MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Acinetobacter sp. ADP1 chromosome

Total Repeats: 2235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_005966	TTGCC	2	10	3221409	3221418	0 %	40 %	20 %	40 %	50086301
2002	NC_005966	CATTT	2	10	3221834	3221843	20 %	60 %	0 %	20 %	50086301
2003	NC_005966	ATTGG	2	10	3223683	3223692	20 %	40 %	40 %	0 %	50086301
2004	NC_005966	TTGAT	2	10	3223871	3223880	20 %	60 %	20 %	0 %	50086301
2005	NC_005966	TACCT	2	10	3225045	3225054	20 %	40 %	0 %	40 %	50086302
2006	NC_005966	CCCAT	2	10	3225400	3225409	20 %	20 %	0 %	60 %	50086303
2007	NC_005966	CTCTA	2	10	3226987	3226996	20 %	40 %	0 %	40 %	50086305
2008	NC_005966	AATCG	2	10	3228196	3228205	40 %	20 %	20 %	20 %	50086306
2009	NC_005966	TTTCA	2	10	3229494	3229503	20 %	60 %	0 %	20 %	50086308
2010	NC_005966	AAACC	2	10	3230468	3230477	60 %	0 %	0 %	40 %	50086309
2011	NC_005966	ACTGA	2	10	3230815	3230824	40 %	20 %	20 %	20 %	50086309
2012	NC_005966	CTATA	2	10	3234416	3234425	40 %	40 %	0 %	20 %	50086314
2013	NC_005966	AATGA	2	10	3234964	3234973	60 %	20 %	20 %	0 %	50086314
2014	NC_005966	GAATA	2	10	3237944	3237953	60 %	20 %	20 %	0 %	50086316
2015	NC_005966	ATTTG	2	10	3239251	3239260	20 %	60 %	20 %	0 %	50086318
2016	NC_005966	CACAA	2	10	3239712	3239721	60 %	0 %	0 %	40 %	50086318
2017	NC_005966	TTAAA	2	10	3240047	3240056	60 %	40 %	0 %	0 %	50086318
2018	NC_005966	CATTA	2	10	3240198	3240207	40 %	40 %	0 %	20 %	50086318
2019	NC_005966	GAAAT	2	10	3240416	3240425	60 %	20 %	20 %	0 %	50086318
2020	NC_005966	GAAAA	2	10	3240541	3240550	80 %	0 %	20 %	0 %	50086318
2021	NC_005966	TTTAT	2	10	3244110	3244119	20 %	80 %	0 %	0 %	50086321
2022	NC_005966	CTGAT	2	10	3245906	3245915	20 %	40 %	20 %	20 %	50086322
2023	NC_005966	ACTGC	2	10	3246166	3246175	20 %	20 %	20 %	40 %	50086322
2024	NC_005966	AAAGA	2	10	3246214	3246223	80 %	0 %	20 %	0 %	50086322
2025	NC_005966	CTGTT	2	10	3246656	3246665	0 %	60 %	20 %	20 %	50086322
2026	NC_005966	AGACC	2	10	3247356	3247365	40 %	0 %	20 %	40 %	50086323
2027	NC_005966	TGATC	2	10	3250958	3250967	20 %	40 %	20 %	20 %	50086326
2028	NC_005966	CATAG	2	10	3252337	3252346	40 %	20 %	20 %	20 %	50086328
2029	NC_005966	TGACA	2	10	3253051	3253060	40 %	20 %	20 %	20 %	50086328
2030	NC_005966	AGTCA	2	10	3255056	3255065	40 %	20 %	20 %	20 %	50086330
2031	NC_005966	GAATT	2	10	3256774	3256783	40 %	40 %	20 %	0 %	50086330
2032	NC_005966	TTCTG	2	10	3259835	3259844	0 %	60 %	20 %	20 %	50086331
2033	NC_005966	ACAGT	2	10	3261446	3261455	40 %	20 %	20 %	20 %	50086332
2034	NC_005966	GAAAA	2	10	3266647	3266656	80 %	0 %	20 %	0 %	50086338
2035	NC_005966	CTTAA	2	10	3271100	3271109	40 %	40 %	0 %	20 %	50086341
2036	NC_005966	ATTGG	2	10	3271749	3271758	20 %	40 %	40 %	0 %	50086341
2037	NC_005966	GCCCA	2	10	3271884	3271893	20 %	0 %	20 %	60 %	50086341
2038	NC_005966	GGACT	2	10	3273691	3273700	20 %	20 %	40 %	20 %	50086343
2039	NC_005966	GGCTG	2	10	3274376	3274385	0 %	20 %	60 %	20 %	50086343
2040	NC_005966	ACTCA	2	10	3277179	3277188	40 %	20 %	0 %	40 %	50086345
2041	NC_005966	GACCA	2	10	3283967	3283976	40 %	0 %	20 %	40 %	50086352
2042	NC_005966	ATTTT	2	10	3287249	3287258	20 %	80 %	0 %	0 %	50086353
2043	NC_005966	AAGTG	2	10	3292011	3292020	40 %	20 %	40 %	0 %	50086357
2044	NC_005966	GGCAT	2	10	3292417	3292426	20 %	20 %	40 %	20 %	50086357
2045	NC_005966	GCCCG	2	10	3293427	3293436	0 %	0 %	40 %	60 %	50086357
2046	NC_005966	GCCGT	2	10	3295787	3295796	0 %	20 %	40 %	40 %	50086359
2047	NC_005966	TGCTT	2	10	3296577	3296586	0 %	60 %	20 %	20 %	50086360
2048	NC_005966	CCAGA	2	10	3298150	3298159	40 %	0 %	20 %	40 %	50086360
