MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Desulfovibrio vulgaris str. Hildenborough plasmid pDV

Total Repeats: 362

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005863	CG	3	6	176	181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005863	GC	3	6	347	352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_005863	CG	3	6	621	626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_005863	AC	3	6	1480	1485	50 %	0 %	0 %	50 %	46562243
5	NC_005863	AC	3	6	2227	2232	50 %	0 %	0 %	50 %	46562242
6	NC_005863	CG	3	6	2806	2811	0 %	0 %	50 %	50 %	46562242
7	NC_005863	AG	4	8	3014	3021	50 %	0 %	50 %	0 %	46562242
8	NC_005863	GC	3	6	3316	3321	0 %	0 %	50 %	50 %	46562242
9	NC_005863	CA	3	6	4207	4212	50 %	0 %	0 %	50 %	46562242
10	NC_005863	GC	3	6	4875	4880	0 %	0 %	50 %	50 %	46562242
11	NC_005863	GC	3	6	4926	4931	0 %	0 %	50 %	50 %	46562242
12	NC_005863	GC	3	6	5054	5059	0 %	0 %	50 %	50 %	46562242
13	NC_005863	TA	3	6	5441	5446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005863	AC	3	6	5913	5918	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_005863	GC	3	6	6353	6358	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005863	GC	3	6	7040	7045	0 %	0 %	50 %	50 %	46562272
17	NC_005863	GC	3	6	7246	7251	0 %	0 %	50 %	50 %	46562272
18	NC_005863	CG	3	6	7333	7338	0 %	0 %	50 %	50 %	46562272
19	NC_005863	CT	3	6	7823	7828	0 %	50 %	0 %	50 %	46562240
20	NC_005863	GC	3	6	7967	7972	0 %	0 %	50 %	50 %	46562240
21	NC_005863	GC	3	6	9058	9063	0 %	0 %	50 %	50 %	46562239
22	NC_005863	GC	3	6	9708	9713	0 %	0 %	50 %	50 %	46562239
23	NC_005863	CG	3	6	10626	10631	0 %	0 %	50 %	50 %	46562238
24	NC_005863	CG	3	6	10771	10776	0 %	0 %	50 %	50 %	46562238
25	NC_005863	CG	3	6	11062	11067	0 %	0 %	50 %	50 %	46562238
26	NC_005863	CG	4	8	14484	14491	0 %	0 %	50 %	50 %	46562236
27	NC_005863	GC	3	6	15072	15077	0 %	0 %	50 %	50 %	46562235
28	NC_005863	TG	3	6	15507	15512	0 %	50 %	50 %	0 %	46562235
29	NC_005863	GT	3	6	15876	15881	0 %	50 %	50 %	0 %	46562235
30	NC_005863	GT	3	6	16171	16176	0 %	50 %	50 %	0 %	46562235
31	NC_005863	GC	3	6	16883	16888	0 %	0 %	50 %	50 %	46562234
32	NC_005863	TC	3	6	17898	17903	0 %	50 %	0 %	50 %	46562233
33	NC_005863	GC	3	6	18163	18168	0 %	0 %	50 %	50 %	46562233
34	NC_005863	GC	4	8	18361	18368	0 %	0 %	50 %	50 %	46562232
35	NC_005863	GC	3	6	19052	19057	0 %	0 %	50 %	50 %	46562231
36	NC_005863	CG	3	6	19071	19076	0 %	0 %	50 %	50 %	46562231
37	NC_005863	CA	3	6	20085	20090	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_005863	CG	3	6	20149	20154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_005863	GT	3	6	20320	20325	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005863	GC	3	6	20981	20986	0 %	0 %	50 %	50 %	46562270
41	NC_005863	GC	3	6	21065	21070	0 %	0 %	50 %	50 %	46562270
42	NC_005863	GA	3	6	21443	21448	50 %	0 %	50 %	0 %	46562270
43	NC_005863	CG	3	6	22063	22068	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_005863	CT	3	6	22163	22168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_005863	GA	3	6	22476	22481	50 %	0 %	50 %	0 %	46562229
46	NC_005863	CA	3	6	23642	23647	50 %	0 %	0 %	50 %	46562228
47	NC_005863	GT	3	6	24477	24482	0 %	50 %	50 %	0 %	46562227
