MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 chromosome

Total Repeats: 1059

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005861	AATTTA	2	12	690	701	50 %	50 %	0 %	0 %	46445636
2	NC_005861	ACTTTT	2	12	4240	4251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_005861	AAAGCA	2	12	5415	5426	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	46445638
4	NC_005861	AATAAA	2	12	10851	10862	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	46445641
5	NC_005861	AAAAGC	2	12	10889	10900	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	46445641
6	NC_005861	CAGGAA	2	12	15410	15421	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	46445643
7	NC_005861	TCTATT	2	12	18082	18093	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	46445643
8	NC_005861	TATATT	2	12	21432	21443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445645
9	NC_005861	TAATTA	2	12	23640	23651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005861	ATTAAA	2	12	25313	25324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445648
11	NC_005861	TTATTT	2	12	25629	25640	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	46445648
12	NC_005861	AAACCA	2	12	31557	31568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445652
13	NC_005861	CAAATC	2	12	32557	32568	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	46445654
14	NC_005861	ATTTGT	2	12	34746	34757	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005861	TCTTTA	2	12	42419	42430	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	46445661
16	NC_005861	TGGAAG	2	12	42704	42715	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	46445661
17	NC_005861	ATTTCA	2	12	42860	42871	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	46445661
18	NC_005861	ATGGCA	2	12	43250	43261	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_005861	TTAATC	2	12	48834	48845	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	46445667
20	NC_005861	AGTATT	2	12	52064	52075	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	46445668
21	NC_005861	AGCTGA	2	12	52967	52978	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46445668
22	NC_005861	ATATGG	2	12	54389	54400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005861	GAACAA	2	12	54470	54481	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	46445669
24	NC_005861	AATATG	2	12	55399	55410	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005861	TTTAAT	2	12	56494	56505	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445671
26	NC_005861	ATTTGA	2	12	58485	58496	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	46445672
27	NC_005861	TTGTTA	2	12	58977	58988	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46445672
28	NC_005861	AAATTT	2	12	63050	63061	50 %	50 %	0 %	0 %	46445674
29	NC_005861	ACTTTT	2	12	64157	64168	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	46445674
30	NC_005861	TGAAAT	2	12	66557	66568	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	46445675
31	NC_005861	GGGCTT	2	12	68924	68935	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	46445676
32	NC_005861	GAAATT	2	12	75302	75313	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	46445678
33	NC_005861	ATGCAT	2	12	80170	80181	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46445679
34	NC_005861	TCTTTT	2	12	84102	84113	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	46445680
35	NC_005861	AATTTC	2	12	90544	90555	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	46445684
36	NC_005861	AATTTT	2	12	91280	91291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005861	TAGACC	2	12	105367	105378	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	46445691
38	NC_005861	AGCATG	2	12	105958	105969	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46445691
39	NC_005861	CCTAGG	2	12	109074	109085	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46445692
40	NC_005861	TGGAAT	2	12	111788	111799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445693
41	NC_005861	GAAATG	2	12	111980	111991	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46445693
42	NC_005861	TTAAAA	2	12	113702	113713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445693
43	NC_005861	AGCAAA	2	12	117217	117228	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	46445695
44	NC_005861	CTATTA	2	12	120106	120117	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	46445697
45	NC_005861	ATTTTG	2	12	120851	120862	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005861	TTTGTT	2	12	126792	126803	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	161611311
47	NC_005861	TTTTCT	2	12	128461	128472	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_005861	CTTCTC	2	12	130821	130832	0 %	50 %	0 %	50 %	46445705
49	NC_005861	GTGAGG	2	12	132894	132905	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	46445707
50	NC_005861	TATAAT	2	12	135272	135283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005861	TCAAAT	2	12	135353	135364	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	46445711
52	NC_005861	ATTTTT	2	12	137365	137376	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	46445712
53	NC_005861	TTGAAA	2	12	137792	137803	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	46445712
54	NC_005861	AAGACC	2	12	141324	141335	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	46445716
55	NC_005861	TCCTTC	2	12	144087	144098	0 %	50 %	0 %	50 %	46445718
56	NC_005861	ATCTAA	2	12	144156	144167	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	46445718
57	NC_005861	TTTTGG	2	12	158581	158592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445730
