MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27 chromosome

Total Repeats: 3724

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005957	CAAAT	2	10	1322	1331	60 %	20 %	0 %	20 %	49479264
2	NC_005957	TTCAA	2	10	1936	1945	40 %	40 %	0 %	20 %	49476685
3	NC_005957	AATTT	2	10	2262	2271	40 %	60 %	0 %	0 %	49476685
4	NC_005957	ATTGA	2	10	4317	4326	40 %	40 %	20 %	0 %	49477032
5	NC_005957	AGCAA	2	10	5896	5905	60 %	0 %	20 %	20 %	49476686
6	NC_005957	ATTCT	2	10	8268	8277	20 %	60 %	0 %	20 %	49476687
7	NC_005957	TGAAA	2	10	17960	17969	60 %	20 %	20 %	0 %	49478184
8	NC_005957	GTCAA	2	10	19017	19026	40 %	20 %	20 %	20 %	49476690
9	NC_005957	GGACA	2	10	20964	20973	40 %	0 %	40 %	20 %	49478185
10	NC_005957	TTTTA	2	10	21933	21942	20 %	80 %	0 %	0 %	49476691
11	NC_005957	AAGTA	2	10	22277	22286	60 %	20 %	20 %	0 %	49476691
12	NC_005957	AGATG	2	10	26322	26331	40 %	20 %	40 %	0 %	49476694
13	NC_005957	AAAAG	2	10	35399	35408	80 %	0 %	20 %	0 %	49480016
14	NC_005957	AAGAC	2	10	35695	35704	60 %	0 %	20 %	20 %	49480016
15	NC_005957	GTGAA	2	10	36443	36452	40 %	20 %	40 %	0 %	49480017
16	NC_005957	GTATT	2	10	36533	36542	20 %	60 %	20 %	0 %	49480017
17	NC_005957	AATGA	2	10	42210	42219	60 %	20 %	20 %	0 %	49477589
18	NC_005957	ATCGT	2	10	45403	45412	20 %	40 %	20 %	20 %	49477600
19	NC_005957	ATTAG	2	10	46391	46400	40 %	40 %	20 %	0 %	49480336
20	NC_005957	AAGTG	2	10	46564	46573	40 %	20 %	40 %	0 %	49480336
21	NC_005957	AAGAC	2	10	48172	48181	60 %	0 %	20 %	20 %	49479996
22	NC_005957	CATCT	2	10	55493	55502	20 %	40 %	0 %	40 %	49479988
23	NC_005957	CAAAA	2	10	56265	56274	80 %	0 %	0 %	20 %	49479988
24	NC_005957	TGCGA	2	10	57441	57450	20 %	20 %	40 %	20 %	49479988
25	NC_005957	GATTT	2	10	57518	57527	20 %	60 %	20 %	0 %	49479988
26	NC_005957	TGCTA	2	10	59541	59550	20 %	40 %	20 %	20 %	49479931
27	NC_005957	AAGGT	2	10	59932	59941	40 %	20 %	40 %	0 %	49479931
28	NC_005957	TATTT	2	10	60072	60081	20 %	80 %	0 %	0 %	49479931
29	NC_005957	TTGGA	2	10	62753	62762	20 %	40 %	40 %	0 %	49480881
30	NC_005957	AAAGA	2	10	63587	63596	80 %	0 %	20 %	0 %	49479326
31	NC_005957	TTATG	2	10	65073	65082	20 %	60 %	20 %	0 %	49481740
32	NC_005957	TTCCA	2	10	65237	65246	20 %	40 %	0 %	40 %	49481740
33	NC_005957	AATGA	2	10	68984	68993	60 %	20 %	20 %	0 %	49476703
34	NC_005957	CGTTA	2	10	69364	69373	20 %	40 %	20 %	20 %	49479325
35	NC_005957	GATTA	2	10	69459	69468	40 %	40 %	20 %	0 %	49479325
36	NC_005957	GAAAA	2	10	70080	70089	80 %	0 %	20 %	0 %	49476704
37	NC_005957	GAACA	2	10	72834	72843	60 %	0 %	20 %	20 %	49479980
38	NC_005957	GAAAA	2	10	75218	75227	80 %	0 %	20 %	0 %	49479971
39	NC_005957	GACAA	2	10	75325	75334	60 %	0 %	20 %	20 %	49479971
40	NC_005957	AGAGC	2	10	75578	75587	40 %	0 %	40 %	20 %	49479971
41	NC_005957	ATTTA	2	10	76101	76110	40 %	60 %	0 %	0 %	49479967
42	NC_005957	AAAAC	2	10	79121	79130	80 %	0 %	0 %	20 %	49478206
43	NC_005957	AAATA	2	10	79767	79776	80 %	20 %	0 %	0 %	49481554
44	NC_005957	GTATG	2	10	81942	81951	20 %	40 %	40 %	0 %	49481679
45	NC_005957	TGTTA	2	10	81990	81999	20 %	60 %	20 %	0 %	49481679
