MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Mycobacterium ulcerans AGY99 plasmid pMUM001

Total Repeats: 380

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005916	TGCT	2	8	809	816	0 %	50 %	25 %	25 %	49146085
2	NC_005916	AAAC	2	8	913	920	75 %	0 %	0 %	25 %	49146085
3	NC_005916	GCCG	2	8	955	962	0 %	0 %	50 %	50 %	49146085
4	NC_005916	AGCG	2	8	1065	1072	25 %	0 %	50 %	25 %	49146085
5	NC_005916	GATC	2	8	1182	1189	25 %	25 %	25 %	25 %	49146086
6	NC_005916	GTAA	2	8	1643	1650	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005916	TTAC	2	8	1718	1725	25 %	50 %	0 %	25 %	49146087
8	NC_005916	TCAC	2	8	1966	1973	25 %	25 %	0 %	50 %	49146087
9	NC_005916	CTCG	2	8	2084	2091	0 %	25 %	25 %	50 %	49146087
10	NC_005916	TCCT	2	8	2317	2324	0 %	50 %	0 %	50 %	49146088
11	NC_005916	GGCC	2	8	2689	2696	0 %	0 %	50 %	50 %	49146088
12	NC_005916	TGCG	2	8	2702	2709	0 %	25 %	50 %	25 %	49146088
13	NC_005916	GACG	2	8	3556	3563	25 %	0 %	50 %	25 %	49146089
14	NC_005916	CGGA	2	8	3593	3600	25 %	0 %	50 %	25 %	49146089
15	NC_005916	CGCA	2	8	4772	4779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005916	ACCC	2	8	5170	5177	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
17	NC_005916	GTGG	2	8	5329	5336	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005916	GGCC	2	8	5388	5395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_005916	GGGT	2	8	5449	5456	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005916	ACTT	2	8	5638	5645	25 %	50 %	0 %	25 %	49146090
21	NC_005916	GATC	2	8	6218	6225	25 %	25 %	25 %	25 %	49146090
22	NC_005916	GCTT	2	8	6674	6681	0 %	50 %	25 %	25 %	49146092
23	NC_005916	GCCA	2	8	7230	7237	25 %	0 %	25 %	50 %	49146093
24	NC_005916	CGAT	2	8	8237	8244	25 %	25 %	25 %	25 %	49146094
25	NC_005916	GGAG	2	8	8298	8305	25 %	0 %	75 %	0 %	49146094
26	NC_005916	GGTC	2	8	9134	9141	0 %	25 %	50 %	25 %	49146095
27	NC_005916	GGTT	2	8	9484	9491	0 %	50 %	50 %	0 %	49146095
28	NC_005916	ACTG	2	8	9527	9534	25 %	25 %	25 %	25 %	49146095
29	NC_005916	CCGG	2	8	9611	9618	0 %	0 %	50 %	50 %	49146095
30	NC_005916	GCTG	2	8	9715	9722	0 %	25 %	50 %	25 %	49146095
31	NC_005916	AACA	2	8	9982	9989	75 %	0 %	0 %	25 %	49146095
32	NC_005916	ACCG	2	8	10230	10237	25 %	0 %	25 %	50 %	49146095
33	NC_005916	CAAG	2	8	10270	10277	50 %	0 %	25 %	25 %	49146095
34	NC_005916	ATCG	2	8	10485	10492	25 %	25 %	25 %	25 %	49146096
35	NC_005916	TGCG	2	8	10926	10933	0 %	25 %	50 %	25 %	49146097
36	NC_005916	GCTG	2	8	11478	11485	0 %	25 %	50 %	25 %	49146098
37	NC_005916	GGGT	2	8	11546	11553	0 %	25 %	75 %	0 %	49146098
38	NC_005916	GACG	2	8	11719	11726	25 %	0 %	50 %	25 %	49146098
39	NC_005916	CTGC	2	8	11925	11932	0 %	25 %	25 %	50 %	49146099
40	NC_005916	GCGG	2	8	12168	12175	0 %	0 %	75 %	25 %	49146099
41	NC_005916	GGCG	2	8	12188	12195	0 %	0 %	75 %	25 %	49146099
42	NC_005916	TCGG	2	8	12298	12305	0 %	25 %	50 %	25 %	49146099
43	NC_005916	CGGC	2	8	12386	12393	0 %	0 %	50 %	50 %	49146099
44	NC_005916	CAGC	2	8	12545	12552	25 %	0 %	25 %	50 %	49146099
45	NC_005916	CCAA	2	8	13137	13144	50 %	0 %	0 %	50 %	49146100
46	NC_005916	GCTG	2	8	14258	14265	0 %	25 %	50 %	25 %	49146102
47	NC_005916	CGGT	2	8	14310	14317	0 %	25 %	50 %	25 %	49146102
