MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 chromosome

Total Repeats: 30662

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005861	AGA	2	6	156	161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445635
2	NC_005861	TAT	2	6	171	176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445635
3	NC_005861	AGC	2	6	186	191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445635
4	NC_005861	CAA	2	6	270	275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445635
5	NC_005861	AGA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005861	TGA	2	6	541	546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445636
7	NC_005861	ATT	2	6	555	560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445636
8	NC_005861	CTA	2	6	779	784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_005861	TTA	2	6	811	816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005861	TTA	2	6	906	911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005861	CTC	2	6	1110	1115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445637
12	NC_005861	ATC	2	6	1119	1124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445637
13	NC_005861	AGC	2	6	1183	1188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445637
14	NC_005861	GAA	2	6	1214	1219	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
15	NC_005861	GAA	2	6	1223	1228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
16	NC_005861	GTT	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
17	NC_005861	GAT	2	6	1319	1324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445637
18	NC_005861	TAA	2	6	1462	1467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445637
19	NC_005861	ATT	2	6	1529	1534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
20	NC_005861	TTA	2	6	1566	1571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
21	NC_005861	ATT	2	6	1664	1669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
22	NC_005861	TCT	2	6	1823	1828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445637
23	NC_005861	ACA	2	6	1963	1968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445637
24	NC_005861	ATT	2	6	1983	1988	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
25	NC_005861	CAG	2	6	1998	2003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445637
26	NC_005861	AAC	2	6	2049	2054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445637
27	NC_005861	AGG	2	6	2134	2139	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445637
28	NC_005861	CTT	2	6	2247	2252	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445637
29	NC_005861	AGG	2	6	2323	2328	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445637
30	NC_005861	GAT	2	6	2413	2418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445637
31	NC_005861	AAG	2	6	2469	2474	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
32	NC_005861	TCA	2	6	2548	2553	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445637
33	NC_005861	GTT	2	6	2608	2613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
34	NC_005861	AAG	2	6	2628	2633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
35	NC_005861	AAG	2	6	2652	2657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
36	NC_005861	TGA	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445637
37	NC_005861	GAA	2	6	2715	2720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
38	NC_005861	TTC	2	6	2725	2730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445637
39	NC_005861	GTT	2	6	2855	2860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
40	NC_005861	GCA	2	6	2921	2926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445637
41	NC_005861	GGA	2	6	3005	3010	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445637
42	NC_005861	GTT	2	6	3030	3035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
43	NC_005861	AGA	2	6	3046	3051	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445637
44	NC_005861	TGA	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445637
45	NC_005861	ATT	2	6	3452	3457	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445637
46	NC_005861	CAA	2	6	3470	3475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445637
47	NC_005861	CAG	2	6	3513	3518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445637
48	NC_005861	CCT	2	6	3618	3623	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445637
49	NC_005861	AAC	2	6	3745	3750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445637
50	NC_005861	TGT	2	6	3865	3870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445637
51	NC_005861	ATA	3	9	4054	4062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005861	ATT	2	6	4121	4126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005861	CCA	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_005861	AAT	2	6	4294	4299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005861	GCA	2	6	4443	4448	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445638
56	NC_005861	CAA	2	6	4479	4484	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445638
57	NC_005861	ACG	2	6	4516	4521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445638
58	NC_005861	GTG	2	6	4597	4602	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46445638
59	NC_005861	GTG	2	6	4696	4701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46445638
60	NC_005861	TAA	2	6	4874	4879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445638
61	NC_005861	GAT	2	6	5043	5048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445638
62	NC_005861	CGA	2	6	5162	5167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445638
63	NC_005861	TGG	2	6	5387	5392	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46445638
64	NC_005861	GCA	2	6	5409	5414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445638
65	NC_005861	TCA	2	6	5432	5437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445638
66	NC_005861	GCT	2	6	5454	5459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46445638
67	NC_005861	GGA	2	6	5463	5468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445638
68	NC_005861	AAG	2	6	5491	5496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445638
69	NC_005861	TTA	3	9	5660	5668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445638
70	NC_005861	AGA	2	6	5771	5776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	46445638
71	NC_005861	TCT	2	6	5953	5958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
72	NC_005861	TGA	2	6	5965	5970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445639
73	NC_005861	CGC	2	6	6021	6026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46445639
74	NC_005861	CTA	2	6	6065	6070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445639
75	NC_005861	GTT	2	6	6121	6126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445639
