MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium ulcerans AGY99 plasmid pMUM001

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005916	GTAA	2	8	1643	1650	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005916	CGCA	2	8	4772	4779	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_005916	ACCC	2	8	5170	5177	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
4	NC_005916	GTGG	2	8	5329	5336	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005916	GGCC	2	8	5388	5395	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_005916	GGGT	2	8	5449	5456	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005916	GCCT	2	8	15073	15080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_005916	CAAA	2	8	15104	15111	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_005916	TGCA	2	8	15380	15387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_005916	CGCT	2	8	16897	16904	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_005916	GCAC	2	8	16983	16990	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_005916	GAGC	2	8	17002	17009	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_005916	ATCT	2	8	17111	17118	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_005916	CAGA	2	8	18648	18655	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_005916	CAGA	2	8	23990	23997	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_005916	GAAC	2	8	25031	25038	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_005916	GTCT	2	8	28351	28358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
18	NC_005916	TTAA	2	8	72472	72479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005916	CCAC	2	8	72966	72973	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
20	NC_005916	AGGA	2	8	74122	74129	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005916	GTCT	2	8	74870	74877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_005916	CGGG	2	8	76525	76532	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
23	NC_005916	CGGC	2	8	77925	77932	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_005916	GCCG	2	8	77972	77979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_005916	AAAT	2	8	79057	79064	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005916	TTAA	2	8	137297	137304	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005916	CCAC	2	8	137791	137798	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_005916	AGGA	2	8	138947	138954	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005916	AGTG	2	8	141658	141665	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005916	TGAT	2	8	141817	141824	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005916	TCGG	2	8	144177	144184	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_005916	CAGA	2	8	146021	146028	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_005916	CCAG	2	8	147450	147457	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
34	NC_005916	CAGA	2	8	150684	150691	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_005916	CGTC	2	8	151257	151264	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_005916	GGTT	2	8	152249	152256	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005916	CAGA	2	8	156509	156516	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_005916	GCTC	2	8	158461	158468	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_005916	CTCA	2	8	162391	162398	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_005916	GTCT	2	8	162410	162417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_005916	AGAA	2	8	173736	173743	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.