Hexa-nucleotide Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 237

Go To Repeat Summary Page

Download The Result in

S.No.Genome IDMotifIterationsLengthStartEndA%T%G%C% Protein ID
1NC_005838CCCGGG2129039140 %0 %50 %50 %46255072
2NC_005838GTCTCC212248324940 %33.33 %16.67 %50 %46255074
3NC_005838AGGGCC2122983299416.67 %0 %50 %33.33 %46255075
4NC_005838CCAGGG2123109312016.67 %0 %50 %33.33 %46255075
5NC_005838CGAAGG2123157316833.33 %0 %50 %16.67 %46255075
6NC_005838AGGTCC2123584359516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %46255076
7NC_005838GCGGTG212497149820 %16.67 %66.67 %16.67 %46255077
8NC_005838GGCCTC212591059210 %16.67 %33.33 %50 %46255078
9NC_005838GCCCTC212605960700 %16.67 %16.67 %66.67 %46255079
10NC_005838AGGCTC2127350736116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %46255080
11NC_005838GTGGGG212749175020 %16.67 %83.33 %0 %46255080
12NC_005838CCGAGG2128032804316.67 %0 %50 %33.33 %46255081
13NC_005838TCCAGG2128869888016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %46255081
14NC_005838CCTGGC212982898390 %16.67 %33.33 %50 %46255083
15NC_005838GGGGTG212994099510 %16.67 %83.33 %0 %46255083
16NC_005838GAGGCG212110751108616.67 %0 %66.67 %16.67 %46255084
17NC_005838ACCCTC212112831129416.67 %16.67 %0 %66.67 %46255085
18NC_005838CGCCCC21211666116770 %0 %16.67 %83.33 %46255085
19NC_005838CCCTGG21212265122760 %16.67 %33.33 %50 %46255085
20NC_005838GGTCCT21212679126900 %33.33 %33.33 %33.33 %46255086
21NC_005838CCTGGA212129191293016.67 %16.67 %33.33 %33.33 %46255086
22NC_005838CACCCC212132521326316.67 %0 %0 %83.33 %46255086
23NC_005838GCCTTG21214071140820 %33.33 %33.33 %33.33 %46255088
24NC_005838CCCTCC21214216142270 %16.67 %0 %83.33 %46255088
25NC_005838GCCTGG21215184151950 %16.67 %50 %33.33 %46255090
26NC_005838CCTCCG21216621166320 %16.67 %16.67 %66.67 %46255092
27NC_005838GGCCCT21217742177530 %16.67 %33.33 %50 %Non-Coding
28NC_005838CCCTCC21218552185630 %16.67 %0 %83.33 %46255094
29NC_005838CGGCCT21218922189330 %16.67 %33.33 %50 %46255094
30NC_005838TGGGGA212196831969416.67 %16.67 %66.67 %0 %46255094
31NC_005838AGACGA212212732128450 %0 %33.33 %16.67 %46255095
32NC_005838TCCACG212216042161516.67 %16.67 %16.67 %50 %46255096
33NC_005838GTTCAC212259452595616.67 %33.33 %16.67 %33.33 %46255099
34NC_005838CAGGTG212266472665816.67 %16.67 %50 %16.67 %46255100
35NC_005838CCCAGG212271372714816.67 %0 %33.33 %50 %46255100
36NC_005838GCCCAG212273932740416.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
37NC_005838CACCTT212288902890116.67 %33.33 %0 %50 %46255103
38NC_005838GAGCGC212291392915016.67 %0 %50 %33.33 %46255103
39NC_005838ATCGGG212292772928816.67 %16.67 %50 %16.67 %46255104
40NC_005838CGGGGG21231907319180 %0 %83.33 %16.67 %46255106
41NC_005838CGTGGC21232335323460 %16.67 %50 %33.33 %46255107
42NC_005838GGGCCT21232892329030 %16.67 %50 %33.33 %46255107
43NC_005838GGCGGT21233844338550 %16.67 %66.67 %16.67 %46255108
44NC_005838CTGGAG212343573436816.67 %16.67 %50 %16.67 %46255109
45NC_005838TCCTCG21237474374850 %33.33 %16.67 %50 %46255112
