MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 1249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005823	TATAA	2	10	2368	2377	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005823	GAAAA	2	10	3132	3141	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005823	TTTAA	2	10	4481	4490	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005823	GTTTT	2	10	4576	4585	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005823	ATTTA	2	10	19522	19531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005823	ATAAA	2	10	19952	19961	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005823	AGATT	2	10	19970	19979	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005823	GCCTT	2	10	20770	20779	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
9	NC_005823	TAAAA	2	10	26372	26381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_005823	ACTAA	2	10	27472	27481	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_005823	TGTAA	2	10	37245	37254	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005823	TAAAA	2	10	39694	39703	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005823	TTCAA	2	10	48181	48190	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14	NC_005823	TTTAT	2	10	64150	64159	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005823	AGATA	2	10	71631	71640	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005823	CTAAA	2	10	83447	83456	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_005823	ATTAA	2	10	86758	86767	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005823	TTGAG	2	10	94864	94873	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005823	CCCAC	2	10	95031	95040	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
20	NC_005823	ATTTT	2	10	95556	95565	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005823	GTTTT	2	10	97045	97054	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005823	ATTTT	2	10	99341	99350	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005823	TAAAA	2	10	102945	102954	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005823	ATATT	2	10	103569	103578	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005823	AATTT	2	10	116667	116676	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005823	ATACA	2	10	119519	119528	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_005823	CCTTT	2	10	122783	122792	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_005823	AATCG	2	10	126672	126681	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_005823	TTTTA	2	10	133284	133293	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005823	ATTCG	2	10	136612	136621	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
31	NC_005823	ATTGA	2	10	139449	139458	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005823	AGTAT	2	10	151014	151023	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005823	AAATT	2	10	151047	151056	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005823	ATTTT	2	10	151202	151211	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005823	TAATA	2	10	151964	151973	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005823	AAAAT	2	10	157083	157092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005823	TAAAT	2	10	165879	165888	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005823	TGGTT	2	10	169868	169877	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
39	NC_005823	TCTAA	2	10	175591	175600	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
40	NC_005823	ATTGG	2	10	179574	179583	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005823	AGATT	2	10	179748	179757	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005823	TTTTC	2	10	184526	184535	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
43	NC_005823	TATTC	2	10	190957	190966	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_005823	TGGAA	2	10	191302	191311	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
45	NC_005823	TACGG	2	10	198027	198036	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_005823	ATAAA	2	10	199258	199267	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005823	TTCTG	2	10	199908	199917	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
48	NC_005823	TATTT	2	10	201894	201903	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_005823	AACGG	2	10	206359	206368	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
50	NC_005823	GTAAT	2	10	207246	207255	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005823	TTTTA	2	10	217830	217839	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_005823	TGAAA	2	10	227271	227280	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005823	TTTAT	2	10	227372	227381	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005823	CGATT	2	10	240337	240346	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
55	NC_005823	TAATA	2	10	241106	241115	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005823	ATTGG	3	15	263433	263447	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_005823	ATTTT	2	10	270154	270163	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005823	ACAAA	2	10	271410	271419	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
59	NC_005823	TTTAT	2	10	274935	274944	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005823	TTTCT	2	10	277128	277137	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_005823	AATTT	2	10	299334	299343	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005823	GTTCT	2	10	303882	303891	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
63	NC_005823	ATTTT	2	10	304614	304623	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005823	GAAAT	2	10	304678	304687	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
65	NC_005823	ATTTT	2	10	316219	316228	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_005823	ATTTG	2	10	320067	320076	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
67	NC_005823	TATAA	2	10	320566	320575	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_005823	TAATA	2	10	320612	320621	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_005823	GGGAA	2	10	328766	328775	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
70	NC_005823	AGATC	2	10	328821	328830	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_005823	TTTTA	2	10	329286	329295	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_005823	TATTC	2	10	334065	334074	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
73	NC_005823	ATTGA	2	10	334398	334407	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
