MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 chromosome

Total Repeats: 2429

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005957	AAAGGC	2	12	1269	1280	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	49479264
2	NC_005957	CTATTA	2	12	1856	1867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_005957	TGGCGA	2	12	3556	3567	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	49477032
4	NC_005957	TCTTTG	2	12	3657	3668	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	49477032
5	NC_005957	ACAAGC	2	12	7856	7867	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	49476687
6	NC_005957	TGAAGA	2	12	8084	8095	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	49476687
7	NC_005957	ATTCTT	2	12	8432	8443	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	49476687
8	NC_005957	TTTCGT	2	12	10907	10918	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_005957	GGCAAT	2	12	17420	17431	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	49478184
10	NC_005957	GAACTG	2	12	17750	17761	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	49478184
11	NC_005957	TTTCGT	2	12	30708	30719	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_005957	CACATA	2	12	35116	35127	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	49480016
13	NC_005957	AAATGA	2	12	37840	37851	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	49481560
14	NC_005957	TGTAGA	2	12	37945	37956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49481560
15	NC_005957	GAAAAT	2	12	38611	38622	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	49479031
16	NC_005957	TTGAAA	2	12	40108	40119	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	49481556
17	NC_005957	TTTAAA	2	12	41448	41459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005957	GCACGT	2	12	52467	52478	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	49476699
19	NC_005957	ATTAAC	2	12	56859	56870	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	49479988
20	NC_005957	TTTTAA	2	12	60479	60490	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49479931
21	NC_005957	TATTGA	2	12	66459	66470	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	49481740
22	NC_005957	CAGGTA	2	12	70228	70239	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	49476704
23	NC_005957	AGCGTT	2	12	72559	72570	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	49479980
24	NC_005957	CTGGTG	2	12	74066	74077	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	49479972
25	NC_005957	CTTTTT	2	12	74480	74491	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_005957	AAAAAG	2	12	75087	75098	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	49479971
27	NC_005957	GTATCT	2	12	79268	79279	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	49479321
28	NC_005957	CAGTTA	2	12	79817	79828	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	49481554
29	NC_005957	TTATAT	2	12	82144	82155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005957	TATATT	2	12	82239	82250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005957	AGTCAA	2	12	93115	93126	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_005957	AGAAGC	2	12	100019	100030	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	49476705
33	NC_005957	TTTAAT	2	12	100851	100862	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49479305
34	NC_005957	GCAGTA	2	12	103645	103656	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	49476707
35	NC_005957	GAACAA	2	12	104119	104130	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	49476707
36	NC_005957	CTAGCG	2	12	107508	107519	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	49476710
37	NC_005957	GTAGAA	2	12	110127	110138	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	49476713
38	NC_005957	TCTGGT	2	12	110957	110968	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	49479292
39	NC_005957	GAAGCT	2	12	111556	111567	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	49479291
40	NC_005957	ATGCGA	2	12	120992	121003	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	49479285
41	NC_005957	GCAAGA	2	12	123073	123084	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	49478969
42	NC_005957	AGTAGA	2	12	123178	123189	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	49478969
43	NC_005957	GCAGTA	2	12	123215	123226	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	49478969
44	NC_005957	AGCGTG	2	12	123951	123962	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	49478969
45	NC_005957	ATTCGA	2	12	124471	124482	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	49478969
46	NC_005957	AAGTTG	2	12	124725	124736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49478969
47	NC_005957	GCTAAA	2	12	125111	125122	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	49479276
48	NC_005957	GAAACT	2	12	125318	125329	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	49479276
49	NC_005957	CAAGCT	2	12	125912	125923	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	49479276
50	NC_005957	AACTGA	2	12	127156	127167	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	49479271
51	NC_005957	TAAAGG	2	12	127378	127389	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	49479271
52	NC_005957	GAAATC	2	12	128582	128593	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	49479267
53	NC_005957	ACAAGC	2	12	130931	130942	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	49476719
54	NC_005957	TTGAAG	2	12	134110	134121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49481676
55	NC_005957	AAAGGT	2	12	134220	134231	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	49481676
56	NC_005957	TAGTTG	2	12	134807	134818	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	49481680
57	NC_005957	CTGAAA	2	12	137350	137361	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	49479237
58	NC_005957	TAAACA	2	12	139037	139048	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_005957	TTAGGT	2	12	140958	140969	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	49481737
60	NC_005957	ATTTTT	2	12	143310	143321	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	49481686
