MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCRY

Total Repeats: 258

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005814	AGT	2	6	756	761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476500
2	NC_005814	GGA	2	6	874	879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45476500
3	NC_005814	TTC	2	6	886	891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45476500
4	NC_005814	AGC	2	6	905	910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476500
5	NC_005814	GAA	2	6	958	963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476500
6	NC_005814	GAT	2	6	1033	1038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476500
7	NC_005814	CGT	2	6	1111	1116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476500
8	NC_005814	TTG	2	6	1253	1258	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45476500
9	NC_005814	GCG	2	6	1267	1272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476500
10	NC_005814	ACG	2	6	1678	1683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476501
11	NC_005814	TTA	2	6	1736	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45476501
12	NC_005814	GAA	2	6	2032	2037	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476502
13	NC_005814	CCT	2	6	2233	2238	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45476502
14	NC_005814	CAA	2	6	2534	2539	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45476503
15	NC_005814	GTT	2	6	2660	2665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45476503
16	NC_005814	TGA	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476503
17	NC_005814	ACT	2	6	2939	2944	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476503
18	NC_005814	GCT	2	6	3211	3216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476504
19	NC_005814	CGA	2	6	3302	3307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476505
20	NC_005814	CAT	2	6	3380	3385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476505
21	NC_005814	CTC	2	6	3423	3428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45476505
22	NC_005814	GCT	2	6	3456	3461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476505
23	NC_005814	CCA	2	6	3598	3603	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45476506
24	NC_005814	GCC	2	6	3633	3638	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476506
25	NC_005814	TTA	2	6	3751	3756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45476506
26	NC_005814	AGG	2	6	3775	3780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45476506
27	NC_005814	CGC	2	6	3819	3824	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476506
28	NC_005814	TCA	2	6	3931	3936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476506
29	NC_005814	GGC	2	6	3954	3959	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476506
30	NC_005814	GCT	2	6	3979	3984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476506
31	NC_005814	ACT	2	6	3985	3990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476506
32	NC_005814	ACA	2	6	4010	4015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45476506
33	NC_005814	CGG	2	6	4069	4074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476506
34	NC_005814	GAT	2	6	4104	4109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476506
35	NC_005814	GTG	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45476506
36	NC_005814	GGC	2	6	4226	4231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476506
37	NC_005814	AAC	2	6	4277	4282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45476506
38	NC_005814	GAA	2	6	4290	4295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476506
39	NC_005814	CAT	2	6	4420	4425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476507
40	NC_005814	GGC	2	6	4456	4461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476507
41	NC_005814	CAT	3	9	4540	4548	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476507
42	NC_005814	GGC	2	6	4550	4555	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476507
43	NC_005814	CTG	2	6	4589	4594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476507
44	NC_005814	CTG	2	6	4679	4684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476508
45	NC_005814	CAT	2	6	4702	4707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476508
46	NC_005814	TGA	2	6	4764	4769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476508
47	NC_005814	CAA	2	6	4863	4868	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45476508
48	NC_005814	ATG	3	9	4887	4895	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476508
49	NC_005814	CCA	2	6	4941	4946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45476508
50	NC_005814	AAG	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476508
51	NC_005814	TCA	2	6	4978	4983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476508
52	NC_005814	TCA	2	6	5173	5178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476508
53	NC_005814	TAC	2	6	5219	5224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476508
54	NC_005814	GCG	3	9	5543	5551	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476508
55	NC_005814	CGG	2	6	5562	5567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476508
56	NC_005814	GAA	2	6	5636	5641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476508
57	NC_005814	GAT	2	6	5653	5658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476508
58	NC_005814	CTT	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45476508
59	NC_005814	TGA	2	6	5763	5768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476508
60	NC_005814	CGA	3	9	5773	5781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476508
61	NC_005814	CTG	2	6	5822	5827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476508
62	NC_005814	CAT	2	6	5866	5871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476508
63	NC_005814	AAC	2	6	5933	5938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45476508
64	NC_005814	GCG	2	6	5978	5983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476508
65	NC_005814	CTA	2	6	6151	6156	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476508
66	NC_005814	GAA	2	6	6202	6207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476508
67	NC_005814	TGA	2	6	6258	6263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476508
68	NC_005814	GCA	2	6	6280	6285	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476508
69	NC_005814	TCA	2	6	6477	6482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476508
70	NC_005814	AAC	2	6	6483	6488	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45476508
71	NC_005814	TGA	2	6	6535	6540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476508
72	NC_005814	ACG	2	6	6552	6557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476508
73	NC_005814	CTG	2	6	6824	6829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476508
