MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mycobacterium ulcerans AGY99 plasmid pMUM001

Total Repeats: 2565

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005916	CGG	2	6	156	161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146085
2	NC_005916	CGC	2	6	189	194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
3	NC_005916	CAA	2	6	246	251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146085
4	NC_005916	CCA	2	6	276	281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146085
5	NC_005916	TGC	2	6	338	343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146085
6	NC_005916	GCC	2	6	347	352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
7	NC_005916	CCT	2	6	377	382	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146085
8	NC_005916	TAC	2	6	528	533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146085
9	NC_005916	GCG	2	6	563	568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146085
10	NC_005916	CGC	2	6	574	579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
11	NC_005916	TCG	2	6	651	656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146085
12	NC_005916	CGC	2	6	963	968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
13	NC_005916	CCA	2	6	984	989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146085
14	NC_005916	GCC	2	6	991	996	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
15	NC_005916	TGC	2	6	1002	1007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146085
16	NC_005916	GCT	4	12	1009	1020	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146085
17	NC_005916	CGC	2	6	1026	1031	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146085
18	NC_005916	GCG	2	6	1078	1083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146085
19	NC_005916	CGG	2	6	1087	1092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146085
20	NC_005916	CAG	2	6	1126	1131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146086
21	NC_005916	AGC	2	6	1145	1150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146086
22	NC_005916	TGC	2	6	1153	1158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146086
23	NC_005916	TGC	2	6	1193	1198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146086
24	NC_005916	CGC	2	6	1230	1235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146086
25	NC_005916	GCC	3	9	1268	1276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146086
26	NC_005916	TGG	2	6	1293	1298	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146086
27	NC_005916	CCT	2	6	1732	1737	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146087
28	NC_005916	AGC	2	6	1844	1849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146087
29	NC_005916	CAA	2	6	1877	1882	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146087
30	NC_005916	GAA	2	6	1941	1946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49146087
31	NC_005916	ACA	2	6	1978	1983	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146087
32	NC_005916	TGG	2	6	2021	2026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146087
33	NC_005916	GCC	2	6	2028	2033	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146087
34	NC_005916	CGC	2	6	2050	2055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146087
35	NC_005916	CGA	2	6	2104	2109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146087
36	NC_005916	CAG	2	6	2159	2164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146087
37	NC_005916	GAC	2	6	2189	2194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146087
38	NC_005916	ATC	2	6	2225	2230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146087
39	NC_005916	CAC	2	6	2280	2285	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146087
40	NC_005916	CCT	2	6	2408	2413	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146088
41	NC_005916	CGG	2	6	2420	2425	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146088
42	NC_005916	CCA	2	6	2452	2457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146088
43	NC_005916	GAT	2	6	2532	2537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49146088
44	NC_005916	CCG	2	6	2660	2665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146088
45	NC_005916	GGC	2	6	2718	2723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146088
46	NC_005916	CAG	2	6	2786	2791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146088
47	NC_005916	GCG	2	6	2906	2911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146088
48	NC_005916	GAC	2	6	3032	3037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146089
49	NC_005916	ATT	2	6	3083	3088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	49146089
50	NC_005916	TTC	3	9	3216	3224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49146089
51	NC_005916	TCG	2	6	3241	3246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146089
52	NC_005916	ACA	2	6	3378	3383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146089
53	NC_005916	GCC	2	6	3402	3407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146089
54	NC_005916	GAA	2	6	3409	3414	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49146089
55	NC_005916	AAC	2	6	3578	3583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146089
56	NC_005916	GTC	2	6	3662	3667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146089
57	NC_005916	GCG	2	6	3762	3767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146089
58	NC_005916	GTC	2	6	3872	3877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146089
59	NC_005916	TCG	2	6	5665	5670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146090
60	NC_005916	CTC	2	6	5679	5684	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146090
61	NC_005916	CAC	2	6	5700	5705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146090
62	NC_005916	CGG	2	6	5706	5711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
63	NC_005916	CGG	2	6	5739	5744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
64	NC_005916	CCA	2	6	5745	5750	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146090
65	NC_005916	CCG	2	6	5751	5756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146090
66	NC_005916	TGC	2	6	5851	5856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146090
67	NC_005916	GGC	2	6	5899	5904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
68	NC_005916	TCG	2	6	5917	5922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146090
69	NC_005916	GCC	2	6	6094	6099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146090
70	NC_005916	CGG	2	6	6122	6127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
71	NC_005916	TTC	2	6	6159	6164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49146090
72	NC_005916	CGG	2	6	6290	6295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
73	NC_005916	GCG	2	6	6322	6327	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
74	NC_005916	CGG	3	9	6341	6349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146090
75	NC_005916	GCT	2	6	6365	6370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146090
76	NC_005916	TGG	2	6	6505	6510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146091
77	NC_005916	TGC	2	6	6519	6524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146091
78	NC_005916	CAT	2	6	6551	6556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146091
79	NC_005916	TCG	2	6	6573	6578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146091
80	NC_005916	TCT	2	6	6659	6664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	49146092
81	NC_005916	GCG	2	6	6753	6758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146092
