MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 plasmid pSAS

Total Repeats: 24

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005951	TACTT	2	10	134	143	20 %	60 %	0 %	20 %	49398099
2	NC_005951	ATGAA	2	10	2555	2564	60 %	20 %	20 %	0 %	49398101
3	NC_005951	TAACG	2	10	4066	4075	40 %	20 %	20 %	20 %	49398103
4	NC_005951	GGTTG	2	10	5991	6000	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005951	AATAT	2	10	6477	6486	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005951	TTAAA	2	10	7018	7027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005951	TGTGA	2	10	8664	8673	20 %	40 %	40 %	0 %	49398107
8	NC_005951	GCTGT	2	10	9205	9214	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_005951	AAAGT	2	10	9887	9896	60 %	20 %	20 %	0 %	49398108
10	NC_005951	AACTA	2	10	10575	10584	60 %	20 %	0 %	20 %	49398109
11	NC_005951	AAATC	2	10	10747	10756	60 %	20 %	0 %	20 %	49398109
12	NC_005951	AAATT	2	10	13013	13022	60 %	40 %	0 %	0 %	49398110
13	NC_005951	ATATT	2	10	13963	13972	40 %	60 %	0 %	0 %	49398111
14	NC_005951	TAATT	2	10	14380	14389	40 %	60 %	0 %	0 %	49398112
15	NC_005951	TTGAG	2	10	14392	14401	20 %	40 %	40 %	0 %	49398112
16	NC_005951	GTATC	2	10	15320	15329	20 %	40 %	20 %	20 %	49398112
17	NC_005951	TATTT	2	10	15330	15339	20 %	80 %	0 %	0 %	49398112
18	NC_005951	TTATG	2	10	15524	15533	20 %	60 %	20 %	0 %	49398112
19	NC_005951	AATTA	2	10	16349	16358	60 %	40 %	0 %	0 %	49398113
20	NC_005951	TGATT	2	10	17609	17618	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005951	AACAA	2	10	17925	17934	80 %	0 %	0 %	20 %	49398114
22	NC_005951	TATTT	2	10	17981	17990	20 %	80 %	0 %	0 %	49398114
23	NC_005951	AAACA	2	10	18301	18310	80 %	0 %	0 %	20 %	49398115
24	NC_005951	ATAAA	2	10	19625	19634	80 %	20 %	0 %	0 %	49398116

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.