MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome II

Total Repeats: 137

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005824	AT	3	6	3926	3931	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005824	TA	3	6	5083	5088	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005824	AG	3	6	17681	17686	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005824	AG	3	6	18015	18020	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005824	GT	4	8	20798	20805	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005824	GA	3	6	27074	27079	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005824	GA	3	6	32090	32095	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005824	AG	3	6	36235	36240	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005824	AG	3	6	48154	48159	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005824	TC	3	6	55082	55087	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_005824	TA	3	6	55968	55973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005824	TA	3	6	56062	56067	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005824	CT	3	6	56488	56493	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_005824	TA	3	6	59784	59789	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005824	CT	3	6	64933	64938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005824	AG	3	6	65190	65195	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005824	AT	3	6	66764	66769	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005824	TG	3	6	70373	70378	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005824	TA	3	6	76883	76888	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005824	TA	3	6	79539	79544	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005824	GA	3	6	82250	82255	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005824	TC	3	6	82386	82391	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
23	NC_005824	TA	3	6	89018	89023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005824	AT	3	6	90851	90856	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005824	TG	3	6	91816	91821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005824	AT	3	6	92245	92250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005824	GT	3	6	104036	104041	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005824	TA	3	6	105978	105983	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005824	TC	3	6	106303	106308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_005824	CA	3	6	106599	106604	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_005824	CT	3	6	106674	106679	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_005824	TA	3	6	109164	109169	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005824	AT	3	6	115927	115932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005824	GT	3	6	115938	115943	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005824	TA	3	6	124007	124012	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005824	TA	3	6	124742	124747	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005824	TC	3	6	124798	124803	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_005824	AT	3	6	124932	124937	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005824	TA	3	6	125095	125100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005824	TA	3	6	126760	126765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005824	TA	3	6	126768	126773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005824	TA	3	6	127423	127428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005824	AT	3	6	139616	139621	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_005824	TA	3	6	139939	139944	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005824	AG	3	6	140660	140665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005824	AT	3	6	141077	141082	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005824	TA	3	6	141865	141870	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_005824	CA	3	6	159682	159687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_005824	TA	3	6	160991	160996	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005824	AC	3	6	161046	161051	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_005824	TA	3	6	161214	161219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005824	CT	3	6	169586	169591	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_005824	GA	3	6	174201	174206	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005824	AT	3	6	174365	174370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005824	TG	3	6	178266	178271	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005824	TA	3	6	178304	178309	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005824	TC	3	6	178614	178619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_005824	TC	3	6	181812	181817	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_005824	AG	3	6	182755	182760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005824	TA	3	6	186818	186823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005824	GA	3	6	193891	193896	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005824	TA	3	6	197319	197324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005824	CA	3	6	204492	204497	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_005824	TA	3	6	204655	204660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005824	TA	3	6	206201	206206	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005824	GT	3	6	215031	215036	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005824	TC	3	6	215163	215168	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_005824	AG	3	6	215364	215369	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005824	TA	3	6	216343	216348	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005824	TA	3	6	217048	217053	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_005824	AG	3	6	220068	220073	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005824	TA	3	6	220246	220251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_005824	TA	3	6	220922	220927	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005824	CA	3	6	222596	222601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_005824	TA	4	8	222919	222926	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005824	AT	3	6	223001	223006	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_005824	AT	3	6	223031	223036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005824	AT	4	8	223290	223297	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005824	AC	3	6	223615	223620	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
80	NC_005824	TA	3	6	224664	224669	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_005824	TA	3	6	225547	225552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_005824	TA	3	6	225941	225946	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005824	AG	3	6	227843	227848	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_005824	TG	3	6	234977	234982	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005824	CA	3	6	235215	235220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
86	NC_005824	TA	3	6	237882	237887	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_005824	TA	3	6	238423	238428	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_005824	AT	3	6	240459	240464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005824	GA	3	6	240882	240887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005824	TA	3	6	242591	242596	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005824	CA	3	6	243031	243036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_005824	AT	3	6	247198	247203	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005824	TC	3	6	247699	247704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_005824	AT	3	6	253071	253076	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_005824	AT	3	6	258041	258046	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005824	TA	3	6	258097	258102	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005824	GT	3	6	258279	258284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005824	AT	3	6	258441	258446	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_005824	TG	3	6	259992	259997	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005824	TA	3	6	260168	260173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005824	CT	3	6	261623	261628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_005824	TG	3	6	271289	271294	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005824	TA	4	8	272093	272100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005824	CA	3	6	279010	279015	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_005824	GA	3	6	279911	279916	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005824	TG	3	6	282832	282837	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005824	AG	3	6	284125	284130	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005824	AG	3	6	290278	290283	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005824	AT	3	6	295550	295555	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005824	AT	3	6	295566	295571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_005824	TA	3	6	297120	297125	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_005824	TA	5	10	297249	297258	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_005824	AT	3	6	298027	298032	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005824	AC	3	6	299715	299720	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_005824	CT	3	6	302659	302664	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_005824	TA	3	6	308615	308620	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_005824	TA	3	6	313588	313593	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005824	GT	4	8	313866	313873	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005824	AT	4	8	313985	313992	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005824	TA	3	6	320261	320266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005824	TA	3	6	323600	323605	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005824	TC	3	6	323745	323750	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
123	NC_005824	GC	3	6	323755	323760	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
124	NC_005824	GA	3	6	325892	325897	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005824	TA	3	6	326953	326958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_005824	AG	3	6	327688	327693	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005824	AG	3	6	327804	327809	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_005824	AT	3	6	329257	329262	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005824	AT	3	6	330138	330143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005824	TG	3	6	330591	330596	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005824	AC	3	6	330885	330890	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_005824	GT	3	6	331436	331441	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
133	NC_005824	CT	3	6	336722	336727	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_005824	AG	3	6	337156	337161	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005824	TA	3	6	338176	338181	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005824	TA	3	6	342116	342121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005824	GA	3	6	348969	348974	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.