MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 3223

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005823	TATGT	2	10	803	812	20 %	60 %	20 %	0 %	45655915
2	NC_005823	AATTT	2	10	1376	1385	40 %	60 %	0 %	0 %	45655915
3	NC_005823	GGTTT	2	10	7286	7295	0 %	60 %	40 %	0 %	45655919
4	NC_005823	GGAAA	2	10	7319	7328	60 %	0 %	40 %	0 %	45655919
5	NC_005823	ACGAA	2	10	7336	7345	60 %	0 %	20 %	20 %	45655919
6	NC_005823	AGTTA	2	10	8482	8491	40 %	40 %	20 %	0 %	45655919
7	NC_005823	GGAGG	2	10	9368	9377	20 %	0 %	80 %	0 %	45655920
8	NC_005823	GAGAT	2	10	9968	9977	40 %	20 %	40 %	0 %	45655920
9	NC_005823	AAGGA	2	10	10549	10558	60 %	0 %	40 %	0 %	45655920
10	NC_005823	GGTTT	2	10	11934	11943	0 %	60 %	40 %	0 %	45655921
11	NC_005823	ATGGA	2	10	12893	12902	40 %	20 %	40 %	0 %	45655923
12	NC_005823	TCAAG	2	10	13291	13300	40 %	20 %	20 %	20 %	45655923
13	NC_005823	TCGGA	2	10	15326	15335	20 %	20 %	40 %	20 %	45655925
14	NC_005823	GTTTT	2	10	17821	17830	0 %	80 %	20 %	0 %	45655927
15	NC_005823	TTAGA	2	10	17908	17917	40 %	40 %	20 %	0 %	45655927
16	NC_005823	TAAAA	2	10	18375	18384	80 %	20 %	0 %	0 %	45655927
17	NC_005823	GATTC	2	10	20673	20682	20 %	40 %	20 %	20 %	45655930
18	NC_005823	ATATT	2	10	21298	21307	40 %	60 %	0 %	0 %	45655931
19	NC_005823	AAAAT	2	10	21471	21480	80 %	20 %	0 %	0 %	45655931
20	NC_005823	ATTTT	2	10	24334	24343	20 %	80 %	0 %	0 %	45655935
21	NC_005823	GAAGT	2	10	28249	28258	40 %	20 %	40 %	0 %	45655937
22	NC_005823	GAAAA	2	10	29717	29726	80 %	0 %	20 %	0 %	45655938
23	NC_005823	TATTT	2	10	30378	30387	20 %	80 %	0 %	0 %	45655938
24	NC_005823	CGATC	2	10	30986	30995	20 %	20 %	20 %	40 %	45655938
25	NC_005823	GAAAA	2	10	33651	33660	80 %	0 %	20 %	0 %	45655940
26	NC_005823	TATTT	2	10	34220	34229	20 %	80 %	0 %	0 %	45655941
27	NC_005823	GTTTG	2	10	34520	34529	0 %	60 %	40 %	0 %	45655941
28	NC_005823	TACTT	2	10	34633	34642	20 %	60 %	0 %	20 %	45655941
29	NC_005823	TTTCT	2	10	35562	35571	0 %	80 %	0 %	20 %	45655943
30	NC_005823	AGAAT	2	10	35855	35864	60 %	20 %	20 %	0 %	45655943
31	NC_005823	TACAT	2	10	36800	36809	40 %	40 %	0 %	20 %	45655944
32	NC_005823	ATTTC	2	10	37636	37645	20 %	60 %	0 %	20 %	45655945
33	NC_005823	GTTTG	2	10	38643	38652	0 %	60 %	40 %	0 %	45655945
34	NC_005823	AAAAT	2	10	40513	40522	80 %	20 %	0 %	0 %	45655946
35	NC_005823	TGGAA	2	10	41618	41627	40 %	20 %	40 %	0 %	45655948
36	NC_005823	TTAAA	2	10	42624	42633	60 %	40 %	0 %	0 %	45655949
37	NC_005823	GGAAA	2	10	43122	43131	60 %	0 %	40 %	0 %	45655949
38	NC_005823	ATCGA	2	10	44112	44121	40 %	20 %	20 %	20 %	45655949
39	NC_005823	GAATT	2	10	44945	44954	40 %	40 %	20 %	0 %	45655951
40	NC_005823	AAAAT	2	10	47319	47328	80 %	20 %	0 %	0 %	45655952
41	NC_005823	CAATC	2	10	48628	48637	40 %	20 %	0 %	40 %	45655953
42	NC_005823	TAAAG	2	10	49936	49945	60 %	20 %	20 %	0 %	45655954
43	NC_005823	AGATC	2	10	52429	52438	40 %	20 %	20 %	20 %	45655957
44	NC_005823	AAAAG	2	10	53125	53134	80 %	0 %	20 %	0 %	45655957
45	NC_005823	AACAT	2	10	55847	55856	60 %	20 %	0 %	20 %	45655959
46	NC_005823	TTTGA	2	10	58736	58745	20 %	60 %	20 %	0 %	45655962
