MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 3627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005835	TGCC	2	8	834	841	0 %	25 %	25 %	50 %	46198309
2	NC_005835	GAGG	2	8	1106	1113	25 %	0 %	75 %	0 %	46198309
3	NC_005835	GCGG	2	8	2904	2911	0 %	0 %	75 %	25 %	46198312
4	NC_005835	CGGG	2	8	3301	3308	0 %	0 %	75 %	25 %	46198312
5	NC_005835	CCGC	2	8	4139	4146	0 %	0 %	25 %	75 %	46198313
6	NC_005835	CTCC	2	8	5004	5011	0 %	25 %	0 %	75 %	46198314
7	NC_005835	CACC	2	8	5237	5244	25 %	0 %	0 %	75 %	46198314
8	NC_005835	CGGG	2	8	5576	5583	0 %	0 %	75 %	25 %	46198314
9	NC_005835	GGTG	2	8	6122	6129	0 %	25 %	75 %	0 %	46198314
10	NC_005835	GGAC	2	8	6209	6216	25 %	0 %	50 %	25 %	46198315
11	NC_005835	CTTC	2	8	7193	7200	0 %	50 %	0 %	50 %	46198316
12	NC_005835	CCTC	2	8	7364	7371	0 %	25 %	0 %	75 %	46198316
13	NC_005835	GCCC	2	8	7851	7858	0 %	0 %	25 %	75 %	46198317
14	NC_005835	CGGG	2	8	8570	8577	0 %	0 %	75 %	25 %	46198317
15	NC_005835	CGCC	2	8	9193	9200	0 %	0 %	25 %	75 %	46198318
16	NC_005835	GCTG	2	8	9504	9511	0 %	25 %	50 %	25 %	46198318
17	NC_005835	CTGG	2	8	9538	9545	0 %	25 %	50 %	25 %	46198318
18	NC_005835	GGCG	2	8	13509	13516	0 %	0 %	75 %	25 %	46198321
19	NC_005835	CGGG	2	8	14110	14117	0 %	0 %	75 %	25 %	46198322
20	NC_005835	GCGG	2	8	14244	14251	0 %	0 %	75 %	25 %	46198322
21	NC_005835	GAAG	2	8	17083	17090	50 %	0 %	50 %	0 %	46198326
22	NC_005835	CGCC	2	8	17614	17621	0 %	0 %	25 %	75 %	46198327
23	NC_005835	GAGG	2	8	19697	19704	25 %	0 %	75 %	0 %	46198330
24	NC_005835	GCCC	2	8	19771	19778	0 %	0 %	25 %	75 %	46198330
25	NC_005835	GCGG	2	8	20674	20681	0 %	0 %	75 %	25 %	46198331
26	NC_005835	CGGG	2	8	22159	22166	0 %	0 %	75 %	25 %	46198333
27	NC_005835	GCCC	2	8	22476	22483	0 %	0 %	25 %	75 %	46198334
28	NC_005835	GGCG	2	8	23433	23440	0 %	0 %	75 %	25 %	46198335
29	NC_005835	GGAG	2	8	24515	24522	25 %	0 %	75 %	0 %	46198336
30	NC_005835	CCCT	2	8	24930	24937	0 %	25 %	0 %	75 %	46198336
31	NC_005835	GCCC	2	8	26639	26646	0 %	0 %	25 %	75 %	46198337
32	NC_005835	CGGG	2	8	27752	27759	0 %	0 %	75 %	25 %	46198338
33	NC_005835	TCCT	2	8	27826	27833	0 %	50 %	0 %	50 %	46198338
34	NC_005835	ACCC	2	8	28749	28756	25 %	0 %	0 %	75 %	46198339
35	NC_005835	GGCA	2	8	29802	29809	25 %	0 %	50 %	25 %	46198340
36	NC_005835	GCGG	2	8	30926	30933	0 %	0 %	75 %	25 %	46198342
37	NC_005835	GGTG	2	8	31061	31068	0 %	25 %	75 %	0 %	46198343
38	NC_005835	AGGG	2	8	31783	31790	25 %	0 %	75 %	0 %	46198343
39	NC_005835	GGCC	2	8	32285	32292	0 %	0 %	50 %	50 %	46198343
40	NC_005835	GAGG	2	8	32951	32958	25 %	0 %	75 %	0 %	46198344
41	NC_005835	GTGG	2	8	34028	34035	0 %	25 %	75 %	0 %	46198344
42	NC_005835	GCGG	2	8	36640	36647	0 %	0 %	75 %	25 %	46198347
43	NC_005835	GCCC	2	8	36808	36815	0 %	0 %	25 %	75 %	46198347
44	NC_005835	CGGG	2	8	37194	37201	0 %	0 %	75 %	25 %	46198348
45	NC_005835	ACCC	2	8	37372	37379	25 %	0 %	0 %	75 %	46198348
46	NC_005835	CACC	2	8	37773	37780	25 %	0 %	0 %	75 %	46198348
47	NC_005835	CCTC	2	8	38122	38129	0 %	25 %	0 %	75 %	46198349