48	NC_005863	GC	3	6	24563	24568	0 %	0 %	50 %	50 %	46562227
49	NC_005863	CA	4	8	25864	25871	50 %	0 %	0 %	50 %	304570524
50	NC_005863	CG	3	6	26183	26188	0 %	0 %	50 %	50 %	304570524
51	NC_005863	GT	3	6	26280	26285	0 %	50 %	50 %	0 %	304570524
52	NC_005863	AG	3	6	26489	26494	50 %	0 %	50 %	0 %	304570524
53	NC_005863	GC	3	6	26843	26848	0 %	0 %	50 %	50 %	46562226
54	NC_005863	GC	3	6	27017	27022	0 %	0 %	50 %	50 %	46562226
55	NC_005863	CG	3	6	27207	27212	0 %	0 %	50 %	50 %	46562226
56	NC_005863	GC	4	8	27910	27917	0 %	0 %	50 %	50 %	46562225
57	NC_005863	GA	3	6	28294	28299	50 %	0 %	50 %	0 %	46562225
58	NC_005863	TC	3	6	28328	28333	0 %	50 %	0 %	50 %	46562225
59	NC_005863	GC	3	6	28738	28743	0 %	0 %	50 %	50 %	46562224
60	NC_005863	GC	3	6	28959	28964	0 %	0 %	50 %	50 %	46562224
61	NC_005863	GC	3	6	29157	29162	0 %	0 %	50 %	50 %	46562224
62	NC_005863	GC	3	6	30052	30057	0 %	0 %	50 %	50 %	46562223
63	NC_005863	GC	3	6	30925	30930	0 %	0 %	50 %	50 %	46562222
64	NC_005863	TG	3	6	31036	31041	0 %	50 %	50 %	0 %	46562222
65	NC_005863	CG	3	6	31113	31118	0 %	0 %	50 %	50 %	46562222
66	NC_005863	TA	3	6	31527	31532	50 %	50 %	0 %	0 %	46562220
67	NC_005863	GC	3	6	32588	32593	0 %	0 %	50 %	50 %	46562218
68	NC_005863	GC	3	6	32936	32941	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_005863	GC	3	6	33149	33154	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_005863	GC	3	6	34374	34379	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_005863	GC	3	6	34733	34738	0 %	0 %	50 %	50 %	46562216
72	NC_005863	TG	3	6	35018	35023	0 %	50 %	50 %	0 %	46562216
73	NC_005863	GT	3	6	35641	35646	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005863	AG	3	6	36551	36556	50 %	0 %	50 %	0 %	46562215
75	NC_005863	AT	4	8	36655	36662	50 %	50 %	0 %	0 %	46562214
76	NC_005863	GT	3	6	36667	36672	0 %	50 %	50 %	0 %	46562214
77	NC_005863	CG	3	6	37542	37547	0 %	0 %	50 %	50 %	46562213
78	NC_005863	GC	3	6	38025	38030	0 %	0 %	50 %	50 %	46562213
79	NC_005863	GC	3	6	38888	38893	0 %	0 %	50 %	50 %	46562213
80	NC_005863	GC	3	6	39165	39170	0 %	0 %	50 %	50 %	46562213
81	NC_005863	CG	3	6	39302	39307	0 %	0 %	50 %	50 %	46562213
82	NC_005863	CG	3	6	39387	39392	0 %	0 %	50 %	50 %	46562213
83	NC_005863	GC	3	6	39845	39850	0 %	0 %	50 %	50 %	46562213
84	NC_005863	GC	3	6	39877	39882	0 %	0 %	50 %	50 %	46562213
85	NC_005863	AC	3	6	40529	40534	50 %	0 %	0 %	50 %	46562212
86	NC_005863	GC	4	8	41764	41771	0 %	0 %	50 %	50 %	46562211
87	NC_005863	GC	3	6	41862	41867	0 %	0 %	50 %	50 %	46562211
88	NC_005863	GC	3	6	43156	43161	0 %	0 %	50 %	50 %	46562211
89	NC_005863	GC	4	8	43798	43805	0 %	0 %	50 %	50 %	46562211
90	NC_005863	GC	3	6	43911	43916	0 %	0 %	50 %	50 %	46562211
91	NC_005863	CG	3	6	45430	45435	0 %	0 %	50 %	50 %	46562210
92	NC_005863	CG	3	6	46358	46363	0 %	0 %	50 %	50 %	46562209
93	NC_005863	GC	3	6	47308	47313	0 %	0 %	50 %	50 %	46562208
94	NC_005863	CG	3	6	47800	47805	0 %	0 %	50 %	50 %	46562208
95	NC_005863	GC	3	6	48587	48592	0 %	0 %	50 %	50 %	46562207
96	NC_005863	CG	3	6	48895	48900	0 %	0 %	50 %	50 %	46562207
97	NC_005863	CG	3	6	49709	49714	0 %	0 %	50 %	50 %	46562206
98	NC_005863	GA	3	6	50477	50482	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005863	CG	3	6	50990	50995	0 %	0 %	50 %	50 %	46562205
