MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 45943

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005823	CTT	2	6	184	189	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_005823	GGA	2	6	300	305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655915
3	NC_005823	GAA	2	6	337	342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655915
4	NC_005823	TAT	2	6	480	485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655915
5	NC_005823	AGC	2	6	549	554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655915
6	NC_005823	TCT	2	6	820	825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655915
7	NC_005823	GAT	2	6	916	921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655915
8	NC_005823	TCA	2	6	1134	1139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655915
9	NC_005823	GAA	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655915
10	NC_005823	CTT	2	6	1216	1221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655915
11	NC_005823	TCT	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655915
12	NC_005823	CTT	2	6	1555	1560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655915
13	NC_005823	CAA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655915
14	NC_005823	TAT	2	6	1688	1693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005823	TAA	2	6	1788	1793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005823	AGT	2	6	1799	1804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005823	TCA	2	6	1814	1819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_005823	TCA	2	6	2011	2016	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_005823	AGA	2	6	2063	2068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005823	CGA	2	6	2083	2088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_005823	ATT	2	6	2105	2110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_005823	AGT	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005823	AAG	2	6	2334	2339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005823	CAA	2	6	2396	2401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_005823	TGA	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005823	ATG	2	6	2497	2502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005823	AAT	2	6	2564	2569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005823	TCA	2	6	2678	2683	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_005823	GTA	2	6	2691	2696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005823	TAC	2	6	2710	2715	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_005823	GTT	2	6	2743	2748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005823	TAT	2	6	2849	2854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005823	ATT	2	6	2915	2920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005823	TAA	2	6	3025	3030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005823	ATT	2	6	3088	3093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005823	TAC	2	6	3214	3219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_005823	AAT	2	6	3234	3239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005823	TAC	2	6	3341	3346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655916
39	NC_005823	TAT	2	6	3364	3369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655916
40	NC_005823	CTG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655916
41	NC_005823	AAG	2	6	3466	3471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655916
42	NC_005823	AAC	2	6	3493	3498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655916
43	NC_005823	AGA	2	6	3548	3553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655916
44	NC_005823	TTC	2	6	3566	3571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655916
45	NC_005823	TGA	2	6	3638	3643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655916
46	NC_005823	TTC	2	6	3668	3673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655916
47	NC_005823	TCT	2	6	3681	3686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655916
48	NC_005823	CTT	2	6	3724	3729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655916
49	NC_005823	TTG	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655916
50	NC_005823	GAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655916
51	NC_005823	TAT	2	6	3878	3883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655916
52	NC_005823	ACA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655916
53	NC_005823	TAT	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655916
54	NC_005823	AGA	2	6	4079	4084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655916
55	NC_005823	AGA	2	6	4121	4126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655916
56	NC_005823	GAC	2	6	4293	4298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655916
57	NC_005823	TAT	2	6	4404	4409	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_005823	TAT	2	6	4415	4420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_005823	ATA	2	6	4421	4426	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_005823	TAT	2	6	4567	4572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_005823	TTA	2	6	4750	4755	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_005823	AGA	2	6	4890	4895	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_005823	TAT	2	6	5055	5060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_005823	GAA	2	6	5104	5109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655917
65	NC_005823	TAT	2	6	5195	5200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655917
66	NC_005823	ATT	2	6	5261	5266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655917
67	NC_005823	AAG	2	6	5363	5368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655917
68	NC_005823	TAT	2	6	5411	5416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655917
69	NC_005823	GGT	2	6	5446	5451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655917
70	NC_005823	CGG	2	6	5453	5458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655917
71	NC_005823	AGA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655917
72	NC_005823	TTC	2	6	5487	5492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655917
73	NC_005823	TTA	2	6	5518	5523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655917
74	NC_005823	ATA	2	6	5528	5533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655917
75	NC_005823	CAA	2	6	5637	5642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655917
76	NC_005823	AAG	2	6	5643	5648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655917
77	NC_005823	GTT	2	6	5653	5658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655917
78	NC_005823	GGA	2	6	5704	5709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655917
79	NC_005823	GAT	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655917
80	NC_005823	GGC	2	6	5919	5924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655917
81	NC_005823	ATT	2	6	5933	5938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655917
82	NC_005823	TGA	2	6	5976	5981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655917
83	NC_005823	AGA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655917
84	NC_005823	ACG	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655917
85	NC_005823	GAA	2	6	6234	6239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655918
86	NC_005823	TTG	2	6	6292	6297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655918
87	NC_005823	ATC	2	6	6408	6413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655918
88	NC_005823	CTT	2	6	6484	6489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655918
89	NC_005823	TTC	2	6	6604	6609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655918
90	NC_005823	AAG	2	6	6693	6698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655919
91	NC_005823	GTT	2	6	6968	6973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655919
92	NC_005823	GGT	2	6	6992	6997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655919
93	NC_005823	ATG	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655919
