MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Mycobacterium ulcerans AGY99 plasmid pMUM001

Total Repeats: 249

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005916	TG	3	6	149	154	0 %	50 %	50 %	0 %	49146085
2	NC_005916	CA	4	8	498	505	50 %	0 %	0 %	50 %	49146085
3	NC_005916	GC	3	6	781	786	0 %	0 %	50 %	50 %	49146085
4	NC_005916	AG	3	6	1580	1585	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005916	GC	3	6	2039	2044	0 %	0 %	50 %	50 %	49146087
6	NC_005916	CG	3	6	2143	2148	0 %	0 %	50 %	50 %	49146087
7	NC_005916	GC	3	6	2444	2449	0 %	0 %	50 %	50 %	49146088
8	NC_005916	CA	3	6	3394	3399	50 %	0 %	0 %	50 %	49146089
9	NC_005916	GC	4	8	3735	3742	0 %	0 %	50 %	50 %	49146089
10	NC_005916	GC	3	6	4255	4260	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_005916	TA	3	6	4363	4368	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005916	CA	3	6	4474	4479	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_005916	CA	3	6	4644	4649	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_005916	GC	3	6	5217	5222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_005916	CG	3	6	5731	5736	0 %	0 %	50 %	50 %	49146090
16	NC_005916	GC	3	6	7588	7593	0 %	0 %	50 %	50 %	49146093
17	NC_005916	GC	3	6	7674	7679	0 %	0 %	50 %	50 %	49146094
18	NC_005916	CG	3	6	8021	8026	0 %	0 %	50 %	50 %	49146094
19	NC_005916	GC	3	6	8999	9004	0 %	0 %	50 %	50 %	49146095
20	NC_005916	TC	3	6	9358	9363	0 %	50 %	0 %	50 %	49146095
21	NC_005916	CG	3	6	9436	9441	0 %	0 %	50 %	50 %	49146095
22	NC_005916	CG	3	6	10194	10199	0 %	0 %	50 %	50 %	49146095
23	NC_005916	CG	3	6	10512	10517	0 %	0 %	50 %	50 %	49146096
24	NC_005916	GT	3	6	10731	10736	0 %	50 %	50 %	0 %	49146097
25	NC_005916	TG	3	6	11237	11242	0 %	50 %	50 %	0 %	49146098
26	NC_005916	CG	3	6	11607	11612	0 %	0 %	50 %	50 %	49146098
27	NC_005916	CG	3	6	13192	13197	0 %	0 %	50 %	50 %	49146100
28	NC_005916	GT	3	6	13703	13708	0 %	50 %	50 %	0 %	49146101
29	NC_005916	CG	3	6	14171	14176	0 %	0 %	50 %	50 %	49146102
30	NC_005916	AG	3	6	14210	14215	50 %	0 %	50 %	0 %	49146102
31	NC_005916	CG	3	6	14485	14490	0 %	0 %	50 %	50 %	49146102
32	NC_005916	GC	3	6	14892	14897	0 %	0 %	50 %	50 %	49146102
33	NC_005916	CA	3	6	15484	15489	50 %	0 %	0 %	50 %	49146103
34	NC_005916	CG	3	6	15694	15699	0 %	0 %	50 %	50 %	49146103
35	NC_005916	CT	3	6	17135	17140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_005916	GT	3	6	17263	17268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005916	GC	3	6	19407	19412	0 %	0 %	50 %	50 %	49146108
38	NC_005916	CG	3	6	19833	19838	0 %	0 %	50 %	50 %	49146108
39	NC_005916	GC	3	6	20106	20111	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_005916	CG	3	6	20369	20374	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_005916	GT	3	6	20671	20676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005916	CG	3	6	20783	20788	0 %	0 %	50 %	50 %	49146109
43	NC_005916	CG	3	6	21536	21541	0 %	0 %	50 %	50 %	49146109
44	NC_005916	GT	3	6	22605	22610	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005916	CG	3	6	26113	26118	0 %	0 %	50 %	50 %	49146112
46	NC_005916	CG	3	6	26866	26871	0 %	0 %	50 %	50 %	49146112
47	NC_005916	AC	3	6	29739	29744	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_005916	GC	3	6	29820	29825	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_005916	AG	3	6	30069	30074	50 %	0 %	50 %	0 %	49146116
50	NC_005916	TG	3	6	31663	31668	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
51	NC_005916	GT	3	6	32257	32262	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
52	NC_005916	CA	3	6	32335	32340	50 %	0 %	0 %	50 %	49146116
53	NC_005916	GT	3	6	32383	32388	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
54	NC_005916	GT	3	6	34578	34583	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
55	NC_005916	TG	3	6	34885	34890	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
