MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis biovar Microtus str. 91001 plasmid pCD1

Total Repeats: 56

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_005813	AACG	2	8	4	11	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_005813	AGTG	2	8	3449	3456	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_005813	TGGC	2	8	3485	3492	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4	NC_005813	TAAA	2	8	4907	4914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_005813	GCCC	2	8	4956	4963	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_005813	AGGG	2	8	6201	6208	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
7	NC_005813	GATA	2	8	6709	6716	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_005813	ATAA	2	8	9790	9797	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_005813	TTCT	2	8	10707	10714	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_005813	TGCC	2	8	10747	10754	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_005813	AAAG	2	8	10892	10899	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
12	NC_005813	TCCC	2	8	11221	11228	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_005813	TCCG	2	8	11850	11857	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_005813	TAAA	2	8	13776	13783	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_005813	ATAA	2	8	14085	14092	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_005813	ATCC	2	8	15504	15511	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_005813	TATT	2	8	15522	15529	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_005813	TTAT	2	8	16231	16238	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_005813	ATTT	2	8	16264	16271	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_005813	AAAT	2	8	23588	23595	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_005813	TGCG	2	8	24832	24839	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_005813	TCCC	2	8	25288	25295	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_005813	CTTT	2	8	25471	25478	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
24	NC_005813	CAAA	2	8	25515	25522	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_005813	TAAA	2	8	37635	37642	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_005813	GTTA	2	8	41581	41588	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_005813	TTAT	2	8	43121	43128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_005813	ATAA	2	8	43176	43183	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_005813	ATGT	2	8	43231	43238	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_005813	TTTG	2	8	43240	43247	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31	NC_005813	AAAT	2	8	44474	44481	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_005813	CATT	2	8	44541	44548	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
33	NC_005813	ATAA	2	8	45322	45329	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_005813	TTTA	2	8	45489	45496	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_005813	ATAA	2	8	48458	48465	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_005813	GTCG	2	8	49449	49456	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_005813	GGTG	2	8	49487	49494	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
38	NC_005813	CCGG	2	8	50347	50354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_005813	AGGG	2	8	51360	51367	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
40	NC_005813	ACTG	2	8	52051	52058	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_005813	AAAG	2	8	52164	52171	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_005813	TTTA	2	8	54580	54587	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_005813	ATCT	2	8	55161	55168	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_005813	ATCC	2	8	55223	55230	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_005813	GGCT	2	8	55736	55743	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_005813	TATT	2	8	57137	57144	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_005813	ATCG	2	8	59938	59945	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_005813	TCCC	2	8	61020	61027	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
49	NC_005813	TTGT	2	8	62237	62244	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_005813	TTTA	2	8	62702	62709	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_005813	CAGG	2	8	63897	63904	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
52	NC_005813	TAAT	2	8	67136	67143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_005813	TAAG	2	8	67632	67639	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_005813	AAAG	2	8	67957	67964	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_005813	GTAA	2	8	68192	68199	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_005813	CTGC	2	8	68882	68889	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.