MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Leptospira interrogans serovar Copenhageni str. Fiocruz L1-130 chromosome I

Total Repeats: 35464

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005823	GGA	2	6	300	305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655915
2	NC_005823	GAA	2	6	337	342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655915
3	NC_005823	TAT	2	6	480	485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655915
4	NC_005823	AGC	2	6	549	554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655915
5	NC_005823	TCT	2	6	820	825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655915
6	NC_005823	GAT	2	6	916	921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655915
7	NC_005823	TCA	2	6	1134	1139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655915
8	NC_005823	GAA	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655915
9	NC_005823	CTT	2	6	1216	1221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655915
10	NC_005823	TCT	2	6	1266	1271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655915
11	NC_005823	CTT	2	6	1555	1560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655915
12	NC_005823	CAA	2	6	1563	1568	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655915
13	NC_005823	TAC	2	6	3341	3346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655916
14	NC_005823	TAT	2	6	3364	3369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655916
15	NC_005823	CTG	2	6	3451	3456	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655916
16	NC_005823	AAG	2	6	3466	3471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655916
17	NC_005823	AAC	2	6	3493	3498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655916
18	NC_005823	AGA	2	6	3548	3553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655916
19	NC_005823	TTC	2	6	3566	3571	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655916
20	NC_005823	TGA	2	6	3638	3643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655916
21	NC_005823	TTC	2	6	3668	3673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655916
22	NC_005823	TCT	2	6	3681	3686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655916
23	NC_005823	CTT	2	6	3724	3729	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655916
24	NC_005823	TTG	2	6	3805	3810	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655916
25	NC_005823	GAA	2	6	3820	3825	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655916
26	NC_005823	TAT	2	6	3878	3883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655916
27	NC_005823	ACA	2	6	3982	3987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655916
28	NC_005823	TAT	2	6	3994	3999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655916
29	NC_005823	AGA	2	6	4079	4084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655916
30	NC_005823	AGA	2	6	4121	4126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655916
31	NC_005823	GAC	2	6	4293	4298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655916
32	NC_005823	GAA	2	6	5104	5109	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655917
33	NC_005823	TAT	2	6	5195	5200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655917
34	NC_005823	ATT	2	6	5261	5266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655917
35	NC_005823	AAG	2	6	5363	5368	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655917
36	NC_005823	TAT	2	6	5411	5416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655917
37	NC_005823	GGT	2	6	5446	5451	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655917
38	NC_005823	CGG	2	6	5453	5458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655917
39	NC_005823	AGA	2	6	5461	5466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655917
40	NC_005823	TTC	2	6	5487	5492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655917
41	NC_005823	TTA	2	6	5518	5523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655917
42	NC_005823	ATA	2	6	5528	5533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655917
43	NC_005823	CAA	2	6	5637	5642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655917
44	NC_005823	AAG	2	6	5643	5648	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655917
45	NC_005823	GTT	2	6	5653	5658	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655917
46	NC_005823	GGA	2	6	5704	5709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655917
47	NC_005823	GAT	2	6	5833	5838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655917
48	NC_005823	GGC	2	6	5919	5924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655917
49	NC_005823	ATT	2	6	5933	5938	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655917
50	NC_005823	TGA	2	6	5976	5981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655917
51	NC_005823	AGA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655917
52	NC_005823	ACG	2	6	6061	6066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655917
53	NC_005823	GAA	2	6	6234	6239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655918
54	NC_005823	TTG	2	6	6292	6297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655918
55	NC_005823	ATC	2	6	6408	6413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655918
56	NC_005823	CTT	2	6	6484	6489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655918
57	NC_005823	TTC	2	6	6604	6609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655918
58	NC_005823	AAG	2	6	6693	6698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655919
59	NC_005823	GTT	2	6	6968	6973	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655919
60	NC_005823	GGT	2	6	6992	6997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655919
61	NC_005823	ATG	2	6	7008	7013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655919
62	NC_005823	TTC	2	6	7144	7149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655919
63	NC_005823	TTC	2	6	7168	7173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655919
64	NC_005823	CCA	2	6	7209	7214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45655919
65	NC_005823	GAC	2	6	7439	7444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655919
66	NC_005823	AAG	2	6	7647	7652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655919
67	NC_005823	GAA	2	6	7878	7883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655919
68	NC_005823	GGT	3	9	7898	7906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655919
69	NC_005823	GGT	2	6	7985	7990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655919
70	NC_005823	TTC	2	6	8028	8033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655919
71	NC_005823	GAA	2	6	8093	8098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655919
72	NC_005823	CTT	2	6	8228	8233	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655919
73	NC_005823	CCT	2	6	8294	8299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655919
74	NC_005823	ATT	2	6	8362	8367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655919
75	NC_005823	AGA	2	6	8509	8514	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655919
76	NC_005823	AAG	2	6	8748	8753	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
77	NC_005823	AGA	2	6	8831	8836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
78	NC_005823	TTG	2	6	8901	8906	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655920
79	NC_005823	ATC	2	6	8925	8930	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655920
80	NC_005823	CGG	2	6	9045	9050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655920