46	NC_005957	GAACA	2	10	95506	95515	60 %	0 %	20 %	20 %	49481552
47	NC_005957	GAACA	2	10	95728	95737	60 %	0 %	20 %	20 %	49481552
48	NC_005957	TGAAG	2	10	96668	96677	40 %	20 %	40 %	0 %	49481552
49	NC_005957	AGAAA	2	10	96690	96699	80 %	0 %	20 %	0 %	49481552
50	NC_005957	GAAAA	2	10	96814	96823	80 %	0 %	20 %	0 %	49481552
51	NC_005957	AATTG	2	10	97634	97643	40 %	40 %	20 %	0 %	49481552
52	NC_005957	TGAAA	2	10	98750	98759	60 %	20 %	20 %	0 %	49479310
53	NC_005957	CGTAA	2	10	99714	99723	40 %	20 %	20 %	20 %	49476705
54	NC_005957	TACGT	2	10	101791	101800	20 %	40 %	20 %	20 %	49479302
55	NC_005957	CATTC	2	10	103577	103586	20 %	40 %	0 %	40 %	49476707
56	NC_005957	GAAAA	2	10	104465	104474	80 %	0 %	20 %	0 %	49476707
57	NC_005957	AAAAG	2	10	108566	108575	80 %	0 %	20 %	0 %	49479929
58	NC_005957	GATTG	2	10	108915	108924	20 %	40 %	40 %	0 %	49476711
59	NC_005957	GAAAG	2	10	109216	109225	60 %	0 %	40 %	0 %	49476711
60	NC_005957	GAAAA	2	10	110165	110174	80 %	0 %	20 %	0 %	49476713
61	NC_005957	AGAAA	2	10	113784	113793	80 %	0 %	20 %	0 %	49476714
62	NC_005957	AATCA	2	10	119979	119988	60 %	20 %	0 %	20 %	49479285
63	NC_005957	AACAT	2	10	121570	121579	60 %	20 %	0 %	20 %	49476715
64	NC_005957	ACGTG	2	10	122260	122269	20 %	20 %	40 %	20 %	49479282
65	NC_005957	TCGTA	2	10	123298	123307	20 %	40 %	20 %	20 %	49478969
66	NC_005957	TGGTA	2	10	130384	130393	20 %	40 %	40 %	0 %	49481663
67	NC_005957	GTGCG	2	10	137624	137633	0 %	20 %	60 %	20 %	49479237
68	NC_005957	GAAAT	2	10	142249	142258	60 %	20 %	20 %	0 %	49479231
69	NC_005957	CATTT	2	10	142511	142520	20 %	60 %	0 %	20 %	49479229
70	NC_005957	TTATT	2	10	144422	144431	20 %	80 %	0 %	0 %	49476722
71	NC_005957	GAGCA	2	10	145263	145272	40 %	0 %	40 %	20 %	49481687
72	NC_005957	AAAAG	2	10	145927	145936	80 %	0 %	20 %	0 %	49479927
73	NC_005957	AAAAC	2	10	161256	161265	80 %	0 %	0 %	20 %	49479924
74	NC_005957	CAAAA	2	10	161509	161518	80 %	0 %	0 %	20 %	49479924
75	NC_005957	ATTAC	2	10	162764	162773	40 %	40 %	0 %	20 %	49476725
76	NC_005957	AAGTA	2	10	163832	163841	60 %	20 %	20 %	0 %	49479217
77	NC_005957	ACAGC	2	10	164802	164811	40 %	0 %	20 %	40 %	49479217
78	NC_005957	CGTAG	2	10	164997	165006	20 %	20 %	40 %	20 %	49479217
79	NC_005957	AAAAT	2	10	169073	169082	80 %	20 %	0 %	0 %	49476728
80	NC_005957	TAAAT	2	10	171378	171387	60 %	40 %	0 %	0 %	49476730
81	NC_005957	AGCGC	2	10	174261	174270	20 %	0 %	40 %	40 %	49476731
82	NC_005957	GAAGC	2	10	176882	176891	40 %	0 %	40 %	20 %	49479925
83	NC_005957	TATTT	2	10	179806	179815	20 %	80 %	0 %	0 %	49479197
84	NC_005957	AAAAG	2	10	180974	180983	80 %	0 %	20 %	0 %	49479923
85	NC_005957	AGAGA	2	10	182280	182289	60 %	0 %	40 %	0 %	49479192
86	NC_005957	ACGTA	2	10	182822	182831	40 %	20 %	20 %	20 %	49479192
87	NC_005957	GTGAA	2	10	184674	184683	40 %	20 %	40 %	0 %	49479921
88	NC_005957	AAAGG	2	10	184694	184703	60 %	0 %	40 %	0 %	49479921
89	NC_005957	TTACT	2	10	184885	184894	20 %	60 %	0 %	20 %	49479921
90	NC_005957	AAAAG	2	10	187344	187353	80 %	0 %	20 %	0 %	49479920
91	NC_005957	TTTTA	2	10	188711	188720	20 %	80 %	0 %	0 %	49476734