74	NC_005814	ATC	2	6	6995	7000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476508
75	NC_005814	GAT	2	6	7004	7009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476508
76	NC_005814	GGC	2	6	7051	7056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476508
77	NC_005814	GTG	2	6	7121	7126	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45476508
78	NC_005814	TGT	2	6	7156	7161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45476508
79	NC_005814	GCG	2	6	7182	7187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476508
80	NC_005814	GCG	2	6	7257	7262	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476508
81	NC_005814	TTG	2	6	7592	7597	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45476509
82	NC_005814	CTC	2	6	7666	7671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45476509
83	NC_005814	CGG	2	6	7674	7679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476509
84	NC_005814	TCC	2	6	7681	7686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45476509
85	NC_005814	CAG	2	6	7774	7779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476509
86	NC_005814	ACC	2	6	7954	7959	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45476509
87	NC_005814	AGC	2	6	7980	7985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476509
88	NC_005814	CAG	3	9	8035	8043	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476509
89	NC_005814	TTA	2	6	8096	8101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45476510
90	NC_005814	TCT	2	6	8110	8115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45476510
91	NC_005814	AGA	2	6	8149	8154	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476510
92	NC_005814	AAC	2	6	8161	8166	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45476510
93	NC_005814	AGA	2	6	8188	8193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476510
94	NC_005814	ACA	2	6	8278	8283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45476510
95	NC_005814	GGT	2	6	8334	8339	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	45476511
96	NC_005814	AGG	2	6	8369	8374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45476511
97	NC_005814	ATG	2	6	8400	8405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476511
98	NC_005814	ATG	3	9	8418	8426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476511
99	NC_005814	GCA	2	6	8433	8438	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476511
100	NC_005814	CCA	2	6	8446	8451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45476511
101	NC_005814	CAT	2	6	8456	8461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476511
102	NC_005814	CAT	2	6	8525	8530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476511
103	NC_005814	AGG	2	6	8611	8616	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45476511
104	NC_005814	ATA	2	6	8632	8637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45476511
105	NC_005814	ATT	2	6	8778	8783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45476511
106	NC_005814	TTG	2	6	8823	8828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45476511
107	NC_005814	TAA	2	6	8888	8893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45476511
108	NC_005814	ATT	2	6	8965	8970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45476511
109	NC_005814	GCA	2	6	9096	9101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476511
110	NC_005814	TGC	3	9	9158	9166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476511
111	NC_005814	ACA	2	6	9226	9231	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45476511
112	NC_005814	GAT	2	6	9329	9334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476511
113	NC_005814	AAG	2	6	9384	9389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476511
114	NC_005814	AGC	2	6	9662	9667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476512
115	NC_005814	TGT	2	6	9708	9713	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45476512
116	NC_005814	GGC	2	6	9715	9720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476512
117	NC_005814	CTG	2	6	9727	9732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476512
118	NC_005814	TCG	2	6	9749	9754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476512
119	NC_005814	GAC	2	6	9943	9948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476512
120	NC_005814	CCA	2	6	10115	10120	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45476512
121	NC_005814	AAG	2	6	10129	10134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476512
122	NC_005814	CCG	2	6	10140	10145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476512
123	NC_005814	ACT	2	6	10244	10249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476512
124	NC_005814	ATG	2	6	10302	10307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476512
125	NC_005814	ATG	2	6	10338	10343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476513
126	NC_005814	GCG	2	6	10345	10350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476513
127	NC_005814	GCA	2	6	10400	10405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476513
128	NC_005814	CGT	2	6	10433	10438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476513
129	NC_005814	TGA	2	6	10514	10519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476513
130	NC_005814	GAT	2	6	10704	10709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476513
131	NC_005814	GCA	2	6	10718	10723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476513
132	NC_005814	GAA	2	6	10758	10763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476513
133	NC_005814	ACG	2	6	10930	10935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476513
134	NC_005814	CAG	2	6	11024	11029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476513
135	NC_005814	AGA	2	6	11035	11040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476513
136	NC_005814	CGC	2	6	11147	11152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476513
137	NC_005814	ACG	2	6	11258	11263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476514
138	NC_005814	GAT	2	6	11317	11322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476514
139	NC_005814	GAC	2	6	11383	11388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476514
140	NC_005814	CCG	2	6	11411	11416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476514
141	NC_005814	GAA	2	6	11542	11547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476514
142	NC_005814	AGC	2	6	11642	11647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476514
143	NC_005814	AGC	2	6	11662	11667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476514
144	NC_005814	GGC	2	6	11685	11690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476514
145	NC_005814	GCC	2	6	11695	11700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476514