48	NC_005835	CCCA	2	8	38565	38572	25 %	0 %	0 %	75 %	46198349
49	NC_005835	TGGA	2	8	38887	38894	25 %	25 %	50 %	0 %	46198349
50	NC_005835	TGGA	2	8	38915	38922	25 %	25 %	50 %	0 %	46198349
51	NC_005835	GCCC	2	8	39610	39617	0 %	0 %	25 %	75 %	46198351
52	NC_005835	TCCA	2	8	39787	39794	25 %	25 %	0 %	50 %	46198351
53	NC_005835	CGGG	2	8	40222	40229	0 %	0 %	75 %	25 %	46198351
54	NC_005835	CCGC	2	8	40939	40946	0 %	0 %	25 %	75 %	46198352
55	NC_005835	CGCC	2	8	41188	41195	0 %	0 %	25 %	75 %	46198352
56	NC_005835	GGTG	2	8	41209	41216	0 %	25 %	75 %	0 %	46198352
57	NC_005835	GCCC	2	8	41366	41373	0 %	0 %	25 %	75 %	46198352
58	NC_005835	GTGG	2	8	41495	41502	0 %	25 %	75 %	0 %	46198352
59	NC_005835	GGTG	2	8	41566	41573	0 %	25 %	75 %	0 %	46198352
60	NC_005835	AGGG	2	8	41659	41666	25 %	0 %	75 %	0 %	46198352
61	NC_005835	GCCC	2	8	41913	41920	0 %	0 %	25 %	75 %	46198352
62	NC_005835	GGGA	2	8	42142	42149	25 %	0 %	75 %	0 %	46198353
63	NC_005835	CCGA	2	8	44315	44322	25 %	0 %	25 %	50 %	46198355
64	NC_005835	ACGC	2	8	44354	44361	25 %	0 %	25 %	50 %	46198355
65	NC_005835	GAGG	2	8	44679	44686	25 %	0 %	75 %	0 %	46198356
66	NC_005835	CCGC	2	8	45034	45041	0 %	0 %	25 %	75 %	46198356
67	NC_005835	CCCG	2	8	45601	45608	0 %	0 %	25 %	75 %	46198357
68	NC_005835	ATCC	2	8	45897	45904	25 %	25 %	0 %	50 %	46198357
69	NC_005835	CCCG	2	8	47368	47375	0 %	0 %	25 %	75 %	46198360
70	NC_005835	CCTT	2	8	48266	48273	0 %	50 %	0 %	50 %	46198361
71	NC_005835	CCTG	2	8	48305	48312	0 %	25 %	25 %	50 %	46198361
72	NC_005835	GGCC	2	8	51044	51051	0 %	0 %	50 %	50 %	46198363
73	NC_005835	AGGG	2	8	51964	51971	25 %	0 %	75 %	0 %	46198364
74	NC_005835	GAGG	2	8	52373	52380	25 %	0 %	75 %	0 %	46198365
75	NC_005835	CTTC	2	8	52686	52693	0 %	50 %	0 %	50 %	46198365
76	NC_005835	AGGG	2	8	52792	52799	25 %	0 %	75 %	0 %	46198365
77	NC_005835	CTTC	2	8	53942	53949	0 %	50 %	0 %	50 %	46198368
78	NC_005835	GGAC	2	8	54070	54077	25 %	0 %	50 %	25 %	46198368
79	NC_005835	GGAG	2	8	54502	54509	25 %	0 %	75 %	0 %	46198368
80	NC_005835	CCTT	2	8	54520	54527	0 %	50 %	0 %	50 %	46198368
81	NC_005835	GGCG	2	8	54930	54937	0 %	0 %	75 %	25 %	46198369
82	NC_005835	GGGC	2	8	55578	55585	0 %	0 %	75 %	25 %	46198370
83	NC_005835	CCGC	2	8	57369	57376	0 %	0 %	25 %	75 %	46198372
84	NC_005835	CGGG	2	8	58406	58413	0 %	0 %	75 %	25 %	46198373
85	NC_005835	CCGC	2	8	58560	58567	0 %	0 %	25 %	75 %	46198373
86	NC_005835	CGCC	2	8	58726	58733	0 %	0 %	25 %	75 %	46198374
87	NC_005835	CCTC	2	8	58975	58982	0 %	25 %	0 %	75 %	46198374
88	NC_005835	GGGC	2	8	59039	59046	0 %	0 %	75 %	25 %	46198374
89	NC_005835	GGCG	2	8	59084	59091	0 %	0 %	75 %	25 %	46198374
90	NC_005835	GCCC	2	8	60505	60512	0 %	0 %	25 %	75 %	46198376
91	NC_005835	CCGC	2	8	61344	61351	0 %	0 %	25 %	75 %	46198378
92	NC_005835	CCCG	2	8	61554	61561	0 %	0 %	25 %	75 %	46198378
93	NC_005835	ACCG	2	8	63064	63071	25 %	0 %	25 %	50 %	46198379
94	NC_005835	CGCC	2	8	63980	63987	0 %	0 %	25 %	75 %	46198380
95	NC_005835	GGGC	2	8	64651	64658	0 %	0 %	75 %	25 %	46198381