61	NC_005957	ATATCC	2	12	144377	144388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49476722
62	NC_005957	TGCAAT	2	12	147414	147425	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	49481796
63	NC_005957	TACAAG	2	12	148933	148944	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	49479224
64	NC_005957	TTAGAT	2	12	159000	159011	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	49479220
65	NC_005957	ATCCTG	2	12	161650	161661	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	49479924
66	NC_005957	ATAAAG	2	12	161692	161703	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	49479924
67	NC_005957	GATGGT	2	12	162481	162492	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	49476725
68	NC_005957	CGCATC	2	12	163846	163857	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	49479217
69	NC_005957	ACATAA	3	18	167484	167501	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_005957	AAATAC	2	12	171283	171294	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_005957	CAAAGA	2	12	181123	181134	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	49479923
72	NC_005957	CAAAAT	2	12	182538	182549	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	49479192
73	NC_005957	GTATGT	2	12	185569	185580	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005957	CGGTAT	2	12	186431	186442	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	49480096
75	NC_005957	AGAGCA	2	12	187467	187478	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	49479920
76	NC_005957	TCTTCA	2	12	187680	187691	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	49479919
77	NC_005957	ATTTTG	2	12	188497	188508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	49476734
78	NC_005957	CAACGT	2	12	191645	191656	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	49479187
79	NC_005957	CAAATT	2	12	191738	191749	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	49479187
80	NC_005957	AAATTG	2	12	194208	194219	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005957	GTGGTT	2	12	197602	197613	0 %	50 %	50 %	0 %	49476737
82	NC_005957	GTGGTT	2	12	199630	199641	0 %	50 %	50 %	0 %	49479177
83	NC_005957	ATCTGG	2	12	201310	201321	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	49479174
84	NC_005957	TGATTA	2	12	203116	203127	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	49476738
85	NC_005957	TTCTTT	2	12	206281	206292	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	49476740
86	NC_005957	TATGAA	2	12	214422	214433	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	49479916
87	NC_005957	AAAATA	2	12	214643	214654	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005957	AAGGGG	2	12	214726	214737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005957	AGAGGT	2	12	219696	219707	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005957	TGTTTT	2	12	220586	220597	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	49480879
91	NC_005957	GAAAGA	2	12	228739	228750	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49481730
92	NC_005957	GAGAAT	2	12	229800	229811	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	49480091
93	NC_005957	AAAAAG	2	12	231923	231934	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	49476747
94	NC_005957	TTTCAT	2	12	233982	233993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_005957	TGAAAA	2	12	241987	241998	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	49479130
96	NC_005957	GTAATC	2	12	242193	242204	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	49479130
97	NC_005957	CATCTC	2	12	242550	242561	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	49481707
98	NC_005957	ATAAAG	2	12	242979	242990	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	49481707
99	NC_005957	CATAAT	2	12	243951	243962	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	49476749
100	NC_005957	AAAACA	2	12	245012	245023	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	49480878
101	NC_005957	ATAAAA	2	12	247031	247042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005957	AGCTGA	2	12	258435	258446	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	49479117
103	NC_005957	TAATTG	2	12	261899	261910	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	49479111
104	NC_005957	GGATAT	2	12	262665	262676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49476753
105	NC_005957	GCAACT	2	12	263417	263428	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	49479110
106	NC_005957	GGCATG	2	12	266401	266412	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	49479104
107	NC_005957	CCATTT	2	12	271510	271521	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	49476757
108	NC_005957	TTATAT	2	12	285659	285670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49476762
109	NC_005957	GTTTTA	2	12	293826	293837	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	49476765
110	NC_005957	TTTTGA	2	12	294561	294572	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	49476766
111	NC_005957	TAGAAA	2	12	294963	294974	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	49476767
112	NC_005957	TAGTTC	2	12	296075	296086	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	49476768
113	NC_005957	AAGATG	2	12	304104	304115	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005957	ATTTTT	2	12	304192	304203	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005957	AGTAAT	2	12	309103	309114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005957	TGTACG	2	12	315735	315746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	49479094
117	NC_005957	ACAAAT	2	12	316498	316509	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	49479094
118	NC_005957	TTATGA	2	12	317972	317983	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	49479088
119	NC_005957	TTGTTA	2	12	320056	320067	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	49479086
120	NC_005957	GATGCA	2	12	320523	320534	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	49479086
121	NC_005957	ATTGAT	2	12	321552	321563	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	49479085
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123	NC_005957	ACAACT	2	12	327395	327406	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	49479079
