MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Candidatus Protochlamydia amoebophila UWE25 chromosome

Total Repeats: 4837

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005861	AGA	2	6	357	362	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005861	CTA	2	6	779	784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_005861	TTA	2	6	811	816	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005861	TTA	2	6	906	911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005861	ATA	3	9	4054	4062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005861	ATT	2	6	4121	4126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005861	CCA	2	6	4130	4135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_005861	AAT	2	6	4294	4299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005861	TTA	2	6	8446	8451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005861	AAT	2	6	8542	8547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005861	ATA	2	6	8808	8813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005861	ATT	2	6	8975	8980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005861	TAT	2	6	8998	9003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005861	TTC	2	6	9004	9009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_005861	GAT	2	6	9266	9271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005861	TGT	2	6	11110	11115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005861	TAT	2	6	11214	11219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005861	TTC	2	6	11313	11318	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_005861	TAT	2	6	11413	11418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005861	TTA	2	6	11456	11461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005861	ATT	2	6	11542	11547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005861	ATT	2	6	11556	11561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005861	ATT	2	6	11611	11616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005861	AAT	2	6	20752	20757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005861	GTT	2	6	20814	20819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005861	TGA	2	6	20828	20833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005861	TTA	3	9	21041	21049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005861	CAT	2	6	21209	21214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_005861	AGT	2	6	21274	21279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005861	CAT	2	6	21392	21397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_005861	AGA	2	6	26599	26604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005861	GAA	2	6	28068	28073	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005861	TGA	2	6	28177	28182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005861	ATT	2	6	28397	28402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005861	TGA	2	6	28515	28520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005861	CGA	2	6	29596	29601	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_005861	ATG	2	6	29667	29672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005861	TCT	2	6	29813	29818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_005861	TTC	2	6	29906	29911	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_005861	ATT	2	6	34837	34842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005861	GAG	2	6	34853	34858	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005861	TTA	2	6	35893	35898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005861	TAA	2	6	36500	36505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005861	TTC	2	6	36615	36620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_005861	TAA	3	9	36627	36635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005861	TAT	2	6	36681	36686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005861	AGA	2	6	37398	37403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005861	ATG	2	6	37469	37474	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005861	TGA	2	6	43287	43292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005861	GAA	2	6	43299	43304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005861	ATT	2	6	43440	43445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005861	GCA	2	6	43454	43459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_005861	TAA	2	6	43504	43509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005861	TTA	2	6	43532	43537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005861	GGT	2	6	43546	43551	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005861	AAG	2	6	43974	43979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005861	TTC	2	6	43985	43990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_005861	CAT	2	6	44160	44165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_005861	AAT	2	6	44198	44203	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005861	ATT	2	6	44666	44671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005861	TTG	2	6	46789	46794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005861	AAG	2	6	48220	48225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005861	AAT	2	6	48235	48240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005861	TCT	2	6	48356	48361	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_005861	ATT	2	6	54205	54210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005861	TAA	2	6	54761	54766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005861	CTA	2	6	55393	55398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_005861	GTA	2	6	55431	55436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005861	ATT	2	6	55532	55537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005861	AAT	2	6	55625	55630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005861	GTT	2	6	55787	55792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005861	ATT	2	6	55851	55856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005861	TAA	2	6	55947	55952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005861	TAA	2	6	56049	56054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005861	AAT	2	6	56056	56061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005861	AAT	2	6	56090	56095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005861	TGG	2	6	56103	56108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005861	ATT	2	6	57099	57104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005861	TTA	2	6	57106	57111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005861	TAG	2	6	57127	57132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005861	GTT	2	6	60272	60277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005861	ATA	2	6	60310	60315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005861	GCT	2	6	60316	60321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_005861	TCT	2	6	60598	60603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_005861	TCA	2	6	60619	60624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_005861	TCC	2	6	60671	60676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_005861	TAA	2	6	60810	60815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005861	TTA	2	6	60826	60831	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005861	TTG	2	6	61291	61296	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005861	ATA	2	6	61311	61316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005861	ATT	2	6	61335	61340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005861	AAG	2	6	61457	61462	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005861	TTA	2	6	61481	61486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005861	AAC	2	6	61650	61655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_005861	ATT	2	6	61714	61719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005861	TAA	2	6	61784	61789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005861	TTA	2	6	72312	72317	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005861	ATT	2	6	72382	72387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005861	TTG	2	6	72493	72498	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005861	CCT	2	6	73989	73994	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_005861	TAA	2	6	74000	74005	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005861	GAT	2	6	77504	77509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005861	ATA	2	6	81110	81115	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005861	TAT	2	6	81134	81139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005861	ATT	3	9	81170	81178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005861	TAA	2	6	81210	81215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005861	AAT	2	6	81241	81246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005861	TAA	2	6	81280	81285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005861	TTA	2	6	84726	84731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005861	TAA	2	6	84740	84745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005861	AGC	2	6	84842	84847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_005861	CAA	2	6	84850	84855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_005861	TCA	2	6	85414	85419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_005861	AAT	2	6	87118	87123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005861	ATT	2	6	87158	87163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005861	ATA	2	6	87283	87288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005861	TGA	2	6	87473	87478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005861	TTC	2	6	87509	87514	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_005861	CTT	2	6	87543	87548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_005861	TGA	2	6	87556	87561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005861	ATG	3	9	87593	87601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005861	ATG	2	6	87754	87759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005861	TTA	2	6	89009	89014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_005861	ACA	2	6	89041	89046	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_005861	AAT	2	6	89266	89271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005861	GAT	2	6	89296	89301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005861	ATG	2	6	89303	89308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005861	ATT	2	6	89377	89382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005861	AAT	2	6	89402	89407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005861	TTA	2	6	89547	89552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005861	GCT	2	6	89558	89563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_005861	ATG	2	6	90921	90926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005861	TGA	2	6	91037	91042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005861	AAG	2	6	91043	91048	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005861	ATT	2	6	91187	91192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005861	GCT	2	6	91245	91250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_005861	TGT	2	6	91299	91304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005861	TTC	2	6	91365	91370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_005861	TTA	2	6	91459	91464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005861	AAT	2	6	95079	95084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005861	GTT	2	6	95197	95202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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