MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 chromosome

Total Repeats: 2108

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005861	AAATT	2	10	24	33	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005861	GTTAT	2	10	1609	1618	20 %	60 %	20 %	0 %	46445637
3	NC_005861	GATTG	2	10	1940	1949	20 %	40 %	40 %	0 %	46445637
4	NC_005861	TTTTC	2	10	4303	4312	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_005861	AATTT	2	10	4756	4765	40 %	60 %	0 %	0 %	46445638
6	NC_005861	GAAGT	2	10	4885	4894	40 %	20 %	40 %	0 %	46445638
7	NC_005861	GAAAA	2	10	7904	7913	80 %	0 %	20 %	0 %	46445639
8	NC_005861	TTCTT	2	10	8740	8749	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_005861	TAAAT	2	10	9456	9465	60 %	40 %	0 %	0 %	46445641
10	NC_005861	TTTTC	2	10	10582	10591	0 %	80 %	0 %	20 %	46445641
11	NC_005861	ATCTT	2	10	10779	10788	20 %	60 %	0 %	20 %	46445641
12	NC_005861	GAATT	2	10	12045	12054	40 %	40 %	20 %	0 %	46445642
13	NC_005861	AAATT	2	10	12236	12245	60 %	40 %	0 %	0 %	46445642
14	NC_005861	TGAAT	2	10	12829	12838	40 %	40 %	20 %	0 %	46445642
15	NC_005861	GAATG	2	10	17467	17476	40 %	20 %	40 %	0 %	46445643
16	NC_005861	ATGAC	2	10	17993	18002	40 %	20 %	20 %	20 %	46445643
17	NC_005861	TTTCG	2	10	18260	18269	0 %	60 %	20 %	20 %	46445643
18	NC_005861	AAATG	2	10	18330	18339	60 %	20 %	20 %	0 %	46445643
19	NC_005861	CTTTT	2	10	18464	18473	0 %	80 %	0 %	20 %	46445643
20	NC_005861	TTGAT	2	10	18539	18548	20 %	60 %	20 %	0 %	46445643
21	NC_005861	ATATT	2	10	18567	18576	40 %	60 %	0 %	0 %	46445643
22	NC_005861	GCAAA	2	10	18879	18888	60 %	0 %	20 %	20 %	46445644
23	NC_005861	AATTA	2	10	20722	20731	60 %	40 %	0 %	0 %	46445644
24	NC_005861	ATCAA	2	10	20916	20925	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
25	NC_005861	TTATT	2	10	21558	21567	20 %	80 %	0 %	0 %	46445645
26	NC_005861	TTTGA	2	10	22165	22174	20 %	60 %	20 %	0 %	46445646
27	NC_005861	AATTT	2	10	23540	23549	40 %	60 %	0 %	0 %	46445646
28	NC_005861	ATTTT	2	10	23704	23713	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005861	AATCG	2	10	24324	24333	40 %	20 %	20 %	20 %	46445647
30	NC_005861	ATTAA	2	10	24707	24716	60 %	40 %	0 %	0 %	46445647
31	NC_005861	GATGG	2	10	27029	27038	20 %	20 %	60 %	0 %	46445650
32	NC_005861	TAATT	2	10	28431	28440	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005861	ATTTT	2	10	29219	29228	20 %	80 %	0 %	0 %	46445651
34	NC_005861	GCTAT	2	10	29725	29734	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_005861	TCAAA	2	10	29735	29744	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_005861	ATGAA	2	10	30997	31006	60 %	20 %	20 %	0 %	46445652
37	NC_005861	CCAAG	2	10	31500	31509	40 %	0 %	20 %	40 %	46445652
38	NC_005861	TAAAT	2	10	32092	32101	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005861	AAATA	2	10	33195	33204	80 %	20 %	0 %	0 %	46445655
40	NC_005861	TCGAT	2	10	33526	33535	20 %	40 %	20 %	20 %	46445656
41	NC_005861	CTTTT	2	10	34985	34994	0 %	80 %	0 %	20 %	46445657
42	NC_005861	AGTTT	2	10	35288	35297	20 %	60 %	20 %	0 %	46445657
43	NC_005861	ATTTC	2	10	35388	35397	20 %	60 %	0 %	20 %	46445657
44	NC_005861	ATGAT	2	10	40433	40442	40 %	40 %	20 %	0 %	46445660
45	NC_005861	TTAAA	2	10	43091	43100	60 %	40 %	0 %	0 %	46445661
46	NC_005861	TTTAA	2	10	43119	43128	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005861	AGATG	2	10	43853	43862	40 %	20 %	40 %	0 %	46445662