48	NC_005916	CAGC	2	8	14707	14714	25 %	0 %	25 %	50 %	49146102
49	NC_005916	GCGG	2	8	15009	15016	0 %	0 %	75 %	25 %	49146102
50	NC_005916	GCCT	2	8	15073	15080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_005916	CAAA	2	8	15104	15111	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_005916	TGCA	2	8	15380	15387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_005916	GTCG	2	8	15453	15460	0 %	25 %	50 %	25 %	49146103
54	NC_005916	ACCC	2	8	15513	15520	25 %	0 %	0 %	75 %	49146103
55	NC_005916	GCAC	2	8	16144	16151	25 %	0 %	25 %	50 %	49146103
56	NC_005916	CGCA	2	8	16341	16348	25 %	0 %	25 %	50 %	49146103
57	NC_005916	CCGA	2	8	16481	16488	25 %	0 %	25 %	50 %	49146104
58	NC_005916	CGCT	2	8	16897	16904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_005916	GCAC	2	8	16983	16990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_005916	GAGC	2	8	17002	17009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_005916	ATCT	2	8	17111	17118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_005916	TGCG	2	8	17607	17614	0 %	25 %	50 %	25 %	49146106
63	NC_005916	GGCA	2	8	17646	17653	25 %	0 %	50 %	25 %	49146106
64	NC_005916	CCGG	2	8	17931	17938	0 %	0 %	50 %	50 %	49146106
65	NC_005916	CTGG	2	8	18027	18034	0 %	25 %	50 %	25 %	49146106
66	NC_005916	AAGG	2	8	18381	18388	50 %	0 %	50 %	0 %	49146106
67	NC_005916	CAGA	2	8	18648	18655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_005916	GGGT	2	8	18830	18837	0 %	25 %	75 %	0 %	49146107
69	NC_005916	CGTT	2	8	19777	19784	0 %	50 %	25 %	25 %	49146108
70	NC_005916	CTGC	2	8	20871	20878	0 %	25 %	25 %	50 %	49146109
71	NC_005916	GCAC	2	8	20997	21004	25 %	0 %	25 %	50 %	49146109
72	NC_005916	CACC	2	8	21695	21702	25 %	0 %	0 %	75 %	49146109
73	NC_005916	TGCG	2	8	22949	22956	0 %	25 %	50 %	25 %	49146110
74	NC_005916	GGCA	2	8	22988	22995	25 %	0 %	50 %	25 %	49146110
75	NC_005916	CCCG	2	8	23194	23201	0 %	0 %	25 %	75 %	49146110
76	NC_005916	CCGG	2	8	23273	23280	0 %	0 %	50 %	50 %	49146110
77	NC_005916	CTGG	2	8	23369	23376	0 %	25 %	50 %	25 %	49146110
78	NC_005916	AAGG	2	8	23723	23730	50 %	0 %	50 %	0 %	49146110
79	NC_005916	CAGA	2	8	23990	23997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_005916	AGGT	2	8	24391	24398	25 %	25 %	50 %	0 %	49146111
81	NC_005916	GCCC	2	8	24519	24526	0 %	0 %	25 %	75 %	49146111
82	NC_005916	ACCG	2	8	24758	24765	25 %	0 %	25 %	50 %	49146111
83	NC_005916	GAAC	2	8	25031	25038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_005916	GCGT	2	8	26648	26655	0 %	25 %	50 %	25 %	49146112
85	NC_005916	GCAG	2	8	26776	26783	25 %	0 %	50 %	25 %	49146112
86	NC_005916	GGGC	2	8	27248	27255	0 %	0 %	75 %	25 %	49146113
87	NC_005916	TTGG	2	8	27499	27506	0 %	50 %	50 %	0 %	49146114
88	NC_005916	GTCT	2	8	28351	28358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_005916	CCTT	2	8	28619	28626	0 %	50 %	0 %	50 %	49146115
90	NC_005916	GCCA	2	8	28972	28979	25 %	0 %	25 %	50 %	49146115
91	NC_005916	CCGG	2	8	29069	29076	0 %	0 %	50 %	50 %	49146115
92	NC_005916	GCGG	2	8	29147	29154	0 %	0 %	75 %	25 %	49146115
93	NC_005916	CGGT	2	8	29185	29192	0 %	25 %	50 %	25 %	49146115
94	NC_005916	TGCC	2	8	29354	29361	0 %	25 %	25 %	50 %	49146115
95	NC_005916	CGCA	2	8	29393	29400	25 %	0 %	25 %	50 %	49146115