47	NC_005823	TCGAT	2	10	59614	59623	20 %	40 %	20 %	20 %	45655963
48	NC_005823	AGGAT	2	10	59667	59676	40 %	20 %	40 %	0 %	45655963
49	NC_005823	TTTGT	2	10	60967	60976	0 %	80 %	20 %	0 %	45655964
50	NC_005823	TTGGT	2	10	61585	61594	0 %	60 %	40 %	0 %	45655964
51	NC_005823	GAAGA	2	10	61872	61881	60 %	0 %	40 %	0 %	45655964
52	NC_005823	GAAAA	2	10	65158	65167	80 %	0 %	20 %	0 %	45655966
53	NC_005823	AAAAC	2	10	66813	66822	80 %	0 %	0 %	20 %	45655968
54	NC_005823	AATCT	2	10	67237	67246	40 %	40 %	0 %	20 %	45655968
55	NC_005823	GGGTT	2	10	69565	69574	0 %	40 %	60 %	0 %	45655970
56	NC_005823	ATACC	2	10	71009	71018	40 %	20 %	0 %	40 %	45655971
57	NC_005823	AAAAT	2	10	72437	72446	80 %	20 %	0 %	0 %	45655972
58	NC_005823	TTGAA	2	10	73889	73898	40 %	40 %	20 %	0 %	45655973
59	NC_005823	AAAGA	2	10	75465	75474	80 %	0 %	20 %	0 %	45655974
60	NC_005823	GGATT	2	10	75891	75900	20 %	40 %	40 %	0 %	45655974
61	NC_005823	GGAAA	2	10	76264	76273	60 %	0 %	40 %	0 %	45655974
62	NC_005823	ATTTG	2	10	78020	78029	20 %	60 %	20 %	0 %	45655974
63	NC_005823	GGTTT	2	10	78571	78580	0 %	60 %	40 %	0 %	45655975
64	NC_005823	TTTTG	2	10	78591	78600	0 %	80 %	20 %	0 %	45655975
65	NC_005823	TCACT	2	10	80283	80292	20 %	40 %	0 %	40 %	45655977
66	NC_005823	AAGAA	2	10	81645	81654	80 %	0 %	20 %	0 %	45655977
67	NC_005823	AGAAT	2	10	82528	82537	60 %	20 %	20 %	0 %	45655977
68	NC_005823	AATTA	2	10	82734	82743	60 %	40 %	0 %	0 %	45655977
69	NC_005823	AATCA	2	10	85283	85292	60 %	20 %	0 %	20 %	45655980
70	NC_005823	AATAC	2	10	85621	85630	60 %	20 %	0 %	20 %	45655980
71	NC_005823	TTCTT	2	10	85769	85778	0 %	80 %	0 %	20 %	45655981
72	NC_005823	ATTTT	2	10	87775	87784	20 %	80 %	0 %	0 %	45655983
73	NC_005823	GGATT	2	10	88196	88205	20 %	40 %	40 %	0 %	45655984
74	NC_005823	ATATT	2	10	89138	89147	40 %	60 %	0 %	0 %	45655984
75	NC_005823	AAGGA	2	10	90515	90524	60 %	0 %	40 %	0 %	45655985
76	NC_005823	AGGAA	2	10	91451	91460	60 %	0 %	40 %	0 %	45655986
77	NC_005823	CGGAA	2	10	94439	94448	40 %	0 %	40 %	20 %	45655990
78	NC_005823	TCAGA	2	10	96324	96333	40 %	20 %	20 %	20 %	45655991
79	NC_005823	GTAGA	2	10	99999	100008	40 %	20 %	40 %	0 %	45655996
80	NC_005823	CTTTC	2	10	101321	101330	0 %	60 %	0 %	40 %	45655997
81	NC_005823	GATTG	2	10	101687	101696	20 %	40 %	40 %	0 %	45655997
82	NC_005823	TTGTA	2	10	104073	104082	20 %	60 %	20 %	0 %	45655999
83	NC_005823	TGTAC	2	10	104392	104401	20 %	40 %	20 %	20 %	45655999
84	NC_005823	CTTTT	2	10	104530	104539	0 %	80 %	0 %	20 %	45655999
85	NC_005823	ATTTT	2	10	108652	108661	20 %	80 %	0 %	0 %	45656003
86	NC_005823	CAAAT	2	10	109159	109168	60 %	20 %	0 %	20 %	45656003
87	NC_005823	TTATT	2	10	109304	109313	20 %	80 %	0 %	0 %	45656003
88	NC_005823	TATAA	2	10	110221	110230	60 %	40 %	0 %	0 %	45656004
89	NC_005823	ATTTT	2	10	111379	111388	20 %	80 %	0 %	0 %	45656005
90	NC_005823	AAAAT	2	10	115136	115145	80 %	20 %	0 %	0 %	45656009
91	NC_005823	TTTGT	2	10	115204	115213	0 %	80 %	20 %	0 %	45656009
92	NC_005823	AAAAT	2	10	115467	115476	80 %	20 %	0 %	0 %	45656009
93	NC_005823	TGGTT	2	10	115672	115681	0 %	60 %	40 %	0 %	45656009
