MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Acinetobacter sp. ADP1 chromosome

Total Repeats: 2788

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_005966	ATGAC	2	10	3213180	3213189	40 %	20 %	20 %	20 %	50086291
2502	NC_005966	ATTCA	2	10	3214801	3214810	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2503	NC_005966	CTGAT	2	10	3216468	3216477	20 %	40 %	20 %	20 %	50086294
2504	NC_005966	TCAAT	2	10	3220239	3220248	40 %	40 %	0 %	20 %	50086300
2505	NC_005966	TTGCC	2	10	3221409	3221418	0 %	40 %	20 %	40 %	50086301
2506	NC_005966	CATTT	2	10	3221834	3221843	20 %	60 %	0 %	20 %	50086301
2507	NC_005966	ATTGG	2	10	3223683	3223692	20 %	40 %	40 %	0 %	50086301
2508	NC_005966	TTGAT	2	10	3223871	3223880	20 %	60 %	20 %	0 %	50086301
2509	NC_005966	TACCT	2	10	3225045	3225054	20 %	40 %	0 %	40 %	50086302
2510	NC_005966	CCCAT	2	10	3225400	3225409	20 %	20 %	0 %	60 %	50086303
2511	NC_005966	CTCTA	2	10	3226987	3226996	20 %	40 %	0 %	40 %	50086305
2512	NC_005966	AATCG	2	10	3228196	3228205	40 %	20 %	20 %	20 %	50086306
2513	NC_005966	TATCA	2	10	3228513	3228522	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
2514	NC_005966	TTTCA	2	10	3229494	3229503	20 %	60 %	0 %	20 %	50086308
2515	NC_005966	AAACC	2	10	3230468	3230477	60 %	0 %	0 %	40 %	50086309
2516	NC_005966	ACTGA	2	10	3230815	3230824	40 %	20 %	20 %	20 %	50086309
2517	NC_005966	CTTTA	2	10	3233764	3233773	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2518	NC_005966	CTATA	2	10	3234416	3234425	40 %	40 %	0 %	20 %	50086314
2519	NC_005966	AATGA	2	10	3234964	3234973	60 %	20 %	20 %	0 %	50086314
2520	NC_005966	GAATA	2	10	3237944	3237953	60 %	20 %	20 %	0 %	50086316
2521	NC_005966	AAAAT	2	10	3238963	3238972	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2522	NC_005966	ATTTG	2	10	3239251	3239260	20 %	60 %	20 %	0 %	50086318
2523	NC_005966	CACAA	2	10	3239712	3239721	60 %	0 %	0 %	40 %	50086318
2524	NC_005966	TTAAA	2	10	3240047	3240056	60 %	40 %	0 %	0 %	50086318
2525	NC_005966	CATTA	2	10	3240198	3240207	40 %	40 %	0 %	20 %	50086318
2526	NC_005966	GAAAT	2	10	3240416	3240425	60 %	20 %	20 %	0 %	50086318
2527	NC_005966	GAAAA	2	10	3240541	3240550	80 %	0 %	20 %	0 %	50086318
2528	NC_005966	ATAAG	2	10	3242788	3242797	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2529	NC_005966	TTTAT	2	10	3244110	3244119	20 %	80 %	0 %	0 %	50086321
2530	NC_005966	CTGAT	2	10	3245906	3245915	20 %	40 %	20 %	20 %	50086322
2531	NC_005966	ACTGC	2	10	3246166	3246175	20 %	20 %	20 %	40 %	50086322
2532	NC_005966	AAAGA	2	10	3246214	3246223	80 %	0 %	20 %	0 %	50086322
2533	NC_005966	CTGTT	2	10	3246656	3246665	0 %	60 %	20 %	20 %	50086322
2534	NC_005966	AGACC	2	10	3247356	3247365	40 %	0 %	20 %	40 %	50086323
2535	NC_005966	TGATC	2	10	3250958	3250967	20 %	40 %	20 %	20 %	50086326
2536	NC_005966	CATAG	2	10	3252337	3252346	40 %	20 %	20 %	20 %	50086328
2537	NC_005966	TGACA	2	10	3253051	3253060	40 %	20 %	20 %	20 %	50086328
2538	NC_005966	AGTCA	2	10	3255056	3255065	40 %	20 %	20 %	20 %	50086330
2539	NC_005966	GAATT	2	10	3256774	3256783	40 %	40 %	20 %	0 %	50086330
2540	NC_005966	TTCTG	2	10	3259835	3259844	0 %	60 %	20 %	20 %	50086331
2541	NC_005966	ACAGT	2	10	3261446	3261455	40 %	20 %	20 %	20 %	50086332
