MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005824	TGAA	2	8	12	19	50 %	25 %	25 %	0 %	45655586
2	NC_005824	TCAA	2	8	184	191	50 %	25 %	0 %	25 %	45655586
3	NC_005824	TTCA	2	8	199	206	25 %	50 %	0 %	25 %	45655586
4	NC_005824	TGGT	2	8	524	531	0 %	50 %	50 %	0 %	45655586
5	NC_005824	ACGT	2	8	763	770	25 %	25 %	25 %	25 %	45655586
6	NC_005824	AGTT	2	8	778	785	25 %	50 %	25 %	0 %	45655586
7	NC_005824	ACAA	2	8	876	883	75 %	0 %	0 %	25 %	45655586
8	NC_005824	TCAA	2	8	977	984	50 %	25 %	0 %	25 %	45655586
9	NC_005824	GGCT	2	8	1129	1136	0 %	25 %	50 %	25 %	45655586
10	NC_005824	GACT	2	8	3063	3070	25 %	25 %	25 %	25 %	45655587
11	NC_005824	TTAG	2	8	3124	3131	25 %	50 %	25 %	0 %	45655587
12	NC_005824	TCAA	2	8	3365	3372	50 %	25 %	0 %	25 %	45655587
13	NC_005824	AATT	2	8	3483	3490	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_005824	GAAA	2	8	3873	3880	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005824	AGTT	2	8	3945	3952	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005824	TTTG	2	8	4054	4061	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005824	GTAT	2	8	4237	4244	25 %	50 %	25 %	0 %	45655588
18	NC_005824	TTCC	2	8	4310	4317	0 %	50 %	0 %	50 %	45655588
19	NC_005824	GAAA	2	8	4718	4725	75 %	0 %	25 %	0 %	45655588
20	NC_005824	AGAA	2	8	5471	5478	75 %	0 %	25 %	0 %	45655589
21	NC_005824	TTTC	2	8	5712	5719	0 %	75 %	0 %	25 %	45655589
22	NC_005824	TTTC	2	8	5874	5881	0 %	75 %	0 %	25 %	45655589
23	NC_005824	TGGA	2	8	5893	5900	25 %	25 %	50 %	0 %	45655589
24	NC_005824	AAAT	2	8	6776	6783	75 %	25 %	0 %	0 %	45655591
25	NC_005824	TCAT	2	8	7467	7474	25 %	50 %	0 %	25 %	45655592
26	NC_005824	CTTT	2	8	7895	7902	0 %	75 %	0 %	25 %	45655592
27	NC_005824	CAAA	2	8	8227	8234	75 %	0 %	0 %	25 %	45655592
28	NC_005824	TTAC	2	8	8721	8728	25 %	50 %	0 %	25 %	45655592
29	NC_005824	TATC	2	8	8766	8773	25 %	50 %	0 %	25 %	45655592
30	NC_005824	GATA	2	8	9161	9168	50 %	25 %	25 %	0 %	45655593
31	NC_005824	TTCT	2	8	9508	9515	0 %	75 %	0 %	25 %	45655593
32	NC_005824	GTTC	2	8	9899	9906	0 %	50 %	25 %	25 %	45655594
33	NC_005824	ATTC	2	8	10883	10890	25 %	50 %	0 %	25 %	45655594
34	NC_005824	TTTC	2	8	11635	11642	0 %	75 %	0 %	25 %	45655595
35	NC_005824	TGTT	2	8	11696	11703	0 %	75 %	25 %	0 %	45655595
36	NC_005824	GAAA	2	8	12233	12240	75 %	0 %	25 %	0 %	45655596
37	NC_005824	GGCG	2	8	12278	12285	0 %	0 %	75 %	25 %	45655596
38	NC_005824	GAAA	2	8	12528	12535	75 %	0 %	25 %	0 %	45655596
39	NC_005824	ATTT	2	8	13187	13194	25 %	75 %	0 %	0 %	45655597
40	NC_005824	TTGG	2	8	13637	13644	0 %	50 %	50 %	0 %	45655597
41	NC_005824	CTTT	2	8	13881	13888	0 %	75 %	0 %	25 %	45655598
42	NC_005824	TACT	2	8	14078	14085	25 %	50 %	0 %	25 %	45655598
43	NC_005824	TATT	2	8	15224	15231	25 %	75 %	0 %	0 %	45655599
44	NC_005824	CAAA	2	8	15322	15329	75 %	0 %	0 %	25 %	45655599
45	NC_005824	GATG	2	8	15963	15970	25 %	25 %	50 %	0 %	45655599
46	NC_005824	TTTA	2	8	16199	16206	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005824	TCCA	2	8	16386	16393	25 %	25 %	0 %	50 %	45655600
48	NC_005824	AGAA	2	8	16950	16957	75 %	0 %	25 %	0 %	45655600
49	NC_005824	AACC	2	8	17094	17101	50 %	0 %	0 %	50 %	45655600
50	NC_005824	GGAA	2	8	17432	17439	50 %	0 %	50 %	0 %	45655600
51	NC_005824	AACC	2	8	17691	17698	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
