MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCRY

Total Repeats: 30

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005814	GA	5	10	1417	1426	50 %	0 %	50 %	0 %	45476500
2	NC_005814	TC	3	6	1542	1547	0 %	50 %	0 %	50 %	45476501
3	NC_005814	TA	3	6	2060	2065	50 %	50 %	0 %	0 %	45476502
4	NC_005814	AT	3	6	2336	2341	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005814	GC	3	6	2734	2739	0 %	0 %	50 %	50 %	45476503
6	NC_005814	CA	3	6	3355	3360	50 %	0 %	0 %	50 %	45476505
7	NC_005814	GC	3	6	5399	5404	0 %	0 %	50 %	50 %	45476508
8	NC_005814	TC	3	6	5417	5422	0 %	50 %	0 %	50 %	45476508
9	NC_005814	AC	3	6	6171	6176	50 %	0 %	0 %	50 %	45476508
10	NC_005814	CT	3	6	8493	8498	0 %	50 %	0 %	50 %	45476511
11	NC_005814	AT	3	6	8714	8719	50 %	50 %	0 %	0 %	45476511
12	NC_005814	AT	3	6	8905	8910	50 %	50 %	0 %	0 %	45476511
13	NC_005814	TC	3	6	9077	9082	0 %	50 %	0 %	50 %	45476511
14	NC_005814	GA	3	6	9368	9373	50 %	0 %	50 %	0 %	45476511
15	NC_005814	GC	3	6	9523	9528	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
16	NC_005814	CA	3	6	11754	11759	50 %	0 %	0 %	50 %	45476514
17	NC_005814	TC	3	6	13904	13909	0 %	50 %	0 %	50 %	45476516
18	NC_005814	CA	3	6	14596	14601	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_005814	CG	3	6	15032	15037	0 %	0 %	50 %	50 %	45476520
20	NC_005814	GA	3	6	15782	15787	50 %	0 %	50 %	0 %	45476521
21	NC_005814	TC	3	6	16164	16169	0 %	50 %	0 %	50 %	45476521
22	NC_005814	AT	3	6	16653	16658	50 %	50 %	0 %	0 %	45476521
23	NC_005814	TA	3	6	17880	17885	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_005814	TA	3	6	18396	18401	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_005814	TA	3	6	19092	19097	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005814	CA	3	6	19807	19812	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_005814	CA	3	6	20386	20391	50 %	0 %	0 %	50 %	45476527
28	NC_005814	TA	3	6	20931	20936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005814	GT	3	6	21082	21087	0 %	50 %	50 %	0 %	45476528
30	NC_005814	CT	3	6	21206	21211	0 %	50 %	0 %	50 %	45476528

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.