56	NC_005916	CG	3	6	35919	35924	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
57	NC_005916	GA	3	6	35936	35941	50 %	0 %	50 %	0 %	49146116
58	NC_005916	TG	3	6	37060	37065	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
59	NC_005916	GT	3	6	37654	37659	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
60	NC_005916	CA	3	6	37732	37737	50 %	0 %	0 %	50 %	49146116
61	NC_005916	GT	3	6	37780	37785	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
62	NC_005916	GT	3	6	39975	39980	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
63	NC_005916	TG	3	6	40282	40287	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
64	NC_005916	CG	3	6	41316	41321	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
65	NC_005916	GA	3	6	41333	41338	50 %	0 %	50 %	0 %	49146116
66	NC_005916	TG	3	6	42457	42462	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
67	NC_005916	GT	3	6	43051	43056	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
68	NC_005916	CA	3	6	43129	43134	50 %	0 %	0 %	50 %	49146116
69	NC_005916	GT	3	6	43177	43182	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
70	NC_005916	GT	3	6	45372	45377	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
71	NC_005916	TG	3	6	45679	45684	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
72	NC_005916	CG	3	6	46713	46718	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
73	NC_005916	GA	3	6	46730	46735	50 %	0 %	50 %	0 %	49146116
74	NC_005916	TG	3	6	47854	47859	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
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80	NC_005916	CG	3	6	52110	52115	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
81	NC_005916	GA	3	6	52127	52132	50 %	0 %	50 %	0 %	49146116
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91	NC_005916	TG	3	6	59539	59544	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
92	NC_005916	CG	3	6	59550	59555	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
93	NC_005916	GC	3	6	59845	59850	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
94	NC_005916	GC	3	6	60707	60712	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
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104	NC_005916	CG	3	6	66741	66746	0 %	0 %	50 %	50 %	49146116
105	NC_005916	GA	3	6	66758	66763	50 %	0 %	50 %	0 %	49146116
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107	NC_005916	GT	3	6	68476	68481	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
108	NC_005916	CA	3	6	68554	68559	50 %	0 %	0 %	50 %	49146116
109	NC_005916	GT	3	6	68602	68607	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
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113	NC_005916	GT	3	6	71927	71932	0 %	50 %	50 %	0 %	49146116
114	NC_005916	CA	3	6	73693	73698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_005916	GC	3	6	74590	74595	0 %	0 %	50 %	50 %	49146119
116	NC_005916	AC	3	6	76258	76263	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_005916	AG	3	6	76338	76343	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005916	CG	3	6	76948	76953	0 %	0 %	50 %	50 %	49146121
119	NC_005916	GC	3	6	78177	78182	0 %	0 %	50 %	50 %	49146122
120	NC_005916	CG	3	6	78525	78530	0 %	0 %	50 %	50 %	49146122
121	NC_005916	GC	3	6	78762	78767	0 %	0 %	50 %	50 %	49146122
122	NC_005916	CG	3	6	78791	78796	0 %	0 %	50 %	50 %	49146122
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126	NC_005916	CG	3	6	81389	81394	0 %	0 %	50 %	50 %	49146123
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133	NC_005916	GA	3	6	85970	85975	50 %	0 %	50 %	0 %	49146123
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135	NC_005916	AT	3	6	86513	86518	50 %	50 %	0 %	0 %	49146124
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147	NC_005916	CG	3	6	93489	93494	0 %	0 %	50 %	50 %	49146124
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.