MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Thermus thermophilus HB27

Total Repeats: 107

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005835	GC	3	6	2086	2091	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_005835	AG	3	6	56875	56880	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005835	GC	3	6	83189	83194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_005835	TA	3	6	152109	152114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005835	GC	3	6	159412	159417	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
6	NC_005835	TG	3	6	175016	175021	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005835	CG	3	6	175861	175866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_005835	CG	3	6	216025	216030	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_005835	CT	3	6	281980	281985	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_005835	CG	3	6	315341	315346	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11	NC_005835	GC	3	6	336671	336676	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_005835	CG	3	6	336916	336921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13	NC_005835	CG	3	6	359586	359591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_005835	GC	3	6	370861	370866	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_005835	TC	3	6	397383	397388	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005835	GC	3	6	412938	412943	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_005835	TC	3	6	417920	417925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_005835	GA	3	6	464028	464033	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005835	GC	3	6	493766	493771	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_005835	GC	3	6	498041	498046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_005835	GT	3	6	540913	540918	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005835	GC	3	6	557239	557244	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_005835	GA	3	6	568052	568057	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005835	GA	3	6	570325	570330	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005835	CG	3	6	588775	588780	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_005835	CG	3	6	640117	640122	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_005835	TG	3	6	647798	647803	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005835	AT	3	6	647952	647957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005835	CT	3	6	648277	648282	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_005835	TC	3	6	651175	651180	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_005835	CG	3	6	664923	664928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_005835	AC	3	6	695541	695546	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_005835	AG	3	6	695890	695895	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005835	GA	3	6	696003	696008	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005835	CG	3	6	755039	755044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_005835	CG	3	6	774880	774885	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_005835	CT	3	6	835572	835577	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_005835	AG	3	6	835619	835624	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005835	AC	3	6	835973	835978	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
40	NC_005835	CG	3	6	878047	878052	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_005835	GC	3	6	917296	917301	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_005835	GA	3	6	917558	917563	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005835	GC	3	6	930734	930739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_005835	CT	3	6	963837	963842	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_005835	AT	3	6	967054	967059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005835	AC	3	6	987945	987950	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_005835	CG	3	6	988156	988161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_005835	CG	3	6	988480	988485	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_005835	CG	3	6	1033141	1033146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_005835	CG	3	6	1045981	1045986	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_005835	GC	3	6	1071102	1071107	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_005835	CG	3	6	1092514	1092519	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_005835	GC	3	6	1092533	1092538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_005835	CA	3	6	1137351	1137356	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_005835	AC	3	6	1152546	1152551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_005835	GA	3	6	1160867	1160872	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005835	AG	3	6	1180767	1180772	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005835	GC	3	6	1217256	1217261	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_005835	CG	3	6	1232933	1232938	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_005835	AG	3	6	1234233	1234238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005835	CG	3	6	1252123	1252128	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
62	NC_005835	GC	3	6	1290679	1290684	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_005835	GC	3	6	1298189	1298194	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_005835	GT	3	6	1310333	1310338	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005835	GT	3	6	1310503	1310508	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005835	GC	3	6	1310858	1310863	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_005835	GC	3	6	1310905	1310910	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_005835	AC	3	6	1311516	1311521	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_005835	GC	3	6	1320329	1320334	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
70	NC_005835	GC	3	6	1347763	1347768	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_005835	GC	3	6	1348211	1348216	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_005835	TC	4	8	1357509	1357516	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_005835	GC	4	8	1364370	1364377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
74	NC_005835	GC	3	6	1364835	1364840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_005835	GA	3	6	1393424	1393429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005835	AC	3	6	1407925	1407930	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_005835	CG	3	6	1472314	1472319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_005835	GC	3	6	1486921	1486926	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_005835	TA	3	6	1495452	1495457	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_005835	AG	3	6	1524605	1524610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005835	GA	4	8	1534327	1534334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005835	AG	3	6	1534833	1534838	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005835	GC	3	6	1536156	1536161	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
84	NC_005835	CT	3	6	1536290	1536295	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
85	NC_005835	TC	3	6	1551632	1551637	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_005835	GC	3	6	1553589	1553594	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_005835	GC	3	6	1683825	1683830	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_005835	CT	3	6	1690774	1690779	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_005835	GC	3	6	1721946	1721951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
90	NC_005835	GC	3	6	1729472	1729477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_005835	GC	3	6	1731388	1731393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
92	NC_005835	GC	3	6	1739663	1739668	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_005835	CT	3	6	1754452	1754457	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_005835	GT	3	6	1765227	1765232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005835	GT	3	6	1765397	1765402	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005835	GC	3	6	1765752	1765757	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
97	NC_005835	GC	3	6	1765799	1765804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
98	NC_005835	AC	3	6	1766410	1766415	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_005835	GC	3	6	1808391	1808396	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_005835	GC	3	6	1831785	1831790	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
101	NC_005835	GC	3	6	1831812	1831817	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_005835	CG	3	6	1834686	1834691	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_005835	CT	3	6	1872459	1872464	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_005835	GA	3	6	1872473	1872478	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005835	AG	3	6	1893011	1893016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005835	CG	3	6	1893144	1893149	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
107	NC_005835	CT	3	6	1894468	1894473	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.