46NC_005838GGCCAC212381203813116.67 %0 %33.33 %50 %46255112
47NC_005838CGTCCT21238219382300 %33.33 %16.67 %50 %46255112
48NC_005838CGCCTT21238723387340 %33.33 %16.67 %50 %46255113
49NC_005838CGGGGA212391843919516.67 %0 %66.67 %16.67 %46255113
50NC_005838CGGCCA212392293924016.67 %0 %33.33 %50 %46255113
51NC_005838GTTCTG21240732407430 %50 %33.33 %16.67 %46255115
52NC_005838CCTGGC21241560415710 %16.67 %33.33 %50 %46255116
53NC_005838GCCCTC21242436424470 %16.67 %16.67 %66.67 %46255117
54NC_005838GGACCT212424954250616.67 %16.67 %33.33 %33.33 %46255117
55NC_005838GGGCCC21242524425350 %0 %50 %50 %46255117
56NC_005838CCAGGG212440924410316.67 %0 %50 %33.33 %46255118
57NC_005838CCGTCC21245494455050 %16.67 %16.67 %66.67 %46255119
58NC_005838CTGGGC21245867458780 %16.67 %50 %33.33 %46255119
59NC_005838GCCCAG212475074751816.67 %0 %33.33 %50 %46255122
60NC_005838TTCCTC21247920479310 %50 %0 %50 %46255122
61NC_005838GTGGAG212521995221016.67 %16.67 %66.67 %0 %46255128
62NC_005838AAGGCC212527625277333.33 %0 %33.33 %33.33 %46255129
63NC_005838CGTCTT21255540555510 %50 %16.67 %33.33 %46255131
64NC_005838TCTTCC21256520565310 %50 %0 %50 %46255133
65NC_005838GGTCTT21256863568740 %50 %33.33 %16.67 %46255133
66NC_005838CCGACG212568775688816.67 %0 %33.33 %50 %46255133
67NC_005838TGGCCC21257150571610 %16.67 %33.33 %50 %46255133
68NC_005838CGCCCC21257844578550 %0 %16.67 %83.33 %46255134
69NC_005838GGTCCT21259454594650 %33.33 %33.33 %33.33 %46255137
70NC_005838ACCTCC212604826049316.67 %16.67 %0 %66.67 %46255137
71NC_005838GGAAGC212609616097233.33 %0 %50 %16.67 %46255138
72NC_005838CCTGGC21261175611860 %16.67 %33.33 %50 %46255138
73NC_005838GGCCGG21261577615880 %0 %66.67 %33.33 %46255138
74NC_005838GGCCCT21261763617740 %16.67 %33.33 %50 %46255138
75NC_005838GGGCCT21262423624340 %16.67 %50 %33.33 %46255140
76NC_005838GGGCGA212635326354316.67 %0 %66.67 %16.67 %46255141
77NC_005838AGGTGG212637116372216.67 %16.67 %66.67 %0 %46255141
78NC_005838GGGAGG212649086491916.67 %0 %83.33 %0 %46255142
79NC_005838GCCGAG212668826689316.67 %0 %50 %33.33 %46255144
80NC_005838CGGGTC21270888708990 %16.67 %50 %33.33 %46255149
81NC_005838CCGAGG212711657117616.67 %0 %50 %33.33 %46255149
82NC_005838ACATCC212720897210033.33 %16.67 %0 %50 %46255149
83NC_005838GAGCGT212723427235316.67 %16.67 %50 %16.67 %46255149
84NC_005838CAAGCC212736117362233.33 %0 %16.67 %50 %46255150
85NC_005838GGCCAG212754567546716.67 %0 %50 %33.33 %46255151
86NC_005838CTTCCC21281271812820 %33.33 %0 %66.67 %Non-Coding
87NC_005838GCCTCC21281568815790 %16.67 %16.67 %66.67 %46255156
88NC_005838GCTTGC21282688826990 %33.33 %33.33 %33.33 %46255156
89NC_005838AGGGCC212830958310616.67 %0 %50 %33.33 %46255157
90NC_005838CAGGGC212839378394816.67 %0 %50 %33.33 %46255159
91NC_005838GAGGGG212875258753616.67 %0 %83.33 %0 %46255164
92NC_005838CCTTCC21287959879700 %33.33 %0 %66.67 %46255165
93NC_005838TGCGGG21289507895180 %16.67 %66.67 %16.67 %46255168
94NC_005838ACCCGG212895828959316.67 %0 %33.33 %50 %46255168
95NC_005838CTCCTT21290252902630 %50 %0 %50 %Non-Coding