48	NC_005861	TATAT	2	10	44070	44079	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005861	TTAAA	2	10	44098	44107	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005861	TGTCT	2	10	46964	46973	0 %	60 %	20 %	20 %	46445666
51	NC_005861	TGATT	2	10	50179	50188	20 %	60 %	20 %	0 %	46445667
52	NC_005861	TAGTT	2	10	51493	51502	20 %	60 %	20 %	0 %	46445667
53	NC_005861	AAAAC	2	10	54229	54238	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_005861	AAAAG	2	10	54335	54344	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005861	TAATG	2	10	55457	55466	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005861	TAAAT	2	10	55571	55580	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005861	TAAAT	2	10	55999	56008	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005861	AATAA	2	10	56009	56018	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005861	AAGAA	2	10	56438	56447	80 %	0 %	20 %	0 %	46445671
60	NC_005861	GACAC	2	10	56908	56917	40 %	0 %	20 %	40 %	46445671
61	NC_005861	ATAAA	2	10	57178	57187	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005861	AAGAA	2	10	57986	57995	80 %	0 %	20 %	0 %	46445672
63	NC_005861	TTTGG	2	10	58109	58118	0 %	60 %	40 %	0 %	46445672
64	NC_005861	GAAAA	2	10	60410	60419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005861	CCATC	2	10	60497	60506	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
66	NC_005861	AGCTG	2	10	60723	60732	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
67	NC_005861	ATTTA	2	10	61738	61747	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005861	AGGAG	2	10	62349	62358	40 %	0 %	60 %	0 %	46445674
69	NC_005861	TTTTG	2	10	67932	67941	0 %	80 %	20 %	0 %	46445675
70	NC_005861	GCTTC	2	10	68481	68490	0 %	40 %	20 %	40 %	46445675
71	NC_005861	AACTC	2	10	72273	72282	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_005861	AACGA	2	10	73765	73774	60 %	0 %	20 %	20 %	46445677
73	NC_005861	CAATT	2	10	75741	75750	40 %	40 %	0 %	20 %	46445678
74	NC_005861	GCTCG	2	10	75803	75812	0 %	20 %	40 %	40 %	46445678
75	NC_005861	AGGAG	2	10	81906	81915	40 %	0 %	60 %	0 %	46445680
76	NC_005861	GCCTA	2	10	83510	83519	20 %	20 %	20 %	40 %	46445680
77	NC_005861	ATCTC	2	10	84462	84471	20 %	40 %	0 %	40 %	46445680
78	NC_005861	TTTAA	2	10	85037	85046	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005861	AGGGA	2	10	85303	85312	40 %	0 %	60 %	0 %	46445681
80	NC_005861	AAATT	2	10	85509	85518	60 %	40 %	0 %	0 %	46445682
81	NC_005861	TTTCT	2	10	86883	86892	0 %	80 %	0 %	20 %	46445682
82	NC_005861	CAAAA	2	10	88075	88084	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_005861	TAAAA	2	10	88968	88977	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005861	ATTTA	2	10	89056	89065	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005861	CAAAA	2	10	90953	90962	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_005861	AGGAG	2	10	92149	92158	40 %	0 %	60 %	0 %	46445685
87	NC_005861	GAGAT	2	10	92421	92430	40 %	20 %	40 %	0 %	46445685
88	NC_005861	TGGCT	2	10	92964	92973	0 %	40 %	40 %	20 %	46445685
89	NC_005861	AATAT	2	10	93390	93399	60 %	40 %	0 %	0 %	46445685
90	NC_005861	TCGAT	2	10	94691	94700	20 %	40 %	20 %	20 %	46445685
91	NC_005861	GAGAT	2	10	95970	95979	40 %	20 %	40 %	0 %	46445686
92	NC_005861	AAAAT	2	10	98597	98606	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005861	TTTTA	2	10	102051	102060	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005861	CAGAG	2	10	105013	105022	40 %	0 %	40 %	20 %	46445691
95	NC_005861	TTAGC	2	10	110125	110134	20 %	40 %	20 %	20 %	46445692
