MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 plasmid pSAS

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005951	AT	4	8	183	190	50 %	50 %	0 %	0 %	49398099
2	NC_005951	AT	3	6	2223	2228	50 %	50 %	0 %	0 %	49398100
3	NC_005951	GA	3	6	2534	2539	50 %	0 %	50 %	0 %	49398101
4	NC_005951	TA	3	6	2546	2551	50 %	50 %	0 %	0 %	49398101
5	NC_005951	AG	3	6	3502	3507	50 %	0 %	50 %	0 %	49398102
6	NC_005951	AT	3	6	3541	3546	50 %	50 %	0 %	0 %	49398102
7	NC_005951	AG	4	8	3705	3712	50 %	0 %	50 %	0 %	49398102
8	NC_005951	AT	3	6	3927	3932	50 %	50 %	0 %	0 %	49398103
9	NC_005951	CT	3	6	4138	4143	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_005951	GA	3	6	4161	4166	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005951	TC	3	6	4192	4197	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_005951	TA	3	6	4234	4239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005951	AT	3	6	4830	4835	50 %	50 %	0 %	0 %	49398105
14	NC_005951	CT	3	6	5018	5023	0 %	50 %	0 %	50 %	49398105
15	NC_005951	TA	3	6	5698	5703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005951	TA	3	6	5721	5726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005951	AT	3	6	5915	5920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005951	AT	3	6	6052	6057	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005951	CA	3	6	6916	6921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_005951	AT	3	6	7183	7188	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005951	TA	3	6	7220	7225	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005951	AG	3	6	8290	8295	50 %	0 %	50 %	0 %	49398106
23	NC_005951	TA	3	6	8556	8561	50 %	50 %	0 %	0 %	49398106
24	NC_005951	TG	3	6	8815	8820	0 %	50 %	50 %	0 %	49398107
25	NC_005951	TA	3	6	8884	8889	50 %	50 %	0 %	0 %	49398107
26	NC_005951	AG	3	6	8958	8963	50 %	0 %	50 %	0 %	49398107
27	NC_005951	TA	3	6	9043	9048	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005951	TC	3	6	9119	9124	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_005951	AG	3	6	9143	9148	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005951	AT	3	6	9426	9431	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005951	AT	3	6	9462	9467	50 %	50 %	0 %	0 %	49398108
32	NC_005951	TA	3	6	9756	9761	50 %	50 %	0 %	0 %	49398108
33	NC_005951	CA	3	6	10090	10095	50 %	0 %	0 %	50 %	49398108
34	NC_005951	TA	3	6	10464	10469	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005951	AT	3	6	10489	10494	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005951	AT	3	6	10781	10786	50 %	50 %	0 %	0 %	49398109
37	NC_005951	AT	3	6	10990	10995	50 %	50 %	0 %	0 %	49398109
38	NC_005951	TA	3	6	11087	11092	50 %	50 %	0 %	0 %	49398109
39	NC_005951	AC	3	6	11595	11600	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_005951	TA	3	6	11929	11934	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005951	CA	3	6	12117	12122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_005951	GA	3	6	12400	12405	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005951	AT	3	6	14930	14935	50 %	50 %	0 %	0 %	49398112
44	NC_005951	AT	3	6	15175	15180	50 %	50 %	0 %	0 %	49398112
45	NC_005951	TA	3	6	16877	16882	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005951	AT	3	6	17001	17006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005951	AG	3	6	17381	17386	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005951	TA	3	6	17443	17448	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005951	AG	3	6	17715	17720	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005951	CT	4	8	17731	17738	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_005951	TA	3	6	17816	17821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005951	TA	4	8	17913	17920	50 %	50 %	0 %	0 %	49398114
53	NC_005951	AT	3	6	18333	18338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005951	AG	3	6	18727	18732	50 %	0 %	50 %	0 %	49398116
55	NC_005951	AT	3	6	19061	19066	50 %	50 %	0 %	0 %	49398116
56	NC_005951	AT	4	8	19334	19341	50 %	50 %	0 %	0 %	49398116
57	NC_005951	AT	3	6	19439	19444	50 %	50 %	0 %	0 %	49398116

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.