MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 chromosome

Total Repeats: 354

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005957	CTATTA	2	12	1856	1867	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_005957	TTTCGT	2	12	10907	10918	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_005957	TTTCGT	2	12	30708	30719	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_005957	TTTAAA	2	12	41448	41459	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005957	CTTTTT	2	12	74480	74491	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_005957	TTATAT	2	12	82144	82155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005957	TATATT	2	12	82239	82250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005957	AGTCAA	2	12	93115	93126	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_005957	TAAACA	2	12	139037	139048	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_005957	ACATAA	3	18	167484	167501	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_005957	AAATAC	2	12	171283	171294	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_005957	GTATGT	2	12	185569	185580	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005957	AAATTG	2	12	194208	194219	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005957	AAAATA	2	12	214643	214654	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005957	AAGGGG	2	12	214726	214737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005957	AGAGGT	2	12	219696	219707	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005957	TTTCAT	2	12	233982	233993	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_005957	ATAAAA	2	12	247031	247042	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005957	AAGATG	2	12	304104	304115	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005957	ATTTTT	2	12	304192	304203	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005957	AGTAAT	2	12	309103	309114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005957	TATATT	2	12	333562	333573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005957	AAACAA	2	12	333745	333756	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_005957	TATAAA	2	12	340343	340354	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005957	AAAAAT	2	12	356163	356174	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005957	AATAGA	2	12	356410	356421	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005957	ATTTGA	2	12	357936	357947	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005957	AATGAT	2	12	380560	380571	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005957	TTTATA	2	12	429131	429142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005957	AATGGA	2	12	432923	432934	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005957	AAAAAT	2	12	437097	437108	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005957	ATTTTT	2	12	462013	462024	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005957	CCAATT	2	12	467850	467861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_005957	TTTTCT	2	12	483907	483918	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_005957	GAAGTT	2	12	502263	502274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005957	TAAAAA	2	12	535012	535023	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005957	ATCATT	2	12	541155	541166	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_005957	TGTATA	2	12	592761	592772	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005957	CTTTTT	2	12	605697	605708	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_005957	ACTTAA	2	12	705166	705177	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_005957	TTTTTA	2	12	715270	715281	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005957	TTAAAA	2	12	725039	725050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005957	TTAATT	2	12	731837	731848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005957	TTTTAT	2	12	776540	776551	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005957	ATCAAT	2	12	784502	784513	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_005957	GTATAT	2	12	791514	791525	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005957	ATAAAA	2	12	794255	794266	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005957	ACATTT	2	12	797480	797491	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_005957	ATAAGT	2	12	797554	797565	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005957	ATGTAA	2	12	814685	814696	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005957	TAAAAA	2	12	839885	839896	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005957	AATGTA	2	12	858716	858727	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005957	GTTTTT	2	12	864318	864329	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005957	TCATAT	2	12	871736	871747	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_005957	GTATAT	2	12	875148	875159	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005957	ATTTAT	2	12	902613	902624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005957	AATATT	2	12	908091	908102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005957	AGATGA	2	12	920447	920458	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005957	TAAAAT	2	12	952786	952797	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005957	AGTTTT	2	12	952895	952906	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005957	TAATGT	2	12	964086	964097	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005957	GAAAAA	2	12	976304	976315	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005957	CTTTTT	2	12	996458	996469	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_005957	AGCGAA	2	12	998284	998295	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_005957	AAACAA	2	12	1005958	1005969	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_005957	TACTTT	2	12	1016722	1016733	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_005957	CTTTTT	2	12	1038414	1038425	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_005957	TCTTTT	2	12	1043183	1043194	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_005957	CCTTTT	2	12	1089040	1089051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_005957	ACTTTC	2	12	1095880	1095891	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_005957	TAATAT	2	12	1097714	1097725	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005957	TCCATT	2	12	1099008	1099019	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_005957	TTGATA	2	12	1103666	1103677	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005957	GTATAT	2	12	1103706	1103717	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005957	AATAAA	2	12	1107407	1107418	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005957	ATCTGT	2	12	1120908	1120919	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_005957	TTTATT	2	12	1125986	1125997	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005957	AATATG	2	12	1127075	1127086	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005957	TATTTT	2	12	1127449	1127460	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005957	TGTTTC	2	12	1170418	1170429	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_005957	TCCAGC	2	12	1174711	1174722	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
82	NC_005957	AATATA	2	12	1184443	1184454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005957	CTTTTC	2	12	1195908	1195919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005957	AAGTAT	2	12	1213562	1213573	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005957	GGAGAG	2	12	1258930	1258941	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005957	AAAAAT	2	12	1261249	1261260	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005957	AAAATT	2	12	1267114	1267125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005957	AATGAT	2	12	1309643	1309654	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005957	GGATAA	2	12	1315110	1315121	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005957	AAGAAA	2	12	1319891	1319902	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005957	AATGAA	2	12	1326058	1326069	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005957	AAAAGT	2	12	1327041	1327052	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005957	AAAAGA	2	12	1328384	1328395	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005957	TGCTCA	2	12	1330119	1330130	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_005957	TTTACT	2	12	1335082	1335093	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_005957	GAAAGG	2	12	1370485	1370496	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005957	CCGGAA	2	12	1379374	1379385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_005957	ATACAA	2	12	1384687	1384698	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_005957	GTTTTT	2	12	1407546	1407557	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005957	ATTTCT	2	12	1412563	1412574	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_005957	TTATCA	2	12	1423608	1423619	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_005957	GAAGGA	2	12	1435007	1435018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005957	TTTATG	2	12	1468410	1468421	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005957	ATAATC	2	12	1532241	1532252	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
105	NC_005957	TTTTTA	2	12	1536508	1536519	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005957	ATTTTT	2	12	1578844	1578855	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005957	TTTCTA	2	12	1623297	1623308	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_005957	GCTTAT	2	12	1625370	1625381	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_005957	TATAAC	2	12	1636891	1636902	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_005957	CAGTGA	2	12	1639692	1639703	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_005957	TTTATT	2	12	1658083	1658094	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005957	TTGTTT	2	12	1665720	1665731	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005957	AAAGAG	2	12	1667512	1667523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005957	TTATAT	2	12	1667674	1667685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005957	TTAGAT	2	12	1671427	1671438	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005957	TAAAAA	2	12	1672527	1672538	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005957	ATCCTA	2	12	1678405	1678416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_005957	GAATAG	2	12	1685777	1685788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005957	AATCAT	2	12	1687766	1687777	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_005957	ATACTA	2	12	1750007	1750018	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_005957	TTTTTA	2	12	1767125	1767136	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005957	GGTGTT	2	12	1791443	1791454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005957	AAATTG	2	12	1799199	1799210	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005957	TATTCT	2	12	1800567	1800578	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
125	NC_005957	AATACT	2	12	1819518	1819529	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_005957	AAATAA	2	12	1827094	1827105	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005957	ATATTT	2	12	1845518	1845529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005957	GAAATA	2	12	1860169	1860180	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005957	AAGTAA	2	12	1862099	1862110	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.