76	NC_005861	CTT	3	9	6128	6136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
77	NC_005861	AAT	2	6	6222	6227	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
78	NC_005861	TCA	2	6	6250	6255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445639
79	NC_005861	CTT	2	6	6287	6292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
80	NC_005861	CGG	2	6	6371	6376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	46445639
81	NC_005861	AAC	2	6	6417	6422	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445639
82	NC_005861	CCT	2	6	6433	6438	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445639
83	NC_005861	CTG	2	6	6473	6478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46445639
84	NC_005861	TGC	2	6	6492	6497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46445639
85	NC_005861	GTT	2	6	6524	6529	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445639
86	NC_005861	CTT	2	6	6562	6567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
87	NC_005861	AGG	2	6	6606	6611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445639
88	NC_005861	TGA	2	6	6673	6678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445639
89	NC_005861	TAA	2	6	6717	6722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
90	NC_005861	GTT	2	6	6766	6771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445639
91	NC_005861	ATA	2	6	6808	6813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
92	NC_005861	TCT	2	6	6949	6954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
93	NC_005861	CTT	2	6	6976	6981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
94	NC_005861	TCA	2	6	7024	7029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445639
95	NC_005861	TAA	2	6	7179	7184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
96	NC_005861	TCC	2	6	7185	7190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445639
97	NC_005861	AAT	2	6	7255	7260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
98	NC_005861	TCA	2	6	7270	7275	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	46445639
99	NC_005861	TTC	2	6	7281	7286	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
100	NC_005861	TTC	2	6	7308	7313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
101	NC_005861	TTC	2	6	7329	7334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
102	NC_005861	AAT	2	6	7370	7375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
103	NC_005861	CTT	2	6	7397	7402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
104	NC_005861	AAT	2	6	7434	7439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
105	NC_005861	TAT	2	6	7509	7514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445639
106	NC_005861	TTC	2	6	7614	7619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445639
107	NC_005861	TTA	2	6	7717	7722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445639
108	NC_005861	ATT	2	6	7797	7802	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445639
109	NC_005861	TCC	2	6	7896	7901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445639
110	NC_005861	ATA	2	6	7962	7967	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
111	NC_005861	TCC	2	6	8013	8018	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	46445639
112	NC_005861	GTT	2	6	8107	8112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445639
113	NC_005861	AAT	2	6	8207	8212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445639
114	NC_005861	AGC	2	6	8214	8219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445639
115	NC_005861	TAG	2	6	8279	8284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445639
116	NC_005861	TTA	2	6	8446	8451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005861	AAT	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005861	ATA	2	6	8808	8813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005861	ATT	2	6	8975	8980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005861	TAT	2	6	8998	9003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005861	TTC	2	6	9004	9009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_005861	GGA	2	6	9214	9219	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445640
123	NC_005861	GAT	2	6	9266	9271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005861	GAG	2	6	9529	9534	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	46445641
125	NC_005861	CTT	2	6	9580	9585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445641
126	NC_005861	AGT	2	6	9759	9764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445641
127	NC_005861	ATG	2	6	9791	9796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445641
128	NC_005861	TTC	2	6	9823	9828	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445641
129	NC_005861	CTG	2	6	9889	9894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	46445641
130	NC_005861	ATA	2	6	10002	10007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445641
131	NC_005861	TAA	2	6	10021	10026	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445641
132	NC_005861	TTC	2	6	10336	10341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	46445641
133	NC_005861	GCC	2	6	10406	10411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	46445641
134	NC_005861	AAT	2	6	10451	10456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445641
135	NC_005861	CAA	2	6	10477	10482	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	46445641
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245	NC_005861	TAA	2	6	18824	18829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445643
246	NC_005861	TTA	2	6	18972	18977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445644
247	NC_005861	ATT	2	6	19023	19028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445644
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259	NC_005861	ATT	2	6	19724	19729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	46445644
260	NC_005861	TAA	2	6	19736	19741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	46445644
261	NC_005861	AGC	2	6	19772	19777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	46445644
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263	NC_005861	GAT	2	6	19805	19810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	46445644
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266	NC_005861	GGT	2	6	20302	20307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	46445644
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271	NC_005861	GTT	2	6	20814	20819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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277	NC_005861	TGT	2	6	21472	21477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	46445645
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