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128	NC_005957	AAACAA	2	12	333745	333756	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
129	NC_005957	AAAGAT	2	12	337431	337442	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	49479066
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227	NC_005957	AAAAGG	2	12	536366	536377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49481708
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229	NC_005957	ATCATT	2	12	541155	541166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
230	NC_005957	AGTGAT	2	12	541483	541494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49481764
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233	NC_005957	AAGATG	2	12	549372	549383	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	49476834
234	NC_005957	ACGGTT	2	12	549530	549541	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	49476834
235	NC_005957	GCAGAA	2	12	550430	550441	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	49479863
236	NC_005957	GCTGAA	2	12	551429	551440	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	49480151
237	NC_005957	GAAGCG	2	12	551750	551761	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	49480151
238	NC_005957	AGCAGA	2	12	551896	551907	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	49480151
239	NC_005957	ATTAAT	2	12	558194	558205	50 %	50 %	0 %	0 %	49480154
240	NC_005957	TTATTT	2	12	563229	563240	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	49480900
241	NC_005957	TTTTCA	2	12	563674	563685	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	49480900
242	NC_005957	AAAGAT	2	12	567636	567647	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	49480164
243	NC_005957	AGATGA	2	12	570715	570726	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	49479859
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248	NC_005957	TTGAAA	2	12	577516	577527	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	49480169
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250	NC_005957	ATCTTT	2	12	585707	585718	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	49480173
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252	NC_005957	GGTGCA	2	12	588980	588991	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	49480180
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254	NC_005957	TGCTAA	2	12	592072	592083	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	49480181
255	NC_005957	TGTATA	2	12	592761	592772	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
256	NC_005957	CCAGAA	2	12	593359	593370	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	49480183
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259	NC_005957	TGAAGT	2	12	597420	597431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49480188
260	NC_005957	TAGCGT	2	12	601206	601217	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	49479852
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263	NC_005957	GTAACT	2	12	603695	603706	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	49480192
264	NC_005957	CTTTTT	2	12	605697	605708	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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267	NC_005957	GGCAAT	2	12	613200	613211	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	49476842
268	NC_005957	GCAAAA	2	12	613576	613587	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	49476842
269	NC_005957	CGTCTA	2	12	617055	617066	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	49480197
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272	NC_005957	TTAAAA	2	12	618292	618303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49476843
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311	NC_005957	ACTTAA	2	12	705166	705177	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
312	NC_005957	GAAAGG	2	12	706525	706536	50 %	0 %	50 %	0 %	49480255
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322	NC_005957	ATGGTT	2	12	720931	720942	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	49480290
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324	NC_005957	TAAATT	2	12	724085	724096	50 %	50 %	0 %	0 %	49476880
325	NC_005957	TTAAAA	2	12	725039	725050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
326	NC_005957	TAAATA	2	12	728416	728427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	49476882
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329	NC_005957	GCATTG	2	12	742436	742447	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	49476886
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341	NC_005957	TTCTGG	2	12	764317	764328	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	49476893
342	NC_005957	AAAGCT	2	12	765237	765248	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	49476894
343	NC_005957	TGAATA	2	12	767587	767598	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	49476895
344	NC_005957	GTACTT	2	12	767860	767871	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	49476896
345	NC_005957	TTGTGT	2	12	768095	768106	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49476896
346	NC_005957	CATTTA	2	12	769802	769813	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	49480295
347	NC_005957	ATTGCG	2	12	770778	770789	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	49480258
348	NC_005957	TACACC	2	12	771665	771676	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	49480296
349	NC_005957	TTCATA	2	12	776425	776436	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	49476900
350	NC_005957	TTTTAT	2	12	776540	776551	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
351	NC_005957	GGGAGT	2	12	776779	776790	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	49476901
352	NC_005957	ATTTGC	2	12	777257	777268	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	49476901
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354	NC_005957	AATCAA	2	12	782976	782987	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	49480303
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