52	NC_005824	TGGG	2	8	17818	17825	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005824	GGTT	2	8	18002	18009	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005824	TTTC	2	8	18120	18127	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_005824	AATT	2	8	18272	18279	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005824	AAAT	2	8	18968	18975	75 %	25 %	0 %	0 %	45655601
57	NC_005824	TTGT	2	8	19234	19241	0 %	75 %	25 %	0 %	45655601
58	NC_005824	GTTT	2	8	20619	20626	0 %	75 %	25 %	0 %	45655602
59	NC_005824	CAGA	2	8	20865	20872	50 %	0 %	25 %	25 %	45655603
60	NC_005824	AAAC	2	8	21001	21008	75 %	0 %	0 %	25 %	45655603
61	NC_005824	GTTC	2	8	21346	21353	0 %	50 %	25 %	25 %	45655603
62	NC_005824	AAAG	2	8	21510	21517	75 %	0 %	25 %	0 %	45655603
63	NC_005824	TTAT	2	8	21629	21636	25 %	75 %	0 %	0 %	45655603
64	NC_005824	ATCC	2	8	21852	21859	25 %	25 %	0 %	50 %	45655604
65	NC_005824	GATT	2	8	21921	21928	25 %	50 %	25 %	0 %	45655604
66	NC_005824	AGAA	2	8	22494	22501	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005824	TCAA	2	8	23342	23349	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_005824	ATTT	2	8	23356	23363	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005824	ATAG	2	8	23682	23689	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005824	TGTT	2	8	23999	24006	0 %	75 %	25 %	0 %	45655606
71	NC_005824	AAAG	2	8	24360	24367	75 %	0 %	25 %	0 %	45655606
72	NC_005824	TAAG	2	8	24559	24566	50 %	25 %	25 %	0 %	45655606
73	NC_005824	AATT	2	8	24580	24587	50 %	50 %	0 %	0 %	45655606
74	NC_005824	AAAG	2	8	24827	24834	75 %	0 %	25 %	0 %	45655606
75	NC_005824	ATGT	2	8	25086	25093	25 %	50 %	25 %	0 %	45655608
76	NC_005824	AATT	2	8	25467	25474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005824	TTAT	2	8	25670	25677	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005824	TAAA	2	8	25719	25726	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005824	GCTA	2	8	26234	26241	25 %	25 %	25 %	25 %	45655609
80	NC_005824	TGTC	2	8	26589	26596	0 %	50 %	25 %	25 %	45655610
81	NC_005824	CTTC	2	8	26669	26676	0 %	50 %	0 %	50 %	45655610
82	NC_005824	AACT	2	8	26765	26772	50 %	25 %	0 %	25 %	45655610
83	NC_005824	GAAA	2	8	26881	26888	75 %	0 %	25 %	0 %	45655610
84	NC_005824	AGAA	2	8	27764	27771	75 %	0 %	25 %	0 %	45655611
85	NC_005824	TGAT	2	8	27802	27809	25 %	50 %	25 %	0 %	45655611
86	NC_005824	AACG	2	8	27813	27820	50 %	0 %	25 %	25 %	45655611
87	NC_005824	TGGT	2	8	28208	28215	0 %	50 %	50 %	0 %	45655611
88	NC_005824	AACG	2	8	28525	28532	50 %	0 %	25 %	25 %	45655612
89	NC_005824	AAAC	2	8	28646	28653	75 %	0 %	0 %	25 %	45655612
90	NC_005824	AAAC	2	8	29228	29235	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
91	NC_005824	TTTG	2	8	30098	30105	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_005824	TTGG	2	8	30269	30276	0 %	50 %	50 %	0 %	45655614
93	NC_005824	AAAG	2	8	30398	30405	75 %	0 %	25 %	0 %	45655614
94	NC_005824	GAAA	2	8	30452	30459	75 %	0 %	25 %	0 %	45655614
95	NC_005824	ACTT	2	8	31573	31580	25 %	50 %	0 %	25 %	45655616
96	NC_005824	TCAT	2	8	31775	31782	25 %	50 %	0 %	25 %	45655616
97	NC_005824	ATTT	2	8	32008	32015	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005824	TCTT	2	8	32549	32556	0 %	75 %	0 %	25 %	45655617
99	NC_005824	GAGT	2	8	32791	32798	25 %	25 %	50 %	0 %	45655617
100	NC_005824	ATTT	2	8	33284	33291	25 %	75 %	0 %	0 %	45655617