146	NC_005814	CAA	2	6	11712	11717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45476514
147	NC_005814	CCA	2	6	11750	11755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45476514
148	NC_005814	GCA	2	6	11778	11783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476514
149	NC_005814	ACC	2	6	11809	11814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45476514
150	NC_005814	ACA	2	6	11817	11822	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45476514
151	NC_005814	CAG	2	6	11826	11831	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476514
152	NC_005814	CCG	2	6	11846	11851	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476514
153	NC_005814	ACT	2	6	11995	12000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476514
154	NC_005814	CAC	2	6	12045	12050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45476514
155	NC_005814	CAT	2	6	12053	12058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476514
156	NC_005814	GAA	2	6	12079	12084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476514
157	NC_005814	TCA	2	6	12113	12118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476514
158	NC_005814	CGA	2	6	12122	12127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476514
159	NC_005814	GCC	2	6	12144	12149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476514
160	NC_005814	CGG	2	6	12246	12251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476514
161	NC_005814	GCC	2	6	12344	12349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476514
162	NC_005814	TAC	2	6	12372	12377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476514
163	NC_005814	ATC	2	6	12430	12435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476514
164	NC_005814	AGC	2	6	12627	12632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476515
165	NC_005814	CAC	2	6	12689	12694	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45476515
166	NC_005814	ACG	2	6	12900	12905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476515
167	NC_005814	ACC	2	6	13013	13018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45476515
168	NC_005814	ATC	2	6	13138	13143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476515
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171	NC_005814	TTA	2	6	13335	13340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45476515
172	NC_005814	CCG	2	6	13450	13455	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476515
173	NC_005814	GGC	2	6	13545	13550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476516
174	NC_005814	CGC	2	6	13571	13576	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476516
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189	NC_005814	GAA	2	6	14680	14685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476519
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205	NC_005814	GGA	2	6	16180	16185	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	45476521
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220	NC_005814	GAT	2	6	17389	17394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476522
221	NC_005814	ATC	2	6	17462	17467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476522
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223	NC_005814	CAT	2	6	17649	17654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476522
224	NC_005814	GGC	2	6	17667	17672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476522
225	NC_005814	AAC	2	6	17776	17781	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45476522
226	NC_005814	TGA	2	6	17835	17840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476522
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228	NC_005814	GCG	2	6	17861	17866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476522
229	NC_005814	ATT	2	6	17874	17879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	45476522
230	NC_005814	GTT	2	6	17989	17994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45476523
231	NC_005814	GTC	2	6	17998	18003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476523
232	NC_005814	ATG	2	6	18040	18045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476523
233	NC_005814	TGA	2	6	18194	18199	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476523
234	NC_005814	GAA	3	9	18298	18306	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	45476523
235	NC_005814	TCA	2	6	18617	18622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476524
236	NC_005814	GCA	2	6	18624	18629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476524
237	NC_005814	GCA	2	6	18891	18896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476525
238	NC_005814	GGC	2	6	19011	19016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476525
239	NC_005814	ATA	2	6	19056	19061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	45476525
240	NC_005814	CAT	2	6	19142	19147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476526
241	NC_005814	CGC	2	6	19256	19261	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476526
242	NC_005814	ACC	2	6	19324	19329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45476526
243	NC_005814	ATC	2	6	19395	19400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45476526
244	NC_005814	CGC	2	6	19473	19478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476526
245	NC_005814	TTC	2	6	19522	19527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45476526
246	NC_005814	GCC	2	6	19873	19878	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	45476527
247	NC_005814	CCA	2	6	20230	20235	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	45476527
248	NC_005814	CTG	2	6	20256	20261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476527
249	NC_005814	TCC	2	6	20314	20319	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	45476527
250	NC_005814	TGC	2	6	20380	20385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	45476527
251	NC_005814	CAG	2	6	20547	20552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	45476527
252	NC_005814	GGC	2	6	20697	20702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	45476527
253	NC_005814	ACA	2	6	20705	20710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	45476527
254	NC_005814	GTT	2	6	21021	21026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	45476528
255	NC_005814	TTC	3	9	21227	21235	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45476528
256	NC_005814	CTT	2	6	21369	21374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45476529
257	NC_005814	ATG	3	9	21391	21399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	45476529
258	NC_005814	CTT	2	6	21578	21583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	45476529

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.