82	NC_005916	CTC	2	6	6765	6770	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146092
83	NC_005916	GCT	3	9	6772	6780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146092
84	NC_005916	GCG	2	6	6781	6786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146092
85	NC_005916	GCC	2	6	6906	6911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146092
86	NC_005916	CGA	2	6	7001	7006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146092
87	NC_005916	GCT	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146092
88	NC_005916	GGC	2	6	7050	7055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146092
89	NC_005916	ATC	2	6	7075	7080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146092
90	NC_005916	GCT	2	6	7144	7149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146092
91	NC_005916	GTC	2	6	7247	7252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146093
92	NC_005916	TCG	2	6	7308	7313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146093
93	NC_005916	CAG	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146093
94	NC_005916	CCG	2	6	7368	7373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146093
95	NC_005916	GGC	2	6	7401	7406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146093
96	NC_005916	CGG	2	6	7419	7424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146093
97	NC_005916	CCG	2	6	7432	7437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146093
98	NC_005916	TGG	2	6	7438	7443	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146093
99	NC_005916	GCG	2	6	7492	7497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146093
100	NC_005916	GTG	2	6	7630	7635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146094
101	NC_005916	CGA	2	6	7653	7658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146094
102	NC_005916	ACA	2	6	7688	7693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146094
103	NC_005916	CGG	2	6	7772	7777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146094
104	NC_005916	CCA	2	6	7785	7790	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146094
105	NC_005916	GGA	2	6	7816	7821	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49146094
106	NC_005916	GCG	2	6	7885	7890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146094
107	NC_005916	CCA	2	6	7922	7927	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146094
108	NC_005916	GCC	2	6	8031	8036	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146094
109	NC_005916	GAG	3	9	8038	8046	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	49146094
110	NC_005916	ACC	2	6	8075	8080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146094
111	NC_005916	CGG	2	6	8097	8102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146094
112	NC_005916	CCG	2	6	8112	8117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146094
113	NC_005916	GCA	2	6	8145	8150	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146094
114	NC_005916	GCT	2	6	8152	8157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146094
115	NC_005916	GGC	2	6	8226	8231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146094
116	NC_005916	GGC	2	6	8256	8261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146094
117	NC_005916	GGC	2	6	8325	8330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146094
118	NC_005916	GTG	2	6	8451	8456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146095
119	NC_005916	CGG	2	6	8489	8494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146095
120	NC_005916	CCG	2	6	8560	8565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146095
121	NC_005916	CGA	2	6	8672	8677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146095
122	NC_005916	ATC	2	6	8769	8774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146095
123	NC_005916	GAC	2	6	8910	8915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146095
124	NC_005916	CCT	2	6	8953	8958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	49146095
125	NC_005916	CGC	2	6	8960	8965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146095
126	NC_005916	GGT	2	6	8982	8987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146095
127	NC_005916	GTT	2	6	9038	9043	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49146095
128	NC_005916	TGC	2	6	9100	9105	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146095
129	NC_005916	CCG	2	6	9144	9149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146095
130	NC_005916	CGA	2	6	9155	9160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146095
131	NC_005916	CGC	2	6	9191	9196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146095
132	NC_005916	GCC	2	6	9237	9242	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146095
133	NC_005916	CGG	2	6	9275	9280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146095
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256	NC_005916	ACG	2	6	16046	16051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146103
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259	NC_005916	CGT	2	6	16110	16115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146103
260	NC_005916	CCA	2	6	16154	16159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146103
261	NC_005916	AAG	2	6	16172	16177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49146103
262	NC_005916	ACC	3	9	16213	16221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146103
263	NC_005916	CCA	2	6	16223	16228	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	49146103
264	NC_005916	ACG	2	6	16271	16276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146103
265	NC_005916	TGA	2	6	16292	16297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	49146103
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267	NC_005916	ACA	2	6	16349	16354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	49146103
268	NC_005916	AAG	2	6	16414	16419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	49146103
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285	NC_005916	CGC	2	6	17943	17948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	49146106
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385	NC_005916	GCG	2	6	25615	25620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146112
386	NC_005916	GCA	2	6	25652	25657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146112
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388	NC_005916	GTG	2	6	25720	25725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146112
389	NC_005916	GCG	2	6	25831	25836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146112
390	NC_005916	TGG	2	6	25961	25966	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	49146112
391	NC_005916	TCA	2	6	26008	26013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	49146112
392	NC_005916	GTT	2	6	26085	26090	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49146112
393	NC_005916	GCG	2	6	26104	26109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	49146112
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496	NC_005916	TTG	2	6	34374	34379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49146116
497	NC_005916	TCG	2	6	34438	34443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	49146116
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499	NC_005916	CAG	2	6	34569	34574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	49146116
500	NC_005916	GTT	2	6	34587	34592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	49146116

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