MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Photobacterium profundum SS9 plasmid pPBPR1

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005871	AAAATC	2	12	340	351	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	47104026
2	NC_005871	ACTCAA	2	12	2890	2901	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	47104030
3	NC_005871	CGCACC	2	12	6477	6488	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	47104033
4	NC_005871	CCATTA	2	12	10306	10317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	47104037
5	NC_005871	TGACAC	2	12	12809	12820	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	47104038
6	NC_005871	GGCGAT	2	12	19960	19971	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	47104044
7	NC_005871	CCTCCA	2	12	20372	20383	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	47104044
8	NC_005871	CAAGGC	2	12	21063	21074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	47104044
9	NC_005871	CAAAGG	2	12	27964	27975	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	47104047
10	NC_005871	CATTAT	2	12	34282	34293	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	47104051
11	NC_005871	CCATTT	2	12	37689	37700	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	47104054
12	NC_005871	CTGTTG	3	18	49783	49800	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	47104065
13	NC_005871	TATTGA	2	12	55362	55373	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	47104068
14	NC_005871	AAGATG	2	12	55841	55852	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	47104068
15	NC_005871	TACCTT	2	12	59342	59353	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	47104072
16	NC_005871	CATTTC	2	12	59522	59533	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	47104072
17	NC_005871	ACGGCT	2	12	64700	64711	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	47104078
18	NC_005871	CTGTCG	2	12	74956	74967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	47104087

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.