96	NC_005916	CTCA	2	8	30053	30060	25 %	25 %	0 %	50 %	49146116
97	NC_005916	AGCT	2	8	30423	30430	25 %	25 %	25 %	25 %	49146116
98	NC_005916	TGAA	2	8	30579	30586	50 %	25 %	25 %	0 %	49146116
99	NC_005916	ATCG	2	8	30780	30787	25 %	25 %	25 %	25 %	49146116
100	NC_005916	GTGA	2	8	32211	32218	25 %	25 %	50 %	0 %	49146116
101	NC_005916	GTGG	2	8	32673	32680	0 %	25 %	75 %	0 %	49146116
102	NC_005916	CCGG	2	8	33372	33379	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
103	NC_005916	GGGC	2	8	33526	33533	0 %	0 %	75 %	25 %	49146116
104	NC_005916	GGCG	2	8	33824	33831	0 %	0 %	75 %	25 %	49146116
105	NC_005916	GGGT	2	8	33863	33870	0 %	25 %	75 %	0 %	49146116
106	NC_005916	TGAC	2	8	33946	33953	25 %	25 %	25 %	25 %	49146116
107	NC_005916	ATCG	2	8	34722	34729	25 %	25 %	25 %	25 %	49146116
108	NC_005916	GTGA	2	8	37608	37615	25 %	25 %	50 %	0 %	49146116
109	NC_005916	GTGG	2	8	38070	38077	0 %	25 %	75 %	0 %	49146116
110	NC_005916	CCGG	2	8	38769	38776	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
111	NC_005916	GGGC	2	8	38923	38930	0 %	0 %	75 %	25 %	49146116
112	NC_005916	GGTC	2	8	39557	39564	0 %	25 %	50 %	25 %	49146116
113	NC_005916	ATCG	2	8	40119	40126	25 %	25 %	25 %	25 %	49146116
114	NC_005916	GTGA	2	8	43005	43012	25 %	25 %	50 %	0 %	49146116
115	NC_005916	GTGG	2	8	43467	43474	0 %	25 %	75 %	0 %	49146116
116	NC_005916	CCGG	2	8	44166	44173	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
117	NC_005916	GGGC	2	8	44320	44327	0 %	0 %	75 %	25 %	49146116
118	NC_005916	GGTC	2	8	44954	44961	0 %	25 %	50 %	25 %	49146116
119	NC_005916	ATCG	2	8	45516	45523	25 %	25 %	25 %	25 %	49146116
120	NC_005916	GTGA	2	8	48402	48409	25 %	25 %	50 %	0 %	49146116
121	NC_005916	GTGG	2	8	48864	48871	0 %	25 %	75 %	0 %	49146116
122	NC_005916	CCGG	2	8	49563	49570	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
123	NC_005916	GGGC	2	8	49717	49724	0 %	0 %	75 %	25 %	49146116
124	NC_005916	GGCG	2	8	50015	50022	0 %	0 %	75 %	25 %	49146116
125	NC_005916	GGGT	2	8	50054	50061	0 %	25 %	75 %	0 %	49146116
126	NC_005916	TGAC	2	8	50137	50144	25 %	25 %	25 %	25 %	49146116
127	NC_005916	ATCG	2	8	50913	50920	25 %	25 %	25 %	25 %	49146116
128	NC_005916	GTGA	2	8	53799	53806	25 %	25 %	50 %	0 %	49146116
129	NC_005916	GTGG	2	8	54261	54268	0 %	25 %	75 %	0 %	49146116
130	NC_005916	CCGG	2	8	54960	54967	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
131	NC_005916	GGGC	2	8	55114	55121	0 %	0 %	75 %	25 %	49146116
132	NC_005916	GGTC	2	8	55748	55755	0 %	25 %	50 %	25 %	49146116
133	NC_005916	ATCG	2	8	56310	56317	25 %	25 %	25 %	25 %	49146116
134	NC_005916	TTGC	2	8	58235	58242	0 %	50 %	25 %	25 %	49146116
135	NC_005916	GCGA	2	8	58411	58418	25 %	0 %	50 %	25 %	49146116
136	NC_005916	TTGC	2	8	59207	59214	0 %	50 %	25 %	25 %	49146116
137	NC_005916	GCTG	2	8	59949	59956	0 %	25 %	50 %	25 %	49146116
138	NC_005916	ATGA	2	8	60179	60186	50 %	25 %	25 %	0 %	49146116
139	NC_005916	GCTG	2	8	60347	60354	0 %	25 %	50 %	25 %	49146116
140	NC_005916	GCCA	2	8	60450	60457	25 %	0 %	25 %	50 %	49146116
141	NC_005916	ATCG	2	8	60883	60890	25 %	25 %	25 %	25 %	49146116
142	NC_005916	TTGC	2	8	62852	62859	0 %	50 %	25 %	25 %	49146116
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.