96	NC_005861	AGGAG	2	10	111089	111098	40 %	0 %	60 %	0 %	46445693
97	NC_005861	AAGAT	2	10	111361	111370	60 %	20 %	20 %	0 %	46445693
98	NC_005861	AATTT	2	10	116656	116665	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005861	CTATT	2	10	118675	118684	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_005861	GCTAT	2	10	121189	121198	20 %	40 %	20 %	20 %	46445698
101	NC_005861	TTTGT	2	10	121715	121724	0 %	80 %	20 %	0 %	46445698
102	NC_005861	CATCA	2	10	121951	121960	40 %	20 %	0 %	40 %	46445698
103	NC_005861	TAAAA	2	10	122941	122950	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005861	AATTG	2	10	124054	124063	40 %	40 %	20 %	0 %	46445700
105	NC_005861	TAAAA	2	10	125481	125490	80 %	20 %	0 %	0 %	46445701
106	NC_005861	AATTT	2	10	127119	127128	40 %	60 %	0 %	0 %	161611311
107	NC_005861	CAATT	2	10	128178	128187	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_005861	CTTTT	2	10	128370	128379	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
109	NC_005861	GTTGT	2	10	128535	128544	0 %	60 %	40 %	0 %	46445705
110	NC_005861	GATTT	2	10	128747	128756	20 %	60 %	20 %	0 %	46445705
111	NC_005861	TTTCA	2	10	129121	129130	20 %	60 %	0 %	20 %	46445705
112	NC_005861	AAAAT	2	10	131006	131015	80 %	20 %	0 %	0 %	46445705
113	NC_005861	TGCTT	2	10	134145	134154	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_005861	AAAGC	2	10	134886	134895	60 %	0 %	20 %	20 %	46445710
115	NC_005861	ATCAA	2	10	135211	135220	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_005861	TGATT	2	10	135857	135866	20 %	60 %	20 %	0 %	46445711
117	NC_005861	GAAAG	2	10	137763	137772	60 %	0 %	40 %	0 %	46445712
118	NC_005861	TTAAT	2	10	140384	140393	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005861	TACCA	2	10	141474	141483	40 %	20 %	0 %	40 %	46445716
120	NC_005861	ATTTT	2	10	143343	143352	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005861	CTGAA	2	10	145054	145063	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
122	NC_005861	AAAGT	2	10	146032	146041	60 %	20 %	20 %	0 %	46445720
123	NC_005861	AATCG	2	10	149616	149625	40 %	20 %	20 %	20 %	46445722
124	NC_005861	AATTG	2	10	150427	150436	40 %	40 %	20 %	0 %	46445723
125	NC_005861	AGTAA	2	10	151884	151893	60 %	20 %	20 %	0 %	46445725
126	NC_005861	AATAG	2	10	154190	154199	60 %	20 %	20 %	0 %	46445727
127	NC_005861	TAAAA	2	10	154967	154976	80 %	20 %	0 %	0 %	46445727
128	NC_005861	ACTTT	2	10	155648	155657	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
129	NC_005861	TCATT	2	10	156536	156545	20 %	60 %	0 %	20 %	46445728
130	NC_005861	GCTTG	2	10	156559	156568	0 %	40 %	40 %	20 %	46445728
131	NC_005861	CAAAG	2	10	157086	157095	60 %	0 %	20 %	20 %	46445728
132	NC_005861	AAAGT	2	10	157366	157375	60 %	20 %	20 %	0 %	46445729
133	NC_005861	AAAAT	2	10	159169	159178	80 %	20 %	0 %	0 %	46445730
134	NC_005861	GTTTG	2	10	159420	159429	0 %	60 %	40 %	0 %	46445731
135	NC_005861	GGTTT	2	10	162585	162594	0 %	60 %	40 %	0 %	46445733
136	NC_005861	TACTT	2	10	162875	162884	20 %	60 %	0 %	20 %	46445734
137	NC_005861	GTCTT	2	10	165586	165595	0 %	60 %	20 %	20 %	46445736
138	NC_005861	AAACA	2	10	166543	166552	80 %	0 %	0 %	20 %	46445736
139	NC_005861	ATGAT	2	10	167036	167045	40 %	40 %	20 %	0 %	46445737
140	NC_005861	ATTCT	2	10	168393	168402	20 %	60 %	0 %	20 %	46445737
141	NC_005861	TTTGA	2	10	168778	168787	20 %	60 %	20 %	0 %	46445737
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