58	NC_005861	ATTTTG	2	12	161378	161389	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46445733
59	NC_005861	GGTTCA	2	12	161459	161470	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	46445733
60	NC_005861	GTGGAA	2	12	162444	162455	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	46445733
61	NC_005861	GCTAGG	2	12	162854	162865	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	46445734
62	NC_005861	CCTAAA	2	12	163722	163733	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	46445735
63	NC_005861	GGAATA	2	12	165758	165769	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46445736
64	NC_005861	CATTCC	2	12	167488	167499	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	46445737
65	NC_005861	ATTCTT	2	12	172075	172086	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	46445740
66	NC_005861	CTTTTT	2	12	172974	172985	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	46445741
67	NC_005861	TTGAAT	2	12	174832	174843	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005861	AAAGAT	2	12	174917	174928	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46445742
69	NC_005861	TAAACC	2	12	183150	183161	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	46445749
70	NC_005861	AATAGG	2	12	184045	184056	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46445750
71	NC_005861	ACATTT	2	12	185006	185017	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	46445750
72	NC_005861	GGATTA	2	12	185364	185375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445751
73	NC_005861	GTTGAG	2	12	187254	187265	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	46445752
74	NC_005861	TTTTGA	2	12	189503	189514	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46445754
75	NC_005861	AATTTA	2	12	192876	192887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005861	TAAAAG	2	12	197848	197859	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46445761
77	NC_005861	TTCCAG	2	12	198766	198777	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46445762
78	NC_005861	TTGAGT	2	12	200244	200255	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	46445763
79	NC_005861	GATTTA	2	12	208544	208555	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	46445769
80	NC_005861	TTTTTA	2	12	208638	208649	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	46445769
81	NC_005861	TGAAAA	2	12	210083	210094	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	161611310
82	NC_005861	GAAAAA	2	12	210885	210896	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005861	AGATAT	2	12	214652	214663	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005861	TTTTAG	2	12	216218	216229	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46445775
85	NC_005861	GAATTG	2	12	216400	216411	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445775
86	NC_005861	AAATCA	2	12	219742	219753	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	46445779
87	NC_005861	AAGGAA	2	12	230025	230036	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445787
88	NC_005861	GAATTG	2	12	231720	231731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445788
89	NC_005861	TTCCAA	2	12	237424	237435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445792
90	NC_005861	AAAATA	2	12	238254	238265	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005861	AATCTC	2	12	240766	240777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445795
92	NC_005861	AATGGC	2	12	241493	241504	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46445796
93	NC_005861	CAAAAA	2	12	243437	243448	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	46445798
94	NC_005861	AGCTAA	2	12	244593	244604	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46445799
95	NC_005861	TTCTTT	2	12	247186	247197	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	46445802
96	NC_005861	ATATAA	2	12	250763	250774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445805
97	NC_005861	TAAAAA	2	12	252924	252935	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	46445805
98	NC_005861	CTTTTA	2	12	254395	254406	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	46445806
99	NC_005861	AGATGA	2	12	255588	255599	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46445806
100	NC_005861	TGAAAA	2	12	256179	256190	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46445806
101	NC_005861	GAAAAA	2	12	260498	260509	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	46445807
102	NC_005861	TTTGAA	2	12	260766	260777	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005861	TTAGAG	2	12	261796	261807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445808
104	NC_005861	TCAAAT	2	12	266359	266370	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	46445810
105	NC_005861	AAGAAA	2	12	269556	269567	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	46445812
106	NC_005861	GATTTT	2	12	272700	272711	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46445815
107	NC_005861	GATTTT	2	12	272939	272950	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	46445815
108	NC_005861	AAAATA	2	12	273399	273410	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	46445816
109	NC_005861	CGATAG	2	12	273761	273772	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46445816
110	NC_005861	TAAAAA	2	12	275389	275400	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	46445818
111	NC_005861	GATCGT	2	12	279022	279033	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	46445821
112	NC_005861	GAAAAT	2	12	279907	279918	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46445821
113	NC_005861	CGCTCA	2	12	287509	287520	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	46445827