101	NC_005824	ATTG	2	8	33387	33394	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
102	NC_005824	AAAT	2	8	33405	33412	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005824	AGTC	2	8	33565	33572	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_005824	AAAT	2	8	33698	33705	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005824	TTTG	2	8	34586	34593	0 %	75 %	25 %	0 %	45655618
106	NC_005824	AAAG	2	8	34869	34876	75 %	0 %	25 %	0 %	45655618
107	NC_005824	GGTT	2	8	35820	35827	0 %	50 %	50 %	0 %	45655618
108	NC_005824	TGGG	2	8	36264	36271	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005824	CGTT	2	8	36667	36674	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_005824	TGTA	2	8	39268	39275	25 %	50 %	25 %	0 %	45655621
111	NC_005824	AAAG	2	8	39294	39301	75 %	0 %	25 %	0 %	45655621
112	NC_005824	AAAT	2	8	39706	39713	75 %	25 %	0 %	0 %	45655621
113	NC_005824	GGAA	2	8	40659	40666	50 %	0 %	50 %	0 %	45655622
114	NC_005824	TTCT	2	8	41288	41295	0 %	75 %	0 %	25 %	45655623
115	NC_005824	TTCT	2	8	41549	41556	0 %	75 %	0 %	25 %	45655623
116	NC_005824	TCGA	2	8	41557	41564	25 %	25 %	25 %	25 %	45655623
117	NC_005824	TATG	2	8	41695	41702	25 %	50 %	25 %	0 %	45655623
118	NC_005824	GATA	2	8	42014	42021	50 %	25 %	25 %	0 %	45655624
119	NC_005824	TCAT	2	8	42469	42476	25 %	50 %	0 %	25 %	45655624
120	NC_005824	TCTT	2	8	44379	44386	0 %	75 %	0 %	25 %	45655626
121	NC_005824	ATTT	2	8	44617	44624	25 %	75 %	0 %	0 %	45655626
122	NC_005824	ATCA	2	8	45339	45346	50 %	25 %	0 %	25 %	45655627
123	NC_005824	AAAC	2	8	45702	45709	75 %	0 %	0 %	25 %	45655627
124	NC_005824	ATCA	2	8	45886	45893	50 %	25 %	0 %	25 %	45655627
125	NC_005824	AGAA	2	8	46122	46129	75 %	0 %	25 %	0 %	45655627
126	NC_005824	TGAC	2	8	46168	46175	25 %	25 %	25 %	25 %	45655627
127	NC_005824	AATC	2	8	47383	47390	50 %	25 %	0 %	25 %	45655628
128	NC_005824	TTGT	2	8	47844	47851	0 %	75 %	25 %	0 %	45655629
129	NC_005824	AGGA	2	8	47877	47884	50 %	0 %	50 %	0 %	45655629
130	NC_005824	ATAA	2	8	48050	48057	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005824	GGAA	2	8	48453	48460	50 %	0 %	50 %	0 %	45655630
132	NC_005824	AAAG	2	8	48624	48631	75 %	0 %	25 %	0 %	45655630
133	NC_005824	TTCT	2	8	48797	48804	0 %	75 %	0 %	25 %	45655630
134	NC_005824	ACAA	2	8	49321	49328	75 %	0 %	0 %	25 %	45655630
135	NC_005824	ATTT	2	8	49343	49350	25 %	75 %	0 %	0 %	45655630
136	NC_005824	ACCA	2	8	49704	49711	50 %	0 %	0 %	50 %	45655630
137	NC_005824	TCCA	2	8	50063	50070	25 %	25 %	0 %	50 %	45655631
138	NC_005824	TTTC	2	8	50098	50105	0 %	75 %	0 %	25 %	45655631
139	NC_005824	AGAA	2	8	50650	50657	75 %	0 %	25 %	0 %	45655632
140	NC_005824	AGTT	2	8	51149	51156	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005824	TCGG	2	8	51163	51170	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_005824	GATC	2	8	51867	51874	25 %	25 %	25 %	25 %	45655633
143	NC_005824	TTCT	2	8	52264	52271	0 %	75 %	0 %	25 %	45655634
144	NC_005824	CTTA	2	8	52328	52335	25 %	50 %	0 %	25 %	45655634
145	NC_005824	AATC	2	8	52824	52831	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_005824	TATT	2	8	52964	52971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_005824	TTAA	2	8	54251	54258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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