MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pMT1

Total Repeats: 47

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005815	TA	3	6	1998	2003	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_005815	AG	3	6	18651	18656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005815	TA	3	6	19493	19498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_005815	TA	3	6	28306	28311	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005815	TA	4	8	28333	28340	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_005815	TA	3	6	31797	31802	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005815	AT	3	6	34808	34813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005815	TG	3	6	36149	36154	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005815	CT	3	6	36563	36568	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
10	NC_005815	AT	3	6	38483	38488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_005815	AG	3	6	50233	50238	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005815	AG	3	6	50342	50347	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
13	NC_005815	CT	3	6	50378	50383	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_005815	AT	3	6	50481	50486	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005815	CA	3	6	50521	50526	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005815	AG	3	6	50704	50709	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_005815	AG	3	6	50746	50751	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005815	AG	3	6	51934	51939	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005815	CT	3	6	52136	52141	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_005815	CT	3	6	52341	52346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_005815	CG	4	8	52448	52455	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_005815	TA	3	6	53232	53237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_005815	TA	3	6	55596	55601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005815	CG	3	6	64355	64360	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_005815	CT	3	6	64869	64874	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_005815	GT	3	6	65644	65649	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005815	TC	3	6	66380	66385	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_005815	TC	3	6	66549	66554	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
29	NC_005815	AG	3	6	66784	66789	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005815	TA	3	6	68087	68092	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005815	AT	3	6	68094	68099	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005815	TG	3	6	70548	70553	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_005815	CT	3	6	73131	73136	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_005815	AG	3	6	73895	73900	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005815	CA	3	6	77388	77393	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_005815	GT	3	6	78816	78821	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_005815	CA	3	6	83884	83889	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_005815	CG	3	6	86531	86536	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_005815	GC	3	6	86966	86971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_005815	AT	3	6	90898	90903	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_005815	TA	3	6	98200	98205	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005815	GA	3	6	102139	102144	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005815	CG	3	6	102202	102207	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_005815	AC	3	6	103481	103486	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_005815	TA	3	6	105434	105439	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_005815	CG	3	6	106257	106262	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_005815	CG	3	6	106407	106412	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.