2049	NC_005966	GCCAA	2	10	3302302	3302311	40 %	0 %	20 %	40 %	50086362
2050	NC_005966	AAGCC	2	10	3303110	3303119	40 %	0 %	20 %	40 %	50086363
2051	NC_005966	CAAAA	2	10	3304475	3304484	80 %	0 %	0 %	20 %	50086364
2052	NC_005966	TCAGT	2	10	3305977	3305986	20 %	40 %	20 %	20 %	50086365
2053	NC_005966	CACTG	2	10	3306217	3306226	20 %	20 %	20 %	40 %	50086365
2054	NC_005966	AATGG	2	10	3307994	3308003	40 %	20 %	40 %	0 %	50086367
2055	NC_005966	TATGG	2	10	3310118	3310127	20 %	40 %	40 %	0 %	50086370
2056	NC_005966	TCTGA	2	10	3310562	3310571	20 %	40 %	20 %	20 %	50086370
2057	NC_005966	TGGAA	2	10	3310695	3310704	40 %	20 %	40 %	0 %	50086370
2058	NC_005966	AATTT	2	10	3311175	3311184	40 %	60 %	0 %	0 %	50086371
2059	NC_005966	GGCTG	2	10	3312350	3312359	0 %	20 %	60 %	20 %	50086373
2060	NC_005966	AACCA	2	10	3313089	3313098	60 %	0 %	0 %	40 %	50086373
2061	NC_005966	TATAA	2	10	3317156	3317165	60 %	40 %	0 %	0 %	50086374
2062	NC_005966	CAAAA	2	10	3317499	3317508	80 %	0 %	0 %	20 %	50086374
2063	NC_005966	ACCCA	2	10	3322692	3322701	40 %	0 %	0 %	60 %	50086380
2064	NC_005966	CGATG	2	10	3324345	3324354	20 %	20 %	40 %	20 %	50086382
2065	NC_005966	ATAAA	2	10	3328388	3328397	80 %	20 %	0 %	0 %	50086386
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2067	NC_005966	CGAAT	2	10	3331119	3331128	40 %	20 %	20 %	20 %	50086389
2068	NC_005966	TTGGT	2	10	3331297	3331306	0 %	60 %	40 %	0 %	50086389
2069	NC_005966	ACTGA	2	10	3331754	3331763	40 %	20 %	20 %	20 %	50086390
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2073	NC_005966	CCCAA	2	10	3337198	3337207	40 %	0 %	0 %	60 %	50086391
2074	NC_005966	TCTGA	2	10	3338268	3338277	20 %	40 %	20 %	20 %	50086392
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2081	NC_005966	AATTC	2	10	3342244	3342253	40 %	40 %	0 %	20 %	50086394
2082	NC_005966	AAAAT	2	10	3342567	3342576	80 %	20 %	0 %	0 %	50086395
2083	NC_005966	TTCGA	2	10	3342758	3342767	20 %	40 %	20 %	20 %	50086395
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2089	NC_005966	TTCCA	2	10	3352752	3352761	20 %	40 %	0 %	40 %	50086400
2090	NC_005966	TGTCA	2	10	3353729	3353738	20 %	40 %	20 %	20 %	50086400
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2092	NC_005966	GGCGT	2	10	3358451	3358460	0 %	20 %	60 %	20 %	50086404
2093	NC_005966	TGCTG	2	10	3358766	3358775	0 %	40 %	40 %	20 %	50086404
2094	NC_005966	CACAA	2	10	3363993	3364002	60 %	0 %	0 %	40 %	50086408
2095	NC_005966	ATTTC	2	10	3364881	3364890	20 %	60 %	0 %	20 %	50086409
2096	NC_005966	CAGAC	2	10	3364930	3364939	40 %	0 %	20 %	40 %	50086409
2097	NC_005966	CTTGC	2	10	3366010	3366019	0 %	40 %	20 %	40 %	50086409
2098	NC_005966	CCAGA	2	10	3366371	3366380	40 %	0 %	20 %	40 %	50086410
2099	NC_005966	CCACG	2	10	3367535	3367544	20 %	0 %	20 %	60 %	50086410
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2103	NC_005966	TTGCT	2	10	3369333	3369342	0 %	60 %	20 %	20 %	50086412
2104	NC_005966	GCCAG	2	10	3369417	3369426	20 %	0 %	40 %	40 %	50086412
2105	NC_005966	CCAGC	2	10	3370467	3370476	20 %	0 %	20 %	60 %	50086412
2106	NC_005966	GGTGA	2	10	3370679	3370688	20 %	20 %	60 %	0 %	50086412
2107	NC_005966	AAAAG	2	10	3379654	3379663	80 %	0 %	20 %	0 %	50086420
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2121	NC_005966	ATTTT	2	10	3402828	3402837	20 %	80 %	0 %	0 %	50086437
2122	NC_005966	CAATA	2	10	3404912	3404921	60 %	20 %	0 %	20 %	50086439
2123	NC_005966	GCATT	2	10	3405675	3405684	20 %	40 %	20 %	20 %	50086440
2124	NC_005966	CATTT	2	10	3406117	3406126	20 %	60 %	0 %	20 %	50086440
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.