12	1325877	1325888	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005966	TTCACA	2	12	1332013	1332024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_005966	CTTTGA	2	12	1403572	1403583	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_005966	TGATTG	2	12	1462971	1462982	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005966	TTAACT	2	12	1477445	1477456	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_005966	TTAAAT	2	12	1498446	1498457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005966	TTGAAT	2	12	1509215	1509226	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005966	TAAAAA	2	12	1509229	1509240	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005966	TTTAAA	2	12	1514309	1514320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005966	ATCTTC	2	12	1531095	1531106	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_005966	TTTATC	2	12	1578395	1578406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_005966	AAATAT	2	12	1578417	1578428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005966	ATAAAT	2	12	1596300	1596311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005966	ATGTGC	2	12	1620434	1620445	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_005966	TTTTTA	2	12	1634378	1634389	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005966	TTACAT	2	12	1638069	1638080	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_005966	TGATAA	2	12	1639540	1639551	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005966	CAAACA	2	12	1662652	1662663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005966	TGAATG	2	12	1662672	1662683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005966	TGATGG	2	12	1664523	1664534	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005966	TAAATA	2	12	1705389	1705400	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005966	AATAAA	2	12	1777384	1777395	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005966	ATATTT	2	12	1779028	1779039	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005966	AGGCAC	2	12	1840732	1840743	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_005966	TCATTA	2	12	1855734	1855745	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_005966	ATTTTT	2	12	1868790	1868801	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005966	AATTCA	2	12	1868805	1868816	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_005966	AAAGTA	2	12	1871522	1871533	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005966	TATTGA	2	12	1936927	1936938	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005966	GTAAAT	2	12	1937749	1937760	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005966	TATAAA	2	12	1942143	1942154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005966	CCAAAT	2	12	1957561	1957572	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_005966	TATAAA	2	12	1957733	1957744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005966	GTCGAT	2	12	1957786	1957797	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_005966	TATTTT	2	12	2012188	2012199	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005966	TAAAGT	2	12	2013549	2013560	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005966	TACTCA	2	12	2026253	2026264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_005966	GATAAA	2	12	2034222	2034233	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005966	TGATTG	2	12	2066606	2066617	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005966	AAACCA	2	12	2069225	2069236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_005966	CTATGA	2	12	2078712	2078723	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_005966	ATAAAA	2	12	2081743	2081754	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005966	ATTAAA	2	12	2097894	2097905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005966	CAAATG	2	12	2115253	2115264	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_005966	TATTTT	2	12	2235000	2235011	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005966	AATTTT	2	12	2250261	2250272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005966	TATTTT	2	12	2261398	2261409	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005966	TCAATA	2	12	2297954	2297965	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_005966	TATAAA	2	12	2303079	2303090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005966	CTTCCA	2	12	2401161	2401172	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_005966	GAAAAT	2	12	2449460	2449471	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005966	AATCAT	2	12	2452648	2452659	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_005966	ATTTTT	2	12	2459938	2459949	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005966	AAAATA	2	12	2460029	2460040	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005966	TAAAAA	2	12	2466899	2466910	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005966	TAAATA	2	12	2482613	2482624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005966	AAAATA	2	12	2482766	2482777	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005966	ATAATC	2	12	2568209	2568220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
124	NC_005966	TATTGA	2	12	2613329	2613340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005966	AAATTT	2	12	2622918	2622929	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005966	TTTAAA	2	12	2641797	2641808	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005966	ACTTAT	2	12	2661982	2661993	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_005966	CATGAC	2	12	2682835	2682846	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_005966	AAACTT	2	12	2689800	2689811	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
130	NC_005966	ACAGGA	2	12	2690571	2690582	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_005966	ACAGGA	2	12	2691136	2691147	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_005966	ACAGGA	2	12	2692034	2692045	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.