114	NC_005861	ATTTCC	2	12	291627	291638	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	46445830
115	NC_005861	ATAATT	2	12	292379	292390	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005861	AGTTAT	2	12	292987	292998	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005861	TCATCT	2	12	293137	293148	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	46445832
118	NC_005861	TTCTCA	2	12	293193	293204	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	46445832
119	NC_005861	CTTCAA	2	12	293725	293736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445832
120	NC_005861	TTTATA	2	12	297900	297911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445836
121	NC_005861	CATAAT	2	12	299854	299865	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	46445839
122	NC_005861	TTTAAT	2	12	300764	300775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445840
123	NC_005861	TTTCCT	2	12	301616	301627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445841
124	NC_005861	GTTTTT	2	12	304110	304121	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	46445843
125	NC_005861	TAAAGA	2	12	308406	308417	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46445848
126	NC_005861	CAAACC	2	12	309511	309522	50 %	0 %	0 %	50 %	46445848
127	NC_005861	AGCTAA	2	12	311760	311771	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46445853
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133	NC_005861	TAAAAT	2	12	319560	319571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005861	TGAATT	2	12	323781	323792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	46445862
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229	NC_005861	TGAAAT	2	12	532729	532740	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	46446032
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236	NC_005861	TTGATA	2	12	544118	544129	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
237	NC_005861	ACCAAA	2	12	545248	545259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46446042
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361	NC_005861	ATGGGA	2	12	847299	847310	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	46446329
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468	NC_005861	CCCCTA	2	12	1097675	1097686	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	46446540
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470	NC_005861	AAAATT	2	12	1102672	1102683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_005861	ACACCA	2	12	1105982	1105993	50 %	0 %	0 %	50 %	46446546
472	NC_005861	AAAATT	2	12	1107232	1107243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46446548
473	NC_005861	GGTAAA	2	12	1108398	1108409	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46446549
474	NC_005861	ATTCCA	2	12	1109364	1109375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46446549
475	NC_005861	TTTCTT	2	12	1110590	1110601	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	46446550
476	NC_005861	AAAAGA	2	12	1115772	1115783	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	46446556
477	NC_005861	TATCAA	2	12	1117312	1117323	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	46446557
478	NC_005861	AGACAT	2	12	1120558	1120569	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46446561
479	NC_005861	TTGTTT	2	12	1124888	1124899	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	46446567
480	NC_005861	CCCTAA	2	12	1127546	1127557	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	46446570
481	NC_005861	GATCCT	2	12	1129574	1129585	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	46446572
482	NC_005861	GTTCCT	2	12	1134200	1134211	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	46446572
483	NC_005861	GTTGTC	2	12	1134341	1134352	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	46446572
484	NC_005861	GAAGTA	2	12	1135307	1135318	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	46446572
485	NC_005861	AGGAAA	2	12	1138972	1138983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46446575
486	NC_005861	AAAACA	2	12	1139660	1139671	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	46446576
487	NC_005861	AAATCT	2	12	1139996	1140007	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	46446576
488	NC_005861	TTTCTT	2	12	1149235	1149246	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	46446584
489	NC_005861	CATGCG	2	12	1150416	1150427	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46446585
490	NC_005861	GATAAA	2	12	1150788	1150799	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46446586
491	NC_005861	ATTGAT	2	12	1154435	1154446	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
492	NC_005861	ATCATT	2	12	1155274	1155285	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	46446591
493	NC_005861	ATGATC	2	12	1159046	1159057	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	46446597
494	NC_005861	ATGAAA	2	12	1161539	1161550	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	46446600
495	NC_005861	TCTAAA	2	12	1165463	1165474	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	46446604
496	NC_005861	ATGCCA	2	12	1167376	1167387	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	46446604
497	NC_005861	CCGGAT	2	12	1167390	1167401	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	46446604
498	NC_005861	ATGGCA	2	12	1168451	1168462	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	46446604
499	NC_005861	TTAAAA	2	12	1173261	1173272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46446608
500	NC_005861	GCTAAA	2	12	1176542	1176553	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	46446612

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