MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 plasmid pSAS

Total Repeats: 86

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005951	AAAG	2	8	344	351	75 %	0 %	25 %	0 %	49398099
2	NC_005951	CATA	2	8	659	666	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_005951	TAAG	2	8	988	995	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005951	ATTA	2	8	1124	1131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005951	AGAT	2	8	1364	1371	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005951	AAAG	2	8	1895	1902	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005951	TCAA	2	8	1933	1940	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_005951	GATA	2	8	2045	2052	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005951	TTTG	2	8	2164	2171	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005951	ATTT	2	8	2603	2610	25 %	75 %	0 %	0 %	49398101
11	NC_005951	AGAT	2	8	3233	3240	50 %	25 %	25 %	0 %	49398101
12	NC_005951	AGAA	2	8	3338	3345	75 %	0 %	25 %	0 %	49398101
13	NC_005951	TCCT	2	8	3596	3603	0 %	50 %	0 %	50 %	49398102
14	NC_005951	TTAA	2	8	3654	3661	50 %	50 %	0 %	0 %	49398102
15	NC_005951	TTTC	2	8	3761	3768	0 %	75 %	0 %	25 %	49398102
16	NC_005951	CATT	2	8	3794	3801	25 %	50 %	0 %	25 %	49398102
17	NC_005951	TCAT	2	8	4118	4125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_005951	ATAA	2	8	4246	4253	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005951	ATTT	2	8	4334	4341	25 %	75 %	0 %	0 %	49398104
20	NC_005951	TTTG	2	8	4583	4590	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005951	TTAA	2	8	4668	4675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005951	TCTT	2	8	5059	5066	0 %	75 %	0 %	25 %	49398105
23	NC_005951	TTTA	2	8	5692	5699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005951	ATTT	2	8	6018	6025	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005951	AAAG	2	8	6089	6096	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005951	AAGA	2	8	6125	6132	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005951	TAAA	2	8	6140	6147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005951	TTTA	2	8	6158	6165	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005951	AAAT	2	8	6328	6335	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005951	ATGA	2	8	6339	6346	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005951	AATC	2	8	6491	6498	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_005951	TAAA	2	8	6652	6659	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005951	TAAT	2	8	6702	6709	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005951	TGTA	2	8	6870	6877	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005951	CATT	2	8	6967	6974	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_005951	TTTC	2	8	7336	7343	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_005951	AATT	2	8	7432	7439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005951	TTAT	2	8	7655	7662	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005951	TTAG	2	8	8163	8170	25 %	50 %	25 %	0 %	49398106
40	NC_005951	TGAA	2	8	8308	8315	50 %	25 %	25 %	0 %	49398106
41	NC_005951	TTAC	2	8	8430	8437	25 %	50 %	0 %	25 %	49398106
42	NC_005951	TTTA	2	8	8570	8577	25 %	75 %	0 %	0 %	49398106
43	NC_005951	TATC	2	8	9072	9079	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_005951	TAAT	2	8	9252	9259	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005951	TGGA	2	8	9945	9952	25 %	25 %	50 %	0 %	49398108
46	NC_005951	ATGT	2	8	10063	10070	25 %	50 %	25 %	0 %	49398108
47	NC_005951	TCAT	2	8	10165	10172	25 %	50 %	0 %	25 %	49398108
48	NC_005951	TTAA	2	8	10231	10238	50 %	50 %	0 %	0 %	49398108
49	NC_005951	TAAA	2	8	10418	10425	75 %	25 %	0 %	0 %	49398108
50	NC_005951	ATGA	2	8	10433	10440	50 %	25 %	25 %	0 %	49398108
51	NC_005951	CATA	2	8	10458	10465	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_005951	AATA	2	8	10890	10897	75 %	25 %	0 %	0 %	49398109
53	NC_005951	GTTT	2	8	11110	11117	0 %	75 %	25 %	0 %	49398109
54	NC_005951	TTAA	2	8	11447	11454	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005951	AATG	2	8	11694	11701	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005951	TGAA	2	8	11707	11714	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005951	TTAG	2	8	12783	12790	25 %	50 %	25 %	0 %	49398110
58	NC_005951	TAAG	2	8	12917	12924	50 %	25 %	25 %	0 %	49398110
59	NC_005951	TCGT	2	8	13128	13135	0 %	50 %	25 %	25 %	49398110
60	NC_005951	ATCT	2	8	13181	13188	25 %	50 %	0 %	25 %	49398110
61	NC_005951	CTTA	2	8	13484	13491	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_005951	AAAT	2	8	13818	13825	75 %	25 %	0 %	0 %	49398111
63	NC_005951	TCCA	2	8	14338	14345	25 %	25 %	0 %	50 %	49398112
64	NC_005951	TAAA	2	8	14583	14590	75 %	25 %	0 %	0 %	49398112
65	NC_005951	CTTT	2	8	14626	14633	0 %	75 %	0 %	25 %	49398112
66	NC_005951	TCTT	2	8	14656	14663	0 %	75 %	0 %	25 %	49398112
67	NC_005951	AATT	2	8	14838	14845	50 %	50 %	0 %	0 %	49398112
68	NC_005951	ATTA	2	8	14877	14884	50 %	50 %	0 %	0 %	49398112
69	NC_005951	AATG	2	8	14917	14924	50 %	25 %	25 %	0 %	49398112
70	NC_005951	TCTT	2	8	15059	15066	0 %	75 %	0 %	25 %	49398112
71	NC_005951	ACTT	2	8	15548	15555	25 %	50 %	0 %	25 %	49398112
72	NC_005951	AGCA	2	8	15633	15640	50 %	0 %	25 %	25 %	49398112
73	NC_005951	TAAA	2	8	16118	16125	75 %	25 %	0 %	0 %	49398113
74	NC_005951	TAAA	2	8	16415	16422	75 %	25 %	0 %	0 %	49398113
75	NC_005951	TTAA	2	8	16504	16511	50 %	50 %	0 %	0 %	49398113
76	NC_005951	ATTT	2	8	16837	16844	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005951	ATAA	2	8	16892	16899	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005951	ATTA	2	8	17066	17073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005951	ATTG	2	8	17277	17284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005951	CAAT	2	8	17538	17545	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_005951	AACG	2	8	17749	17756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_005951	TATT	2	8	17848	17855	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005951	ATAA	3	12	18003	18014	75 %	25 %	0 %	0 %	49398114
84	NC_005951	TCAT	2	8	19070	19077	25 %	50 %	0 %	25 %	49398116
85	NC_005951	TTAA	2	8	19450	19457	50 %	50 %	0 %	0 %	49398116
86	NC_005951	GGAT	2	8	19693	19700	25 %	25 %	50 %	0 %	49398116

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.