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Tri-nucleotide Coding Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 3149

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005863	ACG	2	6	733	738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562244
2	NC_005863	ATC	2	6	880	885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562243
3	NC_005863	CAA	3	9	894	902	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562243
4	NC_005863	ACC	2	6	919	924	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562243
5	NC_005863	CAC	2	6	927	932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562243
6	NC_005863	GAC	2	6	1072	1077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562243
7	NC_005863	CGC	2	6	1104	1109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562243
8	NC_005863	TGC	2	6	1133	1138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562243
9	NC_005863	TCA	2	6	1172	1177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562243
10	NC_005863	ATG	2	6	1291	1296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562243
11	NC_005863	TGG	2	6	1301	1306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562243
12	NC_005863	GCA	2	6	1340	1345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562243
13	NC_005863	CGA	2	6	1386	1391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562243
14	NC_005863	CTG	2	6	1426	1431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562243
15	NC_005863	CAA	2	6	1443	1448	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562243
16	NC_005863	TCG	2	6	1466	1471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562243
17	NC_005863	GCA	2	6	1586	1591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562243
18	NC_005863	ACC	2	6	1660	1665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562243
19	NC_005863	CAA	2	6	1779	1784	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562242
20	NC_005863	TCT	2	6	1941	1946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562242
21	NC_005863	CGA	2	6	1966	1971	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
22	NC_005863	GAC	2	6	2055	2060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
23	NC_005863	CGG	2	6	2077	2082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
24	NC_005863	CAC	2	6	2135	2140	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562242
25	NC_005863	TGA	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562242
26	NC_005863	CAC	2	6	2195	2200	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562242
27	NC_005863	ACA	2	6	2247	2252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562242
28	NC_005863	ACA	2	6	2286	2291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562242
29	NC_005863	GAC	2	6	2450	2455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
30	NC_005863	CTT	2	6	2506	2511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562242
31	NC_005863	AGC	2	6	2541	2546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
32	NC_005863	GAC	2	6	2601	2606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
33	NC_005863	CTC	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562242
34	NC_005863	GAA	2	6	2739	2744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562242
35	NC_005863	ACG	2	6	2755	2760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
36	NC_005863	GCA	2	6	2872	2877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
37	NC_005863	CGA	2	6	2890	2895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
38	NC_005863	CAG	2	6	3277	3282	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
39	NC_005863	GCC	2	6	3336	3341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
40	NC_005863	ACC	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562242
41	NC_005863	TCT	2	6	3477	3482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562242
42	NC_005863	CAC	2	6	3527	3532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562242
43	NC_005863	GGT	2	6	3578	3583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562242
44	NC_005863	GCG	2	6	4011	4016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
45	NC_005863	CAT	2	6	4130	4135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562242
46	NC_005863	CGG	2	6	4201	4206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
47	NC_005863	CGC	2	6	4349	4354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
48	NC_005863	CAG	2	6	4392	4397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
49	NC_005863	GCG	2	6	4404	4409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
50	NC_005863	CGC	2	6	4429	4434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
51	NC_005863	CGG	2	6	4463	4468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
52	NC_005863	CAC	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562242
53	NC_005863	CGG	2	6	4577	4582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
54	NC_005863	TTC	2	6	4602	4607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562242
55	NC_005863	CGA	2	6	4697	4702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562242
56	NC_005863	CCG	2	6	4789	4794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
57	NC_005863	GCT	2	6	4825	4830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562242
58	NC_005863	GGC	2	6	4834	4839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562242
59	NC_005863	CCG	2	6	4840	4845	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
60	NC_005863	CGC	2	6	4895	4900	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
61	NC_005863	AAC	2	6	4918	4923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46562242
62	NC_005863	TGC	2	6	5050	5055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562242
63	NC_005863	CGC	2	6	5100	5105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562242
64	NC_005863	TGG	2	6	5515	5520	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562241
65	NC_005863	TGA	2	6	5563	5568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562241
66	NC_005863	TCT	2	6	5587	5592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562241
67	NC_005863	TGC	2	6	5626	5631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562241
68	NC_005863	GAC	2	6	6522	6527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562272
69	NC_005863	CGG	2	6	6563	6568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562272
70	NC_005863	CAG	2	6	6579	6584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562272
71	NC_005863	CGA	2	6	6614	6619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562272
72	NC_005863	ATG	2	6	6655	6660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562272
73	NC_005863	ACG	2	6	6670	6675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562272
74	NC_005863	ATG	2	6	6727	6732	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562272
75	NC_005863	CCG	2	6	6766	6771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562272
76	NC_005863	GCG	2	6	6790	6795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562272
77	NC_005863	CCT	2	6	6806	6811	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562272
78	NC_005863	CGC	2	6	6821	6826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562272
79	NC_005863	CAC	2	6	6870	6875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562272
80	NC_005863	CGT	2	6	6965	6970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562272
81	NC_005863	GTG	2	6	7101	7106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562272
82	NC_005863	CGA	2	6	7109	7114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562272
83	NC_005863	CGT	2	6	7187	7192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562272
84	NC_005863	CGT	2	6	7295	7300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562272
85	NC_005863	AGC	2	6	7409	7414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562272
86	NC_005863	TCC	2	6	7424	7429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562272
87	NC_005863	TGG	2	6	7500	7505	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562240
88	NC_005863	GCA	2	6	7569	7574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562240
89	NC_005863	AGA	2	6	7596	7601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562240
90	NC_005863	GCA	2	6	7606	7611	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562240
91	NC_005863	CAG	2	6	7618	7623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562240
92	NC_005863	CCG	2	6	7641	7646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562240