100	NC_005863	CG	3	6	52061	52066	0 %	0 %	50 %	50 %	46562204
101	NC_005863	CG	3	6	52319	52324	0 %	0 %	50 %	50 %	46562204
102	NC_005863	CG	3	6	53647	53652	0 %	0 %	50 %	50 %	46562275
103	NC_005863	GC	4	8	53686	53693	0 %	0 %	50 %	50 %	46562275
104	NC_005863	GC	4	8	54929	54936	0 %	0 %	50 %	50 %	46562203
105	NC_005863	TG	3	6	55031	55036	0 %	50 %	50 %	0 %	46562203
106	NC_005863	GA	3	6	55341	55346	50 %	0 %	50 %	0 %	46562203
107	NC_005863	CG	3	6	56171	56176	0 %	0 %	50 %	50 %	46562202
108	NC_005863	GC	3	6	56767	56772	0 %	0 %	50 %	50 %	46562202
109	NC_005863	GC	3	6	57019	57024	0 %	0 %	50 %	50 %	46562201
110	NC_005863	GC	3	6	57072	57077	0 %	0 %	50 %	50 %	46562201
111	NC_005863	CG	3	6	57360	57365	0 %	0 %	50 %	50 %	46562201
112	NC_005863	GC	3	6	57550	57555	0 %	0 %	50 %	50 %	46562201
113	NC_005863	GC	4	8	57736	57743	0 %	0 %	50 %	50 %	46562201
114	NC_005863	CG	4	8	58308	58315	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_005863	GC	3	6	58593	58598	0 %	0 %	50 %	50 %	46562200
116	NC_005863	CG	3	6	58922	58927	0 %	0 %	50 %	50 %	46562200
117	NC_005863	CG	3	6	59434	59439	0 %	0 %	50 %	50 %	46562200
118	NC_005863	CG	3	6	60420	60425	0 %	0 %	50 %	50 %	46562276
119	NC_005863	CG	3	6	61050	61055	0 %	0 %	50 %	50 %	46562276
120	NC_005863	CG	3	6	61411	61416	0 %	0 %	50 %	50 %	46562269
121	NC_005863	TC	3	6	61517	61522	0 %	50 %	0 %	50 %	46562269
122	NC_005863	CG	3	6	62509	62514	0 %	0 %	50 %	50 %	46562199
123	NC_005863	GA	3	6	62638	62643	50 %	0 %	50 %	0 %	46562199
124	NC_005863	GC	3	6	63284	63289	0 %	0 %	50 %	50 %	46562199
125	NC_005863	CG	3	6	63511	63516	0 %	0 %	50 %	50 %	46562199
126	NC_005863	GC	3	6	63759	63764	0 %	0 %	50 %	50 %	46562199
127	NC_005863	CG	3	6	64365	64370	0 %	0 %	50 %	50 %	46562268
128	NC_005863	GC	3	6	64372	64377	0 %	0 %	50 %	50 %	46562268
129	NC_005863	GC	3	6	65944	65949	0 %	0 %	50 %	50 %	46562198
130	NC_005863	GC	3	6	66214	66219	0 %	0 %	50 %	50 %	46562198
131	NC_005863	GC	4	8	66723	66730	0 %	0 %	50 %	50 %	46562198
132	NC_005863	CG	3	6	67258	67263	0 %	0 %	50 %	50 %	46562197
133	NC_005863	GC	4	8	68001	68008	0 %	0 %	50 %	50 %	46562196
134	NC_005863	CG	3	6	68540	68545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_005863	CG	3	6	68632	68637	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_005863	GC	3	6	69593	69598	0 %	0 %	50 %	50 %	46562195
137	NC_005863	GC	3	6	69737	69742	0 %	0 %	50 %	50 %	46562195
138	NC_005863	GC	3	6	69977	69982	0 %	0 %	50 %	50 %	46562195
139	NC_005863	TC	3	6	70390	70395	0 %	50 %	0 %	50 %	46562194
140	NC_005863	GC	4	8	70774	70781	0 %	0 %	50 %	50 %	46562194
141	NC_005863	CG	3	6	71870	71875	0 %	0 %	50 %	50 %	46562194
142	NC_005863	CG	3	6	72972	72977	0 %	0 %	50 %	50 %	46562193
143	NC_005863	GC	3	6	73085	73090	0 %	0 %	50 %	50 %	46562193
144	NC_005863	CG	3	6	73468	73473	0 %	0 %	50 %	50 %	46562193
145	NC_005863	GC	3	6	74248	74253	0 %	0 %	50 %	50 %	46562193
146	NC_005863	GC	3	6	74963	74968	0 %	0 %	50 %	50 %	46562192
147	NC_005863	GC	3	6	76169	76174	0 %	0 %	50 %	50 %	46562191
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149	NC_005863	GC	3	6	77223	77228	0 %	0 %	50 %	50 %	46562190
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.