MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bartonella quintana str. Toulouse

Total Repeats: 157

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005955	GTATGT	2	12	13789	13800	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005955	CTTAAA	2	12	15262	15273	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_005955	AGGAAG	2	12	16084	16095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005955	CTTTCT	2	12	33111	33122	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_005955	ATTCCT	2	12	39832	39843	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_005955	ATTAAT	2	12	83254	83265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005955	TTTATG	2	12	133493	133504	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005955	GTTTTT	2	12	145064	145075	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005955	GATTTT	2	12	145810	145821	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005955	GTTTTT	2	12	146171	146182	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005955	TATTTT	2	12	155238	155249	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005955	GTGCGC	2	12	162588	162599	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_005955	TAAAAA	2	12	164045	164056	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005955	TAAAAA	2	12	203038	203049	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005955	TTATTT	2	12	220477	220488	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005955	CTGGTG	2	12	288161	288172	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_005955	GAATCT	2	12	288176	288187	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_005955	TATAAT	2	12	300877	300888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005955	ACTAAA	2	12	328310	328321	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
20	NC_005955	AATAAA	2	12	328446	328457	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005955	AGTATT	2	12	330876	330887	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005955	GTTAGA	2	12	332457	332468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005955	GATAAA	2	12	343249	343260	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005955	CATAAA	2	12	359558	359569	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_005955	GCCTAT	2	12	371378	371389	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_005955	GTAATA	2	12	371495	371506	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005955	AATAAA	2	12	380796	380807	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005955	TTGGGT	2	12	400677	400688	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005955	ATTATA	2	12	403543	403554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005955	TTTGGA	2	12	403849	403860	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005955	GAGAAG	2	12	403881	403892	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005955	CTTTCT	2	12	407782	407793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_005955	TATGAA	2	12	409890	409901	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005955	GTGTTA	2	12	412880	412891	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005955	TTGTTT	2	12	429589	429600	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005955	TGAAAA	2	12	430950	430961	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005955	ATTTTT	2	12	447401	447412	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005955	TTTAAT	2	12	451160	451171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005955	ATCATT	2	12	453482	453493	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_005955	AGGCTT	2	12	453707	453718	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_005955	GCTTAT	2	12	454205	454216	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_005955	TATAAA	2	12	455755	455766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005955	AAGGAT	2	12	458147	458158	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005955	TTATTT	2	12	465996	466007	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005955	ACTCAT	2	12	469259	469270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_005955	ATTTAA	2	12	469532	469543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005955	TTGATT	2	12	475646	475657	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005955	TTTTAC	2	12	500711	500722	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
49	NC_005955	ATTAAG	2	12	518068	518079	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005955	AATAGC	2	12	534418	534429	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_005955	AAAGGC	2	12	556877	556888	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_005955	TTATAA	2	12	570431	570442	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005955	CTTCCA	2	12	579737	579748	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_005955	TGGTAT	2	12	606963	606974	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005955	TCCATA	2	12	612770	612781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_005955	TTTTTG	2	12	620318	620329	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005955	AAGTCG	2	12	623608	623619	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_005955	GGGAGT	2	12	624638	624649	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005955	GAAAAA	2	12	640591	640602	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005955	TTTAAT	2	12	645390	645401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005955	TTTATT	2	12	646174	646185	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005955	GAAAAT	2	12	664981	664992	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005955	TGCCTT	2	12	668050	668061	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_005955	CAATAT	2	12	700162	700173	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_005955	GTGTTT	2	12	700215	700226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005955	AGAATT	2	12	709950	709961	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005955	AGCATT	2	12	715529	715540	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_005955	TAAAGA	2	12	716882	716893	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005955	AACCTT	2	12	726156	726167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_005955	GCTTCC	2	12	730361	730372	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
71	NC_005955	TTCTTA	2	12	731628	731639	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_005955	GAATAT	2	12	749539	749550	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005955	TAACAA	2	12	756182	756193	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_005955	ATAAAA	2	12	761150	761161	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005955	GATTCT	2	12	762183	762194	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_005955	CTGCTT	2	12	771770	771781	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_005955	TTTTCA	2	12	781572	781583	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_005955	ATTTTT	2	12	783203	783214	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005955	AAAAAT	2	12	783221	783232	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005955	TCTGCT	2	12	783667	783678	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_005955	GGCATT	2	12	789463	789474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_005955	TTTTTA	2	12	793896	793907	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005955	TACTAA	2	12	824714	824725	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_005955	TACATT	2	12	826865	826876	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_005955	AGAAAA	2	12	840981	840992	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005955	TTCATT	2	12	901555	901566	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
87	NC_005955	TTGTTT	2	12	918907	918918	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005955	TGCTTT	2	12	925678	925689	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_005955	CAAAAA	2	12	927313	927324	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_005955	AGCAAT	2	12	933563	933574	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_005955	TTAAAA	2	12	941039	941050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005955	ATTCCT	2	12	948784	948795	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_005955	CGTAAA	2	12	976886	976897	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_005955	TTAAAA	2	12	987367	987378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005955	CCAGTT	2	12	999161	999172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_005955	AATCGC	2	12	999255	999266	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_005955	AAGATT	2	12	1040570	1040581	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005955	TCAGAC	2	12	1040622	1040633	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_005955	CCCTAC	2	12	1058191	1058202	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_005955	ACACTA	2	12	1059629	1059640	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_005955	TATGCT	2	12	1072155	1072166	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_005955	CTTTTT	2	12	1072739	1072750	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_005955	GTGAAT	2	12	1074833	1074844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005955	TAAAAA	2	12	1077920	1077931	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005955	CCTTGA	2	12	1083584	1083595	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_005955	TTTATA	2	12	1084168	1084179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005955	AAATAT	2	12	1085678	1085689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005955	CTTGAA	2	12	1101579	1101590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_005955	GAAAGA	2	12	1120227	1120238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005955	TGAAGA	2	12	1122753	1122764	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005955	TAAAAA	2	12	1124079	1124090	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005955	TAAAGA	2	12	1127580	1127591	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005955	AAAAAG	2	12	1142272	1142283	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005955	TGCTTG	2	12	1153074	1153085	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
115	NC_005955	TTTTTC	2	12	1164086	1164097	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_005955	AAAATG	2	12	1165874	1165885	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005955	GATAAA	2	12	1179370	1179381	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005955	AAACGA	2	12	1197459	1197470	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_005955	CTTAAT	2	12	1201410	1201421	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_005955	TCAAAA	2	12	1209877	1209888	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_005955	TACACT	2	12	1210334	1210345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_005955	TACACT	2	12	1213997	1214008	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_005955	TGATCC	2	12	1226954	1226965	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_005955	TTCCTT	2	12	1228649	1228660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_005955	AACGAT	2	12	1232798	1232809	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_005955	TATTTC	2	12	1232994	1233005	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
127	NC_005955	TTCCTT	2	12	1234053	1234064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_005955	ATATTA	2	12	1235182	1235193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005955	AGTGTT	2	12	1271326	1271337	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005955	GCTTTT	2	12	1287256	1287267	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
131	NC_005955	CCTCAT	2	12	1287607	1287618	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_005955	AACCTC	2	12	1287703	1287714	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
133	NC_005955	AAAAGA	2	12	1301066	1301077	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005955	GTATGT	2	12	1306528	1306539	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005955	TTATTT	2	12	1316931	1316942	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005955	TGCGCA	2	12	1319476	1319487	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_005955	CTTCCA	2	12	1356499	1356510	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_005955	AAAAGA	2	12	1357146	1357157	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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145	NC_005955	ATAAAA	2	12	1428319	1428330	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.