93	NC_005863	GCG	2	6	7649	7654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562240
94	NC_005863	GAC	2	6	7672	7677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562240
95	NC_005863	TGC	2	6	7680	7685	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562240
96	NC_005863	CGC	2	6	7702	7707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562240
97	NC_005863	CGG	2	6	7719	7724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562240
98	NC_005863	GAA	2	6	7852	7857	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562240
99	NC_005863	TGG	2	6	7932	7937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562240
100	NC_005863	GAT	2	6	8011	8016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562240
101	NC_005863	CCA	2	6	8085	8090	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562240
102	NC_005863	CCA	2	6	8115	8120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562240
103	NC_005863	ATG	2	6	8210	8215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562240
104	NC_005863	TCG	2	6	8216	8221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562240
105	NC_005863	GTC	2	6	8233	8238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562240
106	NC_005863	GTC	2	6	8281	8286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562240
107	NC_005863	CGA	2	6	8292	8297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562240
108	NC_005863	AGT	2	6	8304	8309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562240
109	NC_005863	TCA	3	9	8321	8329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562240
110	NC_005863	TCG	2	6	8364	8369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562240
111	NC_005863	CTT	2	6	8383	8388	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562240
112	NC_005863	ATG	2	6	8411	8416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562240
113	NC_005863	GAA	2	6	8425	8430	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46562240
114	NC_005863	TTC	2	6	8435	8440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562240
115	NC_005863	CAG	2	6	8902	8907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562239
116	NC_005863	CGC	2	6	8912	8917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562239
117	NC_005863	GCA	2	6	8925	8930	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562239
118	NC_005863	CAC	2	6	8997	9002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562239
119	NC_005863	CGA	2	6	9008	9013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562239
120	NC_005863	CAC	2	6	9071	9076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562239
121	NC_005863	GGC	2	6	9078	9083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562239
122	NC_005863	TTC	2	6	9168	9173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562239
123	NC_005863	TCC	2	6	9319	9324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562239
124	NC_005863	ACC	2	6	9366	9371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562239
125	NC_005863	CGC	2	6	9389	9394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562239
126	NC_005863	CGT	2	6	9410	9415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562239
127	NC_005863	GCC	2	6	9450	9455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562239
128	NC_005863	GCA	2	6	9599	9604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562239
129	NC_005863	GTG	2	6	9630	9635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562239
130	NC_005863	CAG	2	6	9636	9641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562239
131	NC_005863	GAT	2	6	9783	9788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562239
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249	NC_005863	TGG	2	6	17256	17261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46562234
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253	NC_005863	CTT	2	6	17450	17455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562234
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255	NC_005863	GAT	2	6	17468	17473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562234
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257	NC_005863	GAC	2	6	17630	17635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562234
258	NC_005863	AGC	3	9	17653	17661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562234
259	NC_005863	TGA	2	6	17671	17676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562234
260	NC_005863	CTG	2	6	17708	17713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562234
261	NC_005863	GAC	2	6	17741	17746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562234
262	NC_005863	GCG	2	6	17756	17761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562234
263	NC_005863	TCC	2	6	17858	17863	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562233
264	NC_005863	TCG	2	6	17876	17881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562233
265	NC_005863	ACG	2	6	18023	18028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562233
266	NC_005863	CGC	2	6	18099	18104	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562233
267	NC_005863	CTT	2	6	18205	18210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46562233
268	NC_005863	GAT	2	6	18235	18240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562233
269	NC_005863	ATG	2	6	18374	18379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562232
270	NC_005863	TGA	2	6	18420	18425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562232
271	NC_005863	TCG	2	6	18443	18448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562232
272	NC_005863	GAC	2	6	18451	18456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562232
273	NC_005863	GCT	2	6	18477	18482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562232
274	NC_005863	CGG	2	6	18513	18518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562232
275	NC_005863	ACG	2	6	18879	18884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46562231
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277	NC_005863	CTG	2	6	19003	19008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562231
278	NC_005863	TGT	2	6	19065	19070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562231
279	NC_005863	ATC	2	6	19088	19093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562231
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281	NC_005863	ATC	2	6	19124	19129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562231
282	NC_005863	CAC	2	6	19180	19185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562231
283	NC_005863	ATG	2	6	19205	19210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562231
284	NC_005863	TGT	2	6	19221	19226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46562231
285	NC_005863	GGC	2	6	19228	19233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562231
286	NC_005863	CAT	2	6	19243	19248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46562231
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288	NC_005863	CAC	2	6	19318	19323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562231
289	NC_005863	CGT	2	6	19335	19340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562231
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294	NC_005863	GCC	2	6	19480	19485	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46562231
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374	NC_005863	GTG	3	9	26048	26056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	304570524
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376	NC_005863	GCG	2	6	26198	26203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	304570524
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378	NC_005863	CAC	2	6	26794	26799	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	46562226
379	NC_005863	TGA	2	6	26937	26942	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46562226
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382	NC_005863	CGG	3	9	27069	27077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562226
383	NC_005863	TCC	2	6	27122	27127	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46562226
384	NC_005863	TGC	2	6	27140	27145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46562226
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500	NC_005863	CGG	2	6	33805	33810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46562217

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