2542	NC_005966	GAAAA	2	10	3266647	3266656	80 %	0 %	20 %	0 %	50086338
2543	NC_005966	ACGAT	2	10	3267481	3267490	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2544	NC_005966	CTTAA	2	10	3271100	3271109	40 %	40 %	0 %	20 %	50086341
2545	NC_005966	ATTGG	2	10	3271749	3271758	20 %	40 %	40 %	0 %	50086341
2546	NC_005966	GCCCA	2	10	3271884	3271893	20 %	0 %	20 %	60 %	50086341
2547	NC_005966	GGACT	2	10	3273691	3273700	20 %	20 %	40 %	20 %	50086343
2548	NC_005966	GGCTG	2	10	3274376	3274385	0 %	20 %	60 %	20 %	50086343
2549	NC_005966	ACTCA	2	10	3277179	3277188	40 %	20 %	0 %	40 %	50086345
2550	NC_005966	ATTTT	2	10	3278359	3278368	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2551	NC_005966	TTTTA	2	10	3283620	3283629	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2552	NC_005966	GACCA	2	10	3283967	3283976	40 %	0 %	20 %	40 %	50086352
2553	NC_005966	ATTTT	2	10	3287249	3287258	20 %	80 %	0 %	0 %	50086353
2554	NC_005966	AAGTG	2	10	3292011	3292020	40 %	20 %	40 %	0 %	50086357
2555	NC_005966	GGCAT	2	10	3292417	3292426	20 %	20 %	40 %	20 %	50086357
2556	NC_005966	GCCCG	2	10	3293427	3293436	0 %	0 %	40 %	60 %	50086357
2557	NC_005966	GCCGT	2	10	3295787	3295796	0 %	20 %	40 %	40 %	50086359
2558	NC_005966	TGCTT	2	10	3296577	3296586	0 %	60 %	20 %	20 %	50086360
2559	NC_005966	CCAGA	2	10	3298150	3298159	40 %	0 %	20 %	40 %	50086360
2560	NC_005966	TGCTG	2	10	3298731	3298740	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2561	NC_005966	ATTTA	2	10	3298817	3298826	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2562	NC_005966	GCCAA	2	10	3302302	3302311	40 %	0 %	20 %	40 %	50086362
2563	NC_005966	AAGCC	2	10	3303110	3303119	40 %	0 %	20 %	40 %	50086363
2564	NC_005966	TCATT	2	10	3304151	3304160	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2565	NC_005966	CAAAA	2	10	3304475	3304484	80 %	0 %	0 %	20 %	50086364
2566	NC_005966	TTTTA	2	10	3305915	3305924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
2567	NC_005966	TCAGT	2	10	3305977	3305986	20 %	40 %	20 %	20 %	50086365
2568	NC_005966	CACTG	2	10	3306217	3306226	20 %	20 %	20 %	40 %	50086365
2569	NC_005966	AATGG	2	10	3307994	3308003	40 %	20 %	40 %	0 %	50086367
2570	NC_005966	TATGG	2	10	3310118	3310127	20 %	40 %	40 %	0 %	50086370
2571	NC_005966	TCTGA	2	10	3310562	3310571	20 %	40 %	20 %	20 %	50086370
2572	NC_005966	TGGAA	2	10	3310695	3310704	40 %	20 %	40 %	0 %	50086370
2573	NC_005966	AATTT	2	10	3311175	3311184	40 %	60 %	0 %	0 %	50086371
2574	NC_005966	GGCTG	2	10	3312350	3312359	0 %	20 %	60 %	20 %	50086373
2575	NC_005966	AACCA	2	10	3313089	3313098	60 %	0 %	0 %	40 %	50086373
2576	NC_005966	TATAA	2	10	3317156	3317165	60 %	40 %	0 %	0 %	50086374
2577	NC_005966	CAAAA	2	10	3317499	3317508	80 %	0 %	0 %	20 %	50086374
2578	NC_005966	ACCCA	2	10	3322692	3322701	40 %	0 %	0 %	60 %	50086380
2579	NC_005966	CGATG	2	10	3324345	3324354	20 %	20 %	40 %	20 %	50086382
2580	NC_005966	ATCAA	2	10	3324949	3324958	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
2581	NC_005966	ATAAA	2	10	3328388	3328397	80 %	20 %	0 %	0 %	50086386
2582	NC_005966	AGGAT	2	10	3328579	3328588	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
2583	NC_005966	CTGTT	2	10	3330545	3330554	0 %	60 %	20 %	20 %	50086389
