MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCD1

Total Repeats: 18

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005813	CAGGAG	2	12	408	419	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	45478503
2	NC_005813	AATCTT	2	12	10011	10022	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45478515
3	NC_005813	CATTCA	2	12	12746	12757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	45478518
4	NC_005813	TCAATT	2	12	14575	14586	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	45478520
5	NC_005813	GCAAAA	2	12	17701	17712	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	45478525
6	NC_005813	AGTAAC	2	12	23068	23079	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	45478532
7	NC_005813	ACGTTA	2	12	23361	23372	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	45478533
8	NC_005813	AGTTCT	2	12	29816	29827	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45478542
9	NC_005813	GTTCTT	2	12	30944	30955	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	45478543
10	NC_005813	TCATCT	2	12	30979	30990	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	45478543
11	NC_005813	ATCTTG	2	12	36282	36293	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	45478550
12	NC_005813	GTTTAA	2	12	40621	40632	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	45478555
13	NC_005813	AAAAAT	2	12	42390	42401	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	45478557
14	NC_005813	AAATGT	2	12	47060	47071	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45478563
15	NC_005813	TGGAAA	2	12	50749	50760	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45478566
16	NC_005813	GACATC	2	12	52769	52780	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	229220788
17	NC_005813	ATAGAT	2	12	56296	56307	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	45478572
18	NC_005813	TGGAAA	2	12	70053	70064	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	45478587

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.