MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium ulcerans AGY99 plasmid pMUM001

Total Repeats: 182

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005916	TCG	2	6	1456	1461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_005916	GGC	2	6	1472	1477	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005916	GCA	2	6	1498	1503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_005916	CTG	2	6	1507	1512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_005916	GCC	2	6	1609	1614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_005916	GCG	2	6	1687	1692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_005916	CAG	2	6	2299	2304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_005916	CGT	2	6	4140	4145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_005916	GCC	2	6	4163	4168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_005916	GCA	2	6	4427	4432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_005916	ATG	2	6	4456	4461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005916	CAT	2	6	4547	4552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_005916	GCA	2	6	4795	4800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_005916	GAC	2	6	4866	4871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_005916	ACT	2	6	4884	4889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_005916	GCA	2	6	4891	4896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_005916	GCA	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_005916	GCT	2	6	4997	5002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_005916	CGG	2	6	5096	5101	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_005916	CGG	2	6	5162	5167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_005916	CAG	2	6	5233	5238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_005916	TGG	2	6	5310	5315	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005916	GTC	2	6	5361	5366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_005916	TGA	2	6	5370	5375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005916	TGG	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005916	TGG	2	6	5442	5447	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005916	TGG	2	6	5502	5507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005916	TGC	2	6	5514	5519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_005916	GCA	2	6	5568	5573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_005916	CGC	2	6	5595	5600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_005916	CGC	2	6	5612	5617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_005916	GCA	2	6	6606	6611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_005916	CCT	2	6	7171	7176	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
34	NC_005916	GCC	2	6	15196	15201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_005916	TTA	2	6	15249	15254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005916	CGC	2	6	17074	17079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_005916	GGC	2	6	17084	17089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_005916	TGC	2	6	17097	17102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_005916	CGC	2	6	18629	18634	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_005916	GGC	2	6	18665	18670	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_005916	TGG	2	6	18712	18717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005916	GAA	2	6	18758	18763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005916	CCA	2	6	20063	20068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_005916	GCC	2	6	20124	20129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_005916	GCG	2	6	20182	20187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_005916	TCG	2	6	20348	20353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_005916	GCG	2	6	20402	20407	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_005916	TTG	2	6	20473	20478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005916	ACC	2	6	22468	22473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_005916	CCA	2	6	22498	22503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_005916	CCA	2	6	22512	22517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_005916	CGC	2	6	23971	23976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_005916	GTG	3	9	24029	24037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005916	TGG	2	6	25137	25142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005916	TGG	2	6	25151	25156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005916	TGG	2	6	25180	25185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005916	GTT	2	6	26972	26977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005916	CGA	2	6	28150	28155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_005916	ACG	2	6	28199	28204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_005916	ATC	2	6	28277	28282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_005916	CAA	2	6	28307	28312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_005916	GCG	2	6	28373	28378	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_005916	CGC	2	6	29810	29815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_005916	AGC	2	6	29816	29821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_005916	CTC	2	6	29854	29859	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_005916	CGC	2	6	29894	29899	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_005916	TCC	2	6	29933	29938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_005916	CGA	2	6	29947	29952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_005916	GCG	2	6	29966	29971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_005916	TGC	2	6	29979	29984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_005916	TGC	2	6	29988	29993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_005916	GTA	2	6	72485	72490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005916	GTT	2	6	73651	73656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005916	CGC	2	6	73659	73664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_005916	TCG	2	6	73670	73675	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_005916	GCG	2	6	73792	73797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_005916	TGA	2	6	73913	73918	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005916	CGA	2	6	73964	73969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_005916	GCC	2	6	74033	74038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_005916	CGA	2	6	74115	74120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_005916	GCG	2	6	74892	74897	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_005916	GGC	2	6	76418	76423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_005916	GCG	3	9	77935	77943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005916	TGT	2	6	77961	77966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005916	CTC	2	6	78931	78936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_005916	TAA	2	6	79036	79041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005916	GTA	2	6	137310	137315	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005916	GTT	2	6	138476	138481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005916	CGC	2	6	138484	138489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_005916	TCG	2	6	138495	138500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_005916	GCG	2	6	138617	138622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_005916	TGA	2	6	138738	138743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005916	CGA	2	6	138789	138794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_005916	GCC	2	6	138858	138863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_005916	CGA	2	6	138940	138945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_005916	CGC	2	6	140229	140234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_005916	TCA	2	6	140242	140247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_005916	GCG	2	6	140250	140255	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_005916	CAC	2	6	140265	140270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_005916	CCT	2	6	140346	140351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_005916	GAT	2	6	140352	140357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005916	CGG	2	6	140381	140386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_005916	ATG	2	6	140453	140458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005916	GGA	2	6	140503	140508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005916	CCG	2	6	141684	141689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_005916	CGG	2	6	141715	141720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_005916	GTT	2	6	141726	141731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005916	GTA	2	6	141898	141903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005916	TGC	2	6	141907	141912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_005916	TCG	2	6	141928	141933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_005916	ATC	2	6	142027	142032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_005916	GAC	2	6	142195	142200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_005916	GTC	2	6	142696	142701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_005916	GTT	2	6	142725	142730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005916	TGA	2	6	142755	142760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005916	TCG	2	6	142833	142838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_005916	GTC	2	6	142882	142887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_005916	CAA	2	6	144060	144065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_005916	AGC	2	6	144137	144142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_005916	CGC	2	6	144163	144168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_005916	CGC	2	6	146002	146007	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
122	NC_005916	GTT	2	6	146153	146158	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005916	GCC	2	6	146539	146544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
124	NC_005916	CAA	3	9	147405	147413	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_005916	TCA	2	6	147481	147486	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_005916	CGC	2	6	150665	150670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_005916	TGG	2	6	150712	150717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005916	GGC	2	6	150767	150772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_005916	GGC	2	6	150800	150805	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_005916	CGC	2	6	151281	151286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_005916	CGG	2	6	151294	151299	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_005916	GGA	2	6	152179	152184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005916	GCT	2	6	152188	152193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_005916	TGG	2	6	152212	152217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005916	GTT	2	6	152228	152233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005916	TGG	2	6	153453	153458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005916	TTG	2	6	153503	153508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005916	GTT	2	6	153587	153592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.