MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 499

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005824	TC	3	6	414	419	0 %	50 %	0 %	50 %	45655586
2	NC_005824	TC	3	6	3235	3240	0 %	50 %	0 %	50 %	45655587
3	NC_005824	AG	3	6	3319	3324	50 %	0 %	50 %	0 %	45655587
4	NC_005824	AT	3	6	3926	3931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005824	TC	3	6	4330	4335	0 %	50 %	0 %	50 %	45655588
6	NC_005824	TA	3	6	5083	5088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005824	TC	3	6	5763	5768	0 %	50 %	0 %	50 %	45655589
8	NC_005824	TC	3	6	6699	6704	0 %	50 %	0 %	50 %	45655591
9	NC_005824	AT	4	8	7085	7092	50 %	50 %	0 %	0 %	45655591
10	NC_005824	AG	3	6	7191	7196	50 %	0 %	50 %	0 %	45655591
11	NC_005824	AT	3	6	9985	9990	50 %	50 %	0 %	0 %	45655594
12	NC_005824	CT	3	6	10105	10110	0 %	50 %	0 %	50 %	45655594
13	NC_005824	CT	3	6	10273	10278	0 %	50 %	0 %	50 %	45655594
14	NC_005824	AC	3	6	11425	11430	50 %	0 %	0 %	50 %	45655595
15	NC_005824	TA	3	6	11605	11610	50 %	50 %	0 %	0 %	45655595
16	NC_005824	TA	3	6	11924	11929	50 %	50 %	0 %	0 %	45655595
17	NC_005824	TA	4	8	12419	12426	50 %	50 %	0 %	0 %	45655596
18	NC_005824	GA	3	6	12721	12726	50 %	0 %	50 %	0 %	45655596
19	NC_005824	AG	3	6	13345	13350	50 %	0 %	50 %	0 %	45655597
20	NC_005824	AG	3	6	13612	13617	50 %	0 %	50 %	0 %	45655597
21	NC_005824	GA	3	6	13716	13721	50 %	0 %	50 %	0 %	45655597
22	NC_005824	TA	3	6	13977	13982	50 %	50 %	0 %	0 %	45655598
23	NC_005824	AG	3	6	14040	14045	50 %	0 %	50 %	0 %	45655598
24	NC_005824	GA	3	6	14307	14312	50 %	0 %	50 %	0 %	45655598
25	NC_005824	GA	3	6	14903	14908	50 %	0 %	50 %	0 %	45655598
26	NC_005824	CT	3	6	14970	14975	0 %	50 %	0 %	50 %	45655598
27	NC_005824	TC	3	6	15775	15780	0 %	50 %	0 %	50 %	45655599
28	NC_005824	GT	3	6	15932	15937	0 %	50 %	50 %	0 %	45655599
29	NC_005824	TA	3	6	16272	16277	50 %	50 %	0 %	0 %	45655600
30	NC_005824	CT	3	6	16551	16556	0 %	50 %	0 %	50 %	45655600
31	NC_005824	GT	3	6	16573	16578	0 %	50 %	50 %	0 %	45655600
32	NC_005824	AT	3	6	16911	16916	50 %	50 %	0 %	0 %	45655600
33	NC_005824	AG	3	6	17681	17686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005824	AG	3	6	18015	18020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005824	GT	4	8	20798	20805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005824	AT	3	6	21363	21368	50 %	50 %	0 %	0 %	45655603
37	NC_005824	CG	3	6	21567	21572	0 %	0 %	50 %	50 %	45655603
38	NC_005824	TA	3	6	24532	24537	50 %	50 %	0 %	0 %	45655606
39	NC_005824	TC	3	6	25097	25102	0 %	50 %	0 %	50 %	45655608
40	NC_005824	CA	3	6	25342	25347	50 %	0 %	0 %	50 %	45655608
41	NC_005824	CG	3	6	26745	26750	0 %	0 %	50 %	50 %	45655610
42	NC_005824	TC	3	6	26860	26865	0 %	50 %	0 %	50 %	45655610
43	NC_005824	GA	3	6	27074	27079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005824	TC	3	6	28077	28082	0 %	50 %	0 %	50 %	45655611
45	NC_005824	TA	3	6	28125	28130	50 %	50 %	0 %	0 %	45655611
46	NC_005824	AT	3	6	28441	28446	50 %	50 %	0 %	0 %	45655612
47	NC_005824	GA	3	6	29407	29412	50 %	0 %	50 %	0 %	45655613
48	NC_005824	AT	3	6	29546	29551	50 %	50 %	0 %	0 %	45655613
49	NC_005824	AG	3	6	29661	29666	50 %	0 %	50 %	0 %	45655613
50	NC_005824	TC	3	6	31895	31900	0 %	50 %	0 %	50 %	45655616