74	NC_005823	AAATA	2	10	335312	335321	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_005823	ATTTT	2	10	335331	335340	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_005823	TCAAT	2	10	336980	336989	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_005823	TTTAT	2	10	344298	344307	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_005823	TTAAT	2	10	347171	347180	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_005823	TCTAT	2	10	347193	347202	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
80	NC_005823	CATTG	2	10	349871	349880	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_005823	ATTCT	2	10	355505	355514	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
82	NC_005823	TATAG	2	10	356294	356303	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
83	NC_005823	CATTT	2	10	357060	357069	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_005823	TGGAT	2	10	363881	363890	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_005823	GTGAA	2	10	372480	372489	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
86	NC_005823	CAAAA	2	10	374010	374019	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
87	NC_005823	TCAAT	2	10	375840	375849	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
88	NC_005823	AGATT	2	10	376054	376063	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_005823	TTTAA	2	10	386713	386722	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_005823	TTTTG	2	10	387623	387632	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_005823	TCTTA	2	10	388431	388440	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_005823	GTTGT	2	10	392578	392587	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_005823	AATAG	2	10	392661	392670	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_005823	TGCAC	2	10	394141	394150	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
95	NC_005823	ATTTT	2	10	395875	395884	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_005823	AATTA	2	10	396879	396888	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_005823	TTGGT	2	10	403526	403535	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_005823	GCATT	2	10	413409	413418	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_005823	AAATT	2	10	416295	416304	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_005823	TTTAA	2	10	417434	417443	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_005823	TATTC	2	10	417790	417799	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
102	NC_005823	GAATT	2	10	417883	417892	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_005823	AGGGT	2	10	419613	419622	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
104	NC_005823	ATTTT	2	10	420311	420320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_005823	TGATA	2	10	420465	420474	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_005823	AAAAT	2	10	421230	421239	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_005823	ATTGT	2	10	421286	421295	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_005823	AGGGT	2	10	423397	423406	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
109	NC_005823	TTTAT	2	10	423693	423702	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_005823	TCTAT	2	10	426359	426368	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_005823	ATTTC	2	10	427186	427195	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
112	NC_005823	TATTC	2	10	428707	428716	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_005823	TTTAT	2	10	431355	431364	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_005823	AAAAT	2	10	431607	431616	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_005823	ATTAT	2	10	433701	433710	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_005823	CTTTC	2	10	435915	435924	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_005823	ATTGA	2	10	436068	436077	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_005823	ATTTT	2	10	441623	441632	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_005823	AATTT	2	10	444415	444424	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_005823	AAGAA	2	10	444990	444999	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_005823	AATTG	2	10	449497	449506	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
122	NC_005823	TAAAA	2	10	450378	450387	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_005823	AATTC	2	10	452191	452200	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
124	NC_005823	TTTTA	2	10	458975	458984	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_005823	TCTAT	2	10	464239	464248	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
126	NC_005823	TTTTA	2	10	465787	465796	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_005823	TCCTT	2	10	469127	469136	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
128	NC_005823	ATGAA	2	10	471901	471910	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_005823	ATTAA	2	10	473958	473967	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_005823	ATTTA	2	10	477069	477078	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_005823	TAAAA	2	10	482896	482905	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_005823	CCGAA	2	10	494765	494774	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_005823	TAATA	2	10	496786	496795	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_005823	GTTTT	2	10	497509	497518	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_005823	TTTTA	2	10	501915	501924	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_005823	TAAAA	2	10	515522	515531	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_005823	TATTT	2	10	518927	518936	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_005823	ATTGG	2	10	523024	523033	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
139	NC_005823	ATTTA	2	10	532339	532348	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_005823	AATAT	2	10	537952	537961	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_005823	TAATT	2	10	538344	538353	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_005823	AAGAA	2	10	539661	539670	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_005823	GAATA	2	10	539892	539901	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_005823	AAATA	2	10	540978	540987	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_005823	TGAAT	2	10	543193	543202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
146	NC_005823	ATCAG	2	10	549269	549278	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_005823	TGATT	2	10	549784	549793	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
148	NC_005823	AATTT	2	10	551800	551809	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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