96NC_005838GTGGAG212905979060816.67 %16.67 %66.67 %0 %Non-Coding
97NC_005838CCTGGC21293351933620 %16.67 %33.33 %50 %46255173
98NC_005838CCTGGA212947139472416.67 %16.67 %33.33 %33.33 %46255173
99NC_005838GCGGGA212950799509016.67 %0 %66.67 %16.67 %46255173
100NC_005838CAAGGA212952209523150 %0 %33.33 %16.67 %46255174
101NC_005838ATCCGC212956349564516.67 %16.67 %16.67 %50 %46255175
102NC_005838GGGTGG21296730967410 %16.67 %83.33 %0 %46255176
103NC_005838CTGGAG212972479725816.67 %16.67 %50 %16.67 %46255177
104NC_005838CGCCTA212973009731116.67 %16.67 %16.67 %50 %46255177
105NC_005838CGAGCC212998889989916.67 %0 %33.33 %50 %46255179
106NC_005838GGCCAG212999889999916.67 %0 %50 %33.33 %46255179
107NC_005838AAGCGA21210058910060050 %0 %33.33 %16.67 %Non-Coding
108NC_005838CCCGGC2121016951017060 %0 %33.33 %66.67 %46255181
109NC_005838GAGGCC21210205610206716.67 %0 %50 %33.33 %46255181
110NC_005838TACTGG21210222110223216.67 %33.33 %33.33 %16.67 %46255181
111NC_005838CCCTGC2121025071025180 %16.67 %16.67 %66.67 %46255181
112NC_005838GGGTGC2121026751026860 %16.67 %66.67 %16.67 %46255181
113NC_005838GCGTTG2121041701041810 %33.33 %50 %16.67 %46255183
114NC_005838CCCGGG2121066711066820 %0 %50 %50 %46255186
115NC_005838GCCCTG2121073091073200 %16.67 %33.33 %50 %46255186
116NC_005838GTGGAG21210938810939916.67 %16.67 %66.67 %0 %46255188
117NC_005838TCCGCC2121095181095290 %16.67 %16.67 %66.67 %46255188
118NC_005838CCCGGA21210962010963116.67 %0 %33.33 %50 %46255188
119NC_005838GCCCGA21210986710987816.67 %0 %33.33 %50 %46255188
120NC_005838GGGACA21211044511045633.33 %0 %50 %16.67 %46255189
121NC_005838GGACCT21211073111074216.67 %16.67 %33.33 %33.33 %46255189
122NC_005838CCGGGT2121111151111260 %16.67 %50 %33.33 %46255189
123NC_005838CCTGGC2121130501130610 %16.67 %33.33 %50 %46255192
124NC_005838ACATGG21211316311317433.33 %16.67 %33.33 %16.67 %46255192
125NC_005838AGGGCC21211563511564616.67 %0 %50 %33.33 %46255194
126NC_005838TGGCCT2121191041191150 %33.33 %33.33 %33.33 %46255198
127NC_005838CCGGTA21211986411987516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %46255199
128NC_005838GAGGGC21212112412113516.67 %0 %66.67 %16.67 %46255199
129NC_005838AGGCCA21212172912174033.33 %0 %33.33 %33.33 %46255199
130NC_005838AGGGGA21212176812177933.33 %0 %66.67 %0 %46255199
131NC_005838TCCCGG2121233971234080 %16.67 %33.33 %50 %46255199
132NC_005838GGGTGC2121245701245810 %16.67 %66.67 %16.67 %46255200
133NC_005838GGTGCG2121250721250830 %16.67 %66.67 %16.67 %46255200
134NC_005838TCCCCG2121265371265480 %16.67 %16.67 %66.67 %46255201
135NC_005838GGTGGC2121267451267560 %16.67 %66.67 %16.67 %46255201
136NC_005838AGGCCG21212751212752316.67 %0 %50 %33.33 %46255201
137NC_005838GTGGAG21212794312795416.67 %16.67 %66.67 %0 %46255201
138NC_005838ACCCTC21212836012837116.67 %16.67 %0 %66.67 %46255201
139NC_005838GCGTGG2121290991291100 %16.67 %66.67 %16.67 %46255201
140NC_005838CCCCGA21213080713081816.67 %0 %16.67 %66.67 %46255201
141NC_005838GGCCCT2121325401325510 %16.67 %33.33 %50 %46255203
142NC_005838GGGCCA21214014514015616.67 %0 %50 %33.33 %46255209