94	NC_005823	TTC	2	6	7144	7149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655919
95	NC_005823	TTC	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655919
96	NC_005823	CCA	2	6	7209	7214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45655919
97	NC_005823	GAC	2	6	7439	7444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655919
98	NC_005823	AAG	2	6	7647	7652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655919
99	NC_005823	GAA	2	6	7878	7883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655919
100	NC_005823	GGT	3	9	7898	7906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655919
101	NC_005823	GGT	2	6	7985	7990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655919
102	NC_005823	TTC	2	6	8028	8033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655919
103	NC_005823	GAA	2	6	8093	8098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655919
104	NC_005823	CTT	2	6	8228	8233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655919
105	NC_005823	CCT	2	6	8294	8299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655919
106	NC_005823	ATT	2	6	8362	8367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655919
107	NC_005823	AGA	2	6	8509	8514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655919
108	NC_005823	AAG	2	6	8748	8753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
109	NC_005823	AGA	2	6	8831	8836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
110	NC_005823	TTG	2	6	8901	8906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655920
111	NC_005823	ATC	2	6	8925	8930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655920
112	NC_005823	CGG	2	6	9045	9050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655920
113	NC_005823	GAA	2	6	9089	9094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
114	NC_005823	TTA	2	6	9095	9100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655920
115	NC_005823	ATG	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655920
116	NC_005823	AAC	2	6	9156	9161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655920
117	NC_005823	TTC	2	6	9205	9210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655920
118	NC_005823	TCC	2	6	9241	9246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655920
119	NC_005823	ATT	2	6	9359	9364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655920
120	NC_005823	AGA	2	6	9439	9444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
121	NC_005823	AGA	2	6	9862	9867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
122	NC_005823	TCC	2	6	9898	9903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655920
123	NC_005823	ACA	2	6	9913	9918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655920
124	NC_005823	TGA	2	6	9921	9926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655920
125	NC_005823	AGA	2	6	10005	10010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
126	NC_005823	GAA	2	6	10025	10030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
127	NC_005823	ATC	2	6	10043	10048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655920
128	NC_005823	AAG	2	6	10110	10115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
129	NC_005823	TTC	2	6	10174	10179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655920
130	NC_005823	GAA	2	6	10208	10213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
131	NC_005823	GGT	2	6	10286	10291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655920
132	NC_005823	GAT	2	6	10322	10327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655920
133	NC_005823	ATA	2	6	10362	10367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655920
134	NC_005823	AAG	2	6	10434	10439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
135	NC_005823	ATC	2	6	10463	10468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655920
136	NC_005823	TCT	2	6	10534	10539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655920
137	NC_005823	TTA	2	6	10560	10565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655920
138	NC_005823	ATT	2	6	10610	10615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655920
139	NC_005823	CAT	2	6	10726	10731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655920
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143	NC_005823	GAA	2	6	10844	10849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
144	NC_005823	GAA	2	6	10874	10879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
145	NC_005823	GGC	2	6	10898	10903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655920
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152	NC_005823	GAG	2	6	11458	11463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655921
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159	NC_005823	ATT	2	6	12008	12013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655921
160	NC_005823	ACT	2	6	12096	12101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655921
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241	NC_005823	TTA	2	6	19845	19850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_005823	GGA	2	6	20055	20060	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655929
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249	NC_005823	TAT	2	6	21157	21162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655931
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257	NC_005823	GTT	2	6	21714	21719	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
258	NC_005823	TAT	2	6	21751	21756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_005823	AGA	2	6	21822	21827	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
260	NC_005823	CTT	2	6	21924	21929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655932
261	NC_005823	AGA	2	6	21932	21937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655932
262	NC_005823	TCT	2	6	21991	21996	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655932
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264	NC_005823	ATA	2	6	22050	22055	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655932
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395	NC_005823	CTT	2	6	33312	33317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655940
396	NC_005823	TTC	2	6	33517	33522	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655940
397	NC_005823	ATT	2	6	33536	33541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655940
398	NC_005823	GAA	2	6	33726	33731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655940
399	NC_005823	CTT	2	6	33753	33758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655940
400	NC_005823	AGG	2	6	33779	33784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655940
401	NC_005823	TAA	2	6	33785	33790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655940
402	NC_005823	TTC	2	6	33884	33889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655940
403	NC_005823	TGA	2	6	33890	33895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655940
404	NC_005823	CTT	2	6	33910	33915	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655940
405	NC_005823	ATT	2	6	34012	34017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_005823	AAG	2	6	34047	34052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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440	NC_005823	TTC	2	6	37004	37009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655944
441	NC_005823	GTT	2	6	37355	37360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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452	NC_005823	TCC	2	6	38465	38470	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655945
453	NC_005823	TAA	2	6	38510	38515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655945
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470	NC_005823	TTC	2	6	39679	39684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
471	NC_005823	GTT	2	6	39688	39693	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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