MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mycobacterium ulcerans AGY99 plasmid pMUM001

Total Repeats: 2747

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005916	CGG	2	6	156	161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146085
2	NC_005916	CGC	2	6	189	194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
3	NC_005916	CAA	2	6	246	251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146085
4	NC_005916	CCA	2	6	276	281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146085
5	NC_005916	TGC	2	6	338	343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146085
6	NC_005916	GCC	2	6	347	352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
7	NC_005916	CCT	2	6	377	382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146085
8	NC_005916	TAC	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146085
9	NC_005916	GCG	2	6	563	568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146085
10	NC_005916	CGC	2	6	574	579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
11	NC_005916	TCG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146085
12	NC_005916	CGC	2	6	963	968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
13	NC_005916	CCA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146085
14	NC_005916	GCC	2	6	991	996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
15	NC_005916	TGC	2	6	1002	1007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146085
16	NC_005916	GCT	4	12	1009	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146085
17	NC_005916	CGC	2	6	1026	1031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
18	NC_005916	GCG	2	6	1078	1083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146085
19	NC_005916	CGG	2	6	1087	1092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146085
20	NC_005916	CAG	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146086
21	NC_005916	AGC	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146086
22	NC_005916	TGC	2	6	1153	1158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146086
23	NC_005916	TGC	2	6	1193	1198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146086
24	NC_005916	CGC	2	6	1230	1235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146086
25	NC_005916	GCC	3	9	1268	1276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146086
26	NC_005916	TGG	2	6	1293	1298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146086
27	NC_005916	TCG	2	6	1456	1461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_005916	GGC	2	6	1472	1477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_005916	GCA	2	6	1498	1503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_005916	CTG	2	6	1507	1512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_005916	GCC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_005916	GCG	2	6	1687	1692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_005916	CCT	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146087
34	NC_005916	AGC	2	6	1844	1849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146087
35	NC_005916	CAA	2	6	1877	1882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146087
36	NC_005916	GAA	2	6	1941	1946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49146087
37	NC_005916	ACA	2	6	1978	1983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146087
38	NC_005916	TGG	2	6	2021	2026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146087
39	NC_005916	GCC	2	6	2028	2033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146087
40	NC_005916	CGC	2	6	2050	2055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146087
41	NC_005916	CGA	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146087
42	NC_005916	CAG	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146087
43	NC_005916	GAC	2	6	2189	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146087
44	NC_005916	ATC	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146087
45	NC_005916	CAC	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146087
46	NC_005916	CAG	2	6	2299	2304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_005916	CCT	2	6	2408	2413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146088
48	NC_005916	CGG	2	6	2420	2425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146088
49	NC_005916	CCA	2	6	2452	2457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146088
50	NC_005916	GAT	2	6	2532	2537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49146088
51	NC_005916	CCG	2	6	2660	2665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146088
52	NC_005916	GGC	2	6	2718	2723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146088
53	NC_005916	CAG	2	6	2786	2791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146088
54	NC_005916	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146088
55	NC_005916	GAC	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146089
56	NC_005916	ATT	2	6	3083	3088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49146089
57	NC_005916	TTC	3	9	3216	3224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49146089
58	NC_005916	TCG	2	6	3241	3246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146089
59	NC_005916	ACA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146089
60	NC_005916	GCC	2	6	3402	3407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146089
61	NC_005916	GAA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49146089
62	NC_005916	AAC	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146089
63	NC_005916	GTC	2	6	3662	3667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146089
64	NC_005916	GCG	2	6	3762	3767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146089
65	NC_005916	GTC	2	6	3872	3877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146089