143NC_005838GGGCGG2121405661405770 %0 %83.33 %16.67 %46255209
144NC_005838GCCTCC2121408991409100 %16.67 %16.67 %66.67 %46255209
145NC_005838GGTCCT2121411671411780 %33.33 %33.33 %33.33 %46255209
146NC_005838GAAGCG21214142714143833.33 %0 %50 %16.67 %46255209
147NC_005838GGCGCA21214289014290116.67 %0 %50 %33.33 %46255209
148NC_005838GCTTCC2121489811489920 %33.33 %16.67 %50 %46255217
149NC_005838AGGTGC21214927214928316.67 %16.67 %50 %16.67 %46255217
150NC_005838CCGGGA21215065015066116.67 %0 %50 %33.33 %46255218
151NC_005838CCCGCG2121509801509910 %0 %33.33 %66.67 %46255218
152NC_005838AGCGGG21215114315115416.67 %0 %66.67 %16.67 %46255218
153NC_005838GTCTGC2121521701521810 %33.33 %33.33 %33.33 %46255218
154NC_005838GAGCGG21215397115398216.67 %0 %66.67 %16.67 %Non-Coding
155NC_005838TTCCCC2121543581543690 %33.33 %0 %66.67 %Non-Coding
156NC_005838GCCTTC2121551281551390 %33.33 %16.67 %50 %Non-Coding
157NC_005838GCGGGG2121560041560150 %0 %83.33 %16.67 %Non-Coding
158NC_005838CCAGGG21215719715720816.67 %0 %50 %33.33 %46255225
159NC_005838GAGGTT21215760615761716.67 %33.33 %50 %0 %46255225
160NC_005838CCTTCT2121580221580330 %50 %0 %50 %46255225
161NC_005838ACGCGG21216150716151816.67 %0 %50 %33.33 %46255231
162NC_005838GTGGAG21216160216161316.67 %16.67 %66.67 %0 %46255231
163NC_005838CGCCCT2121621841621950 %16.67 %16.67 %66.67 %46255232
164NC_005838CCTTCG2121631381631490 %33.33 %16.67 %50 %46255233
165NC_005838CGGGGA21216334016335116.67 %0 %66.67 %16.67 %46255233
166NC_005838CCCCCA21216446616447716.67 %0 %0 %83.33 %Non-Coding
167NC_005838GACCAG21216458016459133.33 %0 %33.33 %33.33 %46255234
168NC_005838TCACGT21216487616488716.67 %33.33 %16.67 %33.33 %46255234
169NC_005838CCAGGC21216493016494116.67 %0 %33.33 %50 %46255234
170NC_005838GGGCCA21216737116738216.67 %0 %50 %33.33 %46255238
171NC_005838CAGGGC21216746516747616.67 %0 %50 %33.33 %46255238
172NC_005838GGTGCG2121682051682160 %16.67 %66.67 %16.67 %46255239
173NC_005838GGGGGC2121700701700810 %0 %83.33 %16.67 %46255241
174NC_005838CCTGGA21217194217195316.67 %16.67 %33.33 %33.33 %46255243
175NC_005838CCCGTC2121732851732960 %16.67 %16.67 %66.67 %46255244
176NC_005838CTGGAG21217354317355416.67 %16.67 %50 %16.67 %46255244
177NC_005838AGGGCC21217421817422916.67 %0 %50 %33.33 %46255245
178NC_005838TCCAGG21217428717429816.67 %16.67 %33.33 %33.33 %46255245
179NC_005838CGAAGG21217474117475233.33 %0 %50 %16.67 %46255245
180NC_005838GGGCCA21217493017494116.67 %0 %50 %33.33 %46255245
181NC_005838GGGGCA21217622817623916.67 %0 %66.67 %16.67 %46255247
182NC_005838CTCCCC2121769011769120 %16.67 %0 %83.33 %46255248
183NC_005838GGCCAC21217722917724016.67 %0 %33.33 %50 %46255249
184NC_005838CTTGGC2121786131786240 %33.33 %33.33 %33.33 %46255250
185NC_005838CCCCCA21217884617885716.67 %0 %0 %83.33 %46255250
186NC_005838CCCAGG21218219918221016.67 %0 %33.33 %50 %46255255
187NC_005838AGGGTG21218225618226716.67 %16.67 %66.67 %0 %46255255
188NC_005838GCCCTC2121831361831470 %16.67 %16.67 %66.67 %Non-Coding
189NC_005838CGCCTT2121834471834580 %33.33 %16.67 %50 %Non-Coding
190NC_005838TGGAGG21218382018383116.67 %16.67 %66.67 %0 %46255257
191NC_005838CGGGGA21218451818452916.67 %0 %66.67 %16.67 %46255258
192NC_005838CTACCT21218591618592716.67 %33.33 %0 %50 %46255260
193NC_005838CCCCCG2121865391865500 %0 %16.67 %83.33 %46255260
194NC_005838TGAACG21218678518679633.33 %16.67 %33.33 %16.67 %46255260
195NC_005838GGGACG21219177319178416.67 %0 %66.67 %16.67 %46255265
196NC_005838ACCGCC21219192419193516.67 %0 %16.67 %66.67 %Non-Coding
197NC_005838GCGCAC21219248519249616.67 %0 %33.33 %50 %Non-Coding
198NC_005838CCAACG21219317219318333.33 %0 %16.67 %50 %46255267
199NC_005838GTGCCC2121963101963210 %16.67 %33.33 %50 %46255270
200NC_005838GTGAAC21219820119821233.33 %16.67 %33.33 %16.67 %46255271
201NC_005838GCTTCC2121989661989770 %33.33 %16.67 %50 %46255271
202NC_005838CCGCTT2121995751995860 %33.33 %16.67 %50 %46255272
203NC_005838ACGGGG21220057420058516.67 %0 %66.67 %16.67 %Non-Coding
204NC_005838CTACCC21220191920193016.67 %16.67 %0 %66.67 %Non-Coding
205NC_005838GAGGAA21220216320217450 %0 %50 %0 %Non-Coding
206NC_005838GAAAGA21220537320538466.67 %0 %33.33 %0 %Non-Coding
207NC_005838TGGGCT2122067162067270 %33.33 %50 %16.67 %Non-Coding
208NC_005838AGGGCC21220793720794816.67 %0 %50 %33.33 %46255279
209NC_005838GGGAAA21220895620896750 %0 %50 %0 %46255279
210NC_005838CGGGGA21221052121053216.67 %0 %66.67 %16.67 %46255280
211NC_005838ACCTGG21221171421172516.67 %16.67 %33.33 %33.33 %46255282
212NC_005838CGGAGG21221224521225616.67 %0 %66.67 %16.67 %46255282
213NC_005838GAAAGA21221252421253566.67 %0 %33.33 %0 %46255282
214NC_005838TCGCCC2122167162167270 %16.67 %16.67 %66.67 %46255288
215NC_005838CGAGGC21221758921760016.67 %0 %50 %33.33 %46255289
216NC_005838GCCTCC2122182752182860 %16.67 %16.67 %66.67 %46255289
217NC_005838CCGGGC2122189882189990 %0 %50 %50 %46255289
218NC_005838GCCGAG21221944621945716.67 %0 %50 %33.33 %46255290
219NC_005838CTCGCC2122196112196220 %16.67 %16.67 %66.67 %46255290
220NC_005838GCCTGG2122207272207380 %16.67 %50 %33.33 %46255290
221NC_005838GAGGGG21222138122139216.67 %0 %83.33 %0 %46255290
222NC_005838TGGAGG21222160422161516.67 %16.67 %66.67 %0 %46255290
223NC_005838TCCGCC2122233852233960 %16.67 %16.67 %66.67 %46255291
224NC_005838CGGGCC2122240792240900 %0 %50 %50 %46255292
225NC_005838GGCCCT2122248822248930 %16.67 %33.33 %50 %46255292
226NC_005838CCCTAC21222503022504116.67 %16.67 %0 %66.67 %46255293
227NC_005838GGGCCC2122253722253830 %0 %50 %50 %46255294
228NC_005838GCCTCC2122274292274400 %16.67 %16.67 %66.67 %46255294
229NC_005838CCCCAA21222819622820733.33 %0 %0 %66.67 %46255295
230NC_005838GGCCTG2122285972286080 %16.67 %50 %33.33 %46255296
231NC_005838CCCGGG2122286212286320 %0 %50 %50 %46255296
232NC_005838CCTCTT2122298442298550 %50 %0 %50 %46255297
233NC_005838GGACCT21223018023019116.67 %16.67 %33.33 %33.33 %46255297
234NC_005838CTTCCC2122305852305960 %33.33 %0 %66.67 %46255298
235NC_005838GCCCTG2122307952308060 %16.67 %33.33 %50 %46255298
236NC_005838GCGGGG2122308072308180 %0 %83.33 %16.67 %46255298
237NC_005838GGCCCG2122320742320850 %0 %50 %50 %46255299