81	NC_005823	GAA	2	6	9089	9094	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
82	NC_005823	TTA	2	6	9095	9100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655920
83	NC_005823	ATG	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655920
84	NC_005823	AAC	2	6	9156	9161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655920
85	NC_005823	TTC	2	6	9205	9210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655920
86	NC_005823	TCC	2	6	9241	9246	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655920
87	NC_005823	ATT	2	6	9359	9364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655920
88	NC_005823	AGA	2	6	9439	9444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
89	NC_005823	AGA	2	6	9862	9867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
90	NC_005823	TCC	2	6	9898	9903	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45655920
91	NC_005823	ACA	2	6	9913	9918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655920
92	NC_005823	TGA	2	6	9921	9926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655920
93	NC_005823	AGA	2	6	10005	10010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
94	NC_005823	GAA	2	6	10025	10030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
95	NC_005823	ATC	2	6	10043	10048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655920
96	NC_005823	AAG	2	6	10110	10115	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
97	NC_005823	TTC	2	6	10174	10179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655920
98	NC_005823	GAA	2	6	10208	10213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
99	NC_005823	GGT	2	6	10286	10291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655920
100	NC_005823	GAT	2	6	10322	10327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655920
101	NC_005823	ATA	2	6	10362	10367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655920
102	NC_005823	AAG	2	6	10434	10439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
103	NC_005823	ATC	2	6	10463	10468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655920
104	NC_005823	TCT	2	6	10534	10539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655920
105	NC_005823	TTA	2	6	10560	10565	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655920
106	NC_005823	ATT	2	6	10610	10615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655920
107	NC_005823	CAT	2	6	10726	10731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655920
108	NC_005823	GAA	2	6	10743	10748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
109	NC_005823	GTG	2	6	10755	10760	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655920
110	NC_005823	AAG	2	6	10815	10820	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
111	NC_005823	GAA	2	6	10844	10849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
112	NC_005823	GAA	2	6	10874	10879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655920
113	NC_005823	GGC	2	6	10898	10903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655920
114	NC_005823	ATT	2	6	10982	10987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655920
115	NC_005823	CAA	2	6	10997	11002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655920
116	NC_005823	CTG	2	6	11052	11057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655920
117	NC_005823	GCT	2	6	11235	11240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45655921
118	NC_005823	GAA	2	6	11322	11327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655921
119	NC_005823	CAT	2	6	11411	11416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655921
120	NC_005823	GAG	2	6	11458	11463	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655921
121	NC_005823	GAA	2	6	11610	11615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655921
122	NC_005823	AGG	2	6	11755	11760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655921
123	NC_005823	GAA	2	6	11853	11858	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655921
124	NC_005823	ACA	2	6	11891	11896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45655921
125	NC_005823	GAT	2	6	11906	11911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655921
126	NC_005823	GAA	2	6	11925	11930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655921
127	NC_005823	ATT	2	6	12008	12013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655921
128	NC_005823	ACT	2	6	12096	12101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655921
129	NC_005823	GGC	2	6	12256	12261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45655922
130	NC_005823	CGA	3	9	12278	12286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655922
131	NC_005823	TTG	2	6	12754	12759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655923
132	NC_005823	GAA	2	6	12781	12786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655923
133	NC_005823	AAG	2	6	12794	12799	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655923
134	NC_005823	AAG	2	6	12998	13003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45655923
135	NC_005823	GAT	2	6	13060	13065	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655923
136	NC_005823	CGA	2	6	13079	13084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655923
137	NC_005823	ATT	2	6	13205	13210	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655923
138	NC_005823	ACG	2	6	13211	13216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655923
139	NC_005823	CTT	2	6	13238	13243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655923
140	NC_005823	CTT	2	6	13258	13263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655923
141	NC_005823	CGA	2	6	13326	13331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655923
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146	NC_005823	ATT	2	6	14050	14055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655924
147	NC_005823	GTG	2	6	14133	14138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45655924
148	NC_005823	GGA	2	6	14315	14320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45655924
149	NC_005823	TGA	2	6	14363	14368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655924
150	NC_005823	ATT	2	6	14432	14437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655924
151	NC_005823	ACG	2	6	14488	14493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45655924
152	NC_005823	AAT	2	6	14508	14513	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45655924
153	NC_005823	ATC	2	6	14590	14595	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45655924
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164	NC_005823	AGT	2	6	15687	15692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655925
165	NC_005823	TTG	2	6	15740	15745	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45655925
166	NC_005823	ATT	2	6	15775	15780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45655925
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173	NC_005823	CTT	2	6	16492	16497	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655926
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187	NC_005823	CTT	2	6	18483	18488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655928
188	NC_005823	TTC	2	6	18559	18564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45655928
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256	NC_005823	TAG	2	6	26827	26832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45655936
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