51	NC_005824	GA	3	6	32090	32095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005824	AG	3	6	35034	35039	50 %	0 %	50 %	0 %	45655618
53	NC_005824	AT	3	6	35450	35455	50 %	50 %	0 %	0 %	45655618
54	NC_005824	AG	3	6	35470	35475	50 %	0 %	50 %	0 %	45655618
55	NC_005824	AG	3	6	36235	36240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005824	AT	3	6	39322	39327	50 %	50 %	0 %	0 %	45655621
57	NC_005824	TC	3	6	39837	39842	0 %	50 %	0 %	50 %	45655621
58	NC_005824	TA	3	6	40824	40829	50 %	50 %	0 %	0 %	45655623
59	NC_005824	AT	3	6	41024	41029	50 %	50 %	0 %	0 %	45655623
60	NC_005824	TA	3	6	41762	41767	50 %	50 %	0 %	0 %	45655624
61	NC_005824	CG	3	6	42630	42635	0 %	0 %	50 %	50 %	45655624
62	NC_005824	AT	3	6	43105	43110	50 %	50 %	0 %	0 %	45655625
63	NC_005824	AG	3	6	43412	43417	50 %	0 %	50 %	0 %	45655625
64	NC_005824	GT	3	6	43706	43711	0 %	50 %	50 %	0 %	45655626
65	NC_005824	TA	3	6	44096	44101	50 %	50 %	0 %	0 %	45655626
66	NC_005824	GA	3	6	44336	44341	50 %	0 %	50 %	0 %	45655626
67	NC_005824	AT	3	6	45109	45114	50 %	50 %	0 %	0 %	45655627
68	NC_005824	AG	3	6	46426	46431	50 %	0 %	50 %	0 %	45655627
69	NC_005824	TC	3	6	46713	46718	0 %	50 %	0 %	50 %	45655627
70	NC_005824	CT	3	6	47009	47014	0 %	50 %	0 %	50 %	45655628
71	NC_005824	GC	3	6	47136	47141	0 %	0 %	50 %	50 %	45655628
72	NC_005824	AT	3	6	47332	47337	50 %	50 %	0 %	0 %	45655628
73	NC_005824	TG	3	6	47856	47861	0 %	50 %	50 %	0 %	45655629
74	NC_005824	AG	3	6	48154	48159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005824	TA	3	6	48986	48991	50 %	50 %	0 %	0 %	45655630
76	NC_005824	TA	3	6	49019	49024	50 %	50 %	0 %	0 %	45655630
77	NC_005824	TA	3	6	49526	49531	50 %	50 %	0 %	0 %	45655630
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80	NC_005824	TC	3	6	55082	55087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
81	NC_005824	TA	3	6	55968	55973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005824	TA	3	6	56062	56067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005824	CT	3	6	56488	56493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_005824	GA	3	6	57163	57168	50 %	0 %	50 %	0 %	45655637
85	NC_005824	AG	3	6	59285	59290	50 %	0 %	50 %	0 %	45655639
86	NC_005824	CT	3	6	59306	59311	0 %	50 %	0 %	50 %	45655639
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88	NC_005824	TA	3	6	59784	59789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005824	GA	3	6	60705	60710	50 %	0 %	50 %	0 %	45655640
90	NC_005824	CT	3	6	61823	61828	0 %	50 %	0 %	50 %	45655641
91	NC_005824	CA	3	6	62224	62229	50 %	0 %	0 %	50 %	45655641
92	NC_005824	AT	3	6	62445	62450	50 %	50 %	0 %	0 %	45655641
93	NC_005824	TC	3	6	63067	63072	0 %	50 %	0 %	50 %	45655642
94	NC_005824	GA	3	6	63567	63572	50 %	0 %	50 %	0 %	45655642
95	NC_005824	CT	3	6	64933	64938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_005824	AG	3	6	65190	65195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005824	GA	3	6	65553	65558	50 %	0 %	50 %	0 %	45655643
98	NC_005824	TA	3	6	65559	65564	50 %	50 %	0 %	0 %	45655643
99	NC_005824	AT	3	6	66764	66769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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101	NC_005824	AT	3	6	68335	68340	50 %	50 %	0 %	0 %	45655646
