MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus MSSA476 plasmid pSAS

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005951	A	7	7	38	44	100 %	0 %	0 %	0 %	49398099
2	NC_005951	A	6	6	206	211	100 %	0 %	0 %	0 %	49398099
3	NC_005951	A	6	6	324	329	100 %	0 %	0 %	0 %	49398099
4	NC_005951	A	6	6	359	364	100 %	0 %	0 %	0 %	49398099
5	NC_005951	A	6	6	670	675	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005951	T	6	6	709	714	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005951	T	6	6	741	746	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005951	A	6	6	755	760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005951	A	7	7	1044	1050	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005951	A	7	7	1066	1072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005951	T	6	6	1146	1151	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005951	T	6	6	1182	1187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005951	A	6	6	1341	1346	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005951	A	6	6	1468	1473	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005951	A	7	7	1766	1772	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005951	T	6	6	2182	2187	0 %	100 %	0 %	0 %	49398100
17	NC_005951	T	6	6	2608	2613	0 %	100 %	0 %	0 %	49398101
18	NC_005951	A	7	7	2676	2682	100 %	0 %	0 %	0 %	49398101
19	NC_005951	A	6	6	3148	3153	100 %	0 %	0 %	0 %	49398101
20	NC_005951	T	6	6	3354	3359	0 %	100 %	0 %	0 %	49398101
21	NC_005951	A	6	6	3678	3683	100 %	0 %	0 %	0 %	49398102
22	NC_005951	T	6	6	3999	4004	0 %	100 %	0 %	0 %	49398103
23	NC_005951	T	6	6	4033	4038	0 %	100 %	0 %	0 %	49398103
24	NC_005951	A	6	6	4630	4635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005951	T	6	6	4908	4913	0 %	100 %	0 %	0 %	49398105
26	NC_005951	T	8	8	5212	5219	0 %	100 %	0 %	0 %	49398105
27	NC_005951	T	6	6	5283	5288	0 %	100 %	0 %	0 %	49398105
28	NC_005951	T	6	6	5593	5598	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005951	A	6	6	5772	5777	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005951	T	6	6	5898	5903	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005951	A	6	6	6066	6071	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005951	A	6	6	6577	6582	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005951	T	7	7	6816	6822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005951	T	6	6	6828	6833	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005951	A	7	7	6836	6842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005951	A	6	6	7136	7141	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005951	A	6	6	7298	7303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005951	C	7	7	7310	7316	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_005951	A	6	6	7368	7373	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005951	A	7	7	7487	7493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005951	T	6	6	8085	8090	0 %	100 %	0 %	0 %	49398106
42	NC_005951	A	6	6	8298	8303	100 %	0 %	0 %	0 %	49398106
43	NC_005951	T	6	6	8711	8716	0 %	100 %	0 %	0 %	49398107
44	NC_005951	A	6	6	8755	8760	100 %	0 %	0 %	0 %	49398107
45	NC_005951	A	6	6	9031	9036	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005951	A	6	6	9284	9289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005951	T	6	6	9445	9450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005951	A	6	6	9808	9813	100 %	0 %	0 %	0 %	49398108
49	NC_005951	A	8	8	9981	9988	100 %	0 %	0 %	0 %	49398108
50	NC_005951	A	7	7	9990	9996	100 %	0 %	0 %	0 %	49398108
51	NC_005951	T	6	6	10032	10037	0 %	100 %	0 %	0 %	49398108
52	NC_005951	A	6	6	10215	10220	100 %	0 %	0 %	0 %	49398108
53	NC_005951	A	6	6	10245	10250	100 %	0 %	0 %	0 %	49398108
54	NC_005951	A	7	7	10313	10319	100 %	0 %	0 %	0 %	49398108
55	NC_005951	T	6	6	10866	10871	0 %	100 %	0 %	0 %	49398109
56	NC_005951	T	6	6	11392	11397	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005951	T	7	7	11435	11441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005951	G	6	6	12190	12195	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005951	T	6	6	12758	12763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005951	T	6	6	13445	13450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005951	T	6	6	13856	13861	0 %	100 %	0 %	0 %	49398111
62	NC_005951	T	6	6	13952	13957	0 %	100 %	0 %	0 %	49398111
63	NC_005951	T	6	6	14045	14050	0 %	100 %	0 %	0 %	49398112
64	NC_005951	T	6	6	14256	14261	0 %	100 %	0 %	0 %	49398112
65	NC_005951	A	7	7	14808	14814	100 %	0 %	0 %	0 %	49398112
66	NC_005951	T	6	6	14904	14909	0 %	100 %	0 %	0 %	49398112
67	NC_005951	T	8	8	15295	15302	0 %	100 %	0 %	0 %	49398112
68	NC_005951	T	7	7	15337	15343	0 %	100 %	0 %	0 %	49398112
69	NC_005951	A	6	6	15702	15707	100 %	0 %	0 %	0 %	49398112
70	NC_005951	A	8	8	15965	15972	100 %	0 %	0 %	0 %	49398113
71	NC_005951	A	6	6	16123	16128	100 %	0 %	0 %	0 %	49398113
72	NC_005951	A	6	6	16282	16287	100 %	0 %	0 %	0 %	49398113
73	NC_005951	A	6	6	16375	16380	100 %	0 %	0 %	0 %	49398113
74	NC_005951	A	8	8	16447	16454	100 %	0 %	0 %	0 %	49398113
75	NC_005951	A	6	6	16884	16889	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005951	T	6	6	16969	16974	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005951	A	6	6	17170	17175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005951	A	6	6	17947	17952	100 %	0 %	0 %	0 %	49398114
79	NC_005951	A	6	6	18406	18411	100 %	0 %	0 %	0 %	49398116
80	NC_005951	A	6	6	18634	18639	100 %	0 %	0 %	0 %	49398116
81	NC_005951	T	6	6	18643	18648	0 %	100 %	0 %	0 %	49398116
82	NC_005951	A	7	7	18795	18801	100 %	0 %	0 %	0 %	49398116
83	NC_005951	T	6	6	18847	18852	0 %	100 %	0 %	0 %	49398116
84	NC_005951	A	6	6	19222	19227	100 %	0 %	0 %	0 %	49398116
85	NC_005951	T	6	6	19290	19295	0 %	100 %	0 %	0 %	49398116
86	NC_005951	A	6	6	19349	19354	100 %	0 %	0 %	0 %	49398116
87	NC_005951	T	6	6	19549	19554	0 %	100 %	0 %	0 %	49398116
88	NC_005951	A	7	7	19679	19685	100 %	0 %	0 %	0 %	49398116
89	NC_005951	A	6	6	19723	19728	100 %	0 %	0 %	0 %	49398116
90	NC_005951	A	6	6	19749	19754	100 %	0 %	0 %	0 %	49398116
91	NC_005951	T	6	6	19763	19768	0 %	100 %	0 %	0 %	49398116
92	NC_005951	A	7	7	20522	20528	100 %	0 %	0 %	0 %	49398117
93	NC_005951	T	6	6	20544	20549	0 %	100 %	0 %	0 %	49398117

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.