66	NC_005916	CGT	2	6	4140	4145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_005916	GCC	2	6	4163	4168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_005916	GCA	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_005916	ATG	2	6	4456	4461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005916	CAT	2	6	4547	4552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_005916	GCA	2	6	4795	4800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_005916	GAC	2	6	4866	4871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_005916	ACT	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_005916	GCA	2	6	4891	4896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_005916	GCA	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_005916	GCT	2	6	4997	5002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_005916	CGG	2	6	5096	5101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_005916	CGG	2	6	5162	5167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_005916	CAG	2	6	5233	5238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_005916	TGG	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005916	GTC	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_005916	TGA	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005916	TGG	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005916	TGG	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005916	TGG	2	6	5502	5507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005916	TGC	2	6	5514	5519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_005916	GCA	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_005916	CGC	2	6	5595	5600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_005916	CGC	2	6	5612	5617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_005916	TCG	2	6	5665	5670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146090
91	NC_005916	CTC	2	6	5679	5684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146090
92	NC_005916	CAC	2	6	5700	5705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146090
93	NC_005916	CGG	2	6	5706	5711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
94	NC_005916	CGG	2	6	5739	5744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
95	NC_005916	CCA	2	6	5745	5750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146090
96	NC_005916	CCG	2	6	5751	5756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146090
97	NC_005916	TGC	2	6	5851	5856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146090
98	NC_005916	GGC	2	6	5899	5904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
99	NC_005916	TCG	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146090
100	NC_005916	GCC	2	6	6094	6099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146090
101	NC_005916	CGG	2	6	6122	6127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
102	NC_005916	TTC	2	6	6159	6164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49146090
103	NC_005916	CGG	2	6	6290	6295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
104	NC_005916	GCG	2	6	6322	6327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
105	NC_005916	CGG	3	9	6341	6349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
106	NC_005916	GCT	2	6	6365	6370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146090
107	NC_005916	TGG	2	6	6505	6510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146091
108	NC_005916	TGC	2	6	6519	6524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146091
109	NC_005916	CAT	2	6	6551	6556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146091
110	NC_005916	TCG	2	6	6573	6578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146091
111	NC_005916	GCA	2	6	6606	6611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_005916	TCT	2	6	6659	6664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49146092
113	NC_005916	GCG	2	6	6753	6758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146092
114	NC_005916	CTC	2	6	6765	6770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146092
115	NC_005916	GCT	3	9	6772	6780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146092
116	NC_005916	GCG	2	6	6781	6786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146092
117	NC_005916	GCC	2	6	6906	6911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146092
118	NC_005916	CGA	2	6	7001	7006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146092
119	NC_005916	GCT	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146092
120	NC_005916	GGC	2	6	7050	7055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146092
121	NC_005916	ATC	2	6	7075	7080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146092
122	NC_005916	GCT	2	6	7144	7149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146092
123	NC_005916	CCT	2	6	7171	7176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_005916	GTC	2	6	7247	7252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146093
125	NC_005916	TCG	2	6	7308	7313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146093
126	NC_005916	CAG	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146093
127	NC_005916	CCG	2	6	7368	7373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146093
128	NC_005916	GGC	2	6	7401	7406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146093
129	NC_005916	CGG	2	6	7419	7424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146093
130	NC_005916	CCG	2	6	7432	7437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146093
131	NC_005916	TGG	2	6	7438	7443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146093
132	NC_005916	GCG	2	6	7492	7497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146093
133	NC_005916	GTG	2	6	7630	7635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146094
134	NC_005916	CGA	2	6	7653	7658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146094
135	NC_005916	ACA	2	6	7688	7693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146094
136	NC_005916	CGG	2	6	7772	7777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146094
137	NC_005916	CCA	2	6	7785	7790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146094
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139	NC_005916	GCG	2	6	7885	7890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146094
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141	NC_005916	GCC	2	6	8031	8036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146094
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263	NC_005916	TCG	2	6	14442	14447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146102
264	NC_005916	ATG	2	6	14475	14480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49146102
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266	NC_005916	CGA	2	6	14578	14583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146102
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270	NC_005916	TGG	2	6	14800	14805	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146102
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