MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005863	GACAG	2	10	5313	5322	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_005863	TGGGT	2	10	5398	5407	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005863	CTGTC	2	10	13942	13951	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
4	NC_005863	CTGTC	2	10	13956	13965	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_005863	GGCGT	2	10	14182	14191	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_005863	GTGCG	2	10	19748	19757	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
7	NC_005863	GGGGC	2	10	20171	20180	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
8	NC_005863	GGGCG	2	10	20456	20465	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
9	NC_005863	ACGCC	2	10	33018	33027	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_005863	GGCAG	2	10	34154	34163	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_005863	GTGTG	2	10	34510	34519	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005863	GCCTC	2	10	36998	37007	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
13	NC_005863	GGCCC	2	10	40998	41007	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
14	NC_005863	CCCGT	2	10	41146	41155	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_005863	GGGGA	2	10	51953	51962	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005863	CACGC	2	10	80129	80138	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_005863	TGACG	2	10	84934	84943	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
18	NC_005863	GTGCA	2	10	105188	105197	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
19	NC_005863	GGCCC	2	10	122291	122300	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20	NC_005863	GCCAC	2	10	123465	123474	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_005863	GCAAG	2	10	125793	125802	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
22	NC_005863	CCCGC	2	10	130684	130693	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
23	NC_005863	GTCAC	2	10	133431	133440	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_005863	CGCAC	2	10	133514	133523	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_005863	CCGTC	2	10	135806	135815	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
26	NC_005863	CCTGA	2	10	140056	140065	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_005863	GGGCC	2	10	143053	143062	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
28	NC_005863	ACGCC	2	10	149118	149127	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
29	NC_005863	GCACC	2	10	157561	157570	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
30	NC_005863	ACGCA	2	10	167835	167844	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_005863	GGCGG	2	10	167847	167856	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
32	NC_005863	TGCAC	2	10	176396	176405	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_005863	TGGCG	2	10	187292	187301	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.