92	NC_005957	AACGT	2	10	190206	190215	40 %	20 %	20 %	20 %	49479189
93	NC_005957	TAATT	2	10	193364	193373	40 %	60 %	0 %	0 %	49479182
94	NC_005957	TATTT	2	10	193596	193605	20 %	80 %	0 %	0 %	49479918
95	NC_005957	CTAAA	2	10	193897	193906	60 %	20 %	0 %	20 %	49479918
96	NC_005957	GCAAA	2	10	196419	196428	60 %	0 %	20 %	20 %	49480477
97	NC_005957	ATAAA	2	10	197186	197195	80 %	20 %	0 %	0 %	49480477
98	NC_005957	TAAAT	2	10	198231	198240	60 %	40 %	0 %	0 %	49476737
99	NC_005957	TTTGT	2	10	199985	199994	0 %	80 %	20 %	0 %	49479177
100	NC_005957	ATGTT	2	10	201575	201584	20 %	60 %	20 %	0 %	49479174
101	NC_005957	CGTTT	2	10	203915	203924	0 %	60 %	20 %	20 %	49477336
102	NC_005957	AGGTA	2	10	206806	206815	40 %	20 %	40 %	0 %	49480880
103	NC_005957	TAATT	2	10	208919	208928	40 %	60 %	0 %	0 %	49477838
104	NC_005957	AATCA	2	10	211217	211226	60 %	20 %	0 %	20 %	49476741
105	NC_005957	GTTAT	2	10	212930	212939	20 %	60 %	20 %	0 %	49479915
106	NC_005957	GTTAA	2	10	214021	214030	40 %	40 %	20 %	0 %	49479161
107	NC_005957	ATCTT	2	10	215494	215503	20 %	60 %	0 %	20 %	49476742
108	NC_005957	AAGAA	2	10	215655	215664	80 %	0 %	20 %	0 %	49476742
109	NC_005957	GAAGA	2	10	216646	216655	60 %	0 %	40 %	0 %	49476743
110	NC_005957	TGTTA	2	10	219282	219291	20 %	60 %	20 %	0 %	49479917
111	NC_005957	TGGAA	2	10	222134	222143	40 %	20 %	40 %	0 %	49479157
112	NC_005957	AACGG	2	10	222609	222618	40 %	0 %	40 %	20 %	49479157
113	NC_005957	TTTTA	2	10	223291	223300	20 %	80 %	0 %	0 %	49479157
114	NC_005957	TACGG	2	10	225852	225861	20 %	20 %	40 %	20 %	49479154
115	NC_005957	GTAGT	2	10	228687	228696	20 %	40 %	40 %	0 %	49481730
116	NC_005957	TATTC	2	10	229307	229316	20 %	60 %	0 %	20 %	49481730
117	NC_005957	GAAGT	2	10	229690	229699	40 %	20 %	40 %	0 %	49480091
118	NC_005957	CATAT	2	10	229913	229922	40 %	40 %	0 %	20 %	49480091
119	NC_005957	ACGTT	2	10	231699	231708	20 %	40 %	20 %	20 %	49476747
120	NC_005957	GTGAT	2	10	234774	234783	20 %	40 %	40 %	0 %	49481706
121	NC_005957	GGATG	2	10	235641	235650	20 %	20 %	60 %	0 %	49479914
122	NC_005957	GTACT	2	10	235845	235854	20 %	40 %	20 %	20 %	49479914
123	NC_005957	AATGA	2	10	237068	237077	60 %	20 %	20 %	0 %	49480097
124	NC_005957	GTTGT	2	10	237137	237146	0 %	60 %	40 %	0 %	49480097
125	NC_005957	AAATT	2	10	237997	238006	60 %	40 %	0 %	0 %	49476748
126	NC_005957	AGCAG	2	10	239189	239198	40 %	0 %	40 %	20 %	49481739
127	NC_005957	AAGAA	2	10	241485	241494	80 %	0 %	20 %	0 %	49479130
128	NC_005957	CTTTA	2	10	245368	245377	20 %	60 %	0 %	20 %	49480878
129	NC_005957	AAAGA	2	10	248228	248237	80 %	0 %	20 %	0 %	49476750
130	NC_005957	GAAAG	2	10	248851	248860	60 %	0 %	40 %	0 %	49476750
131	NC_005957	TAATT	2	10	260604	260613	40 %	60 %	0 %	0 %	49479111
132	NC_005957	GTATT	2	10	264546	264555	20 %	60 %	20 %	0 %	49477873
133	NC_005957	AACTC	2	10	265996	266005	40 %	20 %	0 %	40 %	49479104
134	NC_005957	GCGTA	2	10	268166	268175	20 %	20 %	40 %	20 %	49476755
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136	NC_005957	TTATT	2	10	279220	279229	20 %	80 %	0 %	0 %	49476760
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