94	NC_005823	ACTTT	2	10	116845	116854	20 %	60 %	0 %	20 %	45656010
95	NC_005823	AAGAA	2	10	117683	117692	80 %	0 %	20 %	0 %	45656010
96	NC_005823	AAATC	2	10	118169	118178	60 %	20 %	0 %	20 %	45656010
97	NC_005823	TTTCT	2	10	123327	123336	0 %	80 %	0 %	20 %	45656014
98	NC_005823	AAAAT	2	10	123538	123547	80 %	20 %	0 %	0 %	45656015
99	NC_005823	ATTAA	2	10	127095	127104	60 %	40 %	0 %	0 %	45656018
100	NC_005823	TCCAA	2	10	127553	127562	40 %	20 %	0 %	40 %	45656018
101	NC_005823	ATTTT	2	10	127867	127876	20 %	80 %	0 %	0 %	45656019
102	NC_005823	ACAAT	2	10	128065	128074	60 %	20 %	0 %	20 %	45656020
103	NC_005823	CTTTT	2	10	128192	128201	0 %	80 %	0 %	20 %	45656020
104	NC_005823	AAAAT	2	10	132077	132086	80 %	20 %	0 %	0 %	45656025
105	NC_005823	AGATC	2	10	133128	133137	40 %	20 %	20 %	20 %	45656025
106	NC_005823	GAAAA	2	10	134517	134526	80 %	0 %	20 %	0 %	45656027
107	NC_005823	ATTTT	2	10	134799	134808	20 %	80 %	0 %	0 %	45656027
108	NC_005823	GAAAA	2	10	134882	134891	80 %	0 %	20 %	0 %	45656027
109	NC_005823	AAAGA	2	10	135389	135398	80 %	0 %	20 %	0 %	45656027
110	NC_005823	TAGGT	2	10	137426	137435	20 %	40 %	40 %	0 %	45656028
111	NC_005823	GTCCC	2	10	140179	140188	0 %	20 %	20 %	60 %	45656030
112	NC_005823	ATTCA	2	10	140375	140384	40 %	40 %	0 %	20 %	45656030
113	NC_005823	TATTT	2	10	140442	140451	20 %	80 %	0 %	0 %	45656030
114	NC_005823	AAATT	2	10	143035	143044	60 %	40 %	0 %	0 %	45656032
115	NC_005823	GAAAT	2	10	143880	143889	60 %	20 %	20 %	0 %	45656032
116	NC_005823	TTCCT	2	10	146701	146710	0 %	60 %	0 %	40 %	45656034
117	NC_005823	CGATT	2	10	146805	146814	20 %	40 %	20 %	20 %	45656034
118	NC_005823	AAGAA	2	10	148131	148140	80 %	0 %	20 %	0 %	45656035
119	NC_005823	CATTT	2	10	148327	148336	20 %	60 %	0 %	20 %	45656035
120	NC_005823	CAACA	2	10	149261	149270	60 %	0 %	0 %	40 %	45656035
121	NC_005823	TTGAA	2	10	150011	150020	40 %	40 %	20 %	0 %	45656035
122	NC_005823	TATCG	2	10	150340	150349	20 %	40 %	20 %	20 %	45656035
123	NC_005823	CGTAT	2	10	151676	151685	20 %	40 %	20 %	20 %	45656036
124	NC_005823	TTATA	2	10	152203	152212	40 %	60 %	0 %	0 %	45656037
125	NC_005823	TTCTA	2	10	152372	152381	20 %	60 %	0 %	20 %	45656037
126	NC_005823	CGAAA	2	10	153939	153948	60 %	0 %	20 %	20 %	45656039
127	NC_005823	GATTC	2	10	153968	153977	20 %	40 %	20 %	20 %	45656039
128	NC_005823	CTTTC	2	10	155147	155156	0 %	60 %	0 %	40 %	45656041
129	NC_005823	TTAAG	2	10	155897	155906	40 %	40 %	20 %	0 %	45656041
130	NC_005823	GATTT	2	10	157225	157234	20 %	60 %	20 %	0 %	45656042
131	NC_005823	ATTTT	2	10	160229	160238	20 %	80 %	0 %	0 %	45656044
132	NC_005823	TAGTC	2	10	161204	161213	20 %	40 %	20 %	20 %	45656045
133	NC_005823	GATTC	2	10	162297	162306	20 %	40 %	20 %	20 %	45656046
134	NC_005823	GGAAG	2	10	167220	167229	40 %	0 %	60 %	0 %	45656049
135	NC_005823	TTTCT	2	10	168023	168032	0 %	80 %	0 %	20 %	45656049
136	NC_005823	CAGAC	2	10	168195	168204	40 %	0 %	20 %	40 %	45656049
137	NC_005823	TCTAA	2	10	170855	170864	40 %	40 %	0 %	20 %	45656051
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