2584	NC_005966	CGAAT	2	10	3331119	3331128	40 %	20 %	20 %	20 %	50086389
2585	NC_005966	TTGGT	2	10	3331297	3331306	0 %	60 %	40 %	0 %	50086389
2586	NC_005966	ACTGA	2	10	3331754	3331763	40 %	20 %	20 %	20 %	50086390
2587	NC_005966	TTTGA	2	10	3333380	3333389	20 %	60 %	20 %	0 %	50086390
2588	NC_005966	TGGTC	2	10	3336291	3336300	0 %	40 %	40 %	20 %	50086391
2589	NC_005966	CATGA	2	10	3336487	3336496	40 %	20 %	20 %	20 %	50086391
2590	NC_005966	CCCAA	2	10	3337198	3337207	40 %	0 %	0 %	60 %	50086391
2591	NC_005966	TCTGA	2	10	3338268	3338277	20 %	40 %	20 %	20 %	50086392
2592	NC_005966	CGGTA	2	10	3339764	3339773	20 %	20 %	40 %	20 %	50086393
2593	NC_005966	TTTGC	2	10	3339952	3339961	0 %	60 %	20 %	20 %	50086393
2594	NC_005966	TTTAT	2	10	3340641	3340650	20 %	80 %	0 %	0 %	50086393
2595	NC_005966	TAAAA	2	10	3341370	3341379	80 %	20 %	0 %	0 %	50086394
2596	NC_005966	AAACT	2	10	3341458	3341467	60 %	20 %	0 %	20 %	50086394
2597	NC_005966	ATTTT	2	10	3341858	3341867	20 %	80 %	0 %	0 %	50086394
2598	NC_005966	AATTC	2	10	3342244	3342253	40 %	40 %	0 %	20 %	50086394
2599	NC_005966	AAAAT	2	10	3342567	3342576	80 %	20 %	0 %	0 %	50086395
2600	NC_005966	TTCGA	2	10	3342758	3342767	20 %	40 %	20 %	20 %	50086395
2601	NC_005966	CGAAG	2	10	3343420	3343429	40 %	0 %	40 %	20 %	50086395
2602	NC_005966	TAAGC	2	10	3343943	3343952	40 %	20 %	20 %	20 %	50086395
2603	NC_005966	ACATT	2	10	3346941	3346950	40 %	40 %	0 %	20 %	50086397
2604	NC_005966	CAATA	2	10	3349081	3349090	60 %	20 %	0 %	20 %	50086398
2605	NC_005966	AATCC	2	10	3350403	3350412	40 %	20 %	0 %	40 %	50086399
2606	NC_005966	TTCCA	2	10	3352752	3352761	20 %	40 %	0 %	40 %	50086400
2607	NC_005966	TGTCA	2	10	3353729	3353738	20 %	40 %	20 %	20 %	50086400
2608	NC_005966	GTTTT	2	10	3354437	3354446	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
2609	NC_005966	ATAAA	2	10	3356551	3356560	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
2610	NC_005966	AAAAC	2	10	3357106	3357115	80 %	0 %	0 %	20 %	50086403
2611	NC_005966	TGATT	2	10	3357664	3357673	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
2612	NC_005966	GGCGT	2	10	3358451	3358460	0 %	20 %	60 %	20 %	50086404
2613	NC_005966	TGCTG	2	10	3358766	3358775	0 %	40 %	40 %	20 %	50086404
2614	NC_005966	CACAA	2	10	3363993	3364002	60 %	0 %	0 %	40 %	50086408
2615	NC_005966	ATTTC	2	10	3364881	3364890	20 %	60 %	0 %	20 %	50086409
2616	NC_005966	CAGAC	2	10	3364930	3364939	40 %	0 %	20 %	40 %	50086409
2617	NC_005966	CTTGC	2	10	3366010	3366019	0 %	40 %	20 %	40 %	50086409
2618	NC_005966	CCAGA	2	10	3366371	3366380	40 %	0 %	20 %	40 %	50086410
2619	NC_005966	CCACG	2	10	3367535	3367544	20 %	0 %	20 %	60 %	50086410
2620	NC_005966	GGAAG	2	10	3367798	3367807	40 %	0 %	60 %	0 %	50086411
2621	NC_005966	TACTG	2	10	3367924	3367933	20 %	40 %	20 %	20 %	50086411
2622	NC_005966	CAGAT	2	10	3368328	3368337	40 %	20 %	20 %	20 %	50086411
2623	NC_005966	TTGCT	2	10	3369333	3369342	0 %	60 %	20 %	20 %	50086412
2624	NC_005966	GCCAG	2	10	3369417	3369426	20 %	0 %	40 %	40 %	50086412
2625	NC_005966	CCAGC	2	10	3370467	3370476	20 %	0 %	20 %	60 %	50086412
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2627	NC_005966	CAATA	2	10	3371268	3371277	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.