96	NC_005835	TCCC	2	8	65382	65389	0 %	25 %	0 %	75 %	46198382
97	NC_005835	CCCT	2	8	65676	65683	0 %	25 %	0 %	75 %	46198382
98	NC_005835	CCGC	2	8	66305	66312	0 %	0 %	25 %	75 %	46198383
99	NC_005835	CATC	2	8	67940	67947	25 %	25 %	0 %	50 %	46198385
100	NC_005835	TCCC	2	8	67948	67955	0 %	25 %	0 %	75 %	46198385
101	NC_005835	CACC	2	8	68418	68425	25 %	0 %	0 %	75 %	46198386
102	NC_005835	CGGG	2	8	68460	68467	0 %	0 %	75 %	25 %	46198386
103	NC_005835	TCCT	2	8	69567	69574	0 %	50 %	0 %	50 %	46198387
104	NC_005835	CTTT	2	8	70975	70982	0 %	75 %	0 %	25 %	46198388
105	NC_005835	GGGC	2	8	71142	71149	0 %	0 %	75 %	25 %	46198388
106	NC_005835	CCAC	2	8	71753	71760	25 %	0 %	0 %	75 %	46198389
107	NC_005835	GGCA	2	8	72806	72813	25 %	0 %	50 %	25 %	46198390
108	NC_005835	CGCC	2	8	73241	73248	0 %	0 %	25 %	75 %	46198390
109	NC_005835	AGGG	2	8	73915	73922	25 %	0 %	75 %	0 %	46198390
110	NC_005835	CGGG	2	8	74499	74506	0 %	0 %	75 %	25 %	46198391
111	NC_005835	CGGG	2	8	74527	74534	0 %	0 %	75 %	25 %	46198391
112	NC_005835	CCCT	2	8	74573	74580	0 %	25 %	0 %	75 %	46198391
113	NC_005835	GCCA	2	8	75533	75540	25 %	0 %	25 %	50 %	46198392
114	NC_005835	TCCT	2	8	75774	75781	0 %	50 %	0 %	50 %	46198393
115	NC_005835	GAGG	2	8	75836	75843	25 %	0 %	75 %	0 %	46198393
116	NC_005835	CTCC	2	8	76031	76038	0 %	25 %	0 %	75 %	46198393
117	NC_005835	CCTT	2	8	76438	76445	0 %	50 %	0 %	50 %	46198393
118	NC_005835	CAGC	2	8	76604	76611	25 %	0 %	25 %	50 %	46198394
119	NC_005835	CGCC	2	8	76694	76701	0 %	0 %	25 %	75 %	46198394
120	NC_005835	GCGG	2	8	77027	77034	0 %	0 %	75 %	25 %	46198395
121	NC_005835	CGGG	2	8	78535	78542	0 %	0 %	75 %	25 %	46198396
122	NC_005835	CGCC	2	8	80256	80263	0 %	0 %	25 %	75 %	46198398
123	NC_005835	GAAG	2	8	80804	80811	50 %	0 %	50 %	0 %	46198399
124	NC_005835	CCCA	2	8	81000	81007	25 %	0 %	0 %	75 %	46198399
125	NC_005835	GCGG	2	8	82701	82708	0 %	0 %	75 %	25 %	46198402
126	NC_005835	TGGA	2	8	82777	82784	25 %	25 %	50 %	0 %	46198402
127	NC_005835	GGGT	2	8	85239	85246	0 %	25 %	75 %	0 %	46198405
128	NC_005835	CCGC	2	8	85616	85623	0 %	0 %	25 %	75 %	46198405
129	NC_005835	TCCG	2	8	85706	85713	0 %	25 %	25 %	50 %	46198405
130	NC_005835	GGCG	2	8	86052	86059	0 %	0 %	75 %	25 %	46198406
131	NC_005835	CGGC	2	8	86352	86359	0 %	0 %	50 %	50 %	46198406
132	NC_005835	GACG	2	8	86508	86515	25 %	0 %	50 %	25 %	46198406
133	NC_005835	GCCC	2	8	86550	86557	0 %	0 %	25 %	75 %	46198406
134	NC_005835	AGCT	2	8	87762	87769	25 %	25 %	25 %	25 %	46198406
135	NC_005835	TCCT	2	8	88218	88225	0 %	50 %	0 %	50 %	46198407
136	NC_005835	GGCC	2	8	88616	88623	0 %	0 %	50 %	50 %	46198407
137	NC_005835	TCCT	2	8	89956	89963	0 %	50 %	0 %	50 %	46198408
138	NC_005835	GTGG	2	8	90431	90438	0 %	25 %	75 %	0 %	46198409
139	NC_005835	GCGG	2	8	90946	90953	0 %	0 %	75 %	25 %	46198409
140	NC_005835	GTGC	2	8	91210	91217	0 %	25 %	50 %	25 %	46198409
141	NC_005835	TCCA	2	8	91822	91829	25 %	25 %	0 %	50 %	46198410
142	NC_005835	ACCG	2	8	92433	92440	25 %	0 %	25 %	50 %	46198411
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