102	NC_005824	AT	3	6	68956	68961	50 %	50 %	0 %	0 %	45655646
103	NC_005824	AT	4	8	69357	69364	50 %	50 %	0 %	0 %	45655646
104	NC_005824	AT	3	6	69915	69920	50 %	50 %	0 %	0 %	45655646
105	NC_005824	TG	3	6	70373	70378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005824	GT	3	6	70893	70898	0 %	50 %	50 %	0 %	45655647
107	NC_005824	TC	3	6	72576	72581	0 %	50 %	0 %	50 %	45655649
108	NC_005824	TA	3	6	72785	72790	50 %	50 %	0 %	0 %	45655649
109	NC_005824	TA	3	6	74164	74169	50 %	50 %	0 %	0 %	45655651
110	NC_005824	GT	3	6	74312	74317	0 %	50 %	50 %	0 %	45655651
111	NC_005824	AC	3	6	76327	76332	50 %	0 %	0 %	50 %	45655653
112	NC_005824	TC	3	6	76340	76345	0 %	50 %	0 %	50 %	45655653
113	NC_005824	TA	3	6	76484	76489	50 %	50 %	0 %	0 %	45655653
114	NC_005824	TA	3	6	76883	76888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005824	GA	3	6	77696	77701	50 %	0 %	50 %	0 %	45655654
116	NC_005824	GA	3	6	78510	78515	50 %	0 %	50 %	0 %	45655654
117	NC_005824	TA	3	6	79539	79544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005824	GA	3	6	79989	79994	50 %	0 %	50 %	0 %	45655656
119	NC_005824	GA	3	6	82250	82255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005824	TC	3	6	82386	82391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
121	NC_005824	AT	3	6	83329	83334	50 %	50 %	0 %	0 %	45655658
122	NC_005824	CT	3	6	84272	84277	0 %	50 %	0 %	50 %	45655658
123	NC_005824	AT	3	6	84466	84471	50 %	50 %	0 %	0 %	45655658
124	NC_005824	AT	3	6	84692	84697	50 %	50 %	0 %	0 %	45655658
125	NC_005824	GT	3	6	87443	87448	0 %	50 %	50 %	0 %	45655660
126	NC_005824	TA	3	6	89018	89023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005824	AT	3	6	90851	90856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005824	AG	3	6	91295	91300	50 %	0 %	50 %	0 %	45655664
129	NC_005824	TG	3	6	91816	91821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005824	AT	3	6	92245	92250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005824	TC	3	6	93538	93543	0 %	50 %	0 %	50 %	45655666
132	NC_005824	TC	3	6	94097	94102	0 %	50 %	0 %	50 %	45655666
133	NC_005824	TA	3	6	94971	94976	50 %	50 %	0 %	0 %	45655667
134	NC_005824	GA	3	6	95359	95364	50 %	0 %	50 %	0 %	45655668
135	NC_005824	GC	3	6	95572	95577	0 %	0 %	50 %	50 %	45655668
136	NC_005824	AT	3	6	96122	96127	50 %	50 %	0 %	0 %	45655668
137	NC_005824	AG	3	6	96969	96974	50 %	0 %	50 %	0 %	45655668
138	NC_005824	GA	3	6	97199	97204	50 %	0 %	50 %	0 %	45655668
139	NC_005824	AT	3	6	97259	97264	50 %	50 %	0 %	0 %	45655668
140	NC_005824	AT	3	6	98284	98289	50 %	50 %	0 %	0 %	45655668
141	NC_005824	TA	3	6	98430	98435	50 %	50 %	0 %	0 %	45655668
142	NC_005824	AT	3	6	101820	101825	50 %	50 %	0 %	0 %	45655671
143	NC_005824	GA	3	6	103615	103620	50 %	0 %	50 %	0 %	45655672
144	NC_005824	GT	3	6	104036	104041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005824	GA	3	6	104265	104270	50 %	0 %	50 %	0 %	45655673
146	NC_005824	TA	3	6	105704	105709	50 %	50 %	0 %	0 %	45655674
147	NC_005824	TA	3	6	105978	105983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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