MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27 plasmid pTT27

Total Repeats: 71

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005838	C	7	7	25172	25178	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
2	NC_005838	C	7	7	25667	25673	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_005838	G	6	6	27282	27287	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005838	C	6	6	28717	28722	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
5	NC_005838	G	6	6	28730	28735	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005838	G	7	7	33892	33898	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005838	C	6	6	33985	33990	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
8	NC_005838	C	6	6	34051	34056	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9	NC_005838	G	6	6	36478	36483	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005838	C	6	6	36492	36497	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_005838	A	6	6	74889	74894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005838	C	6	6	76034	76039	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
13	NC_005838	C	6	6	80852	80857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_005838	C	6	6	81142	81147	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
15	NC_005838	C	8	8	87838	87845	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_005838	G	6	6	88921	88926	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005838	G	7	7	90818	90824	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005838	C	7	7	100406	100412	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
19	NC_005838	G	6	6	100444	100449	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005838	A	6	6	100672	100677	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005838	T	6	6	111658	111663	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005838	G	6	6	124246	124251	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005838	G	7	7	124277	124283	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005838	C	6	6	124439	124444	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_005838	C	8	8	131989	131996	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
26	NC_005838	C	6	6	132214	132219	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
27	NC_005838	G	6	6	138585	138590	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005838	G	6	6	138638	138643	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005838	A	6	6	152840	152845	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005838	C	7	7	153058	153064	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_005838	G	6	6	153096	153101	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005838	C	6	6	153219	153224	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
33	NC_005838	G	6	6	153242	153247	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005838	C	6	6	154766	154771	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
35	NC_005838	C	6	6	155338	155343	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_005838	C	7	7	155347	155353	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
37	NC_005838	T	6	6	155899	155904	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005838	C	6	6	156033	156038	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
39	NC_005838	C	6	6	160999	161004	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
40	NC_005838	C	6	6	161278	161283	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
41	NC_005838	G	6	6	171440	171445	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005838	G	6	6	172595	172600	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005838	C	6	6	172679	172684	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
44	NC_005838	C	6	6	178007	178012	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
45	NC_005838	C	6	6	180049	180054	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_005838	C	6	6	180140	180145	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
47	NC_005838	G	6	6	181450	181455	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005838	C	6	6	182826	182831	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
49	NC_005838	T	6	6	182843	182848	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005838	C	6	6	182900	182905	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
51	NC_005838	C	6	6	182927	182932	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
52	NC_005838	C	10	10	183336	183345	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
53	NC_005838	C	6	6	187186	187191	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
54	NC_005838	G	6	6	187204	187209	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005838	G	6	6	192386	192391	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005838	G	6	6	192414	192419	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005838	G	6	6	200620	200625	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005838	G	6	6	202082	202087	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005838	C	6	6	203078	203083	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
60	NC_005838	C	6	6	203161	203166	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_005838	C	6	6	203189	203194	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_005838	C	6	6	205214	205219	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
63	NC_005838	G	6	6	205408	205413	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005838	G	6	6	205438	205443	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005838	C	6	6	206575	206580	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
66	NC_005838	G	6	6	206599	206604	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005838	G	6	6	209714	209719	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005838	C	6	6	213375	213380	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
69	NC_005838	G	7	7	213412	213418	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005838	A	6	6	213550